Изучение конкурентного взаимодействия ионов серебра с цистеинсодержащими пептидами и серосодержащими аминокислотами c помощью ESI-MS
Автор: Новиков А.В., Бубляев Р.А., Краснов Н.В., Козьмин Ю.П., Кураева Т.Е., Миргородская О.А.
Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie
Рубрика: Оригинальные статьи
Статья в выпуске: 4 т.17, 2007 года.
Бесплатный доступ
Проведено исследование особенностей взаимодействия ионов серебра с серосодержащими аминокислотами и цистеинсодержащими пептидами. С помощью времяпролетного масс-спектрометра с электрораспылением и ортогональным вводом ионов (ESI-о-TOF) доказано, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают цистеин (Cys) и гомоцистеин (Hcy), причем как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цистеина в пептидах. Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеинсодержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.
Короткий адрес: https://sciup.org/14264508
IDR: 14264508
Текст научной статьи Изучение конкурентного взаимодействия ионов серебра с цистеинсодержащими пептидами и серосодержащими аминокислотами c помощью ESI-MS
Проведено исследование особенностей взаимодействия ионов серебра с серосодержащими аминокислотами и цистеинсодержащими пептидами. С помощью времяпролетного масс-спектрометра с электрораспылением и ортогональным вводом ионов (ESI-о-TOF) доказано, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают цистеин (Cys) и гомоцистеин (Hcy), причем как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цистеина в пептидах. Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеинсодержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.
ВВЕДЕНИЕ В качестве лигандов для изучения взаимодей ствия с ионами серебра нами выбраны серосодер-
В настоящее время во всем мире интенсивно изучается влияние ионов серебра на здоровье человека и окружающую среду [1]. Ряд исследований посвящен изучению бактерицидных свойств этих ионов [2–6]. Отмечено также токсическое действие ионов серебра, обусловленное способностью накапливаться в организме человека, что приводит к возникновению такого заболевания, как аргироз, или аргирия [1].
Специфичность взаимодействия ионов серебра с компонентами биологических систем до сих пор мало изучена, что во многом обусловлено рядом методических сложностей. Настоящая работа призвана заполнить пробел в понимании специфичности связывания ионов серебра с серосодержащими группами, входящими с состав пептидов и белков. В качестве метода исследований использована масс-спектрометрия с ионизацией электрораспылением (ESI-MS), которая в настоящее время широко используется для изучения взаимодействия ионов металлов с различными биологически значимыми пептидами и белками [7, 8]. Этот тип ионизации является наиболее "мягким", поскольку не разрушает комплексы (т. е. фрагментация комплексов может произойти лишь при специальных условиях), и, кроме того, позволяет анализировать вещества непосредственно в растворах. К тому же характерное распределение изотопного состава распространенного в природе серебра (51.35 % Ag107 и 48.65 % Ag109) позволяет однозначно выявлять ионы, образующиеся с его участием.
жащие аминокислоты — цистеин (Cys), гомоцистеин (Hcy) и метионин (Met), а в качестве модельных пептидов — цистеинсодержащие синтетические пептиды. Выбор пептидов в качестве таких объектов представляется весьма удачным, т. к. они являются фрагментами белковых молекул, а также удобны с методической точки зрения.
Трудности при изучения взаимодействия ионов серебра с лигандами во многом обусловлены тем, что при регистрации комплексообразования проблематично оценить количественные соотношения свободных и связанных ионов металлов в растворе. С помощью ESI-MS оказалось возможным изучить распределение ионов серебра между лигандами как при достаточной концентрации ионов металла, так и в условиях конкурентной борьбы за "обладание" металлом при недостаточной его концентрации.
РЕЗУЛЬТАТЫ ЭКСПЕРИМЕНТОВ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
Серебро из раствора AgNO 3 в водно-ацетонитрильной смеси (1:1 по объему) в присутствии 1 %-й уксусной кислоты регистрировалось в виде однозарядных кластерных ионов с одной ( m / z = 147.93 и 149.93) или двумя ( m / z = 187.95 и 189.95) молекулами ацетонитрила (рис. 1).
Это свидетельствует о "склонности" ионов серебра к образованию комплексных соединений, в данном случае с ацетонитрилом, концентрация которого в данном случае на 5 порядков превышает
н u о я м к о к о н к К

(CH 3 CN) 2 107Ag+
(CH 3 CN) 1 107Ag+
(CH 3 CN) 2 109Ag+
(CH 3 CN) 1 109Ag+
100 120 140
160 180 m / z
Рис. 1. Масс-спектр раствора AgNО 3 в CH 3 CN
Табл. 1. Результаты масс-спектрометрической регистрации ионов серебра и гомоцистеина в сульфгидрильной форме (Hcy) и в виде дисульфида (Hcy2) при различных соотношениях их концентраций
Масс-спектрометрическое исследование взаимодействия серосодержащих аминокислот с серебром
Выбранные аминокислоты — Сys, Hcy и Met легко регистрируются в ESI-MS в виде протонированных ионов.
Для гомоцистеина отмечено спонтанное обра- зование его дисульфида (Hcy2) (см. рис. 2, а). При внесении в раствор гомоцистеина AgNO3 в концентрациях, меньших чем аминокислоты, в масс-спектре наблюдается уменьшение интенсивности Hcy по сравнению с Hcy2 (см. рис. 2, б). Отметим, что в спектре отсутствуют любые ионы, содержащие серебро. При внесении избытка AgNО3 по сравнению с гомоцистеином в спектре регистрируется только Hcy2 и кластеры серебра с ацетонитрилом. Интенсивности всех регистрируемых ионов представлены в табл. 1.
Аналогичным образом ведет себя и Cys. Как в случае гомоцистеина, так и в случае цистеина при концентрациях AgNO 3 , меньших концентраций
Интенсивность Интенсивность

Рис. 2. ESI-спектр 25 мкмоль гомоцистеина без AgNO 3 (а) и с добавлением 20 мкмоль AgNO 3 (б)

Рис. 3. ESI-масс-спектр Met в присутствии 30 мкмоль AgNO 3 при соотношении их концентраций 1:1 (а) и 10:1 (б)
аминокислот, регистрируются только их сульфгидрильные формы, а при избытке AgNO 3 регистрируются только комплексы серебра с ацетонитрилом. При эквивалентном соотношении реагентов в спектре не видно ни ионов серебра, ни соответствующих ионов аминокислот. Можно полагать, что осуществляется ковалентная модификация сульфгидрильных форм этих аминокислот серебром с образованием нерастворимых продуктов.
Совершенно по-иному ведет себя Met. В эквимолярных концентрациях помимо протонированной формы Met в спектре появляются комплексы ионов серебра как с одной молекулой Met, так и с двумя (рис. 3, а).
Увеличение концентрации Met в 10 раз приводит к увеличению выхода ионов с Ag+, при этом значительно возрастает интенсивность ионов димера Met по сравнению с его мономерной формой (рис. 3, б).
Масс-спектрометрическое исследование взаимодействия пептидов P1 и P2 с серебром, в том числе для P 1 в присутствии Cys или Met
Для изучения взаимодействия пептидов с ионами серебра были использованы синтетические пептиды в виде амидов, аминокислотная последовательность которых и соответственно аминокислотный состав представлены в табл. 2.
Табл. 2. Характеристика пептидов, использованных для изучения взаимодействия с AgNO3
№ |
Пептид |
Аминокислотная последовательность |
М**(Да) |
1 |
P 1 |
Ac-DAEFRHDSGYEVHHQKGGGC |
2267.97 |
2 |
P 2 |
YCAAAACRL |
938.44 |
3 |
P 2 * |
YCAAAACRL |
936.44 |
Примечание . * — дисульфидная форма (SS) P 2 , ** — моноизотопная масса.
Tабл. 3. Состав и интенсивности регистрируемых ионов Р 1 в присутствии AgNO 3 , и в том числе Cys или Met
№ |
Состав смеси (мкмоль) |
Нормированные интенсивности ионов |
||||
Р 1 |
AgNO 3 |
Met |
Cys |
Р 1 |
Р 1 -2Ag |
|
1 |
8 |
0 |
0 |
0 |
1 |
0 |
2 |
8 |
8 |
0 |
0 |
0.84 |
0.16 |
3 |
8 |
30 |
0 |
0 |
0.34 |
0.66 |
4 |
8 |
30 |
0 |
10 |
0.72 |
0.28 |
5 |
8 |
30 |
0 |
20 |
0.81 |
0.19 |
6 |
8 |
30 |
0 |
30 |
1 |
0 |
7 |
8 |
30 |
220 |
0 |
0.51 |
0.49 |
8 |
8 |
30 |
550 |
0 |
0.55 |
0.45 |

Пептид с массой 2267.97 (P 1 ) представлен широким набором аминокислот, в том числе теми, которые могли бы (помимо Cys) выступать в качестве сайтов для комплексообразования. Эксперимент показал, что этот пептид регистрируется в виде 2–5-зарядных ионов в зависимости от условий ионизации. Однако наиболее интенсивными во всех случаях являются 4- и 3-зарядные ионы, как это показано на рис. 4, а.
В присутствии ионов серебра в эквивалентных концентрациях и выше (использованные концентрации реагентов указаны в табл. 3 под № 2, 3) в масс-спектре этого пептида появляются дополнительно 3- и 4-зарядные ионы с серебром, причем эти ионы преимущественно содержат два атома Ag, как это следует из рис. 4, б. Учитывая этот факт, а также способность Cys к ковалентному связыванию, можно полагать, что оба атома Ag связаны именно с Cys: один — ковалентно по сульфгидрильной группе в виде SАg, другой — в виде иона Аg+.
Для выявления других потенциальных сайтов связывания ионов серебра данный пептид был обработан трипсином таким образом, чтобы была отделена часть, содержащая Cys. К полученному гидролизату был добавлен AgNO 3 . Как следует из масс-спектра, представленного на рис. 5, регистрируются ионы, соответствующие следующим триптическим фрагментам Р1: однозарядного иона Т 1-5 с m / z = 679.3 и Т 1-16 в виде двухзарядного и трехзарядного ионов с m / z = 998.9 и m / z = 666.3 соответственно. Ионов с Ag+ не наблюдается, что свидетельствует, что при выбранных концентрациях компонентов комплексообразования не происходит. Вместе с тем в спектре отсутствует соответствующий ион пептида GGGCNH2, который, по-видимому, теряет растворимость аналогично Cys и Hcy после взаимодействия с AgNO 3 .
Для оценки конкурентного взаимодействия

Рис. 5. Масс-спектр триптического гидролизата 8 мкмоль P1 в присутствии 30 мкмоль AgNO3
остатка Cys в Р 1 с серосодержащими аминокислотами приготовлены смеси Р 1 с Cys и Р 1 с Met при концентрациях реагентов, указанных в табл. 3 под № 4–8.
Исходное соотношение концентраций Р 1 и AgNO 3 было выбрано тем же, что и в предыдущем эксперименте (табл. 3, № 3). Из полученных данных (табл. 3, № 4–6) следует, что введение Cys приводит к уменьшению интенсивности иона комплекса пептида с двумя атомами серебра (Р 1 -2Ag)+3; +4. При достижении эквимолярного соотношения концентраций Cys и AgNO 3 ионы (Р 1 -2Ag)+3; +4 полностью исчезают.
В той же таблице (табл. 3, № 6, 7) приведены результаты масс-спектрометрического анализа поведения другого конкурентного лиганда — Met. В этом случае даже при гораздо более высоких концентрациях Met (см. № 8), нежели в присут- ствии Cys (см. № 4–6), интенсивность ионов (Р1-2Ag)+3; +4 лишь несколько снижалась относительно интенсивности ионов Р1.
Несмотря на то что спектральные интенсивности не могут отражать абсолютные концентрации, тем не менее зависимость относительных концентраций разных типов ионов от состава среды способна выявить тенденцию. Однозначным во всех случаях является присутствие или отсутствие какого-либо иона. Так, полное исчезновение ионов (Р1-2Ag)+3; +4 в присутствии аминокислоты Cys указывает на то, что сродство серебра к свободному Cys выше, чем к Cys, присутствующему в P1.
На тех же основаниях является убедительным заключение о том, что Met является заведомо более слабым конкурентом для P 1 , чем Cys.
Использование другого модельного пептида — Р2 для изучения взаимодействия с AgNO3 пред- ставлялось целесообразным из нескольких соображений. Во-первых, в этом пептиде присутствуют два остатка Cys. Во-вторых, этот пептид максимально способен образовывать двухзарядные ионы, что удобно для их интерпретации. В-третьих, этот пептид благодаря способности к спонтанному образованию дисульфидных связей в растворе присутствует в двух формах (см. табл. 2, № 2), что позволяет сопоставить сродство к серебру сульфгидрильных групп и дисульфидных связей.
Для масс-спектрометрического изучения взаимодействия пептида Р 2 с серебром были выбраны два раствора в которых к 22 мкмоль пептида было добавлено в первом варианте — 50 мкмоль AgNO 3 , во втором — 150 мкмоль AgNO 3 , масс-спектры которых представлены на рис. 6.

Рис. 6. ESI-масс-спектры смесей 22 мкмоль Р2 с AgNO3 в концентрациях 50 мкмоль (а) и 150 мкмоль (б)
Табл. 4. Состав и интенсивности регистрируемых ионов в растворах, содержащих 22 мкмоль пептида в двух формах (P2 и *P2) в присутствии AgNO3
№ |
AgNO 3 (мкмоль) |
Типы ионов и их интенсивности |
||||
* P2 |
(P 2 -1Ag)+2 |
(P 2 -2Ag)+2 |
(P 2 -3Ag)+2 |
(2P 2 -4Ag)+3 |
||
1 |
50 |
6250 |
2829 |
3750 |
3987 |
2385 |
2 |
150 |
7270 |
0 |
2533 |
4341 |
0 |
Предварительные эксперименты показали, что пептид, содержащий два Cys, присутствует в растворе в виде двух форм — сульфгидрильной (P 2 ) и дисульфидной (*P 2 ) с соотношениями интенсивностей ~ 2:1 соответственно (данные не показаны).
Из масс-спектра, представленного на рис. 6, а, видно, что при добавлении AgNO 3 в концентрации 50 мкмоль к раствору пептида с содержанием 30 мкмоль SH-групп следует:
-
• полностью исчезает сульфгидрильная форма пептида (P 2 );
-
• P 2 регистрируется исключительно в виде ионов, содержащих атомы серебра; типы регистрируемых ионов и их интенсивности представлены в табл. 4 под № 1;
-
• дисульфидная форма пептида (*P 2 ) регистрируется в виде одно- и двухзарядных ионов без атомов серебра.
Увеличение концентрации ионов серебра в ~ 3 раза (см. рис. 6, б) изменяет и состав регистрируемых ионов P 2 , содержащих атомы серебра, и их интенсивности (см. табл. 4, № 2).
Удивительной особенностью пептида P 2 явилось отсутствие у него способности образовывать ионы с 4 атомами серебра, несмотря на наличие у него двух сульфгидрильных групп, даже при избытке (150 мкмоль) в растворе AgNO 3 . По аналогии с поведением пептида P 1 , казалось бы, можно было ожидать присоединения по паре атомов серебра на каждый из двух остатков цистеина, в то время как в действительности образовывались ионы лишь с тремя атомами серебра. Кроме того, при меньшей концентрации AgNO 3 (50 мкмоль) зарегистрированы ионы с одним атомом серебра (P 2 -1Ag)+2.
Такое поведение пептида P2 легко объясняется наличием остатка аргинина (Arg) в непосредственной близости от одного из остатков цистеина. Это соседство не влияет на образование ковалентной связи цистеина с первым атомом серебра, но мешает образованию заряженного комплекса со следующим ионом Ag+. Присоединению Ag+ здесь мешает уже имеющийся в этих условиях положительный заряд на протонированной гуанидиновой группе соседнего аргинина. Таким образом, присоединение иона Ag+ оказывается здесь возможным лишь к удаленному от аргинина остатку Cys, уже связанному ковалентной связью с атомом серебра.
Таким образом, модельный пептид Р 2 дополнил наши представления о взаимодействии серебра с цистеинсодержащими пептидами, указывая на особое влияние микроокружения вблизи остатков Cys.
ВЫВОДЫ
ESI-масс-спектрометрия показала себя превосходным методом для исследования особенностей конкурентного взаимодействия ионов серебра с аминокислотами и пептидами.
Проведенное нами исследование взаимодействия серосодержащих аминокислот с ионами серебра показало, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают Cys и Hcy. Причем, это преобладание наблюдалось как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цистеина в пептидах.
Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеинсодержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В работе использована уксусная кислота и ацетонитрил производства фирмы Merck; аминокислоты: L-метионин, L-цистеин и D-, L-гомоцистеин (Sigma).
Синтез пептидов осуществляли на твердофазном синтезаторе (Intavis AG, Германия) аналогично схеме, описанной в работе [9]. Оба пептида были синтезированы в виде амидов. По завершении синтеза смолу промывали три раза дихлорметаном (Merck, Германия) и высушивали в токе азота в течение 15 мин. Последующее отщепление пепти- да от смолы и снятие защитных боковых групп выполняли при 21 оС в смеси TFA (Fluka, Германия), триизопропилсилана и воды MilliQ (Millipore, США) в объемном соотношении 95 : 2.5 : 2.5. По истечении двух часов пептиды осаждали холодным (0 оС) трет-бутилметиловым эфиром (Fluka). Пептидный преципитат перерас-творяли в 1%-й водной уксусной кислоте и лиофилизовали.
Масс-спектрометрические измерения проводились на времяпролетном масс-спектрометре с электрораспылением и ортогональным вводом ионов МХ5303 (ESI-o-TOF), разработанном в Лаборатории биомедицинской масс-спектрометрии ИАнП РАН. Все спектры получены в режиме съемки положительных ионов. Объем анализируемой пробы составлял 10–50 мкл, скорость подачи раствора образца 1–5 мкл/мин.