Генетическая характеристика региональных популяций ненецкой породы северного оленя (Rangifer tarandus)

Генетическая характеристика региональных популяций ненецкой породы северного оленя (Rangifer tarandus)

Автор: Денискова Т.Е., Харзинова В.Р., Доцев А.В., Соловьева А.Д., Романенко Т.М., Южаков А.А., Лайшев К.А., Брем Г., Зиновьева Н.А.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Генетика и селекция

Статья в выпуске: 6 т.53, 2018 года.

Бесплатный доступ

Ненецкая порода - наиболее многочисленная аборигенная порода домашнего северного оленя ( Rangifer tarandus ). Благодаря биологической пластичности представители породы легко приспосабливаются к новым пастбищам. Зона разведения породы охватывает территории от Кольского полуострова на западе до Таймыра на востоке. В настоящей работе впервые представлены данные молекулярно-генетических исследований по STR-маркерам северных оленей ненецкой породы из региональных популяций, зона разведения которых практически полностью охватывает современный ареал породы. Нашей целью была характеристика аллелофонда и изучение биоразнобразия региональных популяций домашних северных оленей ненецкой породы и установление филогенетических связей между ними. Выборка включала 787 образцов ткани, отобранных от домашних северных оленей ( Rangifer tarandus ) ненецкой породы в 2017-2018 годах. Всего обследовали 15 популяций в Ненецком (KAN, ILB, IND, TAB, HRP, PIL, IZH, SEV) и Ямало-Ненецком (BRG2, SEY) автономных округах, Республике Коми (INT), Мурманской (MUR) и Архангельской (ARH) областях, а также в Таймырском муниципальном районе (TUH, DUD)...

Еще

Ненецкая порода, северный олень, str маркеры, генетическое разнообразие

Короткий адрес: https://sciup.org/142220063

IDR: 142220063   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2018.6.1152rus

Список литературы Генетическая характеристика региональных популяций ненецкой породы северного оленя (Rangifer tarandus)

  • Баскин Л.М. Северный олень. Управление поведением и популяциями. Оленеводство. Охота. М., 2009.
  • Евстигнеев Ю.А. Коми: В кн.: Россия: коренные народы и зарубежные диаспоры (краткий этно-исторический справочник). СПб, 2008.
  • Южаков А.А., Мухачев А.Д. Этническое оленеводство Западной Сибири: ненецкий тип. Новосибирск, 2001.
  • Васильев В.И. Проблемы формирования северо-самодийских народностей. М., 1979.
  • Южаков А.А. Северное оленеводство и малочисленные народы Сибири. Биосферное хозяйство: теория и практика, 2017, 2(3): 33-39.
  • Квашнин Ю.Н. Ненецкое оленеводство в XX-начале XXI века. Салехард-Тюмень, 2009.
  • Южаков А.А. Ненецкая аборигенная порода северных оленей. Автореф. докт. дис. Новосибирск, 2004
  • Племенное дело: возрождение. Заполярный вестник, 2015 Режим доступа: http://www.norilsk-zv.ru/articles/plemennoe_delo_vozrozhdenie.html. Без даты.
  • Южаков А.А., Романенко Т.М., Лайшев К.А. Феногеографическая изменчивость северных оленей ненецкой породы. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета, 2017, 2(47): 115-122.
  • McDevitt A.D., Mariani S., Hebblewhite M., DeCesare N.J., Morgantini L., Seip D., Weckworth B.V., Musiani M. Survival in the Rockies of an endangered hybrid swarm from diverged caribou (Rangifer tarandus) lineages. Mol. Ecol., 2009, 18(4): 665-679 ( )
  • DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.04050.x
  • Kushny J., Coffin J., Strobeck C. Genetic survey of caribou populations using microsatellite DNA. Rangifer, 1996, 16(Special Issue No. 9): 351-354 ( )
  • DOI: 10.7557/2.16.4.1277
  • Баранова А.И., Холодова М.В., Сипко Т.П. Генетическая структура дикого северного оленя (Rangifer tarandus) России на основании полиморфизма микросателлитных локусов. Актуальные вопросы современной зоологии и экологии животных. Мат. Всероссийской науч. конф., посвященной 70-летнему юбилею кафедры «Зоология и экология» Пензенского государственного университета и памяти профессора В.П. Денисова (1932-1997). Пенза, 2016: 21.
  • Волкова В.В., Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Добрынина Т.И., Зиновьева Н.А. Характеристика аллелофонда локальных пород крупного рогатого скота России по микросателлитным маркерам. Генетика и разведение животных, 2018, 1: 3-10.
  • Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А. Изучение генетического разнообразия и дифференциации региональных популяций романовских овец по микросателлитным маркерам. Аграрная наука Евро-Северо-Востока, 2018, 3(64): 75-80.
  • Харзинова В.Р., Гладырь Е.А., Федоров В.И., Романенко Т.М., Шимит Л.Д., Лайшев К.А., Калашникова Л.А., Зиновьева Н.А. Разработка мультиплексной панели микросателлитов для оценки достоверности происхождения и степени дифференциации популяций северного оленя Rangifer tarandus. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(6): 756-765 ( )
  • DOI: 10.15389/agrobiology.2015.6.756rus
  • Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics, 2012, 28(19): 2537-2539 ( )
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts460
  • Keenan K., McGinnity P., Cross T.F., Crozier W.W., Prodohl P.A. diveRsity: An R package for the estimation of population genetics parameters and their associated errors. Methods Ecol. Evol., 2013, 4(8): 782-788 ( )
  • DOI: 10.1111/2041-210X.12067
  • R Development Core Team. The R Project for Statistical Computing. 2009. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0. Режим доступа: https://www.r-project.org. Без даты.
  • Nei M. Genetic distance between populations. American Naturalist, 1972, 106: 283-392.
  • Belkhir K., Borsa P., Chikhi L., Raufaste N., Bonhomme F. GENETIX 4.05, population genetics software for Windows TM. Université de Montpellier II, Montpellier, France, 2004.
  • Weir B.S., Cockerham C.C. Estimating F-Statistics for the analysis of population structure. Evolution, 1984, 38(6): 1358-1370.
  • Huson D.H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies. Mol. Biol. Evol., 2006, 23(2): 254-267 ( )
  • DOI: 10.1093/molbev/msj030
  • maps: Draw Geographical Maps. Режим доступа: https://CRAN.R-project.org/package=maps. Без даты.
  • Wickham H. ggplot2: Elegant graphics for data analysis. Springer-Verlag, NY, 2009.
  • McLoughlin P.D., Paetkau D., Duda M., Boutin S. Genetic diversity and relatedness of boreal caribou populations in western Canada. Biol. Conserv., 2004, 118(5): 593-598 ( )
  • DOI: 10.1016/j.biocon.2003.10.008
  • Courtois R., Bernatchez L., Ouellet J.P., Breton L. Significance of caribou (Rangifer tarandus) ecotypes from a molecular genetics viewpoint. Conserv. Genet., 2003, 4: 393-404 ( )
  • DOI: 10.1023/A:1024033500799
  • Colson K.E., Mager K.H., Hundertmark K.J. Reindeer introgression and the population genetics of caribou in southwestern Alaska. J. Hered., 2014, 105(5): 585-596 ( )
  • DOI: 10.1093/jhered/esu030
  • Mager K.H., Colson K.E., Groves P., Hundertmark K.J. Population structure over a broad spatial scale driven by nonanthropogenic factors in a wide-ranging migratory mammal, Alaskan caribou. Mol. Ecol., 2014, 23(24): 6045-6057 ( )
  • DOI: 10.1111/mec.12999
  • Zhai J.-C., Liu W.-S., Yin Y.-J., Xia Y.-L., Li H.-P. Analysis on genetic diversity of reindeer (Rangifer tarandus) in the Greater Khingan Mountains using microsatellite markers. Zool. Stud., 2017, 56: 11 ( )
  • DOI: 10.6620/ZS.2017.56-11
  • Cronin M.A., Macneil M.D., Patton J.C. Mitochondrial DNA and microsatellite DNA variation in domestic reindeer (Rangifer tarandus tarandus) and relationships with wild caribou (Rangifer tarandus granti, Rangifer tarandus groenlandicus, and Rangifer tarandus caribou). J. Hered., 2006, 97(5): 525-530 ( )
  • DOI: 10.1093/jhered/esl012
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp