Анализ связи полиморфизма -31G/С (RS9904341) в гене BIRC5 с риском возникновения рака мочевого пузыря

Автор: Башмакова Е.Е., Панамарев Н.С., Кудрявцев А.Н., Черняев Д.В., Слепов Е.В., Зуков Р.А., Франк Л.А.

Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj

Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 4 т.21, 2022 года.

Бесплатный доступ

Цель исследования - изучить связь полиморфизма - 31G/С (rs9904341) в промоторной области гена белка сурвивина BIRC5 с риском возникновения рака мочевого пузыря (РМП) у пациентов Красноярского края. Материал и методы. Аллельный состав исследуемого гена был определен в группе из 158 пациентов (128 мужчин и 30 женщин) с клинически установленным РМП, средний возраст - 65,6 ± 10,7 года (медиана: 66,5; С25-С75: 59-72), а также в контрольной группе из 117 здоровых доноров (90 мужчин и 27 женщин), средний возраст - 60,2 ± 5,1 года (медиана: 60; С25-С75: 57-63,25). Аллельный состав определяли биолюминесцентным способом, ранее разработанным авторами. В качестве контроля использовали образец с генотипом GC, подтвержденным секвенированием по Сэнгеру (ЦКП Геномика, Новосибирск, Россия). Для сравнения количественных данных использовали U-тест Манна-Уитни. Для сравнения частот вариантов гена среди контрольных образцов и случаев РМП применяли критерий χ2 Пирсона. Исследуемая выборка находилась в равновесии Харди-Вайнберга (p>0,05). Ассоциацию между вариантами rs9904341 и РМП оценивали по отношению шансов (OШ) с 95 % доверительным интервалом (ДИ), с уровнем значимости p function show_abstract() { $('#abstract1').hide(); $('#abstract2').show(); $('#abstract_expand').hide(); }

Еще

Рак мочевого пузыря, ген birc5, однонуклеотидный полиморфизм (snp) rs9904341, сурвивин, биолюминесцентный анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/140295753

IDR: 140295753   |   DOI: 10.21294/1814-4861-2022-21-4-64-71

Список литературы Анализ связи полиморфизма -31G/С (RS9904341) в гене BIRC5 с риском возникновения рака мочевого пузыря

  • Аксель Е.М., Матвеев В.Б. Статистика злокачественных новообразований мочевых и мужских половых органов в России и странах бывшего СССР. Онкоурология. 2019. 15(2): 15-24. [Axel E.M., Matveev V.B. Statistics of malignant tumors of urinary and male urogenital organs in Russia and the countries of the former USSR. Cancer Urology. 2019; 15(2): 15-24. (in Russian)]. doi: 10.17650/1726-9776-2019-152-15-24.
  • Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I., Siegel R.L., Torre L.A., JemalA. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2018; 68(6): 394-424. doi: 10.3322/caac.21492.
  • Черняев Д.В., Слепов Е.В., Мазаев А.В., Сафонцев И.П., Зуков Р.А. Интегративные модели оценки риска развития рецидива немышечно-инвазивного рака мочевого пузыря. Эффективная фармакотерапия. 2021. 17(2): 38-42. [Chernyaev D.V., Slepov Ye.V., Mazayev A.V., Safontsev I.P., Zukov R.A. Assessing the recurrence risk of non-muscle-invasive bladder cancer by integrative models. Effective Pharmacotherapy. 2021; 17(2): 38-42. (in Russian)]. doi: 10.33978/23073586-2021-17-2-38-42.
  • JaiswalP.K., GoelA., MittalR.D. Survivin: A molecular biomarker in cancer. Indian J Med Res. 2015; 141(4): 389-97. doi: 10.4103/09715916.159250.
  • Martínez-García D., Manero-Rupérez N., Quesada R., Korrodi-Gregório L., Soto-Cerrato V. Therapeutic strategies involving survivin inhibition in cancer. Med Res Rev. 2019; 39(3): 887-909. doi: 10.1002/ med.21547.
  • Слепов Е.В., Башмакова Е.Е., Панамарев Н.С., Франк Л.А., Зуков Р.А. Белок сурвивин как перспективный маркер диагностики и лечения злокачественных новообразований. Эффективная фармакотерапия. 2021. 17(2): 58-63. [Slepov Ye.V., Bashmakova Ye.Ye., PanamarevN.S., FrankL.A., ZukovR.A. The survivin protein as novel anticancer diagnosis and treatment marker. Effective Pharmacotherapy. 2021; 17(2): 58-63. (in Russian)]. doi 10.33978/2307-3586-2021-17-2-58-63.
  • Xu Y., Fang F., Ludewig G., Iones G., Jones D. A mutation found in the promoter region of the human survivin gene is correlated to overexpression of survivin in cancer cells. DNA Cell Biol. 2004; 23(9): 527-37. doi: 10.1089/dna.2004.23.527.
  • Moazeni-Roodi A., Ghavami S., Hashemi M. Survivin rs9904341 polymorphism significantly increased the risk of cancer: evidence from an updated meta-analysis of case-control studies. Int J Clin Oncol. 2019; 24(4): 335-49. doi: 10.1007/s10147-019-01408-y.
  • Mazoochi T., Karimian M., Ehteram H., Karimian A. Survivin c.-31G>C (rs9904341) gene transversion and urinary system cancers risk: a systematic review and a meta-analysis. Per Med. 2019; 16(1): 67-78. doi: 10.2217/pme-2018-0053.
  • Lin Y.C., Hour T.C., Tsai Y.C., Huang S.P., Wu W.J., Chen C.H., Pu Y.S., Chung S.D., Huang C.Y. Preliminary evidence of polymorphisms of cell cycle regulatory genes and their roles in urinary tract urothelial cancer susceptibility and prognosis in a Taiwan population. Urol Oncol. 2017; 35(9). doi: 10.1016/j.urolonc.2016.08.001.
  • BogdanovicL., LazicM., Bogdanovic J., Soldatovic I., NikolicN., RadunovicM., Radojevic-Skodric S., Milasin J., Basta-Jovanovic G. Polymorphisms of survivin-31 G/C gene are associated with risk of urothelial carcinoma in Serbian population. J BUON. 2017; 22(1): 270-7.
  • Kawata N., Tsuchiya N., Horikawa Y., Inoue T., Tsuruta H., Maita S., Satoh S., Mitobe Y., Narita S., Habuchi T. Two survivin polymorphisms are cooperatively associated with bladder cancer susceptibility. Int J Cancer. 2011; 129(8): 1872-80. doi: 10.1002/ijc.25850.
  • Jaiswal P.K., Goel A., Mandhani A., Mittal R.D. Functional polymorphisms in promoter survivin gene and its association with susceptibility to bladder cancer in North Indian cohort. Mol Biol Rep. 2012; 39(5): 5615-21. doi: 10.1007/s11033-011-1366-1.
  • Huang Z.M., Chiang Y.T., Tung M.C., Wu C.C., Chen K.C., Huang M.T., Wang Y.H., Shen C.H. Survivin promoter rs9904341 polymorphism is associated with tumor stage and grade in patients with bladder cancer. Adv Biosci Biotechnol. 2013; 4(1): 1-5. doi: 10.4236/ abb.2013.41001.
  • Krasitskaya V.V., Kudryavtsev A.N., Shimomura O., Frank L.A. Obelin mutants as reporters in bioluminescent dual analyte binding assay. Anal Methods. 2013; 5(3): 636-40. doi: 10.1039/C2AY25976A.
  • Башмакова Е.Е., Кудрявцев А.Н., Франк Л.А. Разработка способа получения функционально активного рекомбинантного стрептавидина в клетках Escherichia coli. Журнал Сибирского федерального университета. Биология. 2020. 13(2): 218-29. [Bashmakova E.E., Kudryavtsev A.N., Frank L.A. Development of the method to produce functionally active recombinant streptavidin in Escherichia coli cells. J Sib Fed Univ. Biol. 2020; 13(2): 218-29. (in Russian)]. doi: 10.17516/1997-1389-0324.
  • Bashmakova E.E., Krasitskaya V.V., Bondar A.A., Eremina E.N., Slepov E.V., Zukov R.A., Frank L.A. Bioluminescent SNP genotyping technique: Development and application for detection of melanocortin 1 receptor gene polymorphisms. Talanta. 2018; 189: 111-5. doi: 10.1016/j. talanta.2018.06.057.
  • Bashmakova E.E., Krasitskaya V.V., Frank L.A. Simultaneous genotyping of four single nucleotide polymorphisms associated with risk factors of hemostasis disorders. Comb Chem High Throughput Screen. 2015; 18(10): 930-6. doi: 10.2174/1386207318666150917100134.
  • БашмаковаЕ.Е., КрасицкаяВ.В., Юшкова А.Д., Добрецов К.Г., Франк Л.А. К вопросу о генетической предрасположенности к развитию хронической нейросенсорной тугоухости. Вестник оториноларингологии. 2021; 86(1): 15-9. [Bashmakova E.E., Krasitskaya V.V., Yushkova A.D., Dobrecov K.G., Frank L.A. To the question of genetic predisposition to the development of professional sensorineural hearing loss. Bulletin of Otorhinolaryngology. 2021; 86(1): 15-9. (in Russian)]. doi: 10.17116/otorino20218601115.
  • SrivastavaK., SrivastavaA., MittalB. Survivin promoter -31G/C (rs9904341) polymorphism and cancer susceptibility: a meta-analysis. Mol Biol Rep. 2012; 39(2): 1509-16. doi: 10.1007/s11033-011-0889-9.
  • Andric M., Nikolic N., Boskovic M., Milicic B., Skodric S., Basta Jovanovic G., Milasin J. Survivin gene promoter polymorphism -31G/C as a risk factor for keratocystic odontogenic tumor development. Eur J Oral Sci. 2012; 120: 9-13. doi: 10.1111/j.1600-0722.2011.00919.x.
  • AntonacopoulouA.G., FloratouK., Bravou V., Kottorou A., Dimi-trakopoulos F.I., Marousi S., Stavropoulos M., Koutras A.K., Scopa C.D., Kalofonos H.P. The survivin-31 snp in human colorectal cancer correlates with survivin splice variant expression and improved overall survival. Anal Cell Pathol (Amst). 2010; 33(5): 177-89. doi: 10.3233/ACP-CL0-2010-0537. Erratum in: Cell Oncol (Dordr). 2011; 34(4): 407-8.
  • Krieg A., Mahotka C., Krieg T., Grabsch H., Müller W., Takeno S., Suschek C.V., Heydthausen M., Gabbert H.E., Gerharz C.D. Expression of different survivin variants in gastric carcinomas: first clues to a role of survivin-2B in tumour progression. Br J Cancer. 2002; 86(5): 737-43. doi: 10.1038/sj.bjc.6600153.
  • CaldasH., HonseyL.E., AlturaR.A. Survivin 2a: a novel survivin splice variant expressed in human malignancies. Mol Cancer. 2005; 4. 11. doi: 10.1186/1476-4598-4-11.
  • Pavlidou A., Kroupis C., DimasK. Association of survivin splice variants with prognosis and treatment of breast cancer. World J Clin Oncol. 2014; 5(5): 883-94. doi: 10.5306/wjco.v5.i5.883.
  • Jang J.S., Kim KM, Kang K.H., Choi J.E., Lee W.K., Kim C.H., Kang Y.M., Kam S., Kim I.S., Jun J.E., Jung T.H., Park J.Y. Polymorphisms in the survivin gene and the risk of lung cancer. Lung Cancer. 2008; 60(1): 31-9. doi: 10.1016/j.lungcan.2007.09.008.
  • Suga K., Yamamoto T., Yamada Y., Miyatake S., Nakagawa T., Tanigawa N. Correlation between transcriptional expression of survivin isoforms and clinicopathological findings in human colorectal carcinomas. Oncol Rep. 2005; 13(5): 891-7.
  • Koike H., Sekine Y., Kamiya M., Nakazato H., Suzuki K. Gene expression of survivin and its spliced isoforms associated with proliferation and aggressive phenotypes of prostate cancer. Urology. 2008; 72(6): 1229-33. doi: 10.1016/j.urology.2007.12.064.
  • Zhang M., Yang J., Li F. Transcriptional and post-transcriptional controls of survivin in cancer cells: novel approaches for cancer treatment. J Exp Clin Cancer Res. 2006; 25(3): 391-402.
Еще
Статья научная