Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
Автор: Габидуллин Р.А., Иванова О.А., Никитина И.Л., Алехин Е.К.
Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk
Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования
Статья в выпуске: 1 т.24, 2009 года.
Бесплатный доступ
Для автоматизации обработки данных, полученных в тесте подвешивания за хвост, была разработана компьютерная программа AutoTST, которая выполняет распознавание движения в видео файле и последующий подсчет общей продолжительности периодов иммобилизации животного.
Психофармакология, поведенческие тесты, тест подвешивания за хвост, программа для эвм
Короткий адрес: https://sciup.org/14919003
IDR: 14919003
Текст научной статьи Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
АВТОМАТИЗАЦИЯ ПОВЕДЕНЧЕСКИХ ЭКСПЕРИМЕНТОВ С ПОМОЩЬЮ КОМПЬЮТЕРНОЙ ПРОГРАММЫ
«AUTOTST»
Башкирский государственный медицинский университет, г. Уфа
Изучение высшей нервной деятельности в эксперименте предполагает применение тестов, основанных на наблюдении за поведением животных в специально создаваемых условиях [1]. Тесты принудительного плавания [2] и подвешивания за хвост (TST) [3], используемые для выявления антидепрессивно-го действия препаратов, не требуют сложного оборудования и могут быть выполнены в любой лаборатории. Однако одним из серьезных недостатков этих методик является трудоемкость обработки полученных данных, что затрудняет проведение больших по объему исследований. Поэтому целью данной работы явилась оптимизация методов регистрации и обработки результатов поведенческих тестов.
Условно процесс преобразования визуально полученной информации в данные цифрового формата можно разделить на четыре этапа: 1-й – видеозапись хода эксперимента, 2-й – описание по заданным параметрам поведения животных, 3-й – анализ описанного поведения и 4-й – статистическая обработка результатов эксперимента. Для автоматизации процесса обработки данных нами ранее была создана компьютерная программа «BrainTest» (свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2008610170) [4], которая позволяла облегчить работу экспериментатора на 2-м и 3-м этапах работы, но не могла заменить человека в процессе определения типов поведения животного. Помимо больших затрат времени на обработку данных поведенческих тестов, дифференцировка типов поведения, проводимая человеком, может привести к ошибочным результатам вследствие ее субъективности.
Однако в тесте подвешивания за хвост довольно просто реализовать автоматизацию этого этапа обработки данных, поскольку требуется определить лишь 2 типа поведения: иммобилизацию и активность. Поэтому была создана программа «AutoTST» для автоматического распознавания движения в видеофайле и последующего подсчета общей продолжительности периодов иммобилизации животного.
Программа разработана с применением пакета MATLAB 7 и его приложения Simulink. Для иллюстрации работы с программой приведены результаты оценки антидепрессивной активности новых производных триазолов, проводимой в нашей лаборатории. Эксперимент проводился на белых неинбред-ных мышах самцах. Исследуемые соединения животные получали в дозах 2 мг/кг и 20 мг/кг внутрибрюшинно. Через 30 мин после инъекции проводился тест подвешивания за хвост. Мышь подвешвалась за хвост при помощи лейкопластыря так, чтобы голова ее находилась в 10 см от пола. Длительность опыта составила 6 мин. Для сравнения использованы данные теста подвешивания за хвост, полученные при помощи программы «BrainTest». Поскольку в данном случае различия между группами не имеют значения, приведены только совокупные данные эксперимента, в которые входят все животные, включенные в эксперимент: как контрольные, так и опытные.
Как видно из табл. 1, результаты, полученные с помощью двух программ, статистически не отличаются друг от друга.
Примером работы программы может послужить исследование вариабельности показателей в TST в
Сравнение результатов обработки данных программами BrainTest и AutoTST, полученных в TST
зависимости от пола. Для сравнения были использованы данные, собранные в экспериментах на мышах самцах в течение года, а также результаты тестирования 20 самок.
Как видно из табл. 2, различия между интактными самцами и самками в тесте подвешивания за хвост статистически значимы.
Половые различия длительности иммобилизации мышей в TST
AUTOMATIZATION OF BEHAVIORALEXPERIMENTS USING COMPUTERPROGRAM «AUTOTST»
R.A. Gibadoullin, O.A. Ivanova, I.L. Nikitina,Ye.K. Alekhin
Таким образом, тестирование программы показало, что данные «AutoTST» и «BrainTest» хорошо согласуются друг с другом. Но в отличие от «BrainTest» программа «AutoTST» позволяет значительно облегчить проведение эксперимента, а также исключить субъективную оценку типов поведения животных, при просмотре видеозаписи человеком, следовательно, она может быть использована в экспериментальной психофармакологии для автоматизации теста подвешивания за хвост.
Список литературы Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
- Cryan J.F. The tail suspension test as a model for assessing antidepressant activity: Review of pharmacological and genetic studies in mice./J.F. Cryan, C. Mombereau A. Vassout.//Neuroscience & Biobehavioral Reviews. -2005. -Vol. 29. -№ 4-5. -P. 571-625.
- Porsolt R.D. Depression: a new animal model sensitive to antidepressant treatments./R.D. Porsolt, M. Le Pichon, M. Jalfre//Nature. -1977. -Vol. 266. -P. 730-732.
- Steru L. The tail suspension test: a new method for screening antidepressants in mice./L. Steru, R. Chermat, B. Thierry et al.//Psychopharmacology (Berl). -1985. -Vol. 85. -№ 3. -P. 367-370.
- Габидуллин Р.А., Ялалетдинова А.Р., Компьютерная программа «BrainTest» -инструмент регистрации результатов поведенческих экспериментов. 71-я итоговая Республиканская научная конференция студентов и молодых ученых с международным участием «Вопросы теоретической и практической медицины»: Материалы конференции. 2006. -С. 278-280.