Эффективность микросимбионтов чины болотной (Lathyrus palustris L.) и горошка мышиного(Vicia cracca L.), произрастающих в арктической Якутии

Автор: Карлов Д.С., Гуро П.В., Сазанова А.Л., Кузнецова И.Г., Тихомирова Н.Ю., Лащинский Н.Н., Павлов И.С., Белимов А.А., Сафронова В.И.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Агросистемы будущего - от эксперимента к практике микробиопрепараты

Статья в выпуске: 3 т.58, 2023 года.

Бесплатный доступ

Формирование высокопродуктивных пастбищных фитоценозов, основу которых составляют бобовые растения, образующие азотфиксирующий симбиоз с клубеньковыми бактериями, - необходимое условие распространения и устойчивого роста численности травоядных сельскохозяйственных животных в условиях изменения климата и кардинальной перестройки растительных экосистем в Арктике. В то же время вопросы биоразнообразия клубеньковых бактерий на арктических территориях и эффективность их симбиотического взаимодействия с бобовыми растениями в настоящее время остаются в России практически не изученными. В настоящей работе впервые описаны 12 штаммов, изолированных из клубеньков чины болотной и горошка мышиного, произрастающих в Арктической Якутии: изучено их таксономическое положение, а также показана способность формировать эффективный симбиоз как с традиционными бобовыми культурами, так и с дикорастущими растениями, которые более адаптированы к условиям Крайнего Севера и могут использоваться для создания высокопродуктивных пастбищных фитоценозов. Целью работы было изучение генетического разнообразия ризобиальных изолятов из популяций арктических дикорастущих бобовых растений Lathyrus palustris L. и Vicia cracca L., а также оценка их способности формировать азотфиксирующие клубеньки на корнях кормовых пастбищных бобовых культур в условиях микровегетационного опыта. Корневые клубеньки дикорастущих популяций бобовых растений V. cracca и L. palustris были собраны в 2021 году на острове Самойловский и в поселке Тикси в ходе российско-немецкой экспедиции в дельту реки Лены. Ризобиальные штаммы из клубеньков бобовых выделяли по стандартной методике с использованием маннитно-дрожжевой питательной среды YMA. Таксономическое положение 12 изолятов определяли посредством секвенирования 16S рДНК ( rrs ). Для постановки микровегетационных опытов (МВО) использовали семена V. cracca , V. sativa , L. sativus и L. pratensis . Растения культивировали в стерильных стеклянных сосудах объемом 300 мл, содержащих 50 мл агаризованной среды Красильникова-Кореняко. Проростки были инокулированы суспензиями индивидуальных штаммов в количестве 106 клеток/сосуд. В качестве положительного контроля использовали коммерческие штаммы Rhizobium leguminosarum bv. viciae RCAM2802, RCAM2806 и RCAM0626 из Сетевой биоресурсной коллекции в области генетических технологий для сельского хозяйства (ФГБНУ ВНИИСХМ, г. Санкт-Петербург). Неинокулированные растения служили отрицательным контролем. По окончании культивирования проводили подсчет и описание клубеньков, образовавшихся на корнях растений. Азотфиксирующую активность клубеньков определяли ацетиленовым методом с помощью газового хроматографа GC-2014 («Shimadzu», Япония). В условиях отдельного МВО семена V. cracca и L. pratensis дополнительно были инокулированы почвенной вытяжкой из образца, отобранного с острова Котельный (Новосибирские о-ва, Арктическая Якутия). Всего из корневых клубеньков популяций L. palustris и V. cracca было выделено 12 ризобиальных изолятов, отнесенных к родам Rhizobium , Mesorhizobium и Bosea . Штаммы Mesorhizobium sp. 33-3/1 и 32-2/1 были выделены только из популяций, произрастающих в пос. Тикси. Штамм Rhizobium sp. 32-5/1 показал низкое сходство по гену rrs с ближайшим типовым штаммом (менее 98,0 %), что позволяет предположить его принадлежность к новому виду микроорганизмов. При постановке МВО клубеньки формировались только в вариантах инокуляции штаммами Rhizobium sp. 19-1/1, 20-1/1, 33-1/1 и Mesorhizobium sp. 32-2/1. Штамм Rhizobium sp. 19-1/1 формировал неактивные клубеньки на корнях сразу трех видов бобовых (кроме V. cracca ). Штамм Rhizobium sp. 20-1/1 при инокуляции V. cracca сформировал большее число клубеньков и показал более высокую азотфиксирующую активность по сравнению с коммерческим штаммом для обработки вики посевной Rhizobium leguminosarum bv. viciae RCAM0626, однако различия по числу клубеньков между вариантами опыта были недостоверными из-за значительной вариации параметра.

Еще

Арктическая якутия, дельта реки лены, бобовые растения, азотфиксирующие клубеньковые бактерии

Короткий адрес: https://sciup.org/142238887

IDR: 142238887   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2023.3.403rus

Список литературы Эффективность микросимбионтов чины болотной (Lathyrus palustris L.) и горошка мышиного(Vicia cracca L.), произрастающих в арктической Якутии

  • Белоновская Е.А., Тишков А.А., Вайсфельд М.А., Глазов П.М., Кренке-мл. А.Н., Морозова О.В., Покровская И.В., Царевская Н.Г., Тертицкий Г.М. «Позеленение» Российской Арктики и современные тренды изменения ее биоты. Известия Российской академии наук. Серия географическая, 2016, 3: 28-39 (doi: 10.15356/0373-2444-2016-3-28-39).
  • Тишков А.А., Белоновская Е.А., Вайсфельд М.А., Глазов П.М., Кренке А.Н., Тертиц-кий Г.М. «Позеленение» тундры как драйвер современной динамики арктической биоты. Арктика: экология и экономика, 2018, 2(30): 31-44 (doi: 10.25283/2223-4594-2018-2-31-44).
  • Парахин Н.В., Петрова С.Н. Симбиотически фиксированный азот в агроэкосистемах. Вестник аграрной науки, 2009, 3(18): 41-45.
  • Прядильщикова Е.Н., Калабашкин П.Н., Коновалова С.С. Формирование пастбищных фитоценозов на основе новых видов бобовых трав в условиях Европейского Севера России. Владимирский земледелец, 2018, 1(83): 32-35 (doi: 10.24411/2225-2584-2018-00008).
  • Крисс А.Е., Кореняко А.И., Мигулина В.М. Клубеньковые бактерии в Арктике. Микробиология, 1941, 10(1): 61-71.
  • Вишнякова М.А., Бурляева М.О. Потенциал хозяйственной ценности и перспективы использования российских видов чины. Сельскохозяйственная биология, 2006, 6: 85-97.
  • Вишнякова М.А. Виды вики из коллекции ВИР-кормовые растения, перспективные для введения в культуру в Российской Федерации (обзор). Сельскохозяйственная биология, 2007, 42(4): 3-19.
  • Аргунов А.В., Степанова В.В. Структура рациона сибирской косули в Якутии. Экология, 2011, 2: 144-147.
  • Кормовые растения сенокосов и пастбищ СССР. Том 2 /Под ред. И.В. Ларина. Л., 1951.
  • Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию. Том 1. Сорта растений (официальное издание). М., 2021.
  • Баймиев А.Х., Птицын К.Г., Мулдашев А.А., Баймиев А.Х. Генетическая характеристика клубеньковых бактерий бобовых рода Lathyrus, произрастающих на территории Республики Башкортостан. Экологическая генетика, 2011, 9(2): 3-8.
  • Ampomah O.Y., Huss-Danell K. Genetic diversity of rhizobia nodulating native Vicia spp. in Sweden. Systematic and Applied Microbiology, 2016, 39(3): 203-210 (doi: 10.1016/j.syapm.2016.02.002).
  • Villadas P.J., Lasa A.V., Martínez-Hidalgo P., Flores-Félix J.D., Martínez-Molina E., Toro N., Velázquez E., Fernández-López M. Analysis of rhizobial endosymbionts of Vicia, Lathyrus and Trifolium species used to maintain mountain firewalls in Sierra Nevada National Park (South Spain). Systematic and Applied Microbiology, 2017, 40(2): 92-101 (doi: 10.1016/j.syapm.2016.11.008).
  • Aoki S., Kondo T., Prévost D., Nakata S., Kajita T., Ito M. Genotypic and phenotypic diversity of rhizobia isolated from Lathyrus japonicus indigenous to Japan. Systematic and Applied Microbi-ology, 2010, 33(7): 383-397 (doi: 10.1016/j.syapm.2010.07.001).
  • Li Y., Wang E.T., Liu Y., Li X., Yu B., Ren C., Liu W., Li Y., Xie Z. Rhizobium anhuiense as the predominant microsymbionts of Lathyrus maritimus along the Shandong Peninsula seashore line. Systematic and Applied Microbiology, 2016, 39(6): 384-390 (doi: 10.1016/j.syapm.2016.07.001).
  • Chen W.M., Zhu W.F., Bontemps C., Young J.P.W., Wei G.H. Mesorhizobium alhagi sp. nov., isolated from wild Alhagi sparsifolia in north-western China. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2010, 60(4): 958-962 (doi: 10.1099/ijs.0.014043-0).
  • Caudry-Reznick S., Prevost D., Schulman H.M. Some properties of arctic rhizobia. Archives of Microbiology, 1986, 146(1): 12-18.
  • Рябова О.В. К вопросу разработки микробиологических препаратов (фунгицидов и удобрений) для условий Северо-Востока европейской части Российской Федерации. Аграрная наука Евро-Северо-Востока, 2016, 1(50): 31-40.
  • Novikova N., Safronova V. Transconjugants of Agrobacterium radiobacter harbouring sym genes of Rhizobium galegae can form an effective symbiosis with Medicago sativa. FEMS Microbiology Letters, 1992, 93(3): 261-268 (doi: 10.1111/j.1574-6968.1992.tb05107.x).
  • Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., Lane D.J. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study. Journal of Bacteriology, 1991, 173(2): 697-703 (doi: 10.1128/jb.173.2.697-703.1991).
  • Лащинский Н.Н. Использование беспилотных летательных аппаратов в ландшафтно-экологических исследованиях в Арктике. Мат. Всерос. науч.-практ. конф. «Итоги и перспективы геоботанических исследований в Сибири». Новосибирск, 2019: 64-65.
  • Секретарева Н.А., Сытин А.К. Мониторинг флоры окрестностей бухты Тикси (арктическая Якутия). Ботанический журнал, 2006, 91(1): 3-22.
  • Николин Е.Г., Якшина И.А. Внедрение бореальных элементов флоры в арктическую Якутию (пос. Тикси). Экологический вестник Северного Кавказа, 2017, 13(3): 36-37.
  • Большиянов Д.Ю., Макаров А.С., Шнайдер В., Штоф Г. Происхождение и развитие дельты реки Лены. СПб, 2013.
  • Safronova V.I., Kimeklis A.K., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Tikhonovich I.A. Genetic diversity of rhizobia isolated from nodules of the relic species Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Antonie Leeuwenhoek, 2014, 105(2): 389-399 (doi: 10.1007/s10482-013-0089-9).
  • Andrews M., Andrews M.E. Specificity in Legume-Rhizobia symbioses. International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18(4): 705-744 (doi: 10.3390/ijms18040705).
  • Zhang Y.J., Zheng W.T., Everall I., Young J.P.W., Zhang X.X., Tian C.F., Sui X.H., Wang E.T., Chen W.X. Rhizobium anhuiense sp. nov., isolated from effective nodules of Vicia faba and Pisum sativum. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65(9): 2960-2967 (doi: 10.1099/ijs.0.000365).
  • Jiao Y.S., Yan H., Ji Z.J., Liu Y.H., Sui X.H., Wang E.T., Guo B.L., Chen W.X., Chen W.F. Rhizobium sophorae sp. nov. and Rhizobium sophoriradicis sp. nov., nitrogen-fixing rhizobial sym-bionts of the medicinal legume Sophora flavescens. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65(2): 497-503 (doi: 10.1099/ijs.0.068916-0).
  • Zhang J., Li S., Wang N., Yang T., Brunel B., Andrews M., Zong X., Wang E. Rhizobium sophorae is the dominant rhizobial symbiont of Vicia faba L. in North China. Systematic and Applied Mi-crobiology, 2022, 45(1): 126-291 (doi: 10.1016/j.syapm.2021.126291).
  • Saïdi S., Ramírez Bahena M.-H., Santillana N., Zúniga D., Álvarez Martínez E., Peix A., Mhamdi R., Velázquez E. Rhizobium laguerreae sp. nov. nodulates Vicia faba on several conti-nents. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64(1): 242-247 (doi: 10.1099/ijs.0.052191-0).
  • Taha K., Berraho El B., El Attar I., Dekkiche S., Aurag J., Béna G. Rhizobium laguerreae is the main nitrogen-fixing symbiont of cultivated lentil (Lens culinaris) in Morocco. Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41(2): 113-121 (doi: 10.1016/j.syapm.2017.09.008).
  • Zhang J., Shang Y., Peng S., Chen W., Wang E., de Lajudie P., Li B., Guo C., Liu C. Rhizobium sophorae, Rhizobium laguerreae, and two novel Rhizobium genospecies associated with Vicia sativa L. in Northwest China. Plant and Soil, 2019, 442(1): 113-126 (doi: 10.1007/s11104-019-04168-w).
  • Flores-Félix J.D., Sánchez-Juanes F., García-Fraile P., Valverde A., Mateos P.F., Gónzalez-Buitrago J.M., Velázquez E., Rivas R. Phaseolus vulgaris is nodulated by the symbiovar viciae of several genospecies of Rhizobium laguerreae complex in a Spanish region where Lens culinaris is the traditionally cultivated legume. Systematic and Applied Microbiology, 2019, 42(2): 240-247 (doi: 10.1016/j.syapm.2018.10.009).
  • Flores-Félix J.D., Carro L., Cerda-Castillo E., Squartini A., Rivas R., Velázquez E. Analysis of the interaction between Pisum sativum L. and Rhizobium laguerreae strains nodulating this Legume in Northwest Spain. Plants, 2020, 9(12): 1755 (doi: 10.3390/plants9121755).
  • Jiménez-Gómez A., Flores-Félix J.D., García-Fraile P., Mateos P.F., Menéndez E., Veláz-quez E., Rivas R. Probiotic activities of Rhizobium laguerreae on growth and quality of spinach. Scientific Reports, 2018, 8(1): 295 (doi: 10.1038/s41598-017-18632-z).
  • Ayuso-Calles M., García-Estévez I., Jiménez-Gómez A., Flores-Félix J.D., Escribano-Bailón M.T., Rivas R. Rhizobium laguerreae improves productivity and phenolic compound con-tent of lettuce (Lactuca sativa L.) under saline stress conditions. Foods, 2020, 9(9): 1166 (doi: 10.3390/foods9091166).
  • Kabdullayeva T., Crosbie D.B., Marín M. Mesorhizobium norvegicum sp. nov., a rhizobium iso-lated from a Lotus corniculatus root nodule in Norway. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, 70(1): 388-396 (doi: 10.1099/ijsem.0.003769).
  • Jarvis B.D.W., Pankhurst C.E., Patel J.J. Rhizobium loti, a new species of legume root nodule bacteria. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 1982, 32(3): 378-380 (doi: 10.1099/00207713-32-3-378).
  • De Meyer S.E., Willems A. Multilocus sequence analysis of Bosea species and description of Bosea lupini sp. nov., Bosea lathyri sp. nov. and Bosea robiniae sp. nov., isolated from legumes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62(10): 2505-2510 (doi: 10.1099/ijs.0.035477-0).
  • Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Chizhevskaya E.P., Pukhaev A.R., Popov K.P., Willems A., Tikhonovich I.A. Bosea vaviloviae sp. nov., a new species of slow growing rhizobia isolated from nodules of the relict species Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Antonie van Leeuwenhoek, 2015, 107(4): 911-920 (doi: 10.1007/s10482-015-0383-9).
  • Sazanova A.L., Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Karlov D.S., Belimov A.A., Andronov E.E., Chirak E.R., Popova J.P., Verkhozina A.V., Willems A., Tikhonovich I.A. Bosea caraganae sp. nov., a new species of slow-growing bacteria isolated from root nodules of the relict species Caragana jubata (Pall.) Poir. originating from Mongolia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019, 69(9): 2687-2695 (doi: 10.1099/ijsem.0.003509).
  • Pulido-Suárez L., Flores-Félix J.D., Socas-Pérez N., Igual J.M., Velázquez E., Péix Á., León-Barrios M. Endophytic Bosea spartocytisi sp. nov. coexists with rhizobia in root nodules of Spar-tocytisus supranubius growing in soils of Teide National Park (Canary Islands). Systematic and Applied Microbiology, 2022, 45(6): 126374 (doi: 10.1016/j.syapm.2022.126374).
Еще
Статья научная