Экспрессионный анализ микрорнк для диагностики и прогноза рака молочной железы

Экспрессионный анализ микрорнк для диагностики и прогноза рака молочной железы

Автор: Поспехова Н.И., Поярков С.В., Зенит-журавлва Е.Г., Шубин П.В., Карпухин А.В., Каткова Е.В., Хайленко В.А.

Журнал: Злокачественные опухоли @malignanttumors

Рубрика: Молекулярно-генетические аспекты диагностики

Статья в выпуске: 2 т.2, 2012 года.

Бесплатный доступ

В работе проанализированы данные научной литературы последних лет, посвящённые изучению роли микро РНК в возникновении и прогрессировании рака молочной железы, возможности использования этих молекул в качестве биомаркёров рака. Приведены результаты собственных исследований микро РНК. В работе проведен анализ уровней экспрессии 14 микро РНК, ассоциированных с развитием рака молочной железы, в 54 образцах опухолевой и нормальной ткани (27 пациентов). Показано, что паттерны экспрессии микро РНК разнообразны и пациент-специфичны. Установлен ряд закономерностей. Уровень экспрессии miR-182 повышен в 81% случаев. Экспрессия miR-31, супрессора метастазирования, подавлена в 56% случаев.С использованием кластерного анализа выделен кластер коэкспрессии 5-ти микро РНК с преимущественно повышенной экспрессией miR-10b, miR-21, miR-155, miR-34a и miR-335. Предполагается существование ассоциации ко-экспрессирующихся в этом кластере микро РНК с патоморфологическими признаками, в том числе, преимущественным наличием метастазов. При анализе транскрипционной регуляции показано, что все микро РНК из кластера - транскрипционные мишени p53, RelA и NF-kB.Кластеризация и выделение групп микро РНК (signature) позволяют классифицировать пациентов по различным параметрам, выделять особенности, связанные с кластерами, что может расширить представление о роли микро РНК в развитии рака.

Еще

Рак молочной железы, микро рнк, анализ экспрессии микро рнк

Короткий адрес: https://sciup.org/14045439

IDR: 14045439

Список литературы Экспрессионный анализ микрорнк для диагностики и прогноза рака молочной железы

  • Asaga S., Kuo C., Nguyen T. et al. Direct Serum Assay for MicroRNA-21 Concentrations in Early and Advanced Breast Cancer.//Clinical Chemistry. -2011. -V. 57. -P. 184-91
  • Augoff K., McCue B., Plow E. and Sossey-Alaoui K. miR-31 and its host gene lncRNA LOC554202 are regulated by promoter hypermethylation in triple-negative breast cancer.//Mol. Cancer -2012. -V. 11. -P. 5-17
  • Bartel D.P. MicroRNAs: target recogniti and regulatory functi Cell. -2009. -V. 136(2). -P. 215-33
  • Chang N., Wang R., Akagi K. et al. Tumor suppressor BRCA1 epigenetically controls oncogenic microR-NA-155.//Nature Medicine -2011. -V. 17. -P. 1275-1283
  • Eo H.S., Heo J.Y., Choi Y. et al. A pathway-based classification of breast cancer integrating data on differentially expressed genes, copy number variations and MicroRNA target genes.//Mol. Cells. -2012
  • Farazi T.A., Spitzer J.I., Morozov P., Tuschl T. miRNAs in human cancer.//J Pathol. -2011. -V. 223(2). -P. 102-15
  • Foubert E., De Craene B. and Berx G. Key signalling nodes in mammary gland development and cancer. The Snail1-Twist1 conspiracy in malignant breast cancer progression//Breast Cancer Res. -2010. -V. 12. -P. 206-217
  • Heneghan H.M., Miller N., Kelly R. et al. Systemic miRNA-195 differentiates breast cancer from other malignancies and is a potential biomarker for detecting non-invasive and early stage disease.//Oncologist. -2010. -V. 15(7) -P. 673-82
  • Gabriely G., Teplyuk N.M., Krichevsky A.M. Context effect: microRNA-10b in cancer cell proliferation, spread and death.//Autophagy. -2011 -V. 7(11). -P. 1384-6
  • Guttilla I.K., White B.A. Coordinate regulation of FOXO1 by miR-27a, miR-96, and miR-182 in breast cancer cells//J Biol Chem. -2009. -V. 284(35). -P. 23204-16
  • Janga S.C., Mittal N. Construction, structure and dynamics of post-transcriptional regulatory network directed by RNA-binding proteins.//Adv. Exp. Med. Biol. -2011. -V. 722. -P. 103-17
  • Jiang J., Sun X., Wang W. et al. Tumor microR-NA-335 expression is associated with poor prognosis in human glioma// Med. Oncol. -2012. May 27
  • Jiang S., Zhang H.W., Lu M.H. et al. MicroRNA-155 functions as an OncomiR in breast cancer by targeting the suppressor of cytokine signaling 1 gene.//Cancer Res. -2010. -V. 70(8). -P. 3119-27
  • Kastl L., Brown I., Schofield A.C. miRNA-34a is associated with docetaxel resistance in human breast cancer cells.//Breast Cancer Res. Treat. -2012. -V. 131(2). -P.445-54
  • Kong W., He L., CoppolaM. et al. MicroRNA-155 Regulates Cell Survival, Growth, and Chemosensitivity by Targeting FOXO3a in Breast Cancer.//J. Biol. Chem. -2010. -V. 285(23). -P. 17869-17879
  • Kong W., Yang H., He L. et al. MicroRNA-155 is regulated by the transforming growth factor beta/Smad pathway and contributes to epithelial cell plasticity by targeting RhoA.//Mol. Cell. Biol. -2008. -V. 28. -P. 6773-6784
  • Lu Z., Liu M., Stribinskis V. et al. microRNA-21 promotes cell transformation by targeting the programmed cell death 4 gene.//Oncogene. -2008. -V. 27. -P. 4373-4379
  • Lyng M.B., Lænkholm A.V., Søkilde R. et al. Global microRNA expression profiling of high-risk ER+ breast cancers from patients receiving adjuvant tamoxifen mono-therapy: a DBCG study.//PLoS One. -2012. -V. 7(5). e36170
  • Mattie M.D., Benz C.C., Bowers J. et al. Optimized high-throughput microRNA expression profiling provides novel biomarker assessment of clinical prostate and breast cancer biopsies.//Mol. Cancer -2006. -V. 5. -P. 24
  • Mattiske S., Suetani R.J., Neilsen P.M., Callen DF. The Oncogenic Role of miR-155 in Breast Cancer.//Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. -2012. -V. 21(8). -P. 1236-43
  • Moskwa P., Buffa F.M., Pan Y. et al. miR-182-mediated downregulation of BRCA1 impacts DNA repair and sensitivity to PARP inhibitors.//Mol. Cell. -2011. -V.41(2). -P. 210-20
  • Niu J., Shi Y., Tan G. et al. DNA damage induces NF-κB-dependent microRNA-21 up-regulation and promotes breast cancer cell invasion.//J. Biol. Chem. -2012. -V. 287(26). -P. 21783-95
  • Ogino S., Fuchs C.S., Giovannucci E. How many molecular subtypes? Implications of the unique tumor principle in personalized medicine.//Expert Rev. Mol. Di-agn. -2012. -V. 12(6). -P. 621-8
  • Peurala H., Greco D., Heikkinen T. et al. MiR-34a expression has an effect for lower risk of metastasis and associates with expression patterns predicting clinical outcome in breast cancer.//PLoS One. -2011. -V. 6(11):e26122
  • Png K.J., Yoshida M., Zhang X.H. et al. MicroR-NA-335 inhibits tumor reinitiation and is silenced through genetic and epigenetic mechanisms in human breast cancer.//Genes Dev. -2011. -V. 25(3). -P. 226-31
  • Rao X., Di Leva G., Li M. et al. MicroRNA-221/222 confers breast cancer fulvestrant resistance by regulating multiple signaling pathways.//Oncogene. -2011. -V. 30(9). -P. 1082-97
  • Roth С., Rack B., Müller V. et al. Circulating microRNAs as blood-based markers for patients with primary and metastatic breast cancer//Breast Cancer Res. -2010. -V. 12, R90
  • Sato F., Tsuchiya S., Meltzer S.J., Shimizu K. MicroRNAs and epigenetics.//FEBS J. -2011. -V. 278(10). -P. 1598-609
  • Scott G.K., Goga A., Bhaumik D. Et al. Coordinate suppression of ERBB2 and ERBB3 by enforced expression of micro-RNA miR-125a or miR-125b.//J. Biol. Chem. -2007. -V. 282(2). -P. 1479-86
  • Shah M. & Calin G. MicroRNAs miR-221 and miR-222: a new level of regulation in aggressive breast cancer//Genome Medicine -2011. -V. 3. -P. 56-59
  • Si M.L., Zhu S., Wu H. et al. miR-21-mediated tumor growth.//Oncogene. -2007. -V. 26. -P. 2799-803
  • Sorlie T., Perou C.M., Tibshirani R. et al. Gene expression patterns of breast carcinomas distinguish tumor subclasses with clinical implications//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2001. -V. 98. -P. 10869-74
  • Sorlie T., Wang Y., Xiao C. et al. Distinct molecular mechanisms underlying clinically relevant subtypes of breast cancer: gene expression analyses across three different platforms.//BMC. -Genomics. -2006. -V. 7. -P. 127
  • Sossey-Alaoui K., Downs-Kelly E., Das M. et al. WAVE3, an actin remodeling protein, is regulated by the metastasis suppressor microRNA, miR-31, during the invasion-metastasis cascade.//Int. J. Cancer -2011. -V. 129(6). -P.1331-1343
  • Taganov K.D., Boldin M.P., Chang K.J., Baltimore D. NF-kappaB-dependent induction of microRNA miR-146, an inhibitor targeted to signaling proteins of innate immune responses.//Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. -2006. -V. 103. -P. 12481-12486
  • Valastyan S., Reinhardt F., Benaich N. et al. A pleiotropically acting microRNA, miR-31, inhibits breast cancer metastasis.//Cell -2009. -V. 137. -P. 1032-46
  • Vickers M.M., Bar J., Gorn-Hondermann I. et al. Stage-dependent differential expression of microRNAs in colorectal cancer: potential role as markers of meta-static disease.//Clin. Exp. Metastasis. -2012. -V. 29(2). -P.123-32
  • Voliniaa S., Galassoa M., Sanaa M. et al. Breast cancer signatures for invasiveness and prognosis defined by deep sequencing of microRNA.//PNAS -2012. -V. 109. -P. 3024-3029
  • Wang H., Tan G., Dong L. et al. Circulating MiR-125b as a marker predicting chemoresistance in breast cancer.//PLoS One. -2012. -V. 7(4):e34210
  • Yan L., Huang X., Shao Q. et al. MicroRNA miR-21 overexpression in human breast cancer is associated with advanced clinical stage, lymph node metastasis and patient poor prognosis//RNA. -2008 -V. 14(11). -P. 2348-60
  • Yan Z., Xiong Y., Xu W. et al. Identification of hsa-miR-335 as a prognostic signature in gastric cancer.//PLoS One. -2012. -V. 7(7):e40037
  • Zhao J.J., Lin J., Yang H. et al. MicroRNA-221/222 negatively regulates estrogen receptor alpha and is associated with tamoxifen resistance in breast cancer.//J. Biol. Chem. -2008. -V. 283(45). -P. 31079-86
  • Zhu S., Si M.L., Wu H. et al. microRNA-21 targets the tumor suppressor gene tropomyosin 1 (TPM1).//J. Biol. Chem. -2007. -V. 282. -P. 14328-14336
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp