Филогенетический анализ структур ADAMTS-4 и ADAMTS-5

Резюме: ADAMTS-4 и -5 являются аггреканазами, которые участвуют в развитии остеоартроза путем разрушения аггрекана в различных сайтах связывания, из которых наиболее важную роль в патогенезе играет расщепление в связи Glu373-Ala374. Поэтому их изучение является актуальной задачей и по сей день. В настоящий момент уже изучены структурные особенности данных ферментов, однако не достаточно понятно влияние эволюционного развития на их функции и ферментативную активность. В данной работе были проведены исследования insilico. Они заключаются в построении филогенетических деревьев методом максимального правдоподобия в программе MEGA X, установлении изменений в структурах, произошедших в процессе эволюции, и их возможное влияние на ферментативную активность. Помимо этого, был определен организм, наиболее подходящий для экспериментальных исследований. В ходе данного исследования для анализа эволюционных изменений были изучены последовательности организмов из различных семей: Лосось, Цесарка, Лягушка, Питон, Кролик, Леопард, Горилла, Человек. Длины данных последовательностей приблизительно равны, при выравнивании структуры не сильно отличаются. При исследовании построенных по данным последовательностям деревьев было обнаружено, что их структура сильно отличается только в начале, в районе сигнальной поверхности и продомена, в остальной же части изменения незначительны. Также был проведен анализ филогенетических деревьев для определения организма, обладающего наиболее схожей с человеческой структурой и следовательно наиболее подходящего для исследований in vivo. Были исследованы структуры: Бык, Верблюд, Свинья, Осел, Кролик, Крыса, Мышь, а также Человек. Наиболее схожей структурой обладает кролик и следовательно он является более подходящим для экспериментальных исследований.