Фенотипические и генотипические особенности популяций северного оленя ненецкой породы

Фенотипические и генотипические особенности популяций северного оленя ненецкой породы

Автор: Доцев А.В., Романенко Т.М., Харзинова В.Р., Соловьева А.Д., Лайшев К.А., Брем Г., Зиновьева Н.А.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Генетическая структура популяций

Статья в выпуске: 6 т.52, 2017 года.

Бесплатный доступ

Оленеводство - ведущая отрасль животноводства в Ненецком автономном округе (НАО). В настоящее время племенная работа в оленеводстве ведется в основном традиционными методами, которые основаны на оценке фенотипа. Для дальнейшего развития оленеводства и повышения продуктивности необходимо усовершенствовать племенную работу, используя молекулярно-генетические методы. Нашей целью стало изучение экстерьерных и генетических особенностей ненецкой породы оленей в условиях НАО. Были проведены измерения экстерьерных характеристик (высота в холке, глубина груди, ширина груди, обхват груди за лопатками, обхват пясти, косая длина туловища, ширина в седалищных буграх, длина головы, живая масса) в трех хозяйствах: СПК коопхозе «Ерв» (ERV, n = 28), СПК «Индига» (IND, n = 34), СРО «Илебц» (ILB, n = 25). На основании полученных данных вычисляли индексы телосложения: массивность, сбитость, костистость, грудной индекс, растянутость, большеголовость. Для генетической характеристики провели анализ девяти микросателлитных локусов (NVHRT76, RT9, NVHRT24, RT30, RT1, RT6, RT27, NV21, RT7). Статистическая обработка данных выполняли с помощью программного обеспечения R и R пакетов adegenet и diveRsity. По большинству экстерьерных показателей наблюдалось значимое преимущество IND и ILB над ERV: высота в холке соответственно 99,2±0,42; 99,7±0,53 и 97,0±0,46 см (p st - 0,018, DJost - 0,017). Все три популяции характеризовались недостатком гетерозигот (Fis 0, ДИ 95 %). Показатели аллельного разнообразия (Ar) варьировали от 6,17±0,499 (IND) до 6,78±0,494 (ILB). Таким образом, популяции северного оленя, разводимые в НАО, имеют морфологические и генетические различия. При этом популяции, различающиеся генетически, отличаются друг от друга и по морфологическим характеристикам. Экстерьерные показатели в исследованных популяциях находятся в пределах стандарта породы либо превышают их.

Еще

Оленеводство, экстерьер, генетическое разнообразие, микросателлиты

Короткий адрес: https://sciup.org/142214168

IDR: 142214168   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2017.6.1175rus

Список литературы Фенотипические и генотипические особенности популяций северного оленя ненецкой породы

  • Романенко Т.М. Экстерьерная оценка важенок домашних северных оленей в современных условиях Ненецкого АО. Мат. 11-й Всероссийской конференции-школы молодых ученых с международным участием «Современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных БИОТЕХЖ». Дубровицы, 2016: 198-204.
  • Романенко Т.М., Филиппова Г.И. Генетический полиморфизм в популяции домашнего северного оленя Канинско-Тиманской тундры Ненецкого АО. Символ науки, 2015, 11: 45-52.
  • Южаков А.А., Мухачев А.Д. Этническое оленеводство Западной Сибири: ненецкий тип. Красноборск, 2001.
  • Бороздин Э.К., Забродин В.А., Вагин А.С. Северное оленеводство. Л., 1990.
  • Региональный портал НАО «Инфо83». Научно-исследовательские работы по проведению генетического мониторинга северных оленей ненецкой породы. 2014. Режим доступа: https://www.info83.ru/news/obshestvo/37347-nauchno-issledovatelskie-raboti-po-provedeniyu-geneticheskogo-monitoringa-severnih-oleney-neneckoy-porodi. Дата обращения: 15.09.2017.
  • Зиновьева Н.А., Харзинова В.Р., Логвинова Т.И., Гладырь Е.А., Сизарева Е.И., Чинаров Ю.И. Микросателлитные профили как критерии определения чистопородности и оценки степени гетерогенности подборов родительских пар в свиноводстве. Сельскохозяйственная биология, 2011, 6: 47-53.
  • Weber J.L., May P.E. Abundant class of human DNA polymorphisms which can be typed using the polymerase chain reaction. Am. J. Hum. Genet., 1989, 44(3): 388-396.
  • Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucleic Acids Res., 1989, 17: 6463-6471.
  • DeWoody J., Avise J.C. Microsatellite variation in marine, freshwater and anadromous fishes compared with other animals. J. Fish Biol., 2000, 56: 461-473 ( ) DOI: 10.1111/j.1095-8649.2000.tb00748.x
  • Primmer C.R., Ellegren H., Saino N., Mailer A.P. Directional evolution in germline microsatellite mutations. Nat. Genet., 1996, 13: 391-393.
  • Холодова М.В., Баранова А.И., Мизин И.А., Рожнов В.В., Сипко Т.П., Давыдов А.В., Рожков Ю.И., Баранова А.И. Своеобразие генетической структуры новоземельского северного оленя (Rangifer tarandus pearsoni): анализ полиморфизма маркеров ядерной и митохондриальной ДНК. Мат. Mежд. совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». Х съезд Териологического общества при РАН. М., 2016: 445.
  • Баранова А.И., Холодова М.В., Сипко Т.П. Генетическая структура дикого северного оленя (Rangifer tarandus) России на основании полиморфизма микросателлитных локусов. Актуальные вопросы современной зоологии и экологии животных. Мат. Всерос. науч. конф., посвященной 70-летнему юбилею кафедры «Зоология и экология» Пензенского государственного университета и памяти профессора В.П. Денисова (1932-1997). Пенза, 2016: 21.
  • Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Kramarenko A.S, Layshev K.A., Romanenko T.M., Solov’eva A.D., Deniskova T.E., Kostyunina O.V., Brem G., Zinovieva N.A. Study of the allele pool and the degree of genetic Introgression of semi-domesticated and wild populations of reindeer (Rangifer tarandus L., 1758) using microsatellites. Agricultural Biology, 2016, 51(6): 811-823 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2016.6.811eng
  • Южаков А.А., Мухачев А.Д. Этническое оленеводство Западной Сибири: ненецкий тип. Красноборск, 2001.
  • Kharzinova V.R., Gladyr' E.A., Fedorov V.I., Romanenko T.M., Shimit L.D., Layshev K.A., Kalashnikova L.A., Zinovieva N.A. Development of multiplex microsatellite panel to assess the parentage verification in and differentiation degree of reindeer populations (Rangifer tarandus). Agricultural Biology, 2015, 50(6): 756-765 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2015.6.756eng
  • R Core Team. R: a language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. 2012. Режим доступа: http://www.R-project.org. Без даты.
  • Jombart T. adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers. Bioinformatics, 2008, 24: 1403-1405 ( ) DOI: 10.1093/bioinformatics/btn129
  • Wickham H. ggplot2: Elegant graphics for data analysis. Springer-Verlag, NY, 2009.
  • Keenan K., McGinnity P., Cross T.F., Crozier W.W., Prodohl P.A. diveRsity: An R package for the estimation of population genetics parameters and their associated errors. Methods Ecol. Evol., 2013, 4(8): 782-788 ( ) DOI: 10.1111/2041-210X.12067
  • Weir B.S., Cockerham C.C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution, 1984, 38: 1358-1370.
  • Jost L. GST and its relatives do not measure differentiation. Mol. Ecol., 2008, 17: 4015-4026 ( ) DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.03887.x
  • Meirmans P., Hedrick W. Assessing population structure: FST and related measures. Mol. Ecol. Resour., 2010, 11(1): 5-18 ( ) DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02927.x
  • Mager K.H. Population structure and hybridization of Alaskan caribou and reindeer: integrating genetics and local knowledge. Dissertation of the degree doctor of philosophy. Fairbanks, Alaska, 2012.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp