Генетическое разнообразие естественных популяций сосны обыкновенной в северной части Республики Карелии
Автор: Мельчакова Е.В., Малеева Н.А.
Журнал: Лесохозяйственная информация @forestry-information
Рубрика: Материалы 7-го международного совещания "Сохранение лесных генетических ресурсов"
Статья в выпуске: 1, 2023 года.
Бесплатный доступ
Проанализировано генетическое разнообразие и структура 5 популяций сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) из северной части Республики Карелии с использованием 13 микросателлитных локусов. Установлено высокое аллельное разнообразие популяции сосны обыкновенной на исследованных участках, несмотря на то что по степени равномерности распределения аллельных вариантов внутри выборок все исследуемые популяции достаточно однородны. Результат AMOVA-анализа показал относительно невысокий уровень межпопуляционной дифференциации: внутрипопуляционная изменчивость составляет 93 %, а межпопуляционная - 7 %. По результатам кластерного анализа, проведённого на основе матрицы генетических расстояний М. Неи, установлена популяционная структура P. sylvestris в северной части Карелии. Все изученные популяции подразделены на две большие группы.
Pinus sylvestris l, естественные популяции, генетическая структура, пцр, микросателлиты, генетическое разнообразие, est-ssr
Короткий адрес: https://sciup.org/143179856
IDR: 143179856 | DOI: 10.24419/LHI.2304-3083.2023.1.07
Список литературы Генетическое разнообразие естественных популяций сосны обыкновенной в северной части Республики Карелии
- Гаврилова, О.И. Лесовосстановление вырубок и продуктивность лесных культур хвойных пород Республики Карелия / О.И. Гаврилова. - Петрозаводск, 2012. - 351 с.
- Ильинов, А.А. Состояние генофонда сосны обыкновенной Pinus sylvestris L. в Карелии / А.А. Ильинов, Б.В. Раевский // Сибирский лесной журнал. - 2016. - № 5. - С. 45-54.
- Генетическая изменчивость и дифференциация сосны обыкновенной Pinus sylvestris L. на территории Карелии / Ю.А. Янбаев, В.В. Тренин, З.Х. Шигапов, Б.А. Чистяков, Р.М. Бахтиярова // Научные основы селекции древесных растений Севера. - Петрозаводск: КНЦ РАН, 1998. - С. 25-32.
- Bilgen, B.B. Allozyme variations in six natural populations of scots pine (Pinus sylvestris) in Turkey / B.B. Bilgen, N. Kaya // Biología. - 2007. - Т. 62. - № 6. - С. 697-703.
- Genetic differentiation of Pinus sylvestris L. and Pinus mugo aggr. populations in Switzerland / C. Neet-Sarqueda [et al.] // Silvae Genetica. - 1994. - Т. 43. - № 4. - С. 207-214.
- Structure of Pinus sylvestris L. populations in Bulgaria revealed by chloroplast microsatellites and terpenes analysis: provenance tests / K.D. Naydenov [et al.] // Biochemical Systematics and Ecology. - 2005. - Т. 33. - № 12. -С.1226-1245.
- Genetic structure of montane isolates of Pinus sylvestris L. in a Mediterranean refugial area / J.J. Robledo-Arnuncio [et al.] // Journal of Biogeography. - 2005. - Т. 32. - № 4. - С. 595-605.
- Studies of allele frequencies and inbreeding in Scots pine populations by the aid of the isozyme technique. - Text: electronic / D. Rudin [et al.]. - 1974. - Режим доступа:www.thuenen.de
- Multiple origins for Scots Pine (Pinus sylvestris L.) in Scotland: evidence from mitochondrial DNA variation / W.T. Sinclair, J.D. Morman [et al.] // Heredity. - 1998. - 80:233-240. D0I:10.1046/j.1365-2540.1998.00287.x
- Калько, Г.В. ДНК-маркеры для оценки генетических ресурсов ели и сосны / Г.В. Калько // Труды Санкт-Петербургского научно-исследовательского института лесного хозяйства. - 2015. - № 4. - С. 19-34.
- Low-copy microsatellite markers for Pinus taeda L. / C.G. Elsik, V.T. Minihan, S.E. Hall, A.M. Scarpa, C.G. Williams // Genome. - 2000. - V. 43. - P. 550-555.
- Development and characterization of 25 EST-SSR markers in Pinus sylvestris var. mongolica (Pinaceae) / P. Fang [et al.] // Applications in plant sciences. - 2014. - Т. 2. - № 1. - DOI: 10.3732/apps.1300057.
- Cross-amplification and sequence variation of microsatellite loci in Eurasian hard pines / S.C. González-Martínez [et al.] // Theoretical and applied genetics. - 2004. - Т. 109. - № 1. - С. 103-111.
- Single-copy, species-transferable microsatellite markers developed from loblolly pine ESTs / C. Liewlaksaneeyanawin [et al.] // Theoretical and Applied Genetics. - 2004. - Т. 109. - № 2. - С. 361-369.
- Novel polymorphic nuclear microsatellite markers for Pinus sylvestris L. / F. Sebastiani [et al.] // Conservation Genetics Resources. - 2012. - Т. 4. - № 2. - С. 231-234.
- Peakall, R. Genalex 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research / R. Peakall, P.E. Smouse // Molecular Ecol. Notes. - 2006. - N 6. - P. 288-295.
- Кузнецов, В.М. Информационно-энтропийный подход к анализу генетического разнообразия популяций (аналитический обзор) / В.М. Кузнецов // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. - 2022. - Т. 23. - № 2. - С. 159-173.
- Sneath, P.H.A. Numerical Taxonomy.The Principles and Practice of Numerical Classification / P.H.A. Sneath, R.R. Sokal. - San Francisco: W.H. Freeman and Co., 1973. - 549 p.
- Microchecker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data / С. Van Oosterhout, W. Hutchinson, D. Wills, P. Shipley // Molecular Ecol. Resources. - 2004. - № 4. - P. 535-538.
- Wahlund, S. Zusammensetzung von Populationen und Korrelationserscheinungen von Standpunkt der Vererbungslehre aus Betrachet / S. Wahlund // Hereditas. -1928. - V. 11. - P. 65-106.
- Nei, M. Genetic distance between populations / M. Nei // Amer. Natur. - 1972. - V. 106. - P. 283-292.
- Sinclair, W.T. Multiple origins for Scots pine (Pinus sylvestris L.) in Scotland: evidence from mitochondrial DNA variation / W.T. Sinclair, J.D. Morman, R.A. Ennos // Heredity. - 1998. - T. 80. - №. 2. - C. 233-240.
