Квантово-химическое прогнозирование антирадикальной активности 11-дезоксимизопростола
Автор: Катаева Р.М., Аглетдинов Э.Ф., Латыпова Г.М., Катаев В.А., Халимов А.Р., Гизатуллин Т.Р.
Журнал: Волгоградский научно-медицинский журнал @bulletin-volgmed
Статья в выпуске: 3 (67), 2020 года.
Бесплатный доступ
Изучена и охарактеризована прямая антирадикальная активность этилового эфира (±)-11,15-дидезокси-16-метил-16-гидроксипростагландина E1 (11-дезоксимизопростол) при проведении квантово-химических расчётов. Проведены квантово-химические расчеты структуры 11-дезоксимизопростола (11-ДМП) и его радикальных производных с неспаренным электроном у атомов углерода в 12 и 15 положениях. При сравнивании Есв частиц установлено, что более устойчивой структурой является радикал R'ДОМП12* Исходя из полученных данных, представляется вполне вероятным, что 11-дезоксимизопростол может потенциально служить антиоксидантом прямого действия, способным образовывать более устойчивые и менее реакционноспособные радикалы, чем радикалы - производные полиненасыщенных жирных кислот (ПНЖК), участвующие в цепных процессах свободнорадикального окисления в живых системах.
11-дезоксимизопростол, квантово-химическое прогнозирование, антирадикальная активность, процессы свободнорадикального окисления
Короткий адрес: https://sciup.org/142225962
IDR: 142225962
Текст научной статьи Квантово-химическое прогнозирование антирадикальной активности 11-дезоксимизопростола
В патогенезе подавляющего большинства известных на сегодняшний день заболеваний важнейшее значение имеют неспецифические патохимические процессы, определяющие реактивность организма, его адаптивный потенциал при действии эндогенных и экзогенных факторов. Одним из наиболее значимых метаболических процессов такого рода является свободнорадикальное окисление [1]. Поэтому поиск и разработка новых эффективных антиоксидантных средств, обладающих комплексным действием, а также выявление и конкретизация свойств антиоксидантов у лекарственных веществ других фармакологических групп сохраняет актуальность [4, 5].
Исследуемое в рамках настоящей работы вещество, 11-дезоксимизопростол – этиловый эфир (±)-11,15-дидезокси-16-метил-16-гидро-ксипростагландина E1 (11-дезоксимизопростол, 11-ДМП) рассматривается как перспективное лекарственное средство с широким спектром фармакологической активности, обладающее свойствами антиоксиданта [2, 3]. Скрининг биологически активных веществ, согласно современным представлениям, является обязательным этапом при изучении антиоксидантной активности веществ. Механизм про- или антиоксидантного действия, реализуемый (или доминирующий) в конкретной ситуации, зависит от условий реакции и определяет суммарную выраженность про- и антиоксидантной активности in vivo. Поэтому для адекватного планирования эксперимента по изучению про- и антиоксидантной активности вещества in vivo и in vitro и трактовки его результатов необходимо располагать данными по квантовохимическому прогнозированию антирадикаль-ной активности [5, 8].
ЦЕЛЬ РАБОТЫ
Оценка возможности проявления антиоксидантных свойств 11-дезоксимизопростола путем квантово-химических расчетов структуры вещества и его радикальных производных.
МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЯ
Проведены квантово-химические расчеты структуры 11-ДМП и его радикальных производных с неспаренным электроном у атомов углерода в 12 и 15 положениях. В качестве структуры сравнения был выбран метиловый эфир линолевой кислоты (МЛ). Для структуры сравнения и её радикального производного с неспаренным электроном в 11-м положении углеродного скелета были проведены такие же квантово-химические расчеты с использованием программного обеспечения HyperChem Pro 6 (Hypercube Inc., США) [9]. Величины энергии связывания, значения порядков связей и зарядов на атомах рассчитывались как для изолированной частицы, находящейся в вакууме по-луэмпирическим методом AM1 (Austin Model 1) в модификации PM3. Этот же метод был использован для «оптимизации геометрии» структур по алгоритму Полака-Рибера [4].
Критерием оценки стабильности сравниваемых радикальных частиц являлась разность суммарной энергии связей частицы, образовавшейся при гомолитическом разрыве связи C-H (в рассмотренных структурах тетраэдрический углерод) и суммарной энергии связей той же радикальной частицы в режиме «оптимизации геометрии» (тригональный углерод). Дополнительным критерием оценки стабильности радикальных частиц взяты значения «порядков связей», образованных атомом углерода с неспаренным электроном и соседними атомами, орбитали которых перекрываются с p-орбиталью данного атома углерода, что служит характеристикой делокализации электронной плотности [4].
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
Структура сравнения, метиловый эфир линолевой кислоты (МЛ) – соединение близкое по структуре исследуемому веществу (11-ДМП), липидные производные которой подвержены процессам свободнорадикального окисления [10] в живых системах (рис. 1).

Рис. 1. Структура сравнения – метиловый эфир линолевой кислоты и его радикал
Для 11-дезоксимизопростола наиболее вероятными свободнорадикальными частицами представляются радикалы, образующиеся при гомолитическом разрыве связи C-H у 12-го или
15-го атомов углеродного скелета, соседних кратной связи атомов 13 и 14, поскольку это даёт возможность делокализации электронной плотности в π-системе трёх атомов (12, 13, 14)
или, соответственно, (13, 14, 15) и повышению устойчивости такого радикала (рис. 2).
Расчетные данные энергии связывания Е св для частиц RМЛ*, RДОМП12* и RДОМП15* составили соответственно: –21688,47 кДж/моль, –
25617,35 кДж/моль и –25601,96 кДж/моль. «Оптимизация геометрии» вышеприведённых радикальных частиц привела к изменению конфигурации атомов углерода с неспаренным электроном.


(R Д ОМП 12*) (R Д ОМП 15*)
Рис. 2. Радикалы, образующиеся при гомолитическом разрыве связи C-H у 12-го или 15-го атомов углеродного скелета 11-ДМП
Они приобрели тригональное строение и образовали планарные фрагменты:
-
- для RМЛ* (атомы С9, С10, С11, С12, С13);
-
- для RДОМП12* (атомы С12, С13, С14);
-
- для RДОМП15* (атомы С13, С14, С15).
Соответственно, Е св для этих радикальных частиц с планарными фрагментами R’МЛ*, R’ДОМП12* и R’ДОМП15* составили: – 21776,69 кДж/моль, –25711,10 кДж/моль и – 25691,46 кДж/моль. «Выигрыш» энергии вследствие делокализации электронной плотности составил соответственно: –88,22 кДж/моль, – 93,75 кДж/моль и –89,50 кДж/моль.
Порядки связи для R’ДОМП12* С12–С13 составили 1,34 и связи С13–С14 соответственно 1,41, а для R’ДОМП15* связь С13–С14 – 1,37 и С14–С15 – 1,40, что характеризует эти системы как достаточно высоко делокализованные. В радикале R’ДОМП12* частичные заряды на атомах составили: С12 δ = –0,145, С13 δ = –0,100 и C14 δ = –0,144, в радикале R’ДОМП15* частичные заряды на атомах также имеют близкие значения: С13 δ = –0,145, С14 δ = –0,112 и C15 δ = –0,139.
Сравнивая значения Е св частиц RМЛ*, RДОМП12*, RДОМП15* и R’МЛ*, R’ДОМП12*,
R’ДОМП15*, следует считать более предпочтительной, более устойчивой структурой радикал R’ДОМП12* и в сравнении с альтернативной структурой R’ДОМП15*, и в сравнении с типичными радикалами, такими как R’МЛ* – производными высших ненасыщенных жирных кислот (ВНЖК), входящих в состав липидов.
Исходя из полученных данных, представляется вполне вероятным, что 11-дезоксимизопростол может потенциально служить антиоксидантом прямого действия, способным образовывать более устойчивые и менее реакционноспособные радикалы, чем радикалы – производные ВНЖК, участвующие в цепных процессах свободнорадикального окисления в живых системах.
Кроме того, структура 11-дезоксимизопростола располагает двумя достаточно массивными углеродными цепочечными фрагментами, которые в реальных условиях могут создавать стерические препятствия для взаимодействия возможного радикала R’ДОМП12* и тем самым замедлять цепные процессы свободнорадикального окисления, а полярные группы -OH и карбонильные группы могут образовывать дополнительные водородные связи с молекулами воды и другими полярными биогенными молекулами, что может дополнительно стабилизировать данную радикальную частицу.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Таким образом, квантово-механические расчёты подтверждают исходную гипотезу о возможности проявления у 11-ДМП свойств антиоксиданта прямого действия, что дает дополнительные основания для изучения и детализации антирадикальной и антиоксидантной активности 11-ДМП in vitro и in vivo .
Список литературы Квантово-химическое прогнозирование антирадикальной активности 11-дезоксимизопростола
- Дубинина, Е. Е. Продукты метаболизма кислорода в функциональной активности клеток (жизнь и смерть, созидание и разрушение). Физиологические и клинико-биохимические аспекты / Е. Е. Дубинина - Санкт-Петербург: Медицинская пресса, 2006. - 397 с. - Текст: непосредственный.
- Исследование фармакокинетических свойств 11-дезоксимизопростола при внутрижелудочном введении - Текст: непосредственный / Р. М. Катаева, Э. Ф. Аглетдинов, К. В. Булыгин [и др.]. // Сеченовский вестник. - 2019. - Т. 10, № 1. - С. 22 - 28.
- Катаева, Р. М. Влияние 11-дезоксимизопростола на перекисное окисление липидов и окислительную модификацию белков плазмы крови - Текст: непосредственный / Р. М. Катаева // Медицинский вестник Башкортостана. - 2015. - Т. 10, № 6. - С. 41 - 44.
- Мартусевич, А. К. Антиоксидантная терапия: современное состояние, возможности и перспективы. - Текст: непосредственный / А. К. Мартусевич, К. А. Карузин, А. С. Самойлов // Биорадикалы и антиоксиданты. - 2018. - Т. 5, № 1. - C. 5 - 23.
- Минкин, В. И. Теория строения молекул / В. И. Минкин, Б. Я. Симкин, Р. М. Миняев. - Ростов-на-Дону: Феникс, 1997. - 560 с. - Текст: непосредственный.
- Прайер У. Свободные радикалы. - М.: Атомиздат, 1970. - 335 с. Текст: непосредственный.
- Руководство по проведению доклинических исследований лекарственных средств / А. Н. Миронов, Н. Д. Бунятян, А. Н. Васильев [и др.]. - М.: Гриф и К, 2012. - 944 с. - Текст: непосредственный.
- Тринеева, О. В. Методы определения антиоксидантной активности объектов растительного и синтетического происхождения в фармации (Обзор) - Текст: непосредственный / О. В. Тринеева // Разработка и регистрация лекарственных средств. - 2017. - № 4. - С. 180 - 197.
- Laxmi, D. HyperChem 6.03. - Direct text / D. Laxmi, S. Priyadarshy // Biotech. Software Internet Report: The Computer Software Journal for Scientists. - 2002. - Vol. 3, № 1. - P. 5 - 9.
- Umeno, A. Involvement of free radical-mediated oxidation in the pathogenesis of pseudoexfoliation syndrome detected based on specific hydroxylinoleate isomers. - Direct text / A. Umeno // Free Radic. Biol. Med. - 2020. - Vol. 147. - P. 61 - 68.