Генетическое разнообразие Bos grunniens, разводимого в Тянь-Шане Кыргызской Республики

Массивы высокогорных пастбищ, занимающие 90 % территории Кыргызской Республики, благоприятствуют развитию яководства, поскольку яки ( Bos grunniens ) - это исключительно пастбищные животные, приспособленные к обитанию в условиях высокогорного сурового климата. В мире считаные страны занимаются яководством. В Кыргызской Республике яки разводятся с глубокой древности, при этом расселение яка в горах Тянь-Шаня шло с юга на север. В процессе эволюции в горах Тянь-Шаня и Памиро-Алая сформировался определенный тип высокогорного яка, у которого выделено 8 типов мастей, от черной и бурой до пестрой и светло-бурой. В этой связи возникла необходимость выяснения генетической структуры у имеющегося поголовья яков для составления предварительной генетической референсной группы уникальных животных. В настоящей работе с помощью микросателлитных маркеров ДНК впервые определен молекулярно-генетический статус яков, разводимых в высокогорном регионе Тянь-Шаня Кыргызской Республики. Выявлены специфические характеристики, которые отличают кыргызскую популяцию яков от других географических групп этих животных, что вносит существенный вклад в понимание ее генетических особенностей. Полученные данные также дают возможность оценить генетическое разнообразие и риски инбридинга в популяциях яков Тянь-Шаня, что имеет большое значение для разработки стратегий сохранения и рационального использования этих животных. Цель нашего исследования - оценка генетического разнообразия популяции домашнего яка, разводимого в высокогорном регионе Тянь-Шаня Кыргызской Республики с использованием микросателлитных маркеров ДНК. Работа проводилась в 2021-2023 годах на базе НИИ молекулярной биологии и медицины (г. Бишкек, Кыргызская Республика) и в Институте генетики и цитологии (г. Минск, Республика Беларусь). Материалом для исследования служили образцы крови, взятые у взрослого поголовья 55 домашних яков, разводимых в высокогорном регионе Калмак-Ашуу (Кочкорский р-н, Нарынская обл., Кыргызская Республика). Образцы были генотипированы по 15 микросателлитным локусам: ETH3, INRA023, TGLA227, TGLA126, TGLA122, SPS115, ETH225, TGLA53, BM2113, BM1824, ETH10, BM1818, CSSM66, ILSTS006 и CSRM60. ПЦР проводили с использованием Multiplex PCR Master («Jena Bioscience GmbH», Германия) в мультилокусном формате согласно рекомендациям производителя. Далее продукты амплификации объединяли и подвергали фрагментному анализу. Анализ результатов ПЦР осуществляли методом капиллярного электрофореза с помощью автоматического генетического анализатора с лазериндуцированной флуоресцентной детекцией Applied Biosystems 3500 («Thermo Fisher», США). Контролем служили образцы, валидированные с использованием набора COrDIS Cattle (ООО «ГОРДИЗ», РФ). Анализ популяционно-генетических параметров, а также степень дифференциации на основании матрицы генетических дистанций проводили с использованием программного обеспечения GenAlEx 6.503 с последующей визуализацией дендрограмм по алгоритму Neighbor joining в программе Past v.4.03. Генетическую структуру исследуемой выборки яков оценивали посредством кластеризации в программе STRUCTURE 2.3.4. Оптимальное число кластеров (ΔK) определяли с использованием веб-приложения POPHELPER v1.0.10. В 15 аутосомных STR-локусах исследованной выборки было выявлено 89 аллелей, из них 32 - редкие (с частотой встречаемости менее 5,0 %). По результатам оценки генетико-популяционных параметров Na (5,933±0,316), Ne (3,015±0,235), Ho (0,617±0,049), PIC (0,581±0,130) сделано заключение о высоком уровне генетического разнообразия исследуемой выборки яков. Для формирования референсной группы яков, характеризующих их генетическое разнообразие в регионе, создана электронная база генотипов особей. Селекционные схемы при разведении домашнего яка в высокогорном регионе Тянь-Шаня сбалансированы и способствуют сохранению генетического разнообразия. Сравнительный анализ результатов представленного молекулярно-генетического исследования с результатами других аналогичных работ позволяет сделать заключение о значительном генетическом разнообразии домашних яков ( Bos grunniens ), разводимых в Тянь-Шане Кыргызской Республики.