Характеристика бактерий, выделенных из рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край)
Автор: Пьянкова А.А., Усанина Д.И., Алеев В.С., Блинов С.М., Плотникова Е.Г.
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 4, 2020 года.
Бесплатный доступ
Из глинистых отложений рассолоотводящих выработок и рассолосборников рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край) было выделено 29 штаммов галофильных/галотолерантных бактерий. В результате филогенетического анализа, проведенного на основе сравнения последовательностей гена 16S рРНК, было установлено, что выделенные культуры являются представителями классов Gammaproteobacteria (семейств Halomonadaceae и Salinisphaeraceae) и Bacilli (семейства Bacillaceae). Три галофильных штамма SHV2, RV14 и SWV1 имели сходство с ближайшим типовым штаммом вида Salinisphaera hydrothermalis на уровне 95.94-96.62% (ген 16S рРНК), что указывает на принадлежность этих штаммов к новому таксону. Большинство выделенных бактерий семейств Halomonadaceae и Bacillaceae являются экстремофилами: растут при рН 9-10 и высокой солености среды (до 250-270 г/л NaCl). У двух галофильных штаммов рода Halomonas обнаружена способность к деструкции салициловой и бензойной кислот (продуктов разложения полиароматических соединений), что делает их перспективными для использования в биотехнологиях восстановления загрязненных территорий с высоким уровнем минерализации.
Верхнекамское месторождение солей, галофильные и галотолерантные бактерии, гены 16S рРНК
Короткий адрес: https://sciup.org/147229667
IDR: 147229667 | DOI: 10.17072/1994-9952-2020-4-312-320
Список литературы Характеристика бактерий, выделенных из рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край)
- Ананьина Л.Н. и др. Salinicola socius gen. nov., sp. nov. - умеренно галофильная бактерия из ассоциации микроорганизмов, утилизирующей нафталин // Микробиология. 2007. Т. 76, № 3. С. 369-376.
- Егорова Д. О. и др. Особенности разложения хлорированных бифенилов штаммом Rhodococcus wratislaviensis KT112-7 в условиях засоления // Прикладная биохимия и микробиология. 2018. Т. 54, № 3. С. 253-263.
- Кандаурова Ю.М., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Новый галотолерантный штамм-деструктор фталатов Halomonas sp. PG1 // История и методология физиолого-биохимических и почвенных исследований: материалы конф. Пермь, 2017. С. 71-73.
- Карташова Ю.А. и др. Изучение некультивируе-мых бактерий глубинной породы мергеля (Верхнекамское месторождение, Пермский край) // Биология - наука XXI века: материалы 21 междунар. Пущинской школы-конф. молодых ученых. Пущино, 2017. С. 23.
- Кашапова Л.Э. и др. Молекулярно-генетические подходы к изучению микроорганизмов глубинной породы карналлита Верхнекамского месторождения солей // Высокие технологии, определяющие качество жизни: материалы междунар. науч. конф. Пермь, 2018. С. 52-55.
- Корсакова Е.С. Культивируемые аэробные бактерии из района промышленных разработок Верхнекамского месторождения солей: дис. ... канд. биол. наук. Пермь, 2014. 150 с.
- Корсакова Е.С. и др. Разнообразие бактерий семейства Halomonadaceae района разработок Верхнекамского месторождения солей // Микробиология. 2013. Т. 82, № 2. С. 247-250.
- Корсакова Е.С. и др. Микробное разнообразие в глинисто-солевых шламах калийного предприятия (г. Березники, Пермский край) // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2017. Вып. 1. С. 70-79.
- Методы общей бактериологии: пер. с англ. М.: Мир, 1983. Т. 1-3.
- Практикум по агрохимии: учеб. пособие. М.: Изд-во МГУ, 2001. 689 с.
- Пьянкова А.А., Ананьина Л Н. Оптимизация условий культивирования штамма Chromohalobac-ter sp. TC193 для увеличения биосинтеза экто-ина // Материалы V международной конференции молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2018. С. 97-99.
- Пьянкова А.А., Кашапова Л.Э., Плотникова Е.Г. Бактерии глубинной породы каменной соли (Верхнекамское месторождение солей) // Материалы XI Всерос. конгресса молодых ученыхбиологов с междунар. участием. Пермь, 2019. С. 65-66.
- Реутских Е.М., Саралов А.И. Exiguobacterium sp. RS34 - галоалкалотолерантная факультативно анаэробная неспорообразующая бактерия порядка Bacillales из шламохранилища калийного рудника // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2012. Вып. 3. С. 49-53.
- Ястребова О.В., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы фталатов, выделенные из района промышленной добычи и переработки калийно-магниевых солей // Прикладная биохимия и микробиология. 2019. Т. 55, № 4. С. 378-385.
- Ястребова О.В, Корсакова Е.С., Плотникова Е.Г. Характеристика бактерий семейства Micrococ-caceae, выделенных из разных биотопов района солеразработок (Пермский край) // Известия Самарского научного центра РАН. 2018. Т. 20, №5(2). С. 300-306.
- Ai L., Huang Y., Wang C. Purification and characterization of halophilic lipase of Chromohalobacter sp. from ancient salt well // J. Basic. Microbiol. 2018. Vol. 58, № 8. P. 647-657.
- Anan'ina L.N. et al. Naphthalene-degrading bacteria of the genus Rhodococcus from the Verkh-nekamsk salt mining region of Russia // Antonie van Leeuwenhoek. 2011. Vol. 100. P. 309-316.
- Edbeib M.F., Wahab R.A., Huyop F. Halophiles: biology, adaptation, and their role in decontamination of hypersaline environments // World J. Microbiol. Biotechnol. 2016. Vol. 32. P. 135.
- Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Eds Stackebrandt E., Goodfellow M. New York.: John Wiley and Sons. 1991. P. 115-175.
- Megaw J., Gilmore B.F. Draft genome sequence of Halomonas sp. CSM-2, a moderately halophilic bacterium isolated from a triassic salt mine // Microbiol. Resour. Announc. 2018. Vol. 26, № 7(3). P. e00836-18.
- Nanca C.L. et al. Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by moderately halophilic bacteria from Luzon alt Beds // J. Health Pollut. 2018. Vol. 8, № 19. P. 180915.
- Plotnikova E.G. et al. Thalassospira permensis sp. nov., a novel halotolerant bacterium isolated from a naphthalene-utilizing microbial consortium // Microbiology. 2011. Vol. 80, № 5. Р. 703-712.
- Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Develop. Ind. Microbiol. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23-32.
- Romano I. et al. Oceanobacillus oncorhynchi subsp. incaldanensis subsp. nov., an alkalitolerant halo-phile isolated from an algal mat collected from a sulfurous spring in Campania (Italy), and emended description of Oceanobacillus oncorhynchi // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. Vol. 56. P. 805-810.
- Versalovic J. et al. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction // Meth. Cell Mol. Biol. 1994. Vol. 5. P. 25-40.
- Yastrebova O. V. et al. Aerobic spore forming bacteria from the region of salt mining // Russian Journal of Ecology. 2009. Vol. 40, № 7. P. 516-521.
