Филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного из засоленной почвы, в системе рода Brevibacterium
Автор: Ананьина Людмила Николаевна
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Генетика
Статья в выпуске: 4, 2019 года.
Бесплатный доступ
Исследовано филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного ранее из почвы района промышленной соледобычи (г. Березники, Пермский край), в системе рода Brevibacterium на основе анализа нуклеотидных последовательностей ect-генов, кодирующих ферменты биосинтеза осмопротекторного вещества - этоина, и 16S рДНК. Анализ нуклеотидных последовательностей генов ectB и ectC согласовался с результатами анализа 16S рДНК. Однако было выявлено значительное эволюционное расстояние нуклеотидных последовательностей ectC-гена штамма Brevibacterium sp. U1 от филогенетически близкородственного вида B. aurantiacum.
16s рднк, ect-гены, филогения
Короткий адрес: https://sciup.org/147227112
IDR: 147227112 | DOI: 10.17072/1994-9952-2019-4-459-463
Список литературы Филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного из засоленной почвы, в системе рода Brevibacterium
- Ананьина Л.Н., Шестакова Е.А., Плотникова Е.Г. Детекция генов, кодирующих ферменты биосинтеза эктоина, у актинобактерий, выделенных из почвы района разработки Верхнекамского соленосного бассейна // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2018. Вып. 3. С. 264-269.
- Плотникова Е.Г. и др. Характеристика микроорганизмов, выделенных из техногенных почв Прикамья // Экология. 2006. № 4. С. 261-268.
- Anan'ina L.N. et al. Naphthalene-degrading bacteria of the genus Rhodococcus from the Verkhnekamsk salt mining region of Russia // Antonie Van Leeuwenhoek. 2011. Vol. 100. P. 309-316.
- Bernard T. et al. Ectoine accumulation and osmotic regulation in Brevibacterium linens // J. Gen. Microbiol. 1993. Vol. 139. P. 129-136.
- Cai L. et al. Comparative genomics study of polyhydroxyalkanoates (PHA) and ectoine relevant genes from Halomonas sp. TD01 revealed extensive horizontal gene transfer events and co-evolutionary relationships // Microb. Cell Fact. 2011. Vol. 1. P. 88.
- Cogan T. M. et al. Biodiversity of the surface microbial consortia from Limburger, Reblochon, Livarot, Tilsit, and Gubbeen cheeses // Microbiol. Spectr. 2014. Vol. 2.
- DOI: 10.1128/microbiolspec.CM-0010-2012
- Ivanova E.P. et al. Brevibacterium celere sp. nov., isolated from degraded thallus of a brown alga // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. Vol. 54. P. 2107-2111.
- Levesque S. et al. Mobilome of Brevibacterium aurantiacum sheds light on its genetic diversity and its adaptation to smear-ripened cheeses // Front. Microbiol. 2019. Vol. 10. P. 1270.
- Pham N.P. et al. Comparative genomic analysis of Brevibacterium strains: insights into key genetic determinants involved in adaptation to the cheese habitat // BMC Genomics. 2017. Vol. 7. P. 955.
- Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Develop. Ind. Microbiol. 1961. Vol. 2. P. 23-32.
- Widderich N. et al. Biochemical properties of ectoine hydroxylases from extremophiles and their wider taxonomic distribution among microorganisms // PLoS One. 2014. Vol. 8.
- DOI: 10.1371/journal.pone.0093809
- Wilson K. Preparation of genomic DNA from bacteria // Ausubel F.M., Brent R., Kingston R.E., Moore D.D., Seidman J.G., Smith J.A., Struhl K. (eds). Current protocols in molecular biology. 3rd edn. Wiley; New York, 1995.
