Анализ мутаций в генах KRAS и BRAF при раке толстой и прямой кишки в российской популяции

Анализ мутаций в генах KRAS и BRAF при раке толстой и прямой кишки в российской популяции

Автор: Писарева Екатерина Евгеньевна, Любченко Людмила Николаевна, Коваленко Сергей Петрович, Шаманин Владимир Александрович

Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj

Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 2 (74), 2016 года.

Бесплатный доступ

Образцы опухоли толстой и прямой кишки (РТПК) от российских пациентов на наличие мутаций в генах KRAS и BRAF исследовали с помощью двух высокочувствительных методов анализа: аллельспецифической ПЦР в режиме реального времени (ас-рв ПЦР) и секвенирования по Сэнгеру с блокированием аллеля дикого типа. Материал и методы. В качестве материала для исследования использовали срезы свежезамороженной и фиксированной в формалине и заключенной в парафин ткани опухоли от 80 пациентов. На гистологическом исследовании было определено содержание опухолевых клеток в каждом образце. Образцы были протестированы методом ас-рв ПЦР на мутации в гене KRAS (G12C, G12S, G12R, G12V, G12D, G12A, G13D) и мутации BRAFV600E. Затем была проведена амплификация ДНК образцов в присутствии олигонуклеотида, блокирующего амплификацию аллеля KRAS дикого типа с дальнейшем секвенированием ДНК по Сэнгеру. результаты. По данным гистологического заключения из 80 образцов низкое содержание опухолевых клеток (

Еще

Пцр в режиме реального времени, секвенирование по сэнгеру, рак толстой и прямой кишки, мутации

Короткий адрес: https://sciup.org/14056668

IDR: 14056668   |   DOI: 10.21294/1814-4861-2016-15-2-36-41

Список литературы Анализ мутаций в генах KRAS и BRAF при раке толстой и прямой кишки в российской популяции

  • Злокачественные новообразования в России в 2011 году (заболеваемость и смертность)/Под ред. В.И. Чиссова, В.В. Старинского, Г.В. Петровой. М., 2013. С. 1-15.
  • Кит О.И., Водолажский Д.И., Двадненко К.В., Гудуева Е.Н., Кутилин Д.С., Геворкян Ю.А., Владимирова Л.Ю. Частота мутаций в гене KRAS в различных клинических группах пациентов юга России с колоректальным раком//Медицинская генетика. 2014. Т. 13, № 12 (150). С. 35-41.
  • Мазуренко Н.Н., Гагарин И.М., Цыганова И.В., Мочальникова В.В., Бредер В.В., Горбунова В.А. Частота и спектр мутаций KRAS в метастатическом колоректальном раке//Вопросы онкологии. 2013. Т. 59, № 6. С. 751-755.
  • Шубин В.П., Поспехова Н.И., Цуканов А.С., Рыбаков Е.Г., Панина М.В., Сушков О.И., Ачкасов С.И., Жданкина С.Н., Кашников В.Н., Фролов С.А., Шелыгин Ю.А. Частота и спектр мутаций в гене KRAS при роке толстой кишки разной локализации и раке анального канала//Медицинская генетика. 2014. Т.13, № 5 (143). С. 31-35.
  • Arcila M., Lau C., Nafa K., Ladanyi M. Detection of KRAS and BRAF mutations in colorectal carcinoma roles for high-sensitivity locked nucleic acid-PCR sequencing and broad-spectrum mass spectrometry genotyping//J. Mol. Diagn. 2011. Vol. 13 (1). P. 64-73 DOI: 10.1016/j.jmoldx.2010.11.005
  • Blanco-Calvo M., Concha Á., Figueroa A., Garrido F., Valladares-Ayerbes M. Colorectal Cancer Classification and Cell Heterogeneity: A Systems Oncology Approach//Int. J. Mol. Sci. 2015. Vol. 16 (6). P. 13610-13632 DOI: 10.3390/ijms160613610
  • Di Nicolantonio F., Martini M., Molinari F., Sartore-Bianchi A., Arena S., Saletti P., De Dosso S., Mazzucchelli L., Frattini M., Siena S., Bardelli A. Wild-type BRAF is required for response to panitumumab or cetuximab in metastatic colorectal cancer//J. Clin. Oncol. 2008. Vol. 26 (35). P. 5705-5712 DOI: 10.1200/JCO.2008.18.0786
  • Jakovljevic K., Malisic E., Cavic M., Krivokuca A., Dobricic J., Jankovic R. KRAS and BRAF mutations in Serbian patients with colorectal cancer//J. BUON. 2012. Vol. 17 (3). P. 575-580.
  • Jancik S., Drabek J., Berkovcova J., Xu Y.Z., Stankova M., Klein J., Kolek V., Skarda J., Tichy T., Grygarkova I., Radzioch D., Hajduch M. A comparison of Direct sequencing, Pyrosequencing, High resolution melting analysis, TheraScreen DxS, and the K-ras StripAssay for detecting KRAS mutations in non small cell lung carcinomas//J. Exp. Clin. Cancer Res. 2012. Vol. 31. P. 79 DOI: 10.1186/1756-9966-31-79
  • Jean G.W., Shah S.R. Epidermal growth factor receptor monoclonal antibodies for the treatment of metastatic colorectal cancer//Pharmacotherapy. 2008. Vol. 28 (6). P. 742-754 DOI: 10.1592/phco.28.6.742
  • Laurent-Puig P., Cayre A., Manceau G., Buc E., Bachet J.B., Lecomte T., Rougier P., Lievre A., Landi B., Boige V., Ducreux M., Ychou M., Bibeau F., Bouché O., Reid J., Stone S., Penault-Llorca F. Analysis of PTEN, BRAF, and EGFR status in determining benefit from cetuximab therapy in wild-type KRAS metastatic colon cancer//J. Clin. Oncol. 2009. Vol. 27 (35). P. 5924-5930 DOI: 10.1200/JCO.2008.21.6796
  • Lièvre A., Bachet J.B., Le Corre D., Boige V., Landi B., Emile J.F., Côté J.F., Tomasic G., Penna C., Ducreux M., Rougier P., Penault-Llorca F., Laurent-Puig P. KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer//Cancer Res. 2006. Vol. 66 (8). P. 3992-3995.
  • Milbury C.A., Li J., Makrigiorgos G.M. PCR-based methods for the enrichment of minority alleles and mutations//Clin. Chem. 2009. Vol. 55 (4). P. 632-640 DOI: 10.1373/clinchem.2008.113035
  • Pisareva E., Gutkina N., Kovalenko S., Kuehnapfel S., Hartmann A., Heinzerling L., Schneider-Stock R., Lyubchenko L., Shamanin V.A. Sensitive allele-specific real-time PCR test for mutations in BRAF codon V600 in skin melanoma//Melanoma Res. 2014. Vol. 24 (4). P. 322-331 DOI: 10.1097/CMR.0000000000000090
  • Porebska I., Harlozińska A., Bojarowski T. Expression of the tyrosine kinase activity growth factor receptors (EGFR., ERB B2., ERB B3) in colorectal adenocarcinomas and adenomas//Tumour Biol. 2000. Vol. 21 (2). P. 105-115.
  • Samowitz W.S., Sweeney C., Herrick J., Albertsen H., Levin T.R., Murtaugh M.A., Wolff R.K., Slattery M.L. Poor Survival Associated with the BRAF V600E Mutation in Microsatellite-Stable Colon Cancers//Cancer Res. 2005. Vol. 65 (14). P. 6063-6069.
  • Tsiatis A.C., Norris-Kirby A., Rich R.G., Hafez M.J., Gocke C.D., Eshleman J.R., Murphy K.M. Comparison of Sanger sequencing., pyrosequencing., and melting curve analysis for the detection of KRAS mutations: diagnostic and clinical implications//J. Mol. Diagn. 2010. Vol. 12 (4). P. 425-432 DOI: 10.2353/jmoldx.2010.090188
  • van Krieken J.H., Jung A., Kirchner T., Carneiro F., Seruca R., Bosman F.T., Quirke P., Fléjou J.F., Plato Hansen T., de Hertogh G., Jares P., Langner C., Hoefler G., Ligtenberg M., Tiniakos D., Tejpar S., Bevilacqua G., Ensari A. KRAS mutation testing for predicting response to anti-EGFR therapy for colorectal carcinoma: proposal for an European quality assurance program//VirchowsArch. 2008. Vol. 453 (5). P. 417-431 DOI: 10.1007/s00428-008-0665-y
  • Wang D., Liang W., Duan X., Liu L., Shen H., Peng Y., Li B. Detection of KRAS gene mutations in colorectal carcinoma: a study of 6 364 patients//Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi. 2014. Vol. 43 (9). P. 583-587.
  • Yanus G.A., Belyaeva A.V., Ivantsov A.O., Kuligina E.Sh., Suspitsin E.N., Mitiushkina N.V., Aleksakhina S.N., Iyevleva A.G., Zaitseva O.A., Yatsuk O.S., Gorodnova T.V., Strelkova T.N., Efremova S.A., Lepenchuk A.Y., Ochir-Garyaev A.N., Paneyah M.B., Matsko D.E., Togo A.V., Imyanitov E.N. Pattern of clinically relevant mutations in consecutive series of Russian colorectal cancer patients//Med. Oncol. 2013. Vol. 30 (3). P. 686 DOI: 10.1007/s12032-013-0686-5
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp