Анализ дифференциальной экспрессии генов липидного обмена в атеросклеротических бляшках у пациентов с коронарным атеросклерозом

Анализ дифференциальной экспрессии генов липидного обмена в атеросклеротических бляшках у пациентов с коронарным атеросклерозом

Автор: Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Фишман В.С., Полонская Я.В., Каштанова Е.В., Чернявский А.М., Мурашов И.С., Воевода М.И.

Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk

Рубрика: Экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 4 т.36, 2021 года.

Бесплатный доступ

Цель: выполнить анализ дифференциальной экспрессии генов липидного обмена в атеросклеротических бляшках разных типов у пациентов с коронарным атеросклерозом.Материал и методы. Исследование выполнено на образцах атеросклеротических бляшек пациентов с коронарным атеросклерозом без острого коронарного синдрома со стабильной стенокардией напряжения II-IV функционального класса (ФК) в возрасте 45-65 лет. Коронарный атеросклероз подтвержден коронароангиографией. Забор тканей атеросклеротической бляшки проведен интраоперационно при наличии показаний. Полногеномное секвенирование рибонуклеиновой кислоты (РНК) выполнено с использованием Illumina's TruSeq RNA Sample Preparation Kit (Illumina, USA).Результаты. Статистически значимые различия в экспрессии генов между разными типами бляшек были отмечены для LDLR, APOB, PCSK9, LDLRAP1, LIPA, STAP1, ABCA1, APOA1, APOE, LPL, SCARВ1 и SREBF2. Наблюдалось 8-кратное статистически значимое увеличение экспрессии гена APOE (p

Еще

Атеросклеротические бляшки, экспрессия генов, ген apoe, ген apoc1, ген ldlr, ген apob, гены липидного метаболизма, транскриптом

Короткий адрес: https://sciup.org/149139364

IDR: 149139364   |   DOI: 10.29001/2073-8552-2021-36-4-156-163

Список литературы Анализ дифференциальной экспрессии генов липидного обмена в атеросклеротических бляшках у пациентов с коронарным атеросклерозом

  • Noguchi T., Nakao K., Asaumi Y., Morita Y., Otsuka F., Kataoka Y. et al. Noninvasive coronary plaque imaging. J. Atheroscler. Thromb. 2018;25(4):281-293. DOI: 10.5551/jat.RV17019.
  • Lu M., Peng P., Qiao H., Cui Y., Ma L., Cui B. et al. Association between age and progression of carotid artery atherosclerosis: a serial high resolution magnetic resonance imaging study. Int. J. Cardiovasc. Imaging. 2019;35(7):1287-1295. DOI: 10.1007/s10554-019-01538-4.
  • Ahmadi A., Argulian E., Leipsic J., Newby D.E., Narula J. From subclin-ical atherosclerosis to plaque progression and acute coronary events: JACC state-of-the-art review. J. Am. Coll. Cardiol. 2019;74(12):1608-1617. DOI: 10.1016/j.jacc.2019.08.012.
  • Sulkava M., Raitoharju E., Levula M., Seppälä I., Lyytikäinen L.P., Men-nander A. et al. Differentially expressed genes and canonical pathway expression in human atherosclerotic plaques - Tampere Vascular Study. Sci. Rep. 2017;7(1):41483. DOI: 10.1038/srep41483.
  • Levula M., Oksala N., Airla N., Zeitlin R., Salenius J-P., Järvinen O. et al. Genes involved in systemic and arterial bed dependent atherosclerosis - Tampere Vascular Study. PLoS One. 2012;7(4):e33787. DOI: 10.1371/journal.pone.0033787.
  • Иванощук Д.Е., Рагино Ю.И., Шахтшнейдер Е.В., Михайлова С.В., Фишман В.С., Полонская Я.В. и др. Анализ дифференциальной экспрессии матриксных металлопротеиназ в стабильной и нестабильной атеросклеротических бляшках методом полногеномного секвенирования РНК: пилотное исследование. Российский кардиологический журнал. 2018;(8):52-58. DOI: 10.15829/1560-4071-2018-8-52-58. Ivanoschuk D.E., Ragino Yu.I., Shakhtshneider E.V., Mikhailova S.V., Fishman V.S., Polonskaya Ya.V. et al. Analysis of differential expression of matrix metalloproteases in stable and unstable atherosclerotic lesions by a method of full genome sequencing of RNA: Pilot study. Russian Journal of Cardiology. 2018;(8):52-58 (In Russ.). DOI: 10.15829/15604071-2018-8-52-58.
  • Murashov I.S., Volkov A.M., Kazanskaya G.M., Kliver E.E., Chernyav-sky A.M., Nikityuk D.B et al. Immunohistochemical features of different types of unstable atherosclerotic plaques of coronary arteries. Bull. Exp. Biol. Med. 2018;166(1):102-106. DOI: 10.1007/s10517-018-4297-1.
  • Liu W., Zhao Y., Wu J. Gene expression profile analysis of the progression of carotid atherosclerotic plaques. Mol. Med. Rep. 2018;17(4):5789-5795. DOI: 10.3892/mmr.2018.8575.
  • Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Ша-рыш Д.В., Зарубин А.А. и др. Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом. Биомедицинская химия. 2018;64(5):416—422. DOI: 10.18097/pbmc20186405416. Nazarenko M.S., Markov A.V., Sleptsov A.A., Koroleva I.A., Sharysh D.V., Zarubin A.A. et al. Comparative analysis of gene expression in vascular cells of patients with advanced atherosclerosis. Biomeditsinskaya Khi-miya. 2018;64(5):416-422 (In Russ.). DOI: 10.18097/pbmc20186405416.
  • Vrablik M., Tichy L., Freiberger T., Blaha V., Satny M., Hubacek J.A. Genetics of familial рypercholesterolemia: New insights. Front. Genet. 2020;11:574474. DOI: 10.3389/fgene.2020.574474.
  • Lumsden A.L., Mulugeta A., Zhou A., Hypponen E. Apolipoprotein E (APOE) genotype-associated disease risks: a phenome-wide, registry-based, case-control study utilising the UK Biobank. EBioMedicine. 2020;59:102954. DOI: 10.1016/j.ebiom.2020.102954.
  • Welty F.K. Hypobetalipoproteinemia and abetalipoproteinemia: Liver disease and cardiovascular disease. Curr. Opin. Lipidol. 2020;31(2):49-55. DOI: 10.1097/MOL.0000000000000663.
  • Fuior E.V., Gafencu A.V. Apolipoprotein C1: Its pleiotropic effects in lipid metabolism and beyond. Int. J. Mol. Sci. 2019;20(23):5939. DOI: 10.3390/ijms20235939.
  • Marais A.D. Apolipoprotein E in lipoprotein metabolism, health and cardiovascular disease. Pathology. 2019;51(2):165-176. DOI: 10.1016/j. pathol.2018.11.002.
  • Low-Kam C., Rhainds D., Lo K.S., Barhdadi A., Boulé M., Alem S. et al. Variants at the APOE /C1/C2/C4 Locus Modulate Cholesterol Efflux Capacity Independently of High-Density Lipoprotein Cholesterol. J. Am. Heart Assoc. 2018;7(16):e009545. DOI: 10.1161/ JAHA.118.009545.
  • Shi Y., Andhey P.S., Ising C., Wang K., Snipes L.L., Boyer K. et al. Overexpressing low-density lipoprotein receptor reduces tau-associa-ted neurodegeneration in relation to apoE-linked mechanisms. Neuron. 2021;109(15):2413-2426.e7. DOI: 10.1016/j.neuron.2021.05.034.
  • Krishnan N., Chen X., Donnelly-Roberts D., Mohler E.G., Holtzman D.M., Gopalakrishnan S.M. Small molecule phenotypic screen identifies novel regulators of LDLR expression. ACS Chem. Biol. 2020;15(12):3262-3274. DOI: 10.1021/acschembio.0c00851.
  • Sobati S., Shakouri A., Edalati M., Mohammadnejad D., Parvan R., Ma-soumi J. et al. PCSK9: A key target for the Treatment of Cardiovascular Disease (CVD). Adv. Pharm. Bull. 2020;10(4):502-511. DOI: 10.34172/ apb.2020.062.
  • Crone B., Krause A.M., Hornsby W.E., Wilier C.J., Surakka I. Translating genetic association of lipid levels for biological and clinical application. Cardiovasc. Drugs Ther. 2021;35(3):617-626. DOI: 10.1007/s10557-021-07156-4.
  • Schaefer E.J., Geller A.S., Endress G. The biochemical and genetic diagnosis of lipid disorders. Curr. Opin. Lipidol. 2019;30(2):56-62. DOI: 10.1097/M0L.0000000000000590.
  • Kumari A., Kristensen K.K., Ploug M., Winther A.L. The importance of lipoprotein lipase regulation in atherosclerosis. Biomedicines. 2021;9(7):782. DOI: 10.3390/biomedicines9070782.
  • Nakagawa Y., Shimano H. CREBH regulates systemic glucose and lipid metabolism. Int. J. Mol. Sci. 2018;19(5):1396. DOI: 10.3390/ ijms19051396.
  • Aryal B., Price N.L., Suarez Y., Fernández-Hernando C. ANGPTL4 in metabolic and cardiovascular disease. Trends Mol. Med. 2019;25(8): 723-734. DOI: 10.1016/j.molmed.2019.05.010.
Еще
Статья научная
SciUp 2024 © 2024 ©