МЕТОДИКА ОЦЕНКИ КАЧЕСТВА ГЕНОМНОЙ СБОРКИ НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ЧАСТОТНОСТИ K-МЕРОВ В СЕКВЕНАТОРЕ ПАРАЛЛЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ

В настоящее время в связи с развитием приборостроения для проведения генетического анализа существует острая необходимость в разработке методик оценки качества геномной сборки. Подсчет встречаемости различных k-меров часто возникает в задачах сборки генома. В данной работе на основе анализа различных программных средств выбраны программы, которые позволяют оценить качество геномной сборки. С помощью выбранных программ обработаны данные, полученные на отечественном секвенаторе параллельного секвенирования Нанофор СПС. На основе результатов обработки этих данных произведена оценка качества геномной сборки по методике анализа k-меров для прибора Нанофор СПС