Идентификация гена устойчивости к антракнозу Lanr1 у люпина узколистного ( Lupinus angustifolius L.) с помощью ДНК-маркеров AnSeq3 и AnSeq4
Автор: Гришин С.Ю., Заякин В.В., Нам И.Я., Агеева П.А., Лукашевич М.И., Купцов Н.С.
Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology
Рубрика: Молекулярная структура генома и селекция
Статья в выпуске: 1 т.50, 2015 года.
Бесплатный доступ
Антракноз - заболевание люпина узколистного ( Lupinus angustifolius L.), вызываемое грибом Colletotrichum lupini. Устойчивость к нему носит не абсолютный, а относительный характер: высокоустойчивые образцы могут поражаться инфекцией, но в меньшей степени, чем неустойчивые растения. Относительно общего числа генов, связанных с толерантностью к антракнозу, до сих пор нет единого мнения. В настоящее время селекционеры из разных стран заняты созданием более устойчивых к антракнозу сортов посредством объединения в одном генотипе неаллельных генов устойчивости к болезни. Для быстрого и эффективного отбора устойчивых растений разрабатываются ДНК-маркеры, сцепленные с генами устойчивости к заболеванию. Прежде чем использовать ДНК-маркеры в селекции, необходим предварительный анализ их эффективности для тех или иных селекционных образцов из-за возможных «ложноположительных» результатов. Наиболее близкими к Lanr1 представляются ДНК-маркеры AnSeq3 и AnSeq4 (однонуклеотидные полиморфизмы - single nucleotide polymorphisms, SNPs), которые фланкируют ген на расстоянии 0,9 сМ (H. Yang et al., 2012). В настоящей работе мы исследовали возможность использования ДНК-маркеров AnSeq3 и AnSeq4 в селекции российских и белорусских сортов люпина узколистного на устойчивость к антракнозу. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) применяли для выявления аллелей ДНК-маркеров, сцепленных с геном Lanr1 устойчивости к антракнозу люпина узколистного. Объектами для изучения служили 50 сортов и образцов люпина российской, белорусской, польской и австралийской селекции. ДНК выделяли индивидуально из семян в 3-кратной повторности. Представлен список селекционных образцов, а также состав реакционной смеси для ПЦР и условия амплификации ДНК. Для ПЦР использовали ферменты и реактивы фирмы «СибЭнзим» (Россия), праймеры к маркерам AnSeq3 и AnSeq4 сайтспецифичны и синтезированы фирмой «Синтол» (Россия). Электрофорез в полиакриламидном геле применяли для разделения маркерных аллелей. Устойчивый и восприимчивый к антракнозу австралийский селекционный материал использовался в качестве контролей для аллелей AnSeq3 и AnSeq4. ДНК-фрагменты длиной 92 и 87 п.н., соответствующие маркерам AnSeq3 и AnSeq4, были получены для всех 50 селекционных образцов, включенных в исследование. Для 13 сортов российской и 10 сортов польской селекции были обнаружены маркерные аллели, соответствующие восприимчивости к антракнозу. Для белорусского селекционного образца БГБ-6 аллели устойчивости были выявлены по маркерам AnSeq3 и AnSeq4, для сорта Миртан - только по маркеру AnSeq3. Остальным 21 образцам белорусской селекции соответствовали аллели восприимчивости к антракнозу. Ранее с помощью других ДНК-маркеров - AntjM1 и AntjM2 мы показали, что современные сорта Всероссийского НИИ люпина не содержат устойчивых маркерных аллелей, сцепленных с геном Lanr1. Проведенные исследования показали, что ДНК-маркеры AnSeq3 и AnSeq4, сцепленные с геном Lanr1, могут быть полезны в селекции российских и белорусских сортов на устойчивость к антракнозу.
Антракноз, полимеразная цепная реакция (пцр), днк-маркеры anseq3
Короткий адрес: https://sciup.org/142133566
IDR: 142133566 | DOI: 10.15389/agrobiology.2015.1.30rus
Список литературы Идентификация гена устойчивости к антракнозу Lanr1 у люпина узколистного ( Lupinus angustifolius L.) с помощью ДНК-маркеров AnSeq3 и AnSeq4
- Nirenberg H.I., Feiler U., Hagedorn G. Description of Colletotrichum lupini comb. Nov. in modern terms. Mycologia, 2002, 94: 307-320 ( ) DOI: 10.2307/3761809
- Купцов Н.С., Шор В.Ч., Шашко Ю.К. Антракноз люпина и как с ним бороться. Белорусское сельское хозяйство, 2010, 7: 20-23.
- Евсиков Д.О., Иванюк В.Г. Антракноз люпина и меры борьбы с ним. Весцi Акадэмii аграрных навук Рэспублiкi Беларусь, 2001, 4: 57-64.
- Купцов Н.С., Такунов И.П. Люпин. Генетика, селекция, гетерогенные посевы. Клинцы, 2006.
- Cowling W.A. Pedigrees and characteristics of narrow-leafed lupin cultivars released in Australia from 1967 to 1998. Bulletin 4365, Agriculture Western Australia, 1999.
- Buirchell B.J., Yang H. Breeding narrow-leafed lupins in Western Australia for yield, disease resistance and quality using recurrent selection and molecular markers. Mexico, where old and new world lupins meet. Proc. the 11th Int. Lupin Conferense. Guadalajara, Jalisco, Mexico, May 4-9, 2005. ILA, Canterbury, New Zealand, 2005: 10-13.
- Yang H., Boersma J.G., You M., Buirchell B.J., Sweetingham M.W. Development and implementation of a sequence-specific PCR marker linked to a gene conferring resistance to anthracnose disease in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Mol. Breed., 2004, 14: 145-151 ( ) DOI: 10.1023/B:MOLB.0000038003.49638.97
- You M., Boersma J.G., Buirchell B.J., Sweetingham M.W., Siddique K.H.M., Yang H. A PCR-based molecular marker applicable for marker-assisted selection for anthracnose disease resistance in lupin breeding. Cel. Mol. Boil. Let., 2005, 10: 123-134.
- Yang H., Tao Y., Zheng Z., Li C., Sweetingham M.W., Howieson J.G. Application of next-generation sequencing for rapid marker development in molecular plant breeding: a case study on anthracnose disease resistance in Lupinus angustifolius L. BMC Genomics, 2012, 13: 318 ( ) DOI: 10.1186/1471-2164-13-318
- Yang H., Renshaw D., Thomas G., Buirchell B., Sweetingham M. A strategy to develop molecular markers applicable to a wide range of crosses for marker assisted selection in plant breeding: a case study on anthracnose disease resistance in lupin (Lupinus angustifolius L.). Mol. Breed., 2008, 21: 473-483 ( ) DOI: 10.1007/s11032-007-9146-2
- Гришин С.Ю., Заякин В.В., Нам И.Я. Аллельный полиморфизм ДНК-маркеров устойчивости к антракнозу AntjM1, AntjM2 у российских и белорусских сортов люпина узколистного Lupinus angustifolius (L.). Досягнення i проблеми генетикi, селекцiї, та бiотехнологiї: зб. наук. пр. Киев, 2012, т. 4: 291-295.
- Ruge-Wehling B., Dieterich R., Thiele C., Eickmeyer F., Wehling P. Resistance to anthracnose in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.): sources of resistance and development of molecular markers. Journal für Kulturpflanzen, 2009, 61: 62-65.
- Агеева П.А., Почутина Н.А. Реализация биологического потенциала культуры узколистного люпина селекционным путем. Кормопроизводство, 2005, 6: 6-8.
- Артюхова А.В., Гришин С.Ю., Лукашевич М.И., Заякин В.В., Нам И.Я. Разработка метода паспортизации сортов люпина. Вестник Брянского государственного университета, 2010, 4: 82-85.
- Календарь Р.Н., Глазко В.И. Типы молекулярно-генетических маркеров и их применение. Физиология и биохимия культурных растений, 2002, 34(4): 279-296.
- Купцов Н.С. Внутривидовое разнообразие узколистного люпина (Lupinus angustifolius L.) и его использование в селекции. Научные труды по земледелию и растениеводству БелНИИЗК, 1999, 36: 77-85.
- Наумкин В.Н., Артюхов А.И., Лукашевич М.И., Агеева П.А. Перспективы культуры люпина в юго-западной части Центрально-Черноземного региона. Бюллетень научных работ (Белгородская государственная сельскохозяйственная академия), 2008, 15: 3-9.
- Саук И.Б., Анохина В.С., Тимошенко М.К., Цибульская И.Ю., Брыль Е.А. Морфогенетические и биохимические исследования коллекции желтого и узколистного люпина. Молекулярная и прикладная генетика, 2008, 8: 133-137.
- Boersma J.G., Pallotta M., Li C., Buirchell B.J., Sivasithamparam K., Yang H. Construction of a genetic linkage map using MFLP and identification of molecular markers linked to domestication genes in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Cel. Mol. Biol. Let., 2005, 10: 331-344.
- Yang H., Sweetingham M.W., Cowling W.A., Smith P.M.C. DNA fingerprinting based on microsatellite-anchored fragment length polymorphisms, and isolation of sequence-specific PCR markers in lupin (Lupinus angustifolius L.). Mol. Breed., 2001, 7: 203-209 ( ) DOI: 10.1023/A:1011363205557