Генный скрининг в исследовании эндоэкологии человека
Автор: Ильин А.Б., Минькова Н.о, Нурбеков М.К.
Журнал: Вестник Международной академии наук (Русская секция) Электронный ресурс @vestnik-rsias-online
Рубрика: Антропоэкосистемы в биосфере: обеспечение безопасности, здоровья и качества жизни
Статья в выпуске: 2, 2011 года.
Бесплатный доступ
Короткий адрес: https://sciup.org/14315456
IDR: 14315456
Текст статьи Генный скрининг в исследовании эндоэкологии человека
Sholokhov Moscow State Humanitarian University, Moscow, Russia
В широком круге проблем научной экологии, значительное место, занимает экология человека [1]. Высокую актуальность имеют экологические исследования в видах деятельности, в которых физиолого-биохимические обменные процессы в организме человека, происходят ускоренно относительно общей популяции. К такому направлению, относится спорт. Фундаментальных и прикладных экологических исследований в данной области недостаточно, особенно с использованием постгеномных технологий [2].
Современное развитие биотехнологий, особенно значительное снижение стоимости молекулярно-генетических исследований, позволяет углубить изучение и понимание механизмов взаимодействия экологической среды и организма человека на генном, хромосомном и, геномном уровнях, в различных условиях жизнедеятельности.
В рамках лаборатории био-экомониторинга МГГУ им. М.А.Шолохова проводится молекулярный генный скрининг спортсменов с целью исследования кумулятивных эффектов физических нагрузок на различные функциональные системы организма. Исследуются сборные команды России по водному поло, лыжным гонкам и др., видам спорта. Одним из направлений био-экомониторинга спортсменов в настоящее время является, функциональный генный скрининг, в рамках, контроля переносимости тренировочных нагрузок. Актуальность подобных исследований базируется на следующих положениях.
Волевые качества спортсменов, могут, частично компенсировать недостаточный уровень тренированности физических и психических качеств, однако это может приводить к травмам, заболеваниям и даже получившим широкую огласку случаям неожиданной смерти при неполном восстановлении после интенсивных тренировок [3].
В настоящее время ставшие «традиционными» биохимические и физиологические подходы к изучению состояния спортсменов могут быть существенно дополнены технологиями исследований структуры и функции генов и геномных локусов [4].
В обширной научной литературе посвященной данной проблеме существуют достаточно четкие указания на наличие генного контроля важных физиолого-биохимических признаков, среди которых можно выделить комплекс генов белковых факторов – регуляторов ангиогенеза, в частности, генов ферментов внерибосомного этапа белкового синтеза, обеспечивающих взаимосвязь потребности организма спортсмена при определенных видах физических нагрузок с интенсивностью белкового синтеза [5].
Первый этап научной работы по молекулярно-генетической характеристике спортсменов содержал выделение ДНК. Процедура включала осаждение клеток слизистой центрифугированием, обработку осадков препаратами протеиназы К, в соответствующих буферах, содержащих трис-НСl, додецилсульфат натрия и ЭДТА, инкубацию в течение 2 часов при 550С, обработку фенолом, хлороформом, осаждение спиртом и растворение в стерильном буфере ТЕ (10 мМ трис-НСl, рН 7,5; 1 мМ ЭДТА). Электрофорез проводили в 0,7% геле в ТАЕ буфере (20 М трис-ацетатный буфер рН 8,5, сод. 1 мМ ЭДТА).
На втором этапе работы был проведен компьютерный подбор затравок для тестирования гена одной из АРСаз – триптофанил-тРНК-синтетазы (ТРСазы) наиболее тесно связанной с обеспечением функционирования сердечнососудистой и иммунной систем.
Реакция амплификации и РТ-ПЦР осуществлялась как в работе [6]. Параметры температуры для ПЦР-реакции, 94°С – денатурация; 68°С – отжиг; 72°С – элонгация. Всего 30 циклов. Оптимизация условий амплификации, включающая подбор состава буфера (в основном концентрации иона магния) и температуры «отжига», определяющих специфичность связывания затравки с изучаемыми участками гена, позволяет по скорости накопления или количеству образовавшегося в результате ПЦР специфического амплификата ДНК строго ожидаемого размера судить о степени реактивности иммунной системы и восстанавливающих систем организма спортсмена. Параметры температуры для ПЦР-реакции. 94°С – денатурация; 68°С – отжиг; 72°С – элонгация. Всего 30 циклов.
В результате молекулярно-генетического исследования уровня адаптации иммунной системы и степени восстанавливаемости сердечно-сосудистой системы, после нормализации с учетом вероятности разброса данных, были выявлены спортсмены с низким уровнем адаптации иммунной системы и восстановления сердечно-сосудистой системы. В лаборатории содержится база данных ДНК спортсменов, с возможностью ее последующего пополнения, дальнейших, фундаментальных и прикладных научных исследований.
Антропоэкосистемы в биосфере: обеспечение безопасности, здоровья и качества жизни РАЗДЕЛ 1
Список литературы Генный скрининг в исследовании эндоэкологии человека
- Келина Н.Ю., Безручко Н.В. Экология человека. -Ростов н/Д: Феникс, 2009. -394 с.
- Неумывакин И.П., Неумывакина Л.С. Эндоэкология здоровья. -СПб.: Диля, 2005. 539 с.
- Corrado D.,Basso C., Schiavon M., Pelliccia A., Thiene G., Pre-Participation Screening of Young Competitive Athletes for Prevention of Sudden Cardiac Death. J Am Coll Cardiol, 2008, v. 52, p. 1981-1989
- Hardy J., Singleton A. Genomewide association studies and human disease. N Engl J Med. 2009, v. 360(17):1759-68.
- Park S.G., Schimmel P., Kim S. Aminoacyl tRNA synthetases and their connections to disease. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008, v. 105(32),p.11043-11049.
- Liu J., Shue E., Ewalt K.L., Schimmel P. A new gamma-interferon-inducible promoter and splice variants of an anti-angiogenic human tRNA synthetase. Nucleic Acids Res. 2004, v. 32(2), p.719-727.