Интерпретация результатов количественного генетического анализа на основе аппроксимации кинетической кривой полимеразной цепной реакции в реальном времени

На полимерных микрофлюидных устройствах из поликарбоната и полипропилена реализована количественная полимеразная цепная реакция в реальном времени (ПЦР-РВ). Пороговый цикл определяется на основе точки перегиба функции логистического роста первого порядка, достоверно аппроксимирующей кривую ПЦР при отсутствии мешающих факторов, например наличия пузырей в реакционной камере. Использование статистических критериев (обобщенный критерий Стьюдента, однофакторный дисперсионный анализ) выявило незначимость влияния типа полимера на оценку положения порогового цикла при выбранном ранее алгоритме его поиска. При применении альтернативного алгоритма нахождения порогового цикла на основе построения касательной к кинетической кривой в ряде случаев наблюдается значимое влияние типа полимера на оценку положения порогового цикла и, как следствие, на результат количественного анализа. Предложены и обсуждены алгоритмы обнаружения пузырей в реакционной камере на основе выявления разладки в последовательности измерений, связанные как с оценками параметров аппроксимирующей зависимости, так и с характеристиками временнóго ряда, сформированного погрешностями аппроксимации.