Анализ связи уровня метилирования генов MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий

Автор: Королева Юлия Александровна, Зарубин Алексей Андреевич, Марков Антон Владимирович, Казанцев Антон Николаевич, Барбараш Ольга Леонидовна, Назаренко Мария Сергеевна

Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk

Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 2 т.33, 2018 года.

Бесплатный доступ

Осложнения атеросклероза остаются ведущей причиной заболеваемости и смертности в мире. Во все процессы патогенеза вовлечены микро-РНК - короткие регуляторные молекулы, экспрессия которых регулируется метилированием ДНК. Известно, что метилирование и/или экспрессия генов MIR10B и MIR21 варьируют в клетках пораженных атеросклерозом тканях артерий, но данные об изменении уровня метилирования этих генов в лейкоцитах крови и его связи с факторами риска атеросклероза отсутствуют. Цель работы: оценить связь уровня метилирования в генах MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови с факторами риска и патогенетически значимыми признаками атеросклероза сонных артерий. Материал и методы. ДНК для исследования выделена из лейкоцитов крови 122 больных клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий, а также лейкоцитов крови 135 индивидов контрольной группы. Уровень метилирования ДНК проанализирован методом бисульфитного пиросеквенирования. Результаты и обсуждение. В лейкоцитах больных атеросклерозом уровень метилирования генов MIR10B и MIR21 выше, чем в лейкоцитах контрольной группы. У пациентов с атеросклерозом сонных артерий в лейкоцитах выявлена связь уровня метилирования промотора гена MIR21 с сахарным диабетом 2-го типа и уровнем холестерола в сыворотке, а кодирующего региона гена MIR10B - с курением. Выводы. Уровень метилирования ДНК в области генов MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови ассоциирован с риском развития клинически выраженного атеросклероза сонных артерий.

Еще

Атеросклероз, метилирование днк, микрорнк

Короткий адрес: https://sciup.org/149125219

IDR: 149125219   |   DOI: 10.29001/2073-8552-2018-33-2-77-82

Список литературы Анализ связи уровня метилирования генов MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий

  • Madrigal-Matute J., Rotllan N., Aranda J. F., Fernandez-Hernando C. MicroRNAs and atherosclerosis. Curr. Atheroscler. Rep. 2013; 15(5): 322-335. DOI: 10.1007/s11883-013-0322-z
  • Kumar S., Kim C. W., Simmons R. D., Jo H. Role of flow-sensitive microRNAs in endothelial dysfunction and atherosclerosis: mechanosensitive athero-miRs. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2014; 34: 2206-2216. DOI: 10.1161/ATVBAHA.114.303425
  • Andreou I., Sun X., Stone P. H., Edelman E. R., Feinberg M. W. miRNAs in atherosclerotic plaque initiation, progression, and rupture. Trends Mol. Med. 2015; 21: 307-318. 10.1016/j. molmed.2015.02.003. DOI: 10.1016/j.molmed.2015.02.003
  • Volny O., Kasickova L., Coufalova D., Cimflova P., Novak J. MicroRNAs in Cerebrovascular Disease. Adv. Exp. Med. Biol. 2015; 888: 155-195. DOI: 10.1007/978-3-319-22671-2_9
  • Feinberg M. W., Moore K. J. MicroRNA Regulation of Atherosclerosis. Circ. Res. 2016; 118(4): 703-720. 10.1161/CIRCRESAHA. 115.306300. DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.115.306300
  • Santovito D., Egea V., Weber C. Small but smart: MicroRNAs orchestrate atherosclerosis development and progression. Biochim. Biophys. Acta. 2016; 1861(12 Pt B): 2075-2086.
  • DOI: 10.1016/j.bbalip.2015.12.013
  • Fang Z., Du R., Edwards A., Flemington E. K., Zhang K. The sequence structures of human microRNA molecules and their implications. PLoS One. 2013; 8(1): e54215. 10.1371/journal. pone.0054215.
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0054215
  • Piletic K., Kunej T. MicroRNA epigenetic signatures in human disease. Arch. Toxicol. 2016; 90(10): 2405-2419.
  • DOI: 10.1007/s00204-016-1815-7
  • Friedman R. C., Farh K. K.-H., Burge C. B., Bartel D. P. Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs. Genome Res. 2009; 19: 92-105.
  • DOI: 10.1101/gr.082701.108
  • Логинов В. И., Рыков С. В., Фридман М. В., Брага Э. А. Метилирование генов микроРНК и онкогенез. Биохимия. 2015; 80(2): 184-203.
  • Kurozumi S., Yamaguchi Y., Kurosumi M., Ohira M., Matsumoto H., Horiguchi J. Recent trends in microRNA research into breast cancer with particular focus on the associations between microRNAs and intrinsic subtypes. J. Hum. Genet. 2017; 62(1): 15-24.
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.89
  • Nazarenko M. S., Markov, Lebedev I. N., Freidin M. B., Sleptcov A. A., Koroleva I. A., Frolov A. V., Popov V. A., Barbarash O. L. Puzyrev, V. P. A comparison of genome-wide DNA methylation patterns between different vascular tissues from patients with coronary heart disease. PLoS One; 2015, 10(4): e0122601.
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0122601
  • Chhabra R. MiRNA and methylation: a multifaceted liaison. Chembiochem. 2015; 16(2): 195-203.
  • DOI: 10.1002/cbic.201402449
  • Kim K., Lee H. C., Park J. L., Kim M., Kim S. Y., Noh S. M., Song K.-S., Kim J. C., Kim Y. S. Epigenetic regulation of microRNA-10b and targeting of oncogenic MAPRE1 in gastric cancer. Epigenetics. 2011; 6(6): 740-751.
  • DOI: 10.4161/epi.6.6.15874
  • Adams A. T., Kennedy N. A., Hansen R., Ventham N. T., O'Leary K. R., Drummond H. E., Noble C. L., El-Omar E., Russell R. K., Wilson D. C., Nimmo E. R., Satsangi J. Two-stage genomewide methylation profiling in childhood-onset Crohn's Disease implicates epigenetic alterations at the VMP1/MIR21 and HLA loci. Inflamm. Bowel Dis. 2014; 20(10): 1784-1793.
  • DOI: 10.1097/MIB.0000000000000179
  • Baer C., Claus R., Plass C. Genome-wide epigenetic regulation of miRNAs in cancer. Cancer Res. 2013; 73(2): 473-477.
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-12-3731
  • Cipollone F., Felicioni L., Sarzani R., Ucchino S., Spigonardo F., Mandolini C., Malatesta S., Bucci M., Mammarella C., Santovito D., de Lutiis F., Marchetti A., Mezzetti A., Buttitta F. A unique microRNA signature associated with plaque instability in humans. Stroke. 2011; 42(9): 2556-2563.
  • DOI: 10.1161/STROKEAHA.110.597575
  • Fan X., Wang E., Wang X., Cong X., Chen X. MicroRNA-21 is a unique signature associated with coronary plaque instability in humans by regulating matrix metalloproteinase-9 via reversion-inducing cysteine-rich protein with Kazal motifs. Exp. Mol. Pathol. 2014; 96(2): 242-249. 10.1016/j.yexmp. 2014.02.009.
  • DOI: 10.1016/j.yexmp.2014.02.009
  • Raitoharju E., Lyytikainen L. P., Levula M., Oksala N., Mennander A., Tarkka M., Klopp N., Illig T., Kahonen M., Karhunen P. J., Laaksonen R., Lehtimaki T. MiR-21, miR-210, miR34a, and miR-146a/b are up-regulated in human atherosclerotic plaques in the Tampere Vascular Study. Atherosclerosis. 2011; 219(1): 211-217.
  • DOI: 10.1016/j.atherosclerosis.2011.07.020
  • Марков А. В., Назаренко М. С., Королёва Ю. А., Лебедев И. Н., Слепцов А. А., Фролов А. В., Попов В. А., Барбараш О. Л., Барбараш Л. С., Пузырев В. П. Уровень метилирования промоторного региона гена HOXD4 у больных атеросклерозом. Медицинская генетика. 2014; 13(1): 39-42.
Еще
Статья научная