Генетические факторы риска развития хромоты у свиней: мини-обзор

Вафина А.Р. Бермишева М.А. Гилязова И.Р. Карунас А.С. Хуснутдинова Э.К. Гусев О.А.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Обзоры, проблемы

Статья в выпуске: 4 т.61, 2026 года.

Бесплатный доступ

Хромота представляет собой широко распространенную и экономически значимую проблему современного свиноводства. Она служит одним из ведущих факторов снижения продуктивности и благополучия животных, приводит к ухудшению темпов роста, увеличению затрат на лечение и содержание, а также к преждевременной вынужденной выбраковке свиней из племенного стада. Развитие хромоты имеет многофакторную природу и может быть связано с несбалансированным рационом, нарушениями минерального обмена, травмами скелета, заболеваниями конечностей и суставов, инфекционными процессами, скрытыми метаболическими нарушениями, особенностями содержания и наследственной предрасположенностью (M. Heinonen с соавт., 2024). Наряду с действием внешних факторов, важную роль играет генетический компонент, определяющий особенности развития костной, хрящевой и мышечной тканей, конформацию конечностей, прочность скелета и предрасположенность к остеохондрозу (B. Fan с соавт., 2009). Изучение генетической природы хромоты у свиней осуществляется с применением современных молекулярно-генетических подходов, включающих анализ генов-кандидатов, полногеномные ассоциативные исследования, поиск количественных локусов признаков, геномное и таргетное секвенирование (S.K. Onteru с соавт., 2008; B. Jiang с соавт., 2020; О.В. Костюнина с соавт., 2020). Использование этих методов позволило выявить ряд генетических локусов, ассоциированных с признаками здоровья конечностей, минеральной плотностью костной ткани, строением суставов, конформацией тела и риском развития остеохондроза. В настоящее время накоплен значительный массив данных, полученных на свиньях разных пород, который нуждается в систематизации, критической оценке и адаптации для практических задач племенного свиноводства. Целью настоящего обзора стало обобщение данных литературы о влиянии генетических факторов на развитие хромоты у свиней. В работе систематизированы результаты ассоциативных исследований, посвященных анализу молекулярных маркеров признаков здоровья конечностей, а также представлены оценки коэффициентов наследуемости минеральной плотности костной ткани и остеохондроза у свиней разных пород (N. Rangkasenee с соавт., 2013; J.-H. Nan с соавт., 2020; V. Breuil с соавт., 2021). Особое внимание уделено генам, вовлеченным в процессы остеогенеза, хондрогенеза, ремоделирования костной ткани, регуляции кальций-фосфорного обмена, роста и развития организма, а также метаболизма мышечной и жировой тканей (T. Le с соавт., 2017; B. Wang c соавт., 2019; O. Matika с соавт., 2019; F. Szeri c соавт., 2020; B. Jiang c соавт., 2020). Изменения в таких генах могут влиять на формирование скелета, механическую прочность костей, состояние суставного хряща, постановку конечностей и характер движения животных. Формирование фенотипа хромоты обусловлено сложным взаимодействием генетических факторов и факторов окружающей среды. Одни и те же молекулярные механизмы способны одновременно определять интенсивность роста, развитие мышечной массы, жироотложение, качество мясной продукции и устойчивость конечностей к механической нагрузке. Вследствие этого селекция животных с пониженным риском хромоты требует комплексного подхода, поскольку отбор по отдельным признакам здоровья конечностей может сопровождаться нежелательными изменениями хозяйственно ценных характеристик, включая показатели мясной продуктивности. Представленные в обзоре сведения о генетических маркерах, функционально значимых генах и коэффициентах наследуемости признаков, связанных со здоровьем опорно-двигательного аппарата, формируют научную основу для разработки программ геномной селекции. Применение геномного отбора позволит выявлять животных с генетической предрасположенностью к заболеваниям конечностей на ранних этапах онтогенеза, до клинического проявления хромоты. Это может способствовать снижению частоты патологии в племенных стадах, повышению продолжительности продуктивного использования свиней, улучшению их благополучия и уменьшению экономических потерь отрасли.

хромота \ гены-кандидаты \ породы свиней \ минеральная плотность костной ткани \ полногеномный анализ ассоциаций

Короткий адрес: https://sciup.org/142248600

IDS: 142248600   |   УДК: 636.4:619:575.22   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2026.4.593rus

Genetic risk factors for lameness in pigs: a mini-review

Lameness is a widespread and economically significant problem in modern pig farming. It is a leading factor in reduced productivity and animal welfare. It results in reduced growth rates, increased treatment and maintenance costs, and premature culling of pigs from the breeding herd. Lameness is a multifactorial pathology and can be associated with an unbalanced diet, mineral metabolism disorders, skeletal injuries, limb and joint diseases, infectious processes, latent metabolic disorders, management practices, and hereditary predisposition (M. Heinonen et al., 2024). Along with the influence of external factors, the genetic component plays an important role, determining the specific features of bone development, cartilage, and muscle tissues, the conformation of the limbs, the strength of the skeleton, and the predisposition to osteochondrosis (B. Fan et al., 2009). The genetic basis of lameness in pigs is investigated using modern molecular genetic approaches, including candidate gene analysis, genome-wide association studies (GWAS), quantitative trait loci searches, whole genome and targeted sequencing (S.K. Onteru et al., 2008; B. Jiang et al., 2020; O.V. Kostyunina et al., 2020). The use of these methods has made it possible to identify a number of genetic loci associated with indicators of limb health, bone mineral density, joint structure, body conformation, and the risk of developing osteochondrosis. Currently, a significant body of data has been accumulated from pigs of various breeds, which needs to be systematized, critically evaluated, and adapted for practical purposes in breeding pig farming. The aim of this review is to summarize the literature on the influence of genetic factors on the development of lameness in pigs. The paper systematizes the results of association studies devoted to the analysis of molecular markers of limb health traits, and also presents estimates of the heritability coefficients of bone mineral density and osteochondrosis in pigs of different breeds (N. Rangkasenee et al., 2013; J.-H. Nan et al., 2020; V. Breuil et al., 2021). Particular attention is paid to the genes involved in osteogenesis, chondrogenesis, bone tissue remodeling, regulation of calcium-phosphorus metabolism, growth and organism development, as well as the metabolism of muscle and adipose tissue (T. Le et al., 2017; B. Wang et al., 2019; O. Matika et al., 2019; F. Szeri et al., 2020; B. Jiang et al., 2020). Such gene alterations can affect the formation of the skeleton, the mechanical strength of bones, the condition of articular cartilage, the positioning of the limbs and the nature of the movement of animals. The lameness phenotype is due to a complex interaction of genetic and environmental factors. The same molecular mechanisms can simultaneously determine growth rate, muscle development, fat deposition, meat quality, and limb resistance to mechanical stress. Therefore, breeding animals with a reduced risk of lameness requires a comprehensive approach, as selection for individual limb health traits can be accompanied by undesirable changes in economically valuable characteristics, including meat productivity. The information presented in this review on genetic markers, functionally significant genes, and heritability coefficients for traits associated with musculoskeletal health forms the scientific basis for developing genomic selection programs. The use of genomic selection will enable the identification of animals with an increased genetic predisposition to limb diseases before the clinical manifestation. This may help reduce the incidence of pathology in breeding herds, extend the productive life of pigs, improve their welfare, and reduce economic losses in the industry.

Текст научной статьи Генетические факторы риска развития хромоты у свиней: мини-обзор

Хромота остается актуальной проблемой свиноводства. Она представляет собой распространенное клиническое проявление этиологически неоднородных патологий опорно-двигательного аппарата, которое наблю- дается у свиней разных возрастных групп и служит второй по частоте причиной вынужденной выбраковки. На развитие хромоты влияют многочисленные факторы, такие как рацион питания, травмы скелета, заболевания ног, инфекционные болезни, скрытые метаболические заболевания и наследственность (1). Также значительную роль играет генетическая предрасположенность.

Целью настоящего обзора стало обобщение современных данных о вкладе генетических факторов в развитие хромоты у свиней и оценка перспектив использования выявленных генетических маркеров в селекции животных, устойчивых к патологиям конечностей.

Гены развития скелета. Ассоциативные исследования кан-дидатных генов, вовлеченных в развитие скелета и минеральный обмен у свиней, позволили S.K. Onteru с соавт. (2) выявить гены CALCR , HDBP , CALCA , MTHFR , OXTR , IHH , ANKH , LRCH1 и OPN , связанные с признаками строения ног и тела. Краткая характеристика генов, ассоциированных с хромотой у свиней, представлена в таблице.

Гены, ассоциированные с хромотой у свиней

Ген

Название

SSC1           Функция белка

1 Ссылки

MAN1A1

Маннозидаза альфа, член 1 класса 1A

1

Гликозилирование белков

(41, 42)

CALCA

Кальцитонина/кальцитонин-ген-родственный пептид

2

Регуляция фосфорно-кальциевого обмена (кальцитонин); развитие нейрогенного воспаления, вазодилататор (кальцитонин-ген-род-ственный пептид)

(2, 4, 5)

TPO

Тиреоидная пероксидаза

3

Биосинтез гормонов щитовидной железы

(15)

LRPPRC

Богатый лейцином белок, содержащий пентатрикопептид-ный повтор

3

Организация цитоскелета, везикулярный транспорт

(46)

MSH2

MutS гомолог 2, ген кишечной палочки

3

Репарация неспаренных оснований ДНК

(46)

LPIN1

Липин-1

3

Участие в метаболизме липидов, адипогенез

(41, 45)

KRT8

Кератин 8

5

Поддержание структурной целостности клеток, передача сигналов и клеточная дифференцировка

(17)

CCND2

Циклин D2

5

Регуляция клеточного цикла

(46)

A2ML1

Альфа-2-макроглобулин-по-добный белок 1

5

Ингибитор протеаз

(34)

MTHFR

Метилентетрагидрофолатре-дуктаза

6

Участие в метаболизме фолиевой кислоты. Мутации в гене MTHFR приводят к повышению содержания гомоцистеина в крови, что препятствует образованию поперечных связей коллагена в костном матриксе

(2, 7)

TGF β 1

Трансформирующий фактор роста бета 1

6

Участие в процессах эндохондрального окостенения, образования остеофитов

(18)

FAF1

Fas-ассоциированный фактор 1

6

Негативный модулятор дифференцировки остеобластов, индуцированной сигнальным путем Wnt

(17)

ZBTB40

Белок 40, содержащий цинковый палец и домен BTB

6

Способствует остеогенезу и подавляет остео-кластогенез

(19-21)

Lin28a

Гомолог А белка lin-28, связывающего РНК

6

Усиление дифференцировки клеток-предшественников в остеобласты, повышение активность митохондрий и защита клеток внутреннего слоя надкостницы от клеточного старения

(19, 22, 23)

CNR2

Каннабиноидный рецептор 2го типа

6

Регуляция дифференцировки мезенхимальных стволовых клеток в остеобласты

(19, 24)

RYR1

Рианодиновый рецептор 1-го типа

6

Сокращение скелетных мышц

(30, 60)

WRAP73

Белок, содержащий WD-повторы с антисмысловой последовательностью к TP73

6

Участие в процессе оссификации

(46)

SRSF11

Фактор сплайсинга 11, богатого аргинином и серином

6

Регуляция сплайсинга пре-мРНК

(41, 44)

CTH

Цистатионин-гамма-лиаза

6

Участие в метаболизме серосодержащих аминокислот

(41)

SRF

Фактор ответа сыворотки

7

В качестве фактора транскрипции SRF регулирует экспрессию генов, участвующих в различных биологических процессах. В остеобластах регулирует минерализацию и постнатальное развитие костей

(15)

Ïðîäîëæåíèå òàáëèöû

CUL7

Куллин-7

7

Участие в пролиферации и дифференцировке хондроцитов в зоне роста костей

(15)

PTK7

Протеинтирозинкиназа 7

7

Участие в формировании эмбриональных структур и морфогенезе позвоночных

(15)

VEGFA

Фактор роста эндотелия сосудов A

7

Участие в ангиогенезе, остеогенезе и ремоделировании костной ткани

(15)

VRTN

Белок, ассоциированный с развитием позвонков (верт-нин)

7

Полиморфный вариант в гене VRTN ассоциирован с числом грудных позвонков, сосков и длиной туловища

(46, 58)

PPARD

Рецептор дельта, активируемый пролифераторами пероксисом

7

Участие в метаболизме липидов, развитии хряща, пролиферации и дифференцировке хондроцитов

(46-48)

HDBP (GC)

Витамин-D-связывающий белок

8

Участие в метаболизме витамина D, способствует резорбции костной ткани

(2, 4)

OPN

Секретируемый фосфопротеин 1 (остеопонтин)

8

Участие в ремоделировании костной ткани, воспалительных реакциях, иммунном ответе

(2, 11, 12)

CALCR

Рецептор кальцитонина

9

Регуляция метаболизма костной ткани и гомеостаза кальция

(2, 3)

MMP3

Ген матриксной металлопротеиназы 3

9

Участие в разрушении внеклеточного матрикса при заболеваниях суставов

(18)

CCDC3

Белок 3, содержащий биспи-ральный домен

10

Регуляция накопления липидов, адипогенеза, метаболизма в печени, участие в образовании опухолей

(31, 39)

LRCH1

Белок 1, содержащий богатые лейцином повторы и домен гомологии с кальпонином

11

Участие в ответе хондроцитов на механическую нагрузку посредством взаимодействия с цитоскелетом

(2, 10)

PRKAR1A

Регуляторная субъединица альфа цАМФ-зависимой про-теинкиназы 1-го типа

12

Регуляция остеогенной дифференцировки

(15)

GH1

Ген гормона роста

12

Стимуляция роста, регуляция метаболизма

(46)

MSI2

РНК-связывающий белок Musashi-2

12

Регуляция роста эпителия, миграции керати-ноцитов, апоптоза, фокальной адгезии

(34, 37)

OXTR

Рецептор окситоцина

13

Рецепторы окситоцина на поверхности остеобластов связывают гормон окситоцин, что способствует дифференцировке и активному функционированию последних

(2, 6)

PTH1R

Рецептор паратиреоидного гормона 1-го типа

13

Рецептор опосредует действие ПТГ, который регулирует обмен кальция и фосфора, поддерживая нормальный уровень МПКТ

(17)

IGF2BP2

Белок 2, связывающий мРНК инсулиноподобного фактора роста 2

13

Регуляция трансляции инсулиноподобного фактора роста 2

(46)

ROBO2

Трансмембранный рецептор 2

13

Участие в навигации аксонов в развивающейся нервной системе

(34, 36)

ROBO1

Трансмембранный рецептор 1

13

Участие в развитии мозга, в миграции клеток-предшественников нейронов

(33, 36)

ULK4

unc-51-подобная киназа 4

13

Участие в нейрогенезе и развитии коры головного мозга

(31)

TBX5

Транскрипционный фактор 5, содержащий T-box

14

Контроль экспрессии гена GJA5 , кодирующего коннексин 40. Пониженная экспрессия GJA5 приводит к аномальному формированию суставов

(29)

IHH

Сигнальная молекула Indian hedgehog

15

Участие в пролиферации и дифференцировке хондроцитов

(2, 8)

MSTN

Миостатин

15

Ингибирование роста скелетных мышц

(50, 54, 55)

ANKH

Регулятор переноса неорганического пирофосфата

16

Облегчает транспорт пирофосфата из клеток. Мутации в гене ANKH могут приводить к кра-ниометафизарной дисплазии и хондрокальцинозу

(2, 9)

MYO10

Миозин X

16

Участие в дифференцировке и слиянии остеокластов; отсутствие миозина X может привести к повышенной резорбции костной ткани

(13, 14)

RHEB

Гомолог Ras, связывающегося с mTORC1

18

Регуляция хондрогенеза, усиление остеогенеза, увеличение экспрессии остеогенных маркеров

(15)

MINDY4 Деубиквитиназа 4 из нового (FAM188B) семейства деубиквитинирую-щих ферментов, содержащих мотив, взаимодействующий с убиквитином

18

Регуляция клеточного цикла и апоптоза

(31, 40)

Примечание . SSC — обозначение хромосом свиньи. ПТГ — паратиреоидный гормон. МПКТ — минеральная плотность костной ткани.

Ген CALCR кодирует рецептор кальцитонина, участвующий в регу- ляции метаболизма костной ткани и гомеостаза кальция. Изменения в гене CALCR связаны с минеральной плотностью костной ткани (МПКТ) и риском развития переломов и остеопороза. Кальцитонин связывается с этим рецептором и ингибирует резорбцию костей остеокластами, он также играет роль в регуляции кальция в почках (3).

Ген HDBP кодирует витамин D-связывающий белок, влияющий на метаболизм витамина D и резорбцию костей. Он участвует в переносе витамина D, который необходим для усвоения кальция и минерализации костей (4).

Ген CALCA кодирует кальцитонин-ген родственный пептид (CGRP), который выполняет множество функций, в числе которых увеличение диаметра кровеносных сосудов, передача боли и развитие воспаления. Другие белковые продукты гена CALCA — это кальцитонин и катакальцин, необходимые для регулирования содержания кальция в крови. Пептидный гормон кальцитонин вызывает снижение концентрации кальция и фосфата в крови, способствуя включению этих ионов в костную ткань (5).

Ген OXTR кодирует рецептор окситоцина — гормона, влияющего на социальное поведение. Связывание окситоцина с его рецепторами на поверхности клеток костной ткани способствует дифференцировке остеобластов, что приводит к увеличению образования костей и улучшению их микроархитектуры без влияния на их разрушение (6).

Кодируемая геном MTHFR метилентетрагидрофолатредуктаза представляет собой фермент, участвующий в метаболизме фолиевой кислоты, которая необходима для роста и развития клеток. MTHFR — один из важных генов-кандидатов, которые влияют на патогенез остеопороза у человека (7).

Ген IHH кодирует сигнальную молекулу Indian hedgehog и участвует в пролиферации и дифференцировке хондроцитов. Белок IHH действует как сигнальная молекула, влияя на формирование хряща и кости посредством взаимодействия с другими белками (8).

Ген ANKH кодирует гомолог белка прогрессирующего анкилоза у мышей, который облегчает транспорт пирофосфата из клеток, что важно для предотвращения аномальной минерализации костей и хрящей. Мутации в гене ANKH могут приводить к таким состояниям, как краниометафи-зарная дисплазия и хондрокальциноз, которые характеризуются аномальным ростом костей и кальцификацией. Биаллельные инактивирующие мутации в гене ANKH/Ank (человек/мышь) вызывают тяжелую форму артрита. Низкие внеклеточные концентрации ингибитора минерализации пирофосфата лежат в основе кальцификации суставов у мышей и людей, лишенных соответственно функционального Ank или ANKH (9).

Белок LRCH1 принимает участие в реакции хондроцитов на механическую нагрузку посредством взаимодействия с цитоскелетом. У человека однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в гене LRCH1 ассоциирован с остеоартрозом коленного сустава (10). Белок внеклеточного матрикса и цитокин остеопонтин, предположительно, участвует в ремоделировании костей (11). Остеопонтин связан со многими воспалительными состояниями, вызванными инфекциями, аллергическими реакциями, аутоиммунными реакциями и повреждением тканей (12).

Неправильное развитие или дефекты в строении задних конечностей могут приводить к хромоте, болям и снижению продуктивности животного. Вариант Chr16:g.6458337C>T (c.616G>A, p.Ala206Thr) в гене MYO10 показал статистически значимую ассоциацию с конформацией задних конечностей у хряков Swiss Large White (13). MYO10 влияет на активность остеокластов (клеток, рассасывающих костную ткань), участвуя в дифференцировке и 596

слиянии остеокластов, и его отсутствие может привести к повышенной резорбции костной ткани из-за усиленного остеокластогенеза. Остеокласты с пониженным содержанием MYO10 не способны сливаться в многоядерные клетки и деминерализовать субстрат фосфата кальция. У мышей с потерей функции MYO10 наблюдается остеопоротический дефицит, который, вероятно, обусловлен повышенным генезом остеокластов и резорбцией костей (14).

Таким образом, гены развития скелета у свиней участвуют в процессах остеогенеза и хондрогенеза, определяя правильное формирование суставов, длину и прочность конечностей. Их изучение необходимо для выявления генетических причин хромоты у свиней, поскольку мутации в этих генах могут приводить к структурным аномалиям развития скелета, провоцирующим хромоту.

Гены метаболизма костной ткани. Низкая МПКТ становится основной причиной переломов костей и остеомаляции, служит фактором риска развития хромоты у свиней (15). Взрослым свиньям с большей массой тела требуется более высокая прочность конечностей. Повышение МПКТ может способствовать снижению вероятности выбраковки животного по причине перелома конечностей.

В ряде работ были идентифицированы гены-кандидаты, влияющие на минеральный гомеостаз и определяющие восприимчивость к структурной прочности и слабости ног у свиней (16). Обнаружен SNP в гене PTH1R , который ассоциирован с остеохондрозом (17). Сам рецептор опосредует действие паратиреоидного гормона (ПТГ), который участвует в регуляции обмена фосфора и кальция в организме, поддерживая нормальное количество МПКТ. При низком содержании кальция в сыворотке крови происходит секреция ПТГ, что усиливает экскрецию фосфора. ПТГ, связываясь со своим рецептором PTH1R, запускает каскад реакций, в результате чего кальцидиол превращается в активную форму витамина D. Как известно, витамин D играет ключевую роль в поддержании минерального гомеостаза и метаболизма костной ткани (16).

W. Laenoi с соавт. (18) изучили ассоциацию хромоты с вариантами генов металлопротеиназы 3 ( MMP3 ) и трансформирующего фактора роста бета 1 ( TGF β 1 ). Показано, что у свиней F 2 ресурсной популяции, полученной в результате скрещивания животных пород дюрок и пьетрен, полиморфный локус g.158C>T в гене MMP3 ассоциирован с остеохондрозом и МПКТ, g.180G>A в гене TGF β 1 — с состоянием задних конечностей (18). Варианты c.1672C>T в гене рецептора паратиреоидного гормона I типа ( PTH1R ) и g.380914T>C в гене фактора 1, ассоциированного с Fas ( FAF1 ), связаны с поражением костей и суставов, а вариант g.8039G>A в гене кератина ( KRT8 ) — с МПКТ (17).

В результате полногеномного анализа ассоциаций (genome-wide association studies, GWAS) у свиней пород дюрок, ландрас и йоркшир определены гены TPO , SRF , CUL7 , PTK7 , RHEB , VEGFA и PRKAR1A , ассоциированные с прочностью конечностей (15). Гены SRF , CUL7 , VEGFA и PTK7 связаны с развитием костей и гомеостазом костной ткани, PRKAR1A — важный регулятор остеогенной дифференцировки (15).

J.-H. Nan с соавт. (19) определили коэффициент наследуемости МПКТ у свиней: для породы ландрас он составил 0,21, для породы йоркшир – 0,31 (19). На 6-й хромосоме были выбраны потенциальные QTL, ассоциированные с МПКТ у свиней, а в качестве генов-кандидатов предложены ZBTB40 , Lin28a и CNR2 (19).

Согласно данным литературы, ген фактора транскрипции ZBTB40

ассоциирован с МПКТ у людей (20). Известно, что ZBTB40 вовлечен в процесс остеогенеза и подавляет остеокластогенез (21). Белок, кодируемый геном Lin28a , усиливает дифференцировку клеток-предшественников в остеобласты, повышает активность митохондрий и защищает клетки внутреннего слоя надкостницы от клеточного старения (22). Lin28a способствует восстановлению хрящей и костей после травм ушей и пальцев (23). Ген CNR2 кодирует каннабиноидный рецептор второго типа, который регулирует метаболизм костной ткани (24).

Остеохондроз также считается одной из ведущих причин хромоты у свиней. Это заболевание характеризуется первичным поражением суставного хряща, а впоследствии и подлежащей кости. В основе развития остеохондроза лежит генетическая предрасположенность к указанной патологии (25). Коэффициент наследуемости остеохондроза у разных пород свиней оценивается в диапазоне от 0,1 до 0,5 (26). Свиньи породы ландрас более предрасположены к остеохондрозу, чем животные пород йоркшир, гемпшир или дюрок (27). У свиней, полученных от скрещивания дикого кабана с породой крупная белая, определен QTL на 5-й хромосоме, ассоциированный с остеохондрозом, в регионе, гомологичном участку 12-й хромосомы человека (12q14—q24), где расположен потенциальный ген-кандидат, хрящевой гомеопротеин 1 ( CART1 ) (28). Выявлено 19 SNP, ассоциированных с остеохондральными поражениями у свиней (29). Один из полиморфных вариантов c.54T>C находится в гене TBX5 , который участвует в росте и созревании костей, контролируя экспрессию гена GJA5 . Мутации в любом из этих генов снижают экспрессию GJA5 и приводят к аномальному формированию суставов (29). У свиней пород ландрас, дюрок и крупная белая вариант c.1843C>T в гене RYR1 ассоциирован с остеохондрозом, причем аллель Ñ демонстрирует протективный эффект (30).

Гены метаболизма костной ткани вносят существенный вклад в регуляцию обмена фосфора и кальция, активность остеобластов и остеокластов, обеспечивая баланс между резорбцией и формированием костей. Изменения в этих генах могут приводить к снижению МПКТ, повышая риск развития хромоты у свиней.

Гены, ассоциированные с образованием шишек и наростов на задних конечностях свиней. Шишки и наросты в области скакательного сустава задних конечностей (capped hock) представляют собой не содержащие патогенной микрофлоры доброкачественные новообразования соединительной ткани (31) и становятся существенной проблемой для производителей свинины. Подобные дефекты не только ухудшают внешний вид племенных животных, но и сказываются на их способности к свободному передвижению. Такая проблема может затрагивать до 20 % поголовья свиней на фермах (32).

Выявлено 26 полиморфных вариантов, которые ассоциированы с образованием шишек на задних конечностях свиней породы ландрас, из них 15 располагались в генах, участвующих в процессах, связанных с воспалительной реакцией, онкогенезом (33). L. Getmantseva с соавт. (34) обнаружили у свиней породы ландрас 38 SNP, а у свиней породы дюрок — 32 SNP, ассоциированных с образованием шишек на задних конечностях. Полиморфные локусы, расположенные в генах A2ML1 , ROBO2 и MSI2 , ассоциированы с признаком у свиней обеих пород. Ген A2ML1 кодирует альфа-2-макроглобулин-подобный белок 1, ингибитор протеаз. Мутации в этом гене встречаются при синдроме Нунан (35), характеризующимся низкорослостью, врожденными пороками сердца и скелетными аномалиями. Ген ROBO2 кодирует трансмембранный рецептор, необходимый для развития 598

нервной системы (36). РНК-связывающий белок MSI2 участвует во многих процессах, таких как рост эпителия, миграция кератиноцитов, апоптоз, фокальная адгезия (37).

S. Bakoev с соавт. (31) провели ассоциативное исследование полиморфных локусов с общим числом рожденных поросят и предрасположенностью к образованию шишек на скакательных суставах задних конечностей у свиней породы крупная белая. Выявлено шесть SNP, статистически значимо связанных с дефектами задних конечностей, причем три из них располагались в интронах генов ULK4 , CCDC3 и MINDY4 . Ген ULK4 играет значимую роль в нейрогенезе и развитии коры головного мозга на различных стадиях развития. У трехпородных гибридов свиней (дюрок ½ ландрас ½ йоркшир) SNP в этом гене ассоциирован с таким параметром, как высота в холке (38). Ген CCDC3 кодирует белок 3, содержащий биспиральный домен. Он регулирует накопление липидов, адипогенез, метаболизм в печени, участвует в образовании опухолей (39). Ген MINDY4 участвует в развитии злокачественных новообразований, действуя как онкоген (40).

Использование подхода CNV-GWAS, сочетающего поиск вариантов числа копий (copy number variants, CNV) из данных массива SNP и выявление ассоциаций с интересующим фенотипическим признаком, позволило определить три региона вариации числа копий (copy number variation region, CNVR) на 1-й, 3-й и 6-й хромосомах, ассоциированных с дефектами конечностей у свиней крупной белой породы (41). CNVR на 1-й хромосоме перекрывается с геном MAN1A1 , CNVR на 6-й хромосоме охватывает гены SRSF11 и CTH , CNVR на 3-й хромосоме расположен в непосредственной близости от гена LPIN1 (41). Маннозидаза MAN1A1 участвует в гликозилировании белков. Кроме того, предполагается ее роль в процессе дегенерации межпозвоночных дисков (42). У товарных гибридов второго поколения, где в качестве отцовской породы использовались хряки породы дюрок, SNP в гене MAN1A1 ассоциирован с прогнозируемым остаточным потреблением корма (43). Фактор сплайсинга SRSF11 у свиней, вероятно, вовлечен в адипогенез в мышцах (44). Ген CTH регулирует метаболизм серосодержащих аминокислот, недостаточное количество которых приводит к ослаблению иммунных реакций (41). SNP rs335068804 (c.93C>T) в гене LPIN1 , ответственном за метаболизм липидов, ассоциирован с содержанием внутримышечного жира у свиней (45).

Отбор по здоровой конституции широко использовался в качестве основного подхода к снижению хромоты и слабости ног у свиней. В норме задние конечности должны быть правильно сформированы, обеспечивая равномерную нагрузку на копыта и плавную походку. Выявлены генетические локусы, ассоциированные с такими характеристиками, как качество передних конечностей, спины, задних конечностей и общая конституция, у свиней трех датских пород ландрас, йоркшир и дюрок (46). Идентифицированы гены-кандидаты LRPPRC и PPARD у свиней породы ландрас, WRAP73 у породы дюрок, VRTN у пород йоркшир и дюрок для QTL, которые, вероятно, контролируют черты конформации посредством регуляции развития костей и мышц, а гены IGF2BP2 , GH1 , CCND2 и MSH2 могут оказывать влияние посредством процессов, связанных с ростом (46). Несколько GWAS выявили ассоциацию гена PPARD с длиной конечностей (47) и признаками роста и упитанности (48). T. Le с соавт. (46) сделали вывод, что развитие костей и скелета, метаболизм в мышечной и жировой ткани, процессы роста, вероятно, взаимодействуют друг с другом, определяя общую конформацию и движение свиньи. Однако эти взаимодействия еще предстоит изучить более подробно.

Антагонистическая плейотропия аллелей генов, ассоциированных с хозяйственно-ценными признаками. Современные разведение и селекция свиней сталкиваются с серьезной биологической проблемой, связанной с плейотропным действием генов. Проблема заключается в том, что при селекции на экономически важные признаки, такие как толщина и глубина мышц, значительно увеличивается генетический груз в популяции за счет сохранения «вредных» аллелей, которые в гетерозиготном состоянии положительно влияют на хозяйственно ценные признаки животных (49). Так, селекция на высокую мышечную массу и быстрый рост у свиней основана на отборе аллелей генов, вызывающих гипертрофию мышечной ткани и регулирующих сигнальные пути синтеза белка: это гены миостатина ( MSTN ), миоцитарного фактора ( MYOD1 ) и некоторые другие (50, 51). Здоровье конечностей, напротив, зависит от генов, обеспечивающих прочность соединительной ткани и стабильность суставов: это гены коллагенов, которые формируют структурный каркас связок и сухожилий, состоящих из коллагеновых и эластиновых волокон (52). Суть генетического конфликта заключается в том, что гены, ответственные за мышечную гипертрофию, отличаются от генов, регулирующих прочность соединительной ткани, и, по сути, отбор на мясную продуктивность может напрямую ухудшать здоровье конечностей у свиней.

Если рассматривать этот конфликт с точки зрения биомеханики, то при очень быстром росте мышечной массы суставы, сухожилия и связочный аппарат животных не успевают функционально адаптироваться к нагрузке. При высокой силе сокращения мышц при ходьбе механическая прочность сухожилий постепенно снижается. Как следствие, возникают травмы хрящей и связок, разрывы сухожилий. Сочетание высокой мышечной массы и недостаточной прочности связочного аппарата приводит к повышению риска развития дегенеративных изменений суставов (53).

Для увеличения толщины мышц требуются активные анаболические процессы и значительное количество белка. Для реализации этих процессов необходима энергия, и в связи с высокой нагрузкой на организм усиливаются метаболические процессы, увеличивается потребление кислорода, накапливаются продукты распада. При метаболическом воспалении ухудшается здоровье суставов.

Известный пример такого конфликта — обратная генетическая корреляция между слабыми конечностями и ростом мышц, их толщиной. Этот конфликт связан с мутацией в гене миостатина ( MSTN ), который служит фактором роста и дифференцировки и принимает участие в регуляции количества и размера скелетных миоцитов (50). Ген MSTN регулирует рост скелетных мышц и детерминирует количество миофибрилл, особенно в период пренатального развития. Инактивирующие мутации в гене MSTN могут приводить к тому, что масса мышц увеличится втрое, что используется для селекции и разработки биотехнологических подходов, чтобы повысить выход мышечной ткани у животных (50, 54).

Мутация замены гуанина на тимин в 820 положении кодирующей последовательности (c.820G>T) гена миостатина, приводящая к нонсенс-мутации p.E274*, вызывает образование стоп-кодона в экзоне 3 гена миостатина и увеличивает вероятность развития хромоты у животного. Эта же замена в гетерозиготном состоянии приводит к быстрому росту мышц и меньшему количеству жировой ткани, а в гомозиготном состоянии эта мутация ведет к синдрому слабости ног, от которого поросята погибают. Только благодаря конкурентному преимуществу мяса гетерозиготных особей на рынке, аллель, приводящий к высокой летальности, сохраняется в популяции, но с невысокой частотой примерно в 22 % (балансирующий отбор) (55). Других вариантов в гене миостатина, которые были бы ассоциированы с летальными фенотипами у свиней породы дюрок, обнаружено не было (56).

В одной из работ при использовании геномного редактирования у свиней был увеличен выход постного мяса без ущерба для показателей конверсии корма или размера помета, при этом слабость задних конечностей у животных не развивалась (57). Исследователям удалось достичь такого результата благодаря выбору иного участка внутри гена для внесения изменений с целью сохранения аминокислоты C339, необходимой для димеризации миостатина и последующего выведения его из клеток (57).

Таким образом, для решения конфликта между продуктивностью и здоровьем животных может применяться генетическое редактирование.

Ген вертнина ( VRTN ) представляет собой ген-кандидат в QTL на 7й хромосоме свиньи (SSC7), который влияет на число грудных позвонков и оказывает плейотропный эффект на число сосков и длину туловища (58). Так, селекция на определенные аллели этого гена (например, вставку в локусе g.20311_20312ins291) способствует увеличению числа грудных позвонков, что коррелирует с увеличением длины туловища и, как следствие, повышением общей массы туши (58). Интенсивная селекция на повышение мясной продуктивности с использованием VRTN как маркера может приводить к накоплению «генетического груза» (59). Так, увеличенная длина туловища и мышечная масса могут влиять на качество соединительной ткани, приводя к образованию наростов и шишек, развитию воспаления в конечностях животных, а также изменениям липидного обмена и регенерации мышц. Все это необходимо учитывать при разведении свиней с улучшенными хозяйственно ценными признаками.

Ген рецептора рианодина 1 ( RYR1 ) на 6-й хромосоме кодирует кальциевый канал саркоплазматического ретикулума в скелетных мышцах, регулирующий высвобождение ионов кальция при мышечном сокращении. У гомозигот по мутации R615C в 17-м экзоне гена RYR1 происходит нарушение закрытия кальциевого канала, вследствие чего повышается концентрация ионов кальция внутри клеток (60). В гетерозиготном состоянии носители этой мутации демонстрируют повышенную мясную продуктивность, низкое содержание жира и улучшенную конверсию корма, что объясняет интенсивный отбор на указанный аллель в мясных породах, при этом в гомозиготном состоянии у свиней проявляется порок злокачественной гипертермии, который летален для части животных (61). Селекция на мясную продуктивность приводит к тому, что частота патогенного аллеля в популяции достигает 21,4 % у некоторых пород (62).

Таким образом, селекция на продуктивные признаки у свиней создает эволюционный и биологический парадокс: желательный фенотип у гетерозигот сопровождается сохранением и даже распространением летальных рецессивных аллелей, вызывающих серьезные заболевания конечностей. Решение проблемы требует перехода к сбалансированной селекции, одновременно учитывающей как продуктивные признаки, так и здоровье конечностей через геномный анализ, отбор на устойчивость к заболеваниям и предотвращение накопления патогенных аллелей в популяции.

Итак, хромота в современном свиноводстве остается экономически значимой проблемой, по причине которой животные подвергаются вынужденной выбраковке. Несмотря на то, что исследования хромоты у свиней ведутся по всему миру, сложность ее природы и влияние различных факто- ров, как внутренних, так и внешнесредовых, затрудняет возможность точного прогнозирования риска развития хромоты у животных и направленную селекцию. Использование GWAS-анализа и изучение генов-кандидатов в качестве подходов для исследования генетических причин развития хромоты у свиней позволило выделить ряд генов, достоверно ассоциированных с хромотой. Гены развития скелета определяют длину туловища, формирование и крепость конечностей. Гены метаболизма костной ткани регулируют процесс костного ремоделирования, участвуют в поддержании минерального гомеостаза. Полиморфные варианты в этих генах могут приводить к снижению МПКТ, повышая риск развития хромоты у свиней. Понимание механизмов развития патологии конечностей на молекулярно-генетическом уровне поможет снизить частоту возникновения хромоты в племенном стаде и сократить финансовые потери вследствие вынужденной выбраковки животных. Более быстрого прогресса можно добиться, если использовать в процессе селекции информацию о генетических маркерах, а не традиционную схему селекции на основе родословной.

Институт биохимии и генетики