Транскриптомный анализ клеток меланомы, полученных из различных участков первичной опухоли

Введение. Внутриопухолевая гетерогенность представляет собой характерную черту большинства злокачественных новообразований, в том числе и меланомы кожи. Данное свойство является одним из препятствий для проведения эффективной таргетной терапии, поскольку у различных субклонов опухолевых клеток наблюдается вариабельная чувствительность к данным препаратам. С современных позиций терапия злокачественных новообразований требует персонифицированного подхода для каждого конкретного пациента. цель исследования - оценка возможных различий между тканями меланомы, выделенными из различных участков первичной опухоли одного пациента на транскриптомном уровне. материалы и методы. В работе были использованы культуры клеток меланомы, полученные из центральной и периферической частей первичной опухоли двух пациентов. Исследование транскриптомов клеток проводили методом микрочипирования с последующим биоинформатическим анализом. Результаты. В клетках меланомы первого пациента, полученных из центрального и периферического участка одной опухоли, не было выявлено различий по транскриптомному профилю. У второго пациента имели место существенные различия (по 2953 транскриптам из 48226). В клетках, полученных из центрального участка опухоли, выявлено повышение мРНК генов, кодирующих белки, ассоциированные с иммунным ответом опухоли, транспортные белки AbC-семейства, сигнальные молекулы класса цитокинов. В культуре клеток, выделенной из периферического участка этой же опухоли, зарегистрировано увеличение уровня мРНК генов, кодирующих белки внеклеточного матрикса и воспалительного ответа. В целом различия между субклонами клеток второго пациента касались ряда сигнальных каскадов, играющих ведущую роль в онкогенезе (MAPK, PI3K-Akt-mTOR, VEgFAVEgFR2 и др). Заключение. Проведенное исследование позволяет оценить возможные различия между клетками внутри опухоли на транскрипционном уровне с целью поиска новых подходов для персонифицированной терапии.