Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием

Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием

Автор: Ястребова О.В., Плотникова Е.Г.

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Рубрика: Микробиология

Статья в выпуске: 4, 2020 года.

Бесплатный доступ

Проанализированы данные по систематической принадлежности и распространению бактерий сем. Micrococcaceae, выделенных из экосистем с различной степенью антропогенной нагрузки (г. Пермь, Березники, Соликамск, Оса; Пермский край). Показано филогенетическое разнообразие и широкое распространение представителей семейства Micrococcaceae в различных биотопах района разработок Верхнекамского месторождения солей. Разнообразие видов бактерий семейства Micrococcaceae выявлено в почве и ризосфере растений, произрастающих вблизи солеотвалов. На основании анализа гена 16S рРНК исследуемые штаммы семейства Micrococcaceae были отнесены к семи родам: Arthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia. Исследуемые культивируемые бактерии семейства Micrococcaceae, выделенные из экотопов с экстремальными условиями среды, являются перспективными для дальнейшего их использования в биотехнологических целях.

Еще

Micrococcaceae, идентификация, ген 16S рРНК, засоление, загрязненные экотопы

Короткий адрес: https://sciup.org/147229668

IDR: 147229668   |   DOI: 10.17072/1994-9952-2020-4-321-333

Список литературы Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием

  • Гагарских О.Н., Корсакова Е.С. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter, выделенные из загрязненных почв и отходов соледобывающих предприятий Пермского края // Симбиоз -Россия 2014: материалы VII Всероссийского Конгресса молодых биологов. Екатеринбург, 2014. С. 105-107.
  • Гагарских О.Н., Ястребова О.В. Характеристика галотолерантого штамма-деструктора фталатов Arthrobacter sp. PD13-12 // Симбиоз - 2017: X Всерос. конгресс молодых ученых-биологов: сб. тез. Казань, 2017. C. 75-76.
  • Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы стойких органических загрязнителей - эфиров фталевой кислоты, как основа для создания новых экобиотехнологий // Известия Самарского научного центра РАН. 2013. Т. 15, № 3 (5). С. 1633-1636.
  • Плотникова Е.Г. и др. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter - деструкторы полициклических ароматических углеводородов // Экология. 2011. № 6. С. 459-466.
  • Юдин Д.С., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Характеристика бактерий рода Ko^ria - активных деструкторов фталатов // VI Международная конференция молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов: сб. тез. Новосибирск, 2019. С. 236-239.
  • Ястребова О.В., Юдин Д.С., Плотникова Е.Г. Выделение и характеристика смешанных культур и бактерий-деструкторов фталатов // Утилизация и рециклинг отходов производства и потребления: инновационные подходы и технологии: I Всерос. науч.-практ. конф. Киров, 2019. С. 160-162.
  • Altenburger P. et al. Citricoccus muralis gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a medieval wall painting // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2002. Vol. 52. P. 2095-2100.
  • Bergan T., Kocur M. Stomatococcus mucilagi-nosus gen. nov., sp. nov., ep. rev., a member of the family Micrococcaceae // International journal of systematic bacteriology. 1982. Vol. 32. P. 374-377.
  • Busse H.J. Review of the taxonomy of the genus Arthrobacter, emendation of the genus Arthrobacter sensu-lato, proposal to reclassify selected species of the genus Arthrobacter in the novel genera Glutamicibac-ter gen. nov., Paeniglutamicibacter gen. nov., Pseudoglutamicibacter gen. nov., Paenarthrobacter gen. nov. and Pseudarthrobacter gen. nov., and emended description of Arthrobacter roseus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2016. Vol. 66. P. 9-37.
  • Cao Y.R. et al. Enteractinococcus coprophilus gen. nov., sp. nov., of the family Micrococcaceae, isolated from Panthera tigris amoyensis faeces, and transfer of aniella fodinae Dhanjal et al. 2011 to the genus Enteractinococcus as Enteractinococ-cus fodinae comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2012. Vol. 62. P. 2710-2716.
  • Cohn F. Untersuchungen über Bakterien // Beiträge zur Biologie der Pflanzen.1872. Vol. 1 (Heft II). P. 127-224.
  • Conn H.J., Dimmick I. Soil bacteria similar in morphology to Mycobacterium and Corynebacterium // Journal of Bacteriology. 1947. Vol. 54. P. 291-303.
  • Hamedi J., Mohammadipanah F., Ventosa A. Systematic and biotechnological aspects of halophilic and halotolerant actinomycetes // Extremophiles. 2013. Vol. 17. P. 1-13.
  • Hu J., Yang Q., Wang J.L. Biodegradation of di-n-butyl phthalate in sequencing batch reactor bio-augmented with Micrococcus sp. and the bacterial community analysis // International Journal of Environmental Science and Technology. 2015. Vol. 12. P. 2819-2828.
  • Georg L.K., Brown J.M. Rothia, gen. nov. an anaerobic genus of the family Actinomycetaceae // International journal of systematic bacteriology. 1967. Vol. 17. P. 79-88.
  • Koch C., Schumann P., Stackebrandt E. Reclassification of Micrococcus agilis (Ali-Cohen 1889) to the genus Arthrobacter as Arthrobacter agilis comb. nov., and emendation of the genus Arthro-bacter // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 837-839.
  • Kumar S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecular Biology and Evolution. 2016. Vol. 33. P. 1870-1874.
  • Kushner D. Life in high salt and solute concentrations // Microbial life in extreme environments. 1978. P. 317-368.
  • Li W.J., ZhiX.Y., Euzeby J.P. Proposal of Yaniellace-ae fam. nov., Yaniella gen. nov. and Sinobaca gen. nov. as replacements for the illegitimate pro-karyotic names Yaniaceae //. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2008. Vol. 58. P. 525-527.
  • Pribram E. A contribution to the classification of microorganisms // Journal of Bacteriology. 1929. Vol. 18. P. 361-394.
  • Pukall R. et al. Acaricomes phytoseiuli gen. nov., sp. nov., isolated from the predatory mite Phytosei-ulus persimilis // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2006. Vol. 56. P. 465-469.
  • Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Developments in Industrial Microbiology. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23-32.
  • Sanders J.E., Fryer J.L. Renibacterium salmoninar-um gen. nov., sp. nov., the causative agent of bacterial kidney disease in salmonid fishes // International journal of systematic bacteriology. 1980. Vol. 30. P. 496-502.
  • Stackebrandt E. et al. Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesteren-konia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Derma-coccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 682-692.
  • Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Ac-tinobacteria classis nov. // International journal of systematic bacteriology. 1997. Vol. 47. P. 479-491.
  • Vandera E. et al. Comparative proteomic analysis of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 on phe-nanthrene, phthalate and glucose // Journal of Proteomics. 2015. Vol. 113. P. 73-89.
  • Weisburg W.G. et al. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study // Journal of Bacteriology. 1991. Vol. 173. P. 697-703.
  • Yassin A.F. et al. Auritidibacter ignavus gen. nov., sp. nov., a novel bacterium of the family Micro-coccaceae isolated from ear swab of a man with otitis externa, transfer of the family Yaniellaceae Li et al. 2008 to the family Micrococcaceae and emended description of the suborder Micrococ-cineae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2011. Vol. 61. P. 223-230.
  • Zhang Y.Q. et al. Zhihengliuella halotolerans gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Mi-crococcaceae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2007. Vol. 57. P. 1018-1023.
  • Zhou Y. et al. Proposal of Sinomonas flava gen. nov., sp. nov., and description of Sinomonas atrocyanea comb. nov. to accommodate Arthrobacter atrocy-aneus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2009. Vol. 59. P. 259-263.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp