Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
Автор: Габидуллин Р.А., Иванова О.А., Никитина И.Л., Алехин Е.К.
Журнал: Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины @cardiotomsk
Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования
Статья в выпуске: 1 т.24, 2009 года.
Бесплатный доступ
Для автоматизации обработки данных, полученных в тесте подвешивания за хвост, была разработана компьютерная программа AutoTST, которая выполняет распознавание движения в видео файле и последующий подсчет общей продолжительности периодов иммобилизации животного.
Психофармакология, поведенческие тесты, тест подвешивания за хвост, программа для эвм
Короткий адрес: https://sciup.org/14919003
IDR: 14919003 | УДК: 615.214.32.015:612.084:004.42.9:591.1]-092.9
Automatization of behavioral experiments using computer program "AutoTST"
The computer program ?AutoTST? was created for automatization of data processing received in the tail suspension test. The program recognizes movements in video file and subsequently counts total duration of immobilization periods of an animal.
Текст научной статьи Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
АВТОМАТИЗАЦИЯ ПОВЕДЕНЧЕСКИХ ЭКСПЕРИМЕНТОВ С ПОМОЩЬЮ КОМПЬЮТЕРНОЙ ПРОГРАММЫ
«AUTOTST»
Башкирский государственный медицинский университет, г. Уфа
Изучение высшей нервной деятельности в эксперименте предполагает применение тестов, основанных на наблюдении за поведением животных в специально создаваемых условиях [1]. Тесты принудительного плавания [2] и подвешивания за хвост (TST) [3], используемые для выявления антидепрессивно-го действия препаратов, не требуют сложного оборудования и могут быть выполнены в любой лаборатории. Однако одним из серьезных недостатков этих методик является трудоемкость обработки полученных данных, что затрудняет проведение больших по объему исследований. Поэтому целью данной работы явилась оптимизация методов регистрации и обработки результатов поведенческих тестов.
Условно процесс преобразования визуально полученной информации в данные цифрового формата можно разделить на четыре этапа: 1-й – видеозапись хода эксперимента, 2-й – описание по заданным параметрам поведения животных, 3-й – анализ описанного поведения и 4-й – статистическая обработка результатов эксперимента. Для автоматизации процесса обработки данных нами ранее была создана компьютерная программа «BrainTest» (свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2008610170) [4], которая позволяла облегчить работу экспериментатора на 2-м и 3-м этапах работы, но не могла заменить человека в процессе определения типов поведения животного. Помимо больших затрат времени на обработку данных поведенческих тестов, дифференцировка типов поведения, проводимая человеком, может привести к ошибочным результатам вследствие ее субъективности.
Однако в тесте подвешивания за хвост довольно просто реализовать автоматизацию этого этапа обработки данных, поскольку требуется определить лишь 2 типа поведения: иммобилизацию и активность. Поэтому была создана программа «AutoTST» для автоматического распознавания движения в видеофайле и последующего подсчета общей продолжительности периодов иммобилизации животного.
Программа разработана с применением пакета MATLAB 7 и его приложения Simulink. Для иллюстрации работы с программой приведены результаты оценки антидепрессивной активности новых производных триазолов, проводимой в нашей лаборатории. Эксперимент проводился на белых неинбред-ных мышах самцах. Исследуемые соединения животные получали в дозах 2 мг/кг и 20 мг/кг внутрибрюшинно. Через 30 мин после инъекции проводился тест подвешивания за хвост. Мышь подвешвалась за хвост при помощи лейкопластыря так, чтобы голова ее находилась в 10 см от пола. Длительность опыта составила 6 мин. Для сравнения использованы данные теста подвешивания за хвост, полученные при помощи программы «BrainTest». Поскольку в данном случае различия между группами не имеют значения, приведены только совокупные данные эксперимента, в которые входят все животные, включенные в эксперимент: как контрольные, так и опытные.
Как видно из табл. 1, результаты, полученные с помощью двух программ, статистически не отличаются друг от друга.
Примером работы программы может послужить исследование вариабельности показателей в TST в
Сравнение результатов обработки данных программами BrainTest и AutoTST, полученных в TST
зависимости от пола. Для сравнения были использованы данные, собранные в экспериментах на мышах самцах в течение года, а также результаты тестирования 20 самок.
Как видно из табл. 2, различия между интактными самцами и самками в тесте подвешивания за хвост статистически значимы.
Половые различия длительности иммобилизации мышей в TST
AUTOMATIZATION OF BEHAVIORALEXPERIMENTS USING COMPUTERPROGRAM «AUTOTST»
R.A. Gibadoullin, O.A. Ivanova, I.L. Nikitina,Ye.K. Alekhin
Таким образом, тестирование программы показало, что данные «AutoTST» и «BrainTest» хорошо согласуются друг с другом. Но в отличие от «BrainTest» программа «AutoTST» позволяет значительно облегчить проведение эксперимента, а также исключить субъективную оценку типов поведения животных, при просмотре видеозаписи человеком, следовательно, она может быть использована в экспериментальной психофармакологии для автоматизации теста подвешивания за хвост.
Список литературы Автоматизация поведенческих экспериментов с помощью компьютерной программы «AutoTST»
- Cryan J.F. The tail suspension test as a model for assessing antidepressant activity: Review of pharmacological and genetic studies in mice./J.F. Cryan, C. Mombereau A. Vassout.//Neuroscience & Biobehavioral Reviews. -2005. -Vol. 29. -№ 4-5. -P. 571-625.
- Porsolt R.D. Depression: a new animal model sensitive to antidepressant treatments./R.D. Porsolt, M. Le Pichon, M. Jalfre//Nature. -1977. -Vol. 266. -P. 730-732.
- Steru L. The tail suspension test: a new method for screening antidepressants in mice./L. Steru, R. Chermat, B. Thierry et al.//Psychopharmacology (Berl). -1985. -Vol. 85. -№ 3. -P. 367-370.
- Габидуллин Р.А., Ялалетдинова А.Р., Компьютерная программа «BrainTest» -инструмент регистрации результатов поведенческих экспериментов. 71-я итоговая Республиканская научная конференция студентов и молодых ученых с международным участием «Вопросы теоретической и практической медицины»: Материалы конференции. 2006. -С. 278-280.