Анализ белок-белковых взаимодействий сердечно-сосудистых заболеваний: поиск новых потенциальных биомаркеров

Бесплатный доступ

Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) являются одной из ведущих причин смертности и инвалидизации населения во всём мире, что подчёркивает необходимость поиска новых биомаркеров для ранней диагностики и прогноза. В данной работе использован биоинформатический подход для анализа белков, ассоциированных с ССЗ, с опорой на данные открытых баз DisGeNET, OMIM и UniProt. На основе полученного списка проведено построение сети белок-белковых взаимодействий в STRING и её последующий анализ с определением центральных узлов и функционального обогащения. В результате выделены ключевые белки-хабы, такие как IL6, TNF, APOE, VEGFA, ICAM1 и CRP, играющие центральную роль в патогенезе ССЗ и взаимосвязанные с ними белки, потенциально пригодные для использования в качестве биомаркеров. Анализ показал, что основные обогащённые процессы связаны с воспалительным ответом, регуляцией липидного обмена, ангиогенезом и активацией иммунной системы. Полученные результаты подтверждают значимость сетевого биоинформатического анализа для выявления перспективных кандидатов в биомаркеры и могут служить основой для дальнейших клинических исследований.

Еще

Сердечно-сосудистые заболевания, белок-белковые взаимодействия, биоинформатика, патологии сердца, биомаркеры

Короткий адрес: https://sciup.org/170212367

IDR: 170212367   |   DOI: 10.24412/2500-1000-2025-11-2-18-22

Analysis of protein-protein interactions in cardiovascular diseases: search for new potential biomarkers

Cardiovascular diseases (CVDs) are one of the leading causes of mortality and disability worldwide, highlighting the need to identify new biomarkers for early diagnosis and prognosis. In this study, a bioinformatics approach was employed to analyze proteins associated with CVDs, utilizing data from open-access databases such as DisGeNET, OMIM, and UniProt. Based on the obtained list, a protein-protein interaction network was constructed using STRING, followed by its analysis to identify central nodes and perform functional enrichment. As a result, key hub proteins such as IL6, TNF, APOE, VEGFA, ICAM1 and CRP, which play a central role in the pathogenesis of CVD, and proteins associated with them, potentially suitable for use as biomarkers, were identified. The analysis revealed that the main enriched processes are related to inflammatory response, lipid metabolism regulation, angiogenesis, and immune system activation. These findings underscore the importance of network-based bioinformatics analysis for identifying promising biomarker candidates and provide a foundation for further clinical research.

Еще