Capabilities of structure modeling for azaheterocycles and the comparison to FTIR spectroscopy data
Автор: Grishina M.A., Potemkin V.A.
Журнал: Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия: Химия @vestnik-susu-chemistry
Рубрика: Физическая химия
Статья в выпуске: 1 т.10, 2018 года.
Бесплатный доступ
The capabilities of algorithms Globa-AlteQ, MultiGen-AlteQ, MOPS-AlteQ for modeling the structures of both individual molecules and their complexes in liquids, solutions and crystals have been considered. The calculated and experimental IR spectra have been compared. It has been shown that the frequencies in the calculated and experimental spectra are consistent with the correlation coefficients of not less than 0.99, which indicates good possibilities of the methods in modeling both individual molecules and their complexes in liquids, solutions and crystals. Moreover, the proposed methods can be successfully used to further confirm the structure. This is especially important for liquids and solutions where direct structure determination by X-ray diffraction methods is impossible.
Molecular modeling, azaheterocycles, ir spectroscopy, molecular complexes
Короткий адрес: https://sciup.org/147160415
IDR: 147160415 | DOI: 10.14529/chem180103
Список литературы Capabilities of structure modeling for azaheterocycles and the comparison to FTIR spectroscopy data
- Барташевич Е.В., Гришина М.А., Потемкин В.А., Белик А.В. Метод мультиконформационного моделирования пространственной формы молекулы. Журн. структ. химии, 2002, Т. 43, № 6, С. 1120-1127 DOI: 10.1023/A:1023611131068
- Гришина М.А., Барташевич Е.В., Потемкин В.А., Белик А.В. Генетический алгоритм для прогноза строения и свойств молекулярных агломератов в органических веществах. Журн. структ. химии., 2002, Т. 43, № 6, С. 1128-1133 DOI: 10.1023/A:1023663115138
- Потемкин В.А., Арсламбеков Р.М., Барташевич Е.В., Гришина М.А., Белик А.В., Перспикаче С., Гуччионе С. Мультиконформационный метод анализа биологической активности молекулярных структур. Журн. структ. химии, 2002, Т. 43, № 6, С. 1134-1138 DOI: 10.1023/A:1023615231976
- Potemkin V.A., Grishina M.A. A New Paradigm for Pattern Recognition of Drugs. J. Comput. Aided Mol. Des, 2008, V. 22, pp. 489-505 DOI: 10.1007/s10822-008-9203-x
- Grishina M., Bolshakov O., Potemkin A., Potemkin V. Theoretical Investigation of Electron Structure and Surface Morphology of Titanium Dioxide Anatase Nano-particles. Comp. Theor. Chem, 2016, V. 1091, pp. 122-136 DOI: 10.1016/j.comptc.2016.07.003
- Chemosophia s.r.o. (2017). Доступен по адресу http:.www.chemosophia.com (16 сентября, 2017).
- Гришина М.А., Потемкин В.А., Переяславская Е.С, Барташевич Е.В, Русинов В.Л. Моделирование взаимодействия противовирусных препаратов с нейраминидазой гриппа А. Информационно-вычислительные технологии в решении фундаментальных и прикладных задач (Сессия ИВТН-2006). Сборник материалов, М., 2006, С. 13.
- Максаков В.А., Потемкин В.А., Кирин В.П. Теоретическое исследование конформационных состояний трехосмиевых кластеров с аминокислотными лигандами. Журн. структ. химии, 2003, Т. 44, № 5, С. 811-817 DOI: 10.1023/B:JORY.0000029809.88411.8b
- Потемкин В.А., Максаков В.А., Кирин В.П. Теоретическое исследование конформаций трехосмиевых кластеров с хиральным карановым лигандом. Журн. структ. химии, 2004, Т. 45, № 3, С. 430-434 DOI: 10.1007/s10947-005-0006-9
- Потемкин В.А., Максаков В.А., Коренев В.С. Теоретическое исследование конформационных состояний трехосмиевых кластеров с хиральным пинановым лигандом. Журн. структ. химии, 2005, Т. 46, № 1, С. 100-105 DOI: 10.1007/s10947-006-0007-3
- Aladko E.Ya., Ancharov A.I., Goryainov S.V., Kurnosov A.V., Larionov E.G., Likhacheva A.Yu., Manakov A.Yu., Potemkin V.A., Sheromov M.A., Teplykh A.E., Voronin V.I., Zhurko F.V. New Type of Phase Transformation in Gas Hydrate Forming System at High Pressures. Some Experimental and Computational Investigations of Clathrate Hydrates Formed in the SF6-H2O. J. Phys. Chem. B, 2006, vol. 110, no. 42, pp. 21371-21376 DOI: 10.1021/jp061698r
- Гришина М.А., Потемкин В.А., Матерн А.И. Теоретическое исследование реакций окисления акриданов. Журн. структ. химии, 2008, Т. 49, № 1, С. 13-18 DOI: 10.1007/s10947-008-0002-y
- Потемкин В.А., Максаков В.А., Коренев В.С. Теоретическое исследование конформационных состояний трехосмиевых кластеров с хиральным μ-1-NH пинановым лигандом. Журн. структ. химии, 2007, Т. 48, № 2, С. 230-235 DOI: 10.1134/S1070328407080088
- Максаков В.А., Первухина Н.В., Подберезская Н.В., Афонин М.Ю., Потемкин В.А., Кирин В.П. Рентгеноструктурный и конформационный анализ нового трехъядерного кластера осмия Os3(μ,h2-OCC6H5)(η3-C3H5)(CO)9. Журн. структ. химии, 2008, Т. 49, № 5, С. 926-932 DOI: 10.1007/s10947-008-0154-9
- Потемкин В.А., Ившина Н.Н., Максаков В.А. Теоретическое исследование конформационных особенностей трехосмиевых кластеров. Журн. структ. химии, 2009, Т. 50, Приложение, С. S150-S158 DOI: 10.1007/s10947-009-0202-0
- Manakov A.Yu., Likhacheva A.Yu., Potemkin V.A., Ogienko A.G., Kurnosov A.V., Ancharov A.I. Compressibility of Gas Hydrates. ChemPhysChem, 2011, Vol. 12, № 13, pp. 2476-2484 DOI: 10.1002/cphc.201100126
