2D-протеомика рака желудка: идентификация белков с повышенным синтезом в опухоли
Автор: Григорьева Е.С., Букурова Ю.А., Чердынцева Надежда Викторовна, Афанасьев Сергей Геннадьевич, Комарова Т.В., Тузиков Сергей Александрович, Родичева Н.С., Берестень С.Ф.
Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj
Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования
Статья в выпуске: 5 (35), 2009 года.
Бесплатный доступ
Проведен сравнительный протеомный анализ опухолевой и нормальной ткани желудка для идентификации белков, синтез которых значительно повышен в опухоли по сравнению с нормой. Использовались парные образцы опухолевой и нормальной ткани от пациентов с диагнозом рак желудка, полученные при проведении оперативного вмешательства. Для увеличения разрешающей способности 2D-гель электрофореза была использована предварительная экстракция раство- римой фракции белков для удаления мажорных структурных белков. В ходе сравнительного анализа белковых профилей опухолевой и нормальной тканей 4 пациентов с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии выявлено увеличение синтеза 6 белков: тропомиозина-3, тимозина бета-10, циклофилина А, катепсина Д, белка hCG1816442 и белка S100-A9. Повы- шенный уровень синтеза большинства белков подтверждается литературными данными, однако стабильное повышение уровня синтеза белка hCG1816442 в опухоли желудка обнаружено нами впервые. Для циклофилина A показан высокий уровень экспрессии только в опухолевой ткани желудка, что делает перспективными дальнейшие исследования для оценки его диагностической значимости.
Рак желудка, 2d-протеомика
Короткий адрес: https://sciup.org/14055181
IDR: 14055181
Текст научной статьи 2D-протеомика рака желудка: идентификация белков с повышенным синтезом в опухоли
Для идентификации опухолевых маркеров широко применяются протеомные методы сравнительного анализа белковых профилей нормальных и опухолевых тканей [17, 19]. Такой подход позволяет идентифицировать белковые маркеры, ассоциированные с опухолевой трансформацией. Для разработки потенциальных молекулярных маркеров с диагностической целью необходимо выявление белков, содержание которых существенно повышено в опухоли и биологических жидкостях (сыворотка крови), что позволило бы осуществлять их детекцию на ранних этапах опухолевого процесса.
Материал и методы
РФ от 24.12.93 № 2288), получено разрешение этического комитета института.
Результаты и обсуждение
На рис. 1 представлены фрагменты гелей, полученные после двумерного электрофоретического разделения белков экстрактов нор-
Рис. 1. Фрагменты двумерных электрофореграмм, полученных при разделении белков, растворимых в солевом буфере, из нормальной (А, В) и опухолевой (Б, Г) тканей. Цифрами обозначены белки: 1 – TB10, 2 – PPIA, 3 – CTSD/ hCG1816442, 4 – TPM3, 5 – S100A9
СИБИРСКИЙ ОНКОЛОГИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ. 2009. №5 (35)
Таблица 1
Характеристика идентифицированных белков с повышенным содержанием в опухоли
В табл. 2 представлены сведения о спектре обнаруженных белков с повышенным синтезом в индивидуальных опухолях во взаимосвязи со стадией процесса и гистопатологической формой опухоли.
Повышение синтеза во всех 4 опухолевых образцах отмечается только для одного белка – тимозина β-10 (TB10). Повышенный синтез циклофилина А отмечен в 3 случаях из 4, тогда как увеличение синтеза катепсина Д, белка hCG1816442, тропомиозина-3 наблюдалось только в 2 образцах. Кроме того, в 2 случаях из 4 в опухолевых образцах наблюдалось пятно, соответствующее белку S100-A9, которое отсутствовало во всех образцах нормальной ткани. При характеристике спектра белков с повышенным синтезом в опухоли в сопоставлении с гистологическим типом (интестинальный, диффузный или смешанный) не обнаружено четких взаимосвязей, что, очевидно, обусловлено небольшим числом наблюдений и гетерогенностью материала по клинико-морфологическим параметрам. Следует отметить, однако, что циклофиллин не детектировался в опухоли интестинального гистотипа, в то время как во всех опухолях с наличием элементов диффузного гистологического строения (диффузный и смешанный тип) был выявлен его повышенный синтез.
Таблица 2
В целом стратегия выявления белков с повышенным синтезом в злокачественных опухолях предполагает возможность ранней серологической диагностики рака соответствующей локализации с помощью антител, полученных к этим белкам, при этом важным является и аспект прогнозирования рецидива заболевания при мониторинге больного после проведенного противоопухолевого лечения.
Авторы приносят глубокую благодарность Н.А. Лисицыну за плодотворное обсуждение результатов работы.
Настоящая работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (гранты 08 – 04 – 13705 офи-ц, 09 – 04 – 99072 р-офи ) и Международного научнотехнического центра (грант 3909).
