КОРРЕКЦИЯ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ СИГНАЛОВ, ИСКАЖЕННЫХ НАЛОЖЕНИЕМ СПЕКТРАЛЬНЫХ ПОЛОС, В СЕКВЕНАТОРЕ НАНОФОР СПС

Важным этапом в технологии массового параллельного секвенирования нуклеиновых кислот является процесс измерения сигналов флуоресценции. Спектральный состав сигнала флуоресценции несет информацию о типе объекта флуоресценции (нуклеотида), входящего в состав образца ДНК, анализируемого секвенатором. Чем больше нуклеотидов в процессе чтения будет распознано верно, тем точнее будет результат прочтения всего генома. Явление наложения спектральных составляющих сигналов флуоресценции нуклеотидов A, C, G и T (явление перекрестных помех, в англоязычной литературе: сross-talk) – один из негативных факторов, препятствующий достоверному прочтению генома. Для борьбы с этим явлением необходим алгоритм цветокоррекции. Этот алгоритм является решающим в определении типа нуклеотида, находящегося в данных координатах (кластере) в данном цикле чтения. В работе рассматривается алгоритм цветокоррекции, позволяющий с помощью метода линейной регрессии определить матрицу перекрестных помех. На основе этой матрицы определяется обратная матрица, использование которой позволяет существенно снизить влияние наложения спектральных полос на точность оценки измерений сигналов флуоресценции. Алгоритм апробирован на экспериментальных данных и показал высокую достоверность результатов.