Домашний кролик Oryctolagus cuniculus var. domestica L. как модель в изучении доместикации и биомедицинских исследованиях (обзор)

Автор: Щукина Е.С., Косовский Г.Ю., Глазко В.И., Кашапова И.С., Глазко Т.Т.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Обзоры, проблемы

Статья в выпуске: 4 т.55, 2020 года.

Бесплатный доступ

Домашний кролик Oryctolagus cuniculus var. domestica L. относится к тем немногим доместицированным видам, у которых дикий предковый вид существует одновременно с одомашненным (M. Carneiro, 2014), что позволяет изучать механизмы, лежащие в основе процессов доместикации. Следует отметить, что понимание генетических основ синдрома доместикации до сих пор остается неполным (M.A. Zeder, 2006-2017). Предполагается, что одомашнивание представляет собой уникальную форму симбиоза между человеком и доместицированными видами, формирующими общую нишу обитания (M.A. Zeder, 2012). Исследования симбиотических партнеров позволяют накапливать информацию о путях адаптации к такой нише, в том числе у человека. В этой связи важность изучения домашнего кролика трудно переоценить хотя бы потому, что на протяжении многих десятилетий он остается одной из основных моделей в биомедицинских экспериментах (K.M. El-Bayomi, 2013). Уникальные физиологические особенности кролика объясняют его широкое использование при выявлении закономерностей развития и течения многих заболеваний человека. В то же время мы не обнаружили работ, систематизирующих современные сведения по фундаментальной биологии этого доместицированного вида в сравнении с его дикой предковой формой. Задача настоящего обзора - суммировать данные о популяционно-генетической структуре (M. Carneiro, 2014; A.D. Stock, 1976), распределении геномных элементов (M. Carneiro, 2011), составе микробиомов (M.S. Gómez-Conde, 2009), морфометрических характеристиках и физиологических особенностях (С.Н. Боголюбский, 1959) домашнего кролика и предкового подвида европейского кролика, в том числе определяющих значение O. cuniculus var. domestica не только как хозяйственно ценного вида, но и как модельного объекта в различных областях биомедицины. Представленный сравнительный анализ позволяет выделить ряд фенотипических характеристик (J.L. Hendrikse, 2007; I. Brusini, 2018; P.S. Ungar, 2010), а также группу молекулярно-генетических маркеров геномной ДНК, дифференцирующих домашнего кролика от предкового вида (M. Sparwel, 2019). Изучение распределения аллелей различных мобильных генетических элементов, микросателлитов, отдельных структурных генов, вовлеченных в процесс доместикации домашнего кролика, может способствовать повышению эффективности управления генетическими ресурсами не только у этого вида, но и у других домашних животных, что необходимо как в медико-биологических исследованиях, так и для решения задач селекционной работы.

Еще

Синдром доместикации, дикий кролик, домашний кролик, днк маркеры, эдогенные ретровирусы, полилокусное генотипирование, микробиота

Короткий адрес: https://sciup.org/142226324

IDR: 142226324   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2020.4.643rus

Список литературы Домашний кролик Oryctolagus cuniculus var. domestica L. как модель в изучении доместикации и биомедицинских исследованиях (обзор)

  • Глазко В.И. Генные и геномные подписи доместикации. Сельскохозяйственная биология, 2018, 53(4): 659-672 ( ). DOI: 10.15389/agrobiology.2018.4.659rus
  • Zeder M.A., Emshwiller E., Smith B.D., Bradley D.G. Documenting domestication: the intersection of genetics and archaeology. Trends in Genetics, 2006, 22(3): 139-155 ( ). DOI: 10.1016/j.tig.2006.01.007
  • Zeder M.A. The domestication of animals. Journal of Anthropological Research, 2012, 68(2): 161-190 ( ). DOI: 10.3998/jar.0521004.0068.201
  • Zeder M.A. Domestication as a model system for the extended evolutionary synthesis. Interface Focus, 2017, 7(5): 20160133 ( ). DOI: 10.1098/rsfs.2016.0133
  • Lewis S.L., Maslin M.A. Defining the Anthropocene. Nature, 2015, 519(7542): 171-180 ( ). DOI: 10.1038/nature14258
  • El-Bayomi K.M., Awad A., Saleh A.A. Genetic diversity and phylogenetic relationship among some rabbit breeds using random amplified polymorphic DNA markers. Life Science Journal, 2013, 10(1): 1449-1457.
  • Рыбакова А.В., Макарова М.Н., Макаров В.Г. Использование кроликов в доклинических исследованиях. Международный вестник ветеринарии, 2016, 4: 102-106.
  • Сергиенко И.В. История появления статинов. Атеросклероз и дислипидемии, 2011, 1: 57-65.
  • Carneiro M., Afonso S., Geraldes A., Garreau H., Bolet G., Boucher S., Tircazes A., Queney G., Nachman M.W., Ferrand N. The genetic structure of domestic rabbits. Molecular Biology and Evolution, 2011, 28(6): 1801-1816 ( ).
  • DOI: 10.1093/molbev/msr003
  • Максименко О.Г., Дейкин А.В., Ходарович Ю.М., Георгиев П.Г. Использование трансгенных животных в биотехнологии: перспективы и проблемы. Acta Naturae, 2013, 1(16): 33-47.
  • Whitman B.D. Domestic rabbits & their histories: breeds of the world. Overland Park, KS: Leathers Publishing, 2004.
  • Weisbroth S.H. Chapter 14 Neoplastic diseases. In: The biology of the laboratory rabbit /S.H. Weisbroth, R.E. Flatt, A.L. Kraus (eds.). Academic Press, New York, 1974: 332-376.
  • Lindsey J., Fox R. Inherited disease and variations. In: The biology of the laboratory rabbit /P. Manning (ed.), D. Ringler, C. Newcomer (series eds.). Academic Press, San Diego (CA), 1994: 293-319.
  • Lebas F., Coudert P., de Rochambeau H., Thébault R.G. The rabbit: husbandry, health and production. FAO Animal Production and Health Series № 21. FAO, Rome, 1997.
  • Bosze Z., Hiripi L., Carnwath J.W., Niemann H. The transgenic rabbit as model for human diseases and as a source of biologically active recombinant proteins. Transgenic Res., 2003, 12: 541-553 (doi: 10.1023/A:1025816809372).
  • Fan J.L., Watanabe T. Transgenic rabbits as therapeutic protein bioreactors and human disease models. Pharmacology & Therapeutics, 2003, 99(3): 261-282 (
  • DOI: 10.1016/S0163-7258(03)00069-X)
  • Houdebine L.M., Jolivet G., Ripoli P.J. Transgenic rabbits to prepare pharmaceutical proteins. In: Rabbit biotechnology: rabbit genomics, transgenesis, cloning and models /L.M. Houdebine, J. Fan (eds.). Springer, Dordrecht, 2009: 65-75 ( ).
  • DOI: 10.1007/978-90-481-2227-1_8
  • Rogel-Gaillard C., Ferrand N., Hayes H. Rabbit. In: Genome mapping and genomics in domestic animals /N.E. Cockett, C. Kole. Springer, 2009: 165-230.
  • El-Sabrout K., Aggag S., de Souza J.B.F. Jr. Some recent applications of rabbit biotechnology - a review. Animal Biotechnology, 2018, 31(1): 76-80 ( ).
  • DOI: 10.1080/10495398.2018.1539005
  • Gunia M., David I., Hurtaud J., Maupin M., Gilbert H., Garreau H. Genetic parameters for resistance to non-specific diseases and production traits measured in challenging and selection environments; application to a rabbit case. Frontiers in Genetics, 2018, 9: 467 ( ).
  • DOI: 10.3389/fgene.2018.00467
  • Carneiro M., Rubin C., Palma F. et al. Rabbit genome analysis reveals a polygenic basis for phenotypic change during domestication. Science, 2014, 345(6200): 1074-1079 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1253714
  • Fontanesi L., Di Palma F., Flicek P., Smith A.T., Thulin C.G., Alves P.C., Lagomorph Genomics Consortium. LaGomiCs-Lagomorph Genomics Consortium: an international collaborative effort for sequencing the genomes of an entire Mammalian order. Journal of Heredity, 2016, 107(4): 295-308 ( ).
  • DOI: 10.1093/jhered/esw010
  • Linnaeus C. Systema naturae, per regna tria naturae, secundum classes, ordines, genera, species, cum characteribus, differentiis, synonymis, locis. Tomus I. Holmiae, Impensis Direct Laurentii Salvii, 1758 ( ).
  • DOI: 10.5962/bhl.title.542
  • O'Leary M.A., Bloch J.I., Flynn J.J., Gaudin T.J., Giallombardo A., Giannini N.P., Goldberg S.L., Kraatz B.P., Luo Z.X., Meng J., Ni X., Novacek M.J., Perini F.A., Randall Z.S., Rougier G.W., Sargis E.J., Silcox M.T., Simmons N.B., Spaulding M., Velazco P.M., Weksler M., Wible J.R., Cirranello A.L. The placental mammal ancestor and the post-K-Pg radiation of placentals. Science, 2013, 339(6120): 662-667 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1229237
  • Stock A.D. Chromosome banding pattern relationships of hares, rabbits, and pikas (order Lagomorpha). Cytogenetic and Genome Research, 1976, 17(2): 78-88 ( ).
  • DOI: 10.1159/000130692
  • Korstanje R., O'Brien P.C.M., Yang F., Rens W., Bosma A.A., van Lith H.A., Ferguson-Smith M.A. Complete homology maps of the rabbit (Oryctolagus cuniculus) and human by reciprocal chromosome painting. Cytogenetic and Genome Research, 1999, 86(3-4): 317-322 ( ).
  • DOI: 10.1159/000015325
  • Robinson T.J., Yang F., Harrison W.R. Chromosome painting refines the history of genome evolution in hares and rabbits (order Lagomorpha). Cytogenetic and Genome Research, 2002, 96(1-4): 223-227 ( ).
  • DOI: 10.1159/000063034
  • Beklemisheva V.R., Romanenko S.A., Biltueva L.S., Trifonov V.A., Vorobieva N.V., Serdukova N.A., Rubtsova N.V., Brandler O.V., O'Brien P.C., Yang F., Stanyon R., Ferguson-Smith M.A., Graphodatsky A.S. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res., 2011, 19(4): 549-565 ( ).
  • DOI: 10.1007/s10577-011-9210-y
  • Ho S., Larson G. Molecular clocks: when times are a-changin. Trends Genet., 2006, 22(2): 79-83 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.tig.2005.11.006
  • Sana M. Domestication of animals in the Iberian Peninsula. In: The origins and spread of domestic animals in Southwest Asia and Europe /S. Colledge, J. Conolly, K. Dobney, K. Manning, S. Shennan (eds). Left Coast Press, Inc, 2013, 195-221.
  • Quintana J., Ramis D., Bover P. Primera datació d'un mamífer no autòcton (Oryctolagus cuniculus [Linnaeus, 1758]) (Mammalia: Lagomorpha) del jaciment holocènic del Pas d'en Revull (barranc d'Algendar, Ferreries). Revista de Menorca, 2016, 95: 185-200.
  • Clutton-Brock J. A natural history of domesticated mammals. Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1999.
  • Lewis S.T., Short C. A Latin dictionary (importacion). Oxford University Press, 1963.
  • Varronis M.T. Rerum Rusticarum Libri Tres /G. Goetz (ed.). Lipsiae, Teubner, 1929.
  • Nachtsheim H. Vom Wildtier zum Haustier. Berlin: Alfred Metzner, 1936.
  • Méniel P. Callou C. (2003) De la garenne au clapier: etude archeozoologique du Lapin en Europe occidentale. Bulletin de la Société préhistorique française, 2004, 101(2): 371-372.
  • Irving-Pease E.K., Frantz L.A.F., Sykes N., Callou C., Larson G. Rabbits and the specious origins of domestication. Trends in Ecology & Evolution, 2018, 33(3): 149-152 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.tree.2017.12.009
  • Vigne J.-D. The origins of animal domestication and husbandry: a major change in the history of humanity and the biosphere. Comptes Rendus Biologies, 2011, 334(3): 171-181 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.crvi.2010.12.009
  • Price E.O. Behavioral development in animals undergoing domestication. Applied Animal Behaviour Science, 1999, 65(3): 245-271 (
  • DOI: 10.1016/S0168-1591(99)00087-8)
  • Боголюбский С.Н. Происхождение и преобразование домашних животных. М., 1959.
  • Moore W.J. The mammalian skull. Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1981.
  • Sánchez-Villagra M.R., Segura V., Geiger M., Heck L., Veitschegger K., Flores D. On the lack of a universal pattern associated with mammalian domestication: differences in skull growth trajectories across phylogeny. Royal Society Open Science, 2017, 4(10): 170876 ( ).
  • DOI: 10.1098/rsos.170876
  • Wilkins A.S., Wrangham R.W., Fitch W.T. The ‘domestication syndrome' in mammals: a unified explanation based on neural crest cell behavior and genetics. genetics, 2014, 197(3): 795-808 ( ).
  • DOI: 10.1534/genetics.114.165423
  • Hendrikse J.L., Parsons T.E., Hallgrímsson B. Evolvability as the proper focus of evolutionary developmental biology. Evolution & Development, 2007, 9(4): 393-401 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1525-142X.2007.00176.x
  • Wayne R.K. Cranial morphology of domestic and wild canids: the influence of development on morphological change. Evolution, 1986, 40(2): 243-261 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1558-5646.1986.tb00467.x
  • Гиляров М.С. Биологический энциклопедический словарь. М., 1986.
  • Richardson M.K. Vertebrate evolution: the developmental origins of adult variation. BioЕssays, 1999, 21(7): 604-613 ( :73.0.CO;2-U).
  • DOI: 10.1002/(SICI)1521-1878(199907)21
  • Kruska D.C.T. On the evolutionary significance of encephalization in some eutherian mammals: effects of adaptive radiation, domestication, and feralization. Brain, Behavior and Evolution, 2005, 65(2): 73-108 ( ).
  • DOI: 10.1159/000082979
  • Agren T., Engman J., Frick A., Björkstrand J., Larsson E., Furmark T., Fredrikson M. Disruption of reconsolidation erases a fear memory trace in the human amygdala. Science, 2012, 337(6101): 1550-1552 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1223006
  • Davidson R.J., Putnam K.M., Larson C.L. Dysfunction in the neural circuitry of emotion regulation: a possible prelude to violence. Science, 2000, 289(5479): 591-594 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.289.5479.591
  • Brusini I., Carneiro M., Wang C., Rubin C., Ring H., Afonso S., Blanco-Aguiar J.A., Ferrand N., Rafati N., Villafuerte R., Smedby Ö., Damberg P., Hallböök F., Fredrikson M., Andersson L. Changes in brain architecture are consistent with altered fear processing in domestic rabbits. PNAS, 2018, 115(28): 7380-7385 ( ).
  • DOI: 10.1073/pnas.1801024115
  • Ungar P.S. Mammal. Teeth: origin, evolution, and diversity. The Johns Hopkins University Press: Baltimore, 2010.
  • Damuth J., Janis C.M. On the relationship between hypsodonty and feeding ecology in ungulate mammals, and its utility in palaeoecology. Biological Reviews, 2011, 86(3): 733-758 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1469-185x.2011.00176.x
  • Williams S.H., Kay R.F. A comparative test of adaptive explanations for hypsodonty in ungulates and rodents. Journal of Mammalian Evolution, 2001, 8(3): 207-229 (doi: 10.1023/A:1012231829141).
  • Böhmer E. Warum Leiden Hauskaninchen so Häufig an Gebiss-und Verdauungsproblemen? Ein Ratgeber für die Ernährung von Kaninchen. Curoxray, München, 2014.
  • Okuda A., Hori Y., Ichihara N., Asari M., Wiggs R.B. Comparative observation of skeletal-dental abnormalities in wild, domestic, and laboratory rabbits. J. Vet. Dent., 2007, 24(4): 224-229 ( ).
  • DOI: 10.1177/089875640702400403
  • Koenigswald W.V. Diversity of hypsodont teeth in mammalian dentitions - construction and classification. Palaeontographica, Abt. A: Palaeozoology - Stratigraphy, 2011, 294(1-3): 63-94.
  • Evolution of the Rodents: advances in phylogeny, functional morphology and development /P.G. Cox, L. Hautier (eds.). Cambridge University Press, Cambridge, 2015 ( ).
  • DOI: 10.1017/CBO9781107360150
  • Schmidt-Kittler N. Feeding specializations in rodents. Senckenbergiana Lethaea, 2002, 82(1): 141-152 ( ).
  • DOI: 10.1007/BF03043780
  • Ge D., Yao L., Xia L., Zhang Z., Yang Q. Geometric morphometric analysis of skull morphology reveals loss of phylogenetic signal at the generic level in extant lagomorphs (Mammalia: Lagomorpha). Contributions to Zoology, 2015, 84(4): 267-284 ( ).
  • DOI: 10.1163/18759866-08404001
  • Kraatz B.P., Sherratt E., Bumacod N., Wedel M.J. Ecological correlates to cranial morphology in Leporids (Mammalia, Lagomorpha). PeerJ, 2015, 3: e844 ( ).
  • DOI: 10.7717/peerj.844
  • Koenigswald W.V, Anders U., Engels S., Schultz J.A., Ruf I. Tooth morphology in fossil and extant Lagomorpha (Mammalia) reflects different mastication patterns. Journal of Mammalian Evolution, 2010, 17(4): 275-299 ( ).
  • DOI: 10.1007/s10914-010-9140-z
  • Watson P.J., Groning F., Curtis N., Fitton L.C., Herrel A., McCormack S.W., Fagan M.J. Masticatory biomechanics in the rabbit: a multi-body dynamics analysis. J. R. Soc. Interface, 2014, 11(99): 20140564 ( ).
  • DOI: 10.1098/rsif.2014.0564
  • Ardran G.M., Kemp F.H., Ride W.D.L. A radiographic analysis of mastication and swallowing in the domestic rabbit: Oryctolagus cuniculus. Proceedings of the Zoological Society of London, 1958, 130(2): 257-274 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1096-3642.1958.tb00573.x
  • Weijs W.A., Dantuma R. Functional anatomy of the masticatory apparatus in the rabbit (Oryctolagus cuniculus L.). Netherlands Journal of Zoology, 1981, 31(3): 99-147 ( ).
  • DOI: 10.1163/002829680X00212
  • Weijs W.A., Brugman P., Grimbergen C.A. Jaw movements and muscle activity during mastication in growing rabbits. Anat. Rec., 1989, 224(3): 407-416 ( ).
  • DOI: 10.1002/ar.1092240309
  • Ravosa M.J., Scott J.E., McAbee K.R., Veit A.J., Fling A.L. Chewed out: an experimental link between food material properties and repetitive loading of the masticatory apparatus in mammals. PeerJ, 2015, 3: e1345 ( ).
  • DOI: 10.7717/peerj.1345
  • Böhmer E. Dentistry in rabbits and rodents. Wiley Blackwell, Chichester, 2015.
  • Böhmer C., Böhmer E. Shape variation in the craniomandibular system and prevalence of dental problems in domestic rabbits: a case study in evolutionary veterinary science. Vet Sci., 2017, 4(1): 5 ( ).
  • DOI: 10.3390/vetsci4010005
  • Yatsunenko T., Rey F.E., Manary M.J., Trehan I., Dominguez-Bello M.G., Contreras M., Magris M., Hidalgo G., Baldassano R N., Anokhin A.P., Heath A.C., Warner B., Reeder J., Kuczynski J., Caporaso J.G., Lozupone C.A., Lauber C., Clemente J.C., Knights D., Knigh, R., Gordon J.I. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature, 2012, 486(7402): 222-227 ( ).
  • DOI: 10.1038/nature11053
  • Ventura M., Turroni F., Motherway M.O., MacSharry J., van Sinderen D. Host-microbe interactions that facilitate gut colonization by commensal bifidobacteria. Trends Microbiol., 2012, 20(10): 467-476 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.tim.2012.07.002
  • Milani C., Mangifesta M., Mancabelli L., Lugli G.A., James K., Duranti S., Turron, F., Ferrario C., Ossiprandi M.C., van Sinderen D., Ventura M. Unveiling bifidobacterial biogeography across the mammalian branch of the tree of life. ISME J., 2017, 11(12): 2834-2847 ( ).
  • DOI: 10.1038/ismej.2017.138
  • Stott P. Use of space by sympatric European hares (Lepus europaeus) and European rabbits (Oryctolagus cuniculus) in Australia. Mamm Biol., 2003, 68: 317-327 ( ).
  • DOI: 10.1078/1616-5047-00099
  • Wallage-Drees J.M., Deinum B. Quality of the diet selected by wild rabbits (Oryctolagus cuniculus L.) in autumn and winter. Netherlands Journal of Zoology, 1986, 36(4): 438-448 ( ).
  • DOI: 10.1163/002829686X00162
  • Abecia L., Rodríguez-Romeroa N.R., Yañez-Ruizb D., Fondevila M. Biodiversity and fermentative activity of caecal microbial communities in wild and farm rabbits from Spain. Anaerobe, 2012, 18(3): 344-349 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.anaerobe.2012.04.004
  • Gómez-Conde M.S., Pérez de Rozas A., Badiola I., Pérez-Alba L., de Blas C., Carabaño R., García J. Effect of neutral detergent soluble fibre on digestion, intestinal microbiota and performance in twenty-fiveday old weaned rabbits. Livestock Science, 2009, 125(2-3): 192-198 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.livsci.2009.04.010
  • Gidenne T., Jehl N., Lapanouse A., Segura M. Inter-relationship of microbial activity, digestion and gut health in the rabbit: effect of substituting fibre by starch in diets having a high proportion of rapidly fermentable polysaccharides. British Journal of Nutrition, 2004, 92(1): 95-104 ( ).
  • DOI: 10.1079/BJN20041173
  • Pinheiro V., Outor-Monteiro D., Mourão J.L., Cone J.W., Lourenço A.L. Effects of animal type (wild vs. domestic) and diet alfalfa level on intake and digestibility of European adult rabbits (Oryctolagus cuniculus). J. Anim. Physiol. Anim. Nutr., 2018, 102(1): e460-e467 ( ).
  • DOI: 10.1111/jpn.12774
  • Carneiro M., Ferrand N., Nachman M.W. Recombination and speciation: loci near centromeres are more differentiated than loci near telomeres between subspecies of the European rabbit (Oryctolagus cuniculus). Genetics, 2009, 181(2): 593-606 ( ).
  • DOI: 10.1534/genetics.108.096826
  • Geraldes A., Ferrand N., Nachman M.W. Contrasting patterns of introgression at X-linked loci across the hybrid zone between subspecies of the European rabbit (Oryctolagus cuniculus). Genetics, 2006, 173(2): 919-933 ( ).
  • DOI: 10.1534/genetics.105.054106
  • Кузнецов В.М. F-статистики Райта: оценка и интерпретация. Проблемы биологии продуктивных животных, 2014, 4: 80-104.
  • Anderson C.N.K., Ramakrishnan U., Chan Y.L., Hadly E.A. A population genetics model for data from multiple populations and points in time. Bioinformatics, 2004, 21(8): 1733-1734 ( ).
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bti154
  • Oliver F., Christians J.K., Liu X., Rhind S., Verma V., Davison C., Brown S.D., Denny P., Keightley P.D. Regulatory variation at glypican-3 underlies a major growth QTL in mice. PLoS Biology, 2005, 3(5): e135 ( ).
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.0030135
  • Pilia G., Hughes-Benzie R.M., MacKenzie A., Baybayan P., Chen E.Y., Huber R., Neri G., Cao A., Forabosco A., Schlessinger D. Mutations in GPC3, a glypican gene, cause the Simpson-Golabi-Behmel overgrowth syndrome. Nat. Genet., 1996, 12(3): 241-247 ( ).
  • DOI: 10.1038/ng0396-241
  • Brandvain Y., Wright S.I. The limits of natural selection in a nonequilibrium world. Trends Genet., 2016, 32(4): 201-210 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.tig.2016.01.004
  • Geraldes A., Rogel-Gaillard C., Ferrand N. High levels of nucleotide diversity in the European rabbit (Oryctolagus cuniculus) SRY gene. Animal Genetics, 2005, 36(4): 349-351 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1365-2052.2005.01300.x
  • Khaitovich P., Hellmann I., Enard W., Nowick K., Leinweber M., Franz H., Weiss G., Lachmann M., Pääbo S. Parallel patterns of evolution in the genomes and transcriptomes of humans and chimpanzees. Science, 2005, 309(5742): 1850-1854 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1108296
  • Candille S.I., Kaelin C.B., Cattanach B.M., Yu B., Thompson D.A., Nix M.A., Kerns J.A., Schmutz S.M., Millhauser G.L., Barsh G.S. A beta-defensin mutation causes black coat color in domestic dogs. Science, 2007, 318(5855): 1418-1423 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1147880
  • Fang M., Larson G., Soares Ribeiro H., Li N., Andersson L. Contrasting mode of evolution at a coat color locus in wild and domestic pigs. PLoS Genet., 2009, 5(1): e1000341 ( ).
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1000341
  • Ludwig A., Pruvost M., Reissmann M., Benecke N., Brockmann G.A., Castaños P., Cieslak M., Lippold S., Llorente L., Malaspinas A., Slatkin M., Hofreiter M. Coat color variation at the beginning of horse domestication. Science, 2009, 324(5926): 485 ( ).
  • DOI: 10.1126/science.1172750
  • Kerje S., Lind J., Schütz K., Jensen P., Andersson L. Melanocortin 1-receptor (MC1R) mutations are associated with plumage color in chicken. Animal Genetics, 2003, 34(4): 241-248 ( ).
  • DOI: 10.1046/j.1365-2052.2003.00991.x
  • Stern D.L., Orgogozo V. The loci of evolution: how predictable is genetic evolution. evolution, 2008, 62(9): 2155-2177 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1558-5646.2008.00450.x
  • Letko A., Ammann B., Jagannathan V., Henkel J., Leuthard F., Schelling C., Carneiro M., Drögemüller C., Leeb T. A deletion spanning the promoter and first exon of the hair cycle-specific ASIP transcript isoform in black and tan rabbits. Animal Genetics, 2019, 51(1): 137-140 ( ).
  • DOI: 10.1111/age.12881
  • Leung C.L., Green K.J., Liem R.K. Plakins: a family of versatile cytolinker proteins. Trends in Cell Biology, 2002, 12(1): 37-45 (
  • DOI: 10.1016/s0962-8924(01)02180-8)
  • Jacobs D.T., Weigert R., Grode K.D., Donaldson J.G., Cheney R.E. Myosin Vc is a molecular motor that functions in secretory granule trafficking. Molecular Biology of the Cell, 2009, 20(21): 4471-4488 ( ).
  • DOI: 10.1091/mbc.E08-08-0865
  • Wray G.A. The evolutionary significance of cis-regulatory mutations. Nature Reviews Genetics, 2007, 8(3): 206-216 ( ).
  • DOI: 10.1038/nrg2063
  • Lindblad-Toh K., Wade C.M., Mikkelsen T.S. et al. Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog. Nature, 2005, 438: 803-819 ( ).
  • DOI: 10.1038/nature04338
  • Casares-Crespo L., Fernández-Serrano P., Viudes-de-Castro M.P. Proteomic characterization of rabbit (Oryctolagus cuniculus) sperm from two different genotypes. Theriogenology, 2019, 128: 140-148 ( ).
  • DOI: 10.1016/j.theriogenology.2019.01.026
  • Diamond J. Evolution, consequences and future of plant and animal domestication. Nature, 2002, 418: 700-707 ( ).
  • DOI: 10.1038/nature01019
  • Pinheiro A., Woof J.M., Almeida T., Abrantes J., Alves P. C., Gortázar C., Esteves P.J. Leporid immunoglobulin G shows evidence of strong selective pressure on the hinge and CH3 domains. Open Biology, 2014, 4(9): ( ).
  • DOI: 10.1098/rsob.140088
  • Pinheiro A., Almeida T., Esteves P.J. Survey of genetic diversity of IgG in wild and domestic rabbits. International Journal of Immunogenetics, 2015, 42(5): 364-367 ( ).
  • DOI: 10.1111/iji.12222
  • Dubiski S. Immunochemistry and genetics of a "new" allotypic specificity Ae14 of rabbit gamma-G immunoglobulins: recombination in somatic cells. J. Immunol., 1969, 103(1): 120-128.
  • Esteves P.J., Carmo C., Godinho R., van der Loo W. Genetic diversity at the hinge region of the unique immunoglobulin heavy gamma (IGHG) gene in leporids (Oryctolagus, Sylvilagus and Lepus). International Journal of Immunogenetics, 2006, 33(3): 171-177 ( ).
  • DOI: 10.1111/j.1744-313x.2006.00588.x
  • Jern P., Coffin J.M. Effects of retroviruses on host genome function. Annual Review of Genetics, 2008, 42: 709-732 ( ).
  • DOI: 10.1146/annurev.genet.42.110807.091501
  • Sperber G.O., Airola, T., Jern, P., Blomberg, J. Automated recognition of retroviral sequences in genomic data-RetroTector. Nucleic Acids Research, 2007, 35(15): 4964-4976 ( ).
  • DOI: 10.1093/nar/gkm515
  • Rivas-Carrillo S.D., Pettersson M.E., Rubin C., Jern P. Whole-genome comparison of endogenous retrovirus segregation across wild and domestic host species populations. PNAS, 2018, 115(43): 11012-11017 ( ).
  • DOI: 10.1073/pnas.1815056115
  • Sparwel M., Doronina L., Churakov G., Stegemann A., Brosius J., Robinson T.J., Schmitz J. The volcano rabbit in the phylogenetic network of Lagomorphs. Genome Biology and Evolution, 2019, 11(1): 11-16 ( ).
  • DOI: 10.1093/gbe/evy257
  • Rafati N., Blanco-Aguiar J.A., Rubin C J., Sayyab S., Sabatino S.J., Afonso S., Feng C., Alves P.C., Villafuerte R., Ferrand N., Andersson L., Carneiro M. A genomic map of clinal variation across the European rabbit hybrid zone. Mol. Ecol., 2018, 27(6): 1457-1478 ( ).
  • DOI: 10.1111/mec.14494
  • Fulton J.E. Molecular genetics in a modern poultry breeding organization. World's Poultry Science Journal, 2008, 64(2): 171-176 ( ).
  • DOI: 10.1017/S0043933907001778
Еще
Статья обзорная