Экспрессия H/ACA мякРНК в клеточных линиях с хромосомными нарушениями после облучения
Автор: Расторгуева Евгения Владимировна, Погодина Евгения Сергеевна, Юрова Елена Валерьевна, Белобородов Евгений Алексеевич, Сугак Дмитрий Евгеньевич, Саенко Юрий Владимирович, Фомин Александр Николаевич
Журнал: Ульяновский медико-биологический журнал @medbio-ulsu
Рубрика: Физиология
Статья в выпуске: 4, 2022 года.
Бесплатный доступ
Семейство H/ACA мякРНК участвует в биогенезе псевдоуридина, препятствуя генетическим изменениям в клетках, делая их более устойчивыми, через стабильность рибосомальной РНК. Поэтому изучение экспрессии H/ACA мякРНК в клеточных линиях при хромосомных нарушениях после облучения представляет особый интерес. Цель исследования - изучение влияния хромосомных нарушений на экспрессию H/ACA мякРНК в радиорезистентной К562 и радиочувствительной HL-60 клеточных линиях после радиационного воздействия. Материалы и методы. Клеточные линии К562 и HL-60 облучали в дозе 4 Гр. Экспрессию H/ACA мякРНК анализировали с помощью NGS-секвенирования через 1, 4 и 24 ч после облучения. Результаты. Выявили отличия экспрессии H/ACA мякРНК по хромосомам в изучаемых клеточных линиях, а также влияние хромосомных аномалий на экспрессию H/ACA мякРНК после радиационного воздействия. Изменение количества копий нормальных хромосом ведет к незначительным изменениям экспрессии H/ACA мякРНК. Наличие маркерных хромосом приводит к нарушению экспрессии H/ACA мякРНК, что делает невозможным использование H/ACA мякРНК, локализованных в аномальных хромосомах, в качестве маркеров радиорезистентности. Кроме того, при наличии маркерных хромосом снижается количество экспрессирующихся H/ACA мякРНК в K562, несмотря на большее количество генетического материала.
Семейство h/aca мякрнк, раковые клетки, маркерные хромосомы
Короткий адрес: https://sciup.org/14126330
IDR: 14126330 | DOI: 10.34014/2227-1848-2022-4-149-159
Список литературы Экспрессия H/ACA мякРНК в клеточных линиях с хромосомными нарушениями после облучения
- Liang J., Wen J., Huang Z., Chen X.P., Zhang B.X., Chu L. Small Nucleolar RNAs: Insight Into Their Function in Cancer. Front Oncol. 2019; 9: 587.
- Cui L., Nakano K., Obchoei S. Small Nucleolar Noncoding RNA SNORA23, Up-Regulated in Human Pancreatic Ductal Adenocarcinoma, Regulates Expression of Spectrin Repeat-Containing Nuclear Envelope
- 2 to Promote Growth and Metastasis of Xenograft Tumors in Mice. Gastroenterology. 2017; 153 (1): 292–306.e2.
- Zhu W., Zhang T., Luan S. Identification of a novel nine-SnoRNA signature with potential prognostic and therapeutic value in ovarian cancer. Cancer Med. 2022; 11 (10): 2159–2170.
- Rastorgueva E., Liamina D., Panchenko I. The effect of chromosome abnormalities on expression of SnoRNA in radioresistant and radiosensitive cell lines after irradiation. Cancer Biomark. 2022; 34 (4): 545–553.
- Abel Y., Rederstorff M. SnoRNAs and the emerging class of sdRNAs: Multifaceted players in oncogenesis. Biochimie. 2019; 164: 17–21.
- Dsouza V.L., Adiga D., Sriharikrishnaa S., Suresh P.S., Chatterjee A., Kabekkodu S.P. Small nucleolar RNA and its potential role in breast cancer - A comprehensive review. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2021; 1875 (1): 188501.
- McMahon M., Contreras A., Holm M. A single H/ACA small nucleolar RNA mediates tumor suppression downstream of oncogenic RAS. Elife. 2019; 8: e48847.
- McMahon M., Contreras A., Ruggero D. Small RNAs with big implications: new insights into H/ACA snoRNA function and their role in human disease. Wiley Inter discip Rev RNA. 2015; 6 (2): 173–189.
- Garus A., Autexier C. Dyskerin: an essential pseudouridine synthase with multifaceted roles in ribosome biogenesis, splicing, and telomere maintenance. RNA. 2021; 27 (12): 1441–1458.
- Cai C., Peng Y., Shen E. Identification of tumour immune infiltration-associated snoRNAs (TIIsno) for predicting prognosis and immune landscape in patients with colon cancer via a TIIsno score model. EBio Medicine. 2022; 76: 103866.
- Mascotti K., McCullough J., Burger S.R. HPC viability measurement: Trypan blue versus acridine orange and propidium iodide. Transfusion. 2000; 40: 693–696.
- Liang J.C., Ning Y., Wang R.Y. Spectral karyotypic study of the HL-60 cell line: detection of complex rearrangements involving chromosomes 5, 7, and 16 and delineation of critical region of deletion on 5q31.1. Cancer Genet Cytogenet. 1999; 113 (2): 105–109.
- Naumann S., Reutzel D., Speicher M., Decker H.J. Complete karyotype characterization of the K562 cell line by combined application of G-banding, multiplex-fluorescence in situ hybridization, fluorescence in situ hybridization, and comparative genomic hybridization. Leuk Res. 2001; 25 (4): 313–322.
- Chaudhry M.A. Expression pattern of small nucleolar RNA host genes and long non-coding RNA in X-rays-treated lymphoblastoid cells. Int J Mol Sci. 2013; 14 (5): 9099–9110.
- De Falco G., Ambrosio M.R., Fuligni F. Burkitt lymphoma beyond MYC translocation: N-MYC and DNA methyltransferases dysregulation. BMC Cancer. 2015; 15: 668.
- Barozzi C., Zacchini F., Asghar S., Montanaro L. Ribosomal RNA Pseudouridylation: Will Newly Available Methods Finally Define the Contribution of This Modification to Human Ribosome Plasticity? Front Genet. 2022; 13: 920987.
- Slimani W., Jelloul A., Al-Rikabi A. Small supernumerary marker chromosomes (sSMC) and male infertility: characterization of five new cases, review of the literature, and perspectives. J Assist Reprod Genet. 2020; 37 (7): 1729–1736.
- An N., Yu Y., Xi Q. Molecular Characterization of Mosaicism for a Small Supernumerary Marker Chromosome Derived from Chromosome Y in an Infertile Male with Apparently Normal Phenotype: A Case Report and Literature Review. Biomed ResInt. 2019; 2019: 9398275.
