Ассоциация сочетания аберрации числа копии генов WNT-сигналинга и амплификаций генов стволовости в опухоли молочной железы с метастазированием

Введение. Изучена ассоциация с гематогенным метастазированием наличия 2 и более амплификаций генов стволовости и CNA (Copy Number Aberration) локусов генов WNT-сигнального пути в остаточной резидуальной опухоли молочной железы. Идентифицированы гены WNT-pathway, ассоциированные с метастазированием. Материал и методы. В исследование были включены 30 больных раком молочной железы, в резидуальной опухоли которых после неоадъювантной химиотерапии были 2 и более амплификации генов стволовости. У 15 из 30 больных развились гематогенные метастазы, они составили группу с метастазами, во вторую группу без метастазов вошли остальные 15 пациентов. ДНК опухоли была исследована при помощи микроматрицы CytoScanHD Array (Affymetrix, USA). Результаты. Путем вычитания частот амплификаций и делеций по 852 цитобендам между группами с метастазами и без метастазов был установлен 21 цитобенд с наибольшей разницей частот делеций и амплификаций. В них находятся 19 из 150 генов WNT (14 активаторов: SKP1, WNT8A, MAPK9, CCND3, FZD9, WNT8B, CCND1, PLCB2, PRKCB, FZD2, WNT3, WNT9B и 7 негативных регуляторов: GSK3B, APC, CSNK2B, SFRP5, BTRC, TCF7L2, CSNK2A2). Была разработана балльная система, при амплификации активаторов WNT-сигналинга или делеции негативных регуляторов к общей сумме баллов прибавлялся один балл, и, наоборот, при делеции активаторов WNT-сигналинга или амплификации негативных регуляторов от общей суммы отнимался один балл. Показано, что 93 % (14/15) больных с метастазами имеют суммарный балл больше 0, в то время как 93 % (14/15) больных без метастазов имеют суммарный балл, равный нулю или меньше нуля. Различия между группами статистически значимы по двустороннему критерию Фишера с высоким уровнем доверительной вероятности (р=0,000003) и по лог-ранговому тесту (р=0,00004) при оценке безметастатической выживаемости по методу Каплана - Майера. Заключение. Были идентифицированы 19 генов WNT-сигналинга, CNA которых в резидуальной опухоли, совместно с амплификациями генов стволовости ассоциированы с метастазированием и могут использоваться в качестве прогностического фактора.