Генетический полиморфизм возбудителя вирусной диареи (болезни слизистых оболочек) крупного рогатого скота на молочных комплексах Сибири

Генетический полиморфизм возбудителя вирусной диареи (болезни слизистых оболочек) крупного рогатого скота на молочных комплексах Сибири

Автор: Котенева С.В., Нефедченко А.В., Глотова Т.И., Глотов А.Г.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Ветеринарная вирусология

Статья в выпуске: 6 т.53, 2018 года.

Бесплатный доступ

Вирусная диарея (болезнь слизистых оболочек) крупного рогатого скота (ВД-БС КРС) распространена на территории Российской Федерации и наносит значительный экономический ущерб молочному скотоводству (особенно интенсивному), инфицированность в разных регионах достигает от 65 до 100 %. Заболевание вызывают два вида вируса - BVDV-1 и BVDV-2 (Bovine viral diarrhea virus), причем второй считается более вирулентным. Существенную роль в поддержании стационарного неблагополучия хозяйств играют персистентно инфицированные (ПИ) животные, которые становятся постоянным эндогенным источником возбудителя в стаде. Кратковременными источниками возбудителя могут быть транзитно инфицированные (ТИ) животные, у которых болезнь протекает в острой форме. На основании мониторинга генетической структуры вирусов, циркулирующих в локальных популяциях скота, можно получить необходимые сведения об эволюции, географии и путях распространения патогена. Но объем таких работ в России недостаточен. Мы впервые провели филогенетический анализ двух типов вируса вирусной диареи, выделенных от животных иностранного и отечественного происхождения с различными клиническими проявлениями болезни, и установили преобладание BVDV-1b у ПИ и ТИ животных, а также циркуляцию BVDV-2b и BVDV-2c на молочных комплексах Сибири (BVDV-2b и BVDV-2c у животных иностранного и отечественного происхождения выявлены в России впервые)...

Еще

Крупный рогатый скот, вирусная диарея (болезнь слизистых оболочек), субтипы, геном, полимеразная цепная реакция, 5´-нетранслируемый регион (5´-utr), нуклеотидный сиквенс, молекулярная эпизоотология, филогенетический анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/142220072

IDR: 142220072   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2018.6.

Список литературы Генетический полиморфизм возбудителя вирусной диареи (болезни слизистых оболочек) крупного рогатого скота на молочных комплексах Сибири

  • Ridpath J.F. Bovine viral diarrhea virus: global status. Vet. Clin. N. Am.-Food A., 2010, 2(5): 105-121 ( ) DOI: 10.1016/j.cvfa.2009.10.007
  • Верховская А.Е., Сергеев В.А., Алипер Т.И., Иванов Е.В. Особенности диагностики и профилактики вирусной диареи крупного рогатого скота. Ветеринария, 2009, 8: 3-7.
  • Глотов А.Г., Глотова Т.И., Петрова О.Г., Нефедченко А.В., Татарчук А.Т., Котенева С.В., Ветров Г.В., Сергеев А.Н. Распространение вирусных респираторных болезней крупного рогатого скота. Ветеринария, 2002, 3: 17-21.
  • Глотов А.Г., Глотова Т.И., Семенова О.В., Котенева С.В., Никонова А.А. Индикаторы циркуляции возбудителей вирусной диареи (болезни слизистых оболочек) крупного рогатого скота на молочных комплексах в условиях Сибири. Сельскохозяйственная биология, 2016, 51(4): 483-490 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2016.4.483rus
  • Шилова Е.Н., Ряпосова М.В., Шкуратова И.А., Вялых Е.В. Вирусная диарея -болезнь слизистых оболочек крупного рогатого скота в Уральском регионе. Ветеринария, 2014, 5: 19-21.
  • Юров Г.К., Алексеева С.В., Диас Хименес К.А., Неустроев М.П., Юров К.П. Антигенные свойства нецитопатогенных штаммов диареи-болезни слизистых крупного рогатого скота. Российский ветеринарный журнал. Сельскохозяйственные животные, 2013, 2: 24-26.
  • Черных О.Ю., Шевченко А.А., Джаилиди Г.А., Мищенко В.А., Мищенко А.В., Шевкопляс В.Н. Проблемы вирусной диареи крупного рогатого скота. Труды Кубанского государственного аграрного университета, 2016, 58: 194-198.
  • Глотов А.Г., Глотова Т.И. Роль возбудителя вирусной диареи-болезни слизистых оболочек в этиологии респираторных патологий крупного рогатого скота. Ветеринария, 2017, 6: 3-12.
  • Baker J.C. The clinical manifestations of bovine viral diarrhea infection. Vet. Clin. N. Am.-Food A., 1995, 11(3): 425-445 ( )
  • DOI: 10.1016/S0749-0720(15)30460-6
  • Vilček Š., Ďurkovič B., Kolesàrovà M., Greiser-Wilke I., Paton D. Genetic diversity of international bovine viral diarrhea virus (BVDV) isolates: Identification of a new BVDV-1 genetic group. Vet. Res., 2004, 35(5): 609-615 ( 2004036)
  • DOI: 10.1051/vetres:
  • Ridpath J.F. Bovine viral diarrhea virus. In: Encyclopedia of virology/B.W.J. Mahy, M.H.V. van Regenmortel (eds.). Elsevier, Oxford (UK), 2008: 374-380.
  • Yesilbag K., Alpay G., Becher P. Variability and global distribution of subgenotypes of bovine viral diarrhea virus. Viruses, 2017, 9(6): 128 ( )
  • DOI: 10.3390/v9060128
  • Giammarioli M., Ceglie L., Rossi E., Bazzucchi M., Casciari C., Petrini S., De Mia GM. Increased genetic diversity of BVDV-1: recent findings and implications thereof. Virus Genes, 2015, 50(1): 147-151 ( )
  • DOI: 10.1007/s11262-014-1132-2
  • Deng M., Ji S., Fei W., Raza S., He C., Chen Y., Chen H., Guo A. Correction: Prevalence study and genetic typing of bovine viral diarrhea virus (BVDV) in four bovine species in China. PLoS ONE, 2015, 10(7): e0134777 ( )
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0134777
  • Evermann J.F., Ridpath J.F. Clinical and epidemiologic observations of bovine viral diarrhea virus in the northwestern United States. Vet. Microbiol., 2002, 89(2-3): 129-139 ( )
  • DOI: 10.1016/S0378-1135(02)00178-5
  • Carman S., Van Dreumel T., Ridpath J., Hazlett M., Alves D., Dubovi E., Tremblay R., Bolin S., Godkin A., Anderson N. Severe acute bovine viral diarrhea in Ontario, 1993-1995. J. Vet. Diagn. Invest., 1998, 10(1): 27-35 ( )
  • DOI: 10.1177/104063879801000106
  • Silveira S., Weber M.N., Mósena A.C., Da Silva M.S., Streck A.F., Pescador C.A., Flores E.F., Weiblen R., Driemeier D., Ridpath J.F., Canal C.W. Genetic diversity of Brazilian bovine pestiviruses detected between 1995 and 2014. Transbound. Emerg. Dis., 2017, 64(2): 613-623 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12427
  • Pecora A., Malacari D.A., Ridpath J.F., Perez Aguirreburualde M.S., Combessies G., Odeón A.C., Romera S.A., Golemba M.D., Wigdorovitz A. First finding of genetic and antigenic diversity in 1b-BVDV isolates from Argentina. Res. Vet. Sci., 2014, 96(1): 204-212 ( )
  • DOI: 10.1016/j.rvsc.2013.11.004
  • Maya L., Puentes R., Reolón E., Acuña P., Riet F., Rivero R., Cristina J., Colina R. Molecular diversity of bovine viral diarrhea virus in Uruguay. Arch. Virol., 2016, 161(3): 529-535 ( )
  • DOI: 10.1007/s00705-015-2688-4
  • Tajima M., Frey H.R., Yamato O., Maede Y., Moennig V., Scholz H., Greiser-Wilke I. Prevalence of genotypes 1 and 2 of bovine viral diarrhea virus in Lower Saxony, Germany. Virus Res., 2001, 76(1): 31-42 ( )
  • DOI: 10.1016/S0168-1702(01)00244-1
  • Novácková M., Jacková A., Kolesárová M., Vilcek S. Genetic analysis of a bovine viral diarrhea virus 2 isolate from Slovakia. Acta Virol., 2008, 52(3): 161-166.
  • Luzzago C., Lauzi S., Ebranati E., Giammarioli M., Moreno A., Cannella V., Masoero L., Canelli E., Guercio A., Caruso C., Ciccozzi M., De Mia G.M., Acutis P.L., Zehender G., Peletto S. Extended genetic diversity of bovine viral diarrhea virus and frequency of genotypes and subtypes in cattle in Italy between 1995 and 2013. Biomed. Res. Int., 2014, 2014: 147-145 ( )
  • DOI: 10.1155/2014/147145
  • Oem J.K., Hyun B.H., Cha S.H., Lee K.K., Kim S.H., Kim H.R., Park C.K., Joo Y.S. Phylogenetic analysis and characterization of Korean bovine viral diarrhea viruses. Vet. Microbiol., 2009, 139(3-4): 356-360 ( )
  • DOI: 10.1016/j.vetmic.2009.06.017
  • Yamamoto T., Kozasa T., Aoki H., Sekiguchi H., Morino S., Nakamura S. Genomic analyses of bovine viral diarrhea viruses isolated from cattle imported into Japan between 1991 and 2005. Vet. Microbiol., 2008, 127(3-4): 386-391 ( )
  • DOI: 10.1016/j.vetmic.2007.08.020
  • Ochirkhuu N., Konnai S., Odbileg R., Odzaya B., Gansukh S., Murata S., Ohashi K. Molecular detection and characterization of bovine viral diarrhea virus in Mongolian cattle and yaks. Arch. Virol., 2016, 161(8): 2279-2283 ( )
  • DOI: 10.1007/s00705-016-2890-z
  • Giangaspero M., Apicellab S., Harasawa R. Numerical taxonomy of the genus Pestivirus: New software for genotyping based on the palindromic nucleotide substitutions method. J. Virol. Methods, 2013, 192(1-2): 59-67 ( )
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2013.04.023
  • Schweizer M., Peterhans E. Pestiviruses. Annu. Rev. Anim. Biosci., 2014, 2: 141-163 ( )
  • DOI: 10.1146/annurev-animal-022513-114209
  • Simmonds P., Becher P., Collett M.S., Gould E.A., Heinz F.X., Meyers G., Monath T., Pletnev A., Rice C.M., Stiasny K., Thiel H.-J., Weiner A., Bukh J. Family Flaviviridae. In: Virus taxonomy: Ninth report of the international committee on taxonomy of viruses/A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz (eds.). Elsevier Academic Press, San Diego, 2011: 1003-1020.
  • Vilcek S., Durkovic B., Kolesarova M., Paton D.J. Genetic diversity of BVDV: consequences for classification and molecular epidemiology. Prev. Vet. Med., 2005, 72(1-2): 31-35 ( )
  • DOI: 10.1016/j.prevetmed.2005.08.004
  • Шульпин М.И., Аянот П.К., Мищенко В.А. Индикация вируса диареи крупного рогатого скота, генотипирование и филогенетический анализ изолятов, выявленных на территории Российской Федерации. Вопросы вирусологии, 2003, 5: 41-46.
  • Юров Г.К., Алексеенкова С.В., Диас Хименес К.А., Неустроев М.П., Юров К.П. Антигенные свойства нецитопатогенных штаммов вируса диареи-болезни слизистых крупного рогатого скота. Российский ветеринарный журнал. Сельскохозяйственные животные, 2013, 2: 24-26.
  • Глотов А.Г., Котенева С.В., Глотова Т.И., Трегубчак Т.В., Максютов Р.А. Молекулярная эпизоотология вирусной диареи крупного рогатого скота в Сибири. Ветеринария, 2017, 12: 14-20.
  • Vilček S., Herring A.J., Herring J.A., Nettleton P.F, Lowings J.P., Paton D.J. Pestiviruses isolated from pigs, cattle and sheep can be allocated into at least three genogroups using polymerase chain reaction and restriction endonuclease analysis. Arch. Virol., 1994, 136(3-4): 309-323 ( )
  • DOI: 10.1007/BF01321060
  • Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA 7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol., 2016, 33: 1870-1874 ( )
  • DOI: 10.1093/molbev/msw054
  • Felsenstein J. Phylogenies and the comparative method. The American Naturalist, 1985, 125(1): 1-15 ( )
  • DOI: 10.1086/284325
  • Toplak I., Sandvik T., Barlič-Maganja D., Grom J., Paton D.J. Genetic typing of bovine viral diarrhoea virus: most Slovenian isolates are of genotypes 1d and 1f. Vet. Microbiol., 2004, 99: 175-185 ( )
  • DOI: 10.1016/j.vetmic.2003.12.004
  • Giammarioli M., Pellegrini C., Casciari C., Rossi E., De Mia G.M. Genetic diversity of bovine viral diarrhea virus 1: Italian isolates clustered in at least seven subgenotypes. J. Vet. Diagn. Invest., 2008, 20(6): 783-388 ( )
  • DOI: 10.1177/104063870802000611
  • Yeşilbağ K., Förster C., Bank-Wolf B., Yilmaz Z., Alkan F., Ozkul A., Burgu I., Rosales S.C., Thiel H.J., König M. Genetic heterogeneity of bovine viral diarrhoea virus (BVDV) isolates from Turkey: identification of a new subgroup in BVDV-1. Vet. Microbiol., 2008, 130(3-4): 258-267 ( )
  • DOI: 10.1016/j.vetmic.2008.01.016
  • Yeşilbağ K., Förster C., Ozyiğit M. Alpay G., Tuncer P., Thiel H.J., König M. Characterization of bovine viral diarrhea virus BVDV isolates from an outbreak with hemorrhagic enteritis and severe pneumonia. Vet. Microbiol., 2014, 169: 42-49 ( )
  • DOI: 10.1016/j.vetmic.2013.12.005
  • Jenckel M., Hoper D., Schirrmeier H., Reimann I., Goller K.V., Hoffmann B., Beer M., Mixed triple: allied viruses in unique recent isolates of highly virulent type 2 bovine viral diarrhea virus detected by deep sequencing. J. Virol., 2014, 88: 6983-6992 ( )
  • DOI: 10.1128/JVI.00620-14
  • Gethmann J., Homeier T., Holsteg M., Schirrmeier H., Saßerath M., Hoffmann B., Beer M., Conraths F.J. BVD-2 outbreak leads to high losses in cattle farms in Western Germany. Heliyon, 2015, 1(1): e00019 ( )
  • DOI: 10.1016/j.heliyon.2015.e00019
  • Decaro N., Lucente M.S., Lanave G., Gargano P., Larocca V., Losurdo M., Ciambrone L., Marino P.A., Parisi A., Casalinuovo F., Buonavoglia C., Elia G. Evidence for circulation of bovine viral diarrhea virus type 2c in ruminants in Southern Italy. Transbound. Emerg. Dis., 2017, 64(6): 1935-1944 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12592
  • S.V. Koteneva, A.V. Nefedchenko, T.I. Glotova, A.G. Glotov
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp