Генетическое разнообразие и географическое распределение гаплотипов митохондриальной ДНК криптических видов лесных мышей подрода Sylvaemus Западного Кавказа

Автор: Амшокова Альбина Хасмановна, Темботова Фатимат Асланбиевна, Кучинова Екатерина Александровна

Журнал: Известия Самарского научного центра Российской академии наук @izvestiya-ssc

Статья в выпуске: 4-2 т.17, 2015 года.

Бесплатный доступ

Результаты генетического анализа лесных мышей Западного Кавказа, показали, что в его западной части, в пределах Республики Адыгея, симпатрично и симбиотопично обитают две генетически дивергированные линии мышей подрода Sylvaemus (A. uralensis и A. ponticus). В более теплых и влажных условиях равнины и предгорий, а также в лесостепном и поясе широколиственных лесов богатых разнообразными кормовыми ресурсами доминирует A. ponticus. В поясе субальпийских лугов и в пределах верхней границы широколиственных лесов, где биотопы, представлены каменистыми россыпями, напротив, малая лесная мышь. В целом вид A. ponticus на Западном Кавказе генетически более разнороден в сравнении с A. uralensis. Для A. uralensis всего Западного Кавказа установлено наличие сходных гаплотипов, отсутствие географического структурирования выборок, а также минимальные генетические дистанции между ними, что указывает на генетическое единство вида на исследованной территории.

Еще

Генетическое разнообразие, цитохром b, митохондриальная днк, генетическая дистанция, западный кавказ

Короткий адрес: https://sciup.org/148203894

IDR: 148203894

Список литературы Генетическое разнообразие и географическое распределение гаплотипов митохондриальной ДНК криптических видов лесных мышей подрода Sylvaemus Западного Кавказа

Балакирев, А.Е. К вопросу о таксономическом статусе формы ciscaucasicus и ее родственных отношениях с малой лесной мышью Sylvaemus uralensis по данным секвенирования гена цитохрома b мт ДНК/А.Е. Балакирев и др.//Генетика. -2007. -Т. 43. -№12. -С. 1651-1666.
Богданов, А.С. Анализ генетической изменчивости и дифференциации малой лесной мыши Sylvaemus uralensis (Rodentia, Muridae) методом RAPD-PCR/А.С. Богданов, Д.М. Атопкин, Г.Н. Челомина//Известия РАН. Серия биол. -2009. -№3. -С. 276-292.
Doiron, S. A comparative mitogenomic analysis of the potential adaptive value of Arctic charr mtDNA introgression in brook charr populations (Salvelinus fontinalis Mitchill)/S. Doiron, P.U. Blier, L. Bernatchez//Mol. Biol. Evol. 2002. -Vol. 19. -P. 1902-1909.
Гащак, С. О видовом разнообразии мышей рода Sylvaemus в Украине/С. Гащак и др.//Раритетна терiофауна та її охорона. -Луганськ, 2008.-Вып. 9. -С. 80-92.
Амбрамсон, Н.И. Филогеография: итоги, проблемы, перспективы/Н.И. Абрамсон//Вестник ВОГиС. 2007. -Т. II, -№2. -С. 307-331.
Челомина, Г.Н. Филогенетические связи видов и внутривидовых форм лесных мышей рода Sylvaemus по данным частичного секвенирования гена цитохромa b мтДНК/Г.Н. Челомина, Д.М. Атопкин, А.С. Богданов//Генетика. -2007. -Т. 43. -№ 12. -С. 1651-1666.
Hall, T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence aligment editor and analysis program for Windows 95/98/NT/T.A. Hall/Nucl. Asids. Symp. Ser. 1999. -V.41. -95-98.
Tamura K. MEGA 4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0/K. Tamura et. al.//Molecular Biology and Evolution. -2007. -V. 24. -P. 1596-1599.
Nei, M. Molecular Evolutionary Genetics./M. Nei//N.Y.: Columbia Univ. Press, 1987. -512 p.
Bandelt, H.J. Median-Joining Networks for Inferring Intraspecific Phylogenies/H.J. Bandelt, P. Forster, A. Rohl//Mol. Biol. Evol. 1999. -V. 16. -№1. -Р. 37-48.
Kotlik, P. A northern glacial refugium for bank voles (Clethrionomys glareolus)/P. Kotlik, V. Deffontaine, S. Mascheretti//PNAS. 2006. -V.103. -№ 40. -P. 14860-14864.
Амбрамсон, Н.И. Гетическая изменчивость и филогеография рыжей полевки (Clethrionomys glareolus, Arvicolinae, Rodentia) на территории России с анализом зоны интрогрессии мтДНК близкородственного вида -красной полевки (Cl. rutilus)/Н.И. Абрамсон, Е.Н. Родченкова, Ю.А. Костыгов//Генетика. -2009. -Т. 45. -№5. -С. 610-623.
Челомина, Г.Н. Молекулярно-генетические свидетельства глубокого филогенетического разрыва между европейской и азиатской расами малой лесной мыши по данным изменчивости гена цитохрома b мтДНК/Г.Н. Челомина, Д.М. Атопкин//Молекулярная биология. -2010. -Т. 44. -№5. -С.792-803.
Челомин,а Г.Н. Лесные и полевые мыши: молекулярно-генетические аспекты эволюции и систематики/Г.Н. Челомина//Владивосток: Дальнаука, 2005. -205 с.
Martin, Y. Molecular phylogeny of European muroid rodents based on complete cytochrom b sequences/Y. Martin аt. al.//Mol. Phylogenetics and Evolution. -2000. -V. 16. -P. 37-47.
Окулова, Н.М. Биотопическое размещение мелких млекопитающих в горах и предгорьях Краснодарского края и Республики Адыгея/Н.М. Окулова и др.//Млекопитающие горных территорий. Материалы международной конференции. М.: КМК. 2007. -С. 230-233.
Avise, J.C. Phylogeography: the history and formation of species/J.C. Avise//Cambridge; London: Harvard Univ. press, 2000. -447 p.
Сорокин, П.А. Изолированность популяций монгольского дзерена, Procapra gutturosa (Artiodactyla, Bovidae), в прошлом: анализ фрагментов митохондриальной ДНК с разной скоростью мутирования/П.А. Сорокин, М.В. Холодова//Доклады РАН. -2006. -Т. 409(2). -С. 1-2.
Переверзева, В.В. Генетическая структура популяций красной полевки Myodes (Clethrionomys) Rutilus Pallas, 1779 Северного Приохотья по данным об изменчивости нуклеотидных последовательностей гена цитохрома b митохондриальной ДНК/В.В. Переверзева, А.А. Примак, Е.А. Дубинин//Вавилов. журн. генет. и селекции. -2013. -Т. 17. -№ 3. -С. 435-443.
Богданов, А.С. Анализ генетической изменчивости и дифференциации лесных мышей рода Sylvaemus по результатам секвенирования фрагмента гена первой субъединицы цитохромоксидазы/А.С. Богданов и др.//Генетика. -2012. -Т. 48. -№2. -С. 211-224.
Окулова, Н.М. Видовое разнообразие, размещение и численность мелких млекопитающих южных территорий Краснодарского края и республики Адыгея/Н.М. Окулова и др.//Млекопитающие горных территорий. Материалы международной конференции. М.: КМК. -2005. -С. 118-121.

Еще

Статья научная