Компьютерное моделирование эксперимента с использованием оптического твизера для определения свойств взаимодействия молекулярных моторов с микротрубочкой
Автор: Крайкивский П.Б., Галль Л.Н.
Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie
Рубрика: Оригинальные статьи
Статья в выпуске: 3 т.14, 2004 года.
Бесплатный доступ
Рассмотрен вопрос об использовании оптического твизера для исследования свойств взаимодействия молекулярных моторов с микротрубочкой. Разработан экспериментальный метод для исследования влияния силы, приложенной в разных направлениях к молекулярным моторам, на скорость их перемещения по микротрубочке, синхронизации движения группы моторов вдоль микротрубочки, влияния заторов на мобильность моторов. Некоторые возможности методики продемонстрированы с помощью компьютерного моделирования.
Короткий адрес: https://sciup.org/14264348
IDR: 14264348
Список литературы Компьютерное моделирование эксперимента с использованием оптического твизера для определения свойств взаимодействия молекулярных моторов с микротрубочкой
- Крайкивский П.Б., Галль Л.Н. Оптические твизеры -новый метод исследований в биологии//Научное приборостроение. 2004. Т. 14, № 1. С. 10-17.
- Böhm K.J., Unger E. Kinesin and Nanoactuators//Encyclopedia of Nanoscience and Nanotechnology. American Scientific Publishers, 2004. V. 4. p. 345-357.
- Hess H., Howard J., Vogel V. A Piconewton Forcemeter Assembled from Microtubules and Kinesins//Nano Lett. 2002. V. 2, N 10. p. 1113-1115.
- Hess H., Matzke C.M., Doot R.K. et al. Molecular Shuttles Operating Undercover: A New Photolithographic Approach for the Fabrication of Structured Surfaces Supporting Directed Motility//Nano Lett. 2003. V. 3, N 12. p. 1651-1655.
- Hess H., Clemmens J., Howard J. Vogel V. Surface Imaging by Self-Propelled Nanoscale Probes//Nano Lett. 2002. V. 2, N 2. p. 113-116.
- Hess H., Clemmens J., Qin D., Howard J., Vogel V. Light-Controlled Molecular Shuttles Made from Motor Proteins Carrying Cargo on Engineered Surface//Nano Lett. 2001. V. 1, N 5. p. 235-239.
- Hiratsuka Y., Tada T., Oiwa K., Kanayama T. and Uyeda T.Q.P. Controlling the Direction of Kinesin-Driven Microtubule Movements along Microlithographic Tracks//J. Biophys. 2001. V. 81. p. 1555-1561.
- Svoboda K., Schmidt C.F., Schnapp B.J., Block S.M. Direct observation of kinesin stepping by optical trapping interferometry//Nature. 1993. V. 365. p. 721-727.
- Svoboda K., Block S.M. Force and velocity measured for single kinesin molecules//Cell. 1994. V. 77. p. 773-784.
- Kraikivski P., Lipowsky R. and Kierfeld J. Barrier crossing of semiflexible polymers//Europhys. Lett. 2004. V. 66, N 5. p. 763-769.
- Ландау Л.Д., Лифшиц Е.М. Теоретическая физика. В 10 т. Т. VII. Теория упругости. М.: Наука, 1987. 248 с.
- Tirado M.M., Carcia de la Torre J. Translational friction coefficients of rigid, symmetric top macromolecules. Application to circular cylinders//J. Chem. Phys. 1979. V. 71, N 6. p. 2581-2587.
- Block S.M., Asbury C.L., Shaevitz J.W., Lang M.J. Probing the kinesin reaction cycle with a 2D optical force clamp//PNAS. 2003. V. 100, N 5. p. 2351-2356.
- Nedelec F., Surrey T. аnd Maggs A.C. Dynamic Consentration of Motors in Microtubule Arrays//Phys. Rev. Lett. 2001. V. 86, N 14. p. 3192-3195.
- Bohm K.L., Stracke R., Unger E. Speeding up kinesin-driven microtubule gliding in vitro by variation of cofactor composition and physicochemical parametrs//Cell Bio. I. 2000. V. 24, N 6. p. 335-341.
- Pikovsky A., Rosenblum M. and Kurths J. Synchronization a universal concept in nonlinear sciences. Cambridge Univ. Press, 2002. 411 p.
- Gittes F., Schmidt C.F. Thermal noise limitations on micromechanical experiments//J. Eur. Biophys. 1998. V. 27. p. 75-81.
Статья научная
