Биоинформационный и корреляционный анализы экспрессии генов защитных белков в арабидопсисе при тепловом стрессе
Автор: Перфильева А.И., Рихванов Е.Г.
Журнал: Журнал стресс-физиологии и биохимии @jspb
Статья в выпуске: 3 т.9, 2013 года.
Бесплатный доступ
С использованием базы данных AtGenExpress проводили биоинформационный и корреляционный анализы экспрессии генов белков теплового шока (БТШ) и PR-белков в корнях, стеблях и культуре клеток арабидопсиса. Биоинформационный анализ показал эффект подавления БТШ при синтезе PR-белков в корнях, стеблях и культуре клеток арабидопсиса. С помощью корреляционного анализа выявлена обратная корреляционная зависимость между экспрессией генов БТШ и PR-белков только в культуре клеток, на корнях и стеблях арабидопсиса зависимости не наблюдалось.
Биоинформационный анализ, корреляционный анализ, белки теплового шока, pr-белки, арабидопсис
Короткий адрес: https://sciup.org/14323759
IDR: 14323759
Список литературы Биоинформационный и корреляционный анализы экспрессии генов защитных белков в арабидопсисе при тепловом стрессе
- Боровиков В.П. (2005) Популярное введение в программу STATISTICA. М.: АСТ-Пресс. 280 с.
- Гланц С. (1998) Медико-биологическая статистика. М.: Практика. 495с.
- Ивантер Э.В., Коросов А.В. (2010) Элементарная биометрия: учеб. Пособие. Петрозаводск: Изд-во ПетрГУ.-. -104 с.
- Ивантер Э.В., Коросов А.В. (2011) Введение в количественную биологию: учеб. пособие. Петрозаводск: Изд-во ПетрГУ. 302 с.
- Колупаев Ю.Е. Карпец Ю.В. (2010) Формирование адаптивных реакций растений на действие абиотических стрессоров. Киев: Основа,. 352 с.
- Куканков Г. Фигурин В. (2005) Методы обработки экспериментальных данных. Минск: Основа. 122с.
- Малиновский В.И. (2010) Механизмы устойчивости растений к вирусам. Владивосток: Дальнаука. 324 с.
- Платонов А.Е. (2000) Статистический анализ в медицине и биологии: задачи, терминология, логика, компьютерные методы. М.: Издательство РАМН, 52 с.
- Реброва О.Ю. (2002) Статистический анализ медицинских данных Применение пакета прикладных программ STATISTICA. М., МедиаСфера, 312 с.
- Рокицкий П.Ф. (1973) Биологическая статистика. (Изд. 3-е, испр.) Минск: «Вышэйш. школа», 320 с.
- Третьякова О.М. Евтушенков А.И. (2011) Экспрессия PR-генов при бактериальной инфекции. Труды БГУ, 6(1). 163-167.
- Юнкеров В.И. Григорьев С.Г. (2002) Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований, СПб.: ВМсдА, 266 с.
- Kilian J., D. Whitehead, J. Horak, D. Wanke, S. Weinl, O. Batistic, C. D'Angelo, E. Bornberg-Bauer, J. Kudla, K. Harter (2007) The AtGenExpress global stress expression data set: protocols, evaluation and model data analysis of UV-B light, drought and cold stress responses. Plant J. 50(2). 347-363.
- Maimbo M., K. Ohnishi, Y. Hikichi, H. Yoshioka, A. Kiba (2007) Induction of a small heat shock protein and its functional roles in Nicotiana plants in the defense response against Ralstonia solanacearum. Plant Physiol. 145(4). 1588-1599.
- Wang W., B. Vinocur, O. Shoseyov, A. Altman (2004) Role of plant heat-shock proteins and molecular chaperones in the abiotic stress response. Trends Plant Sci. 9(5). 244-252.
