Микробное сообщество техногенно загрязненного грунта района солеразработок (г. Березники)
Автор: Ястребова О.В., Воронина А.О., Ананьина Л.Н., Корсакова Е.С., Плотникова Е.Г.
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 2, 2018 года.
Бесплатный доступ
С использованием молекулярно-генетических методов проведено исследование структуры микробного сообщества грунта, расположенного вблизи солеотвала БКПРУ-3 предприятия ПАО «Уралкалий» (г. Березники, Пермский край). Методом ПЦР-РВ фрагментов гена 16S рРНК в тотальной ДНК исследуемого образца грунта выявлено наличие бактериальных генов 16S рРНК в количестве 6.6 х 1011 (±8.87 х 107) копий гена на 1 г грунта, а также доминирование грамотрицательных бактерий. ДГГЭ-анализ генов 16S рРНК, амплифицированных с тотальной ДНК, выявил, что бактериальные сообщества накопительных культур, полученных на бифениле и ортио-фталате, существенно различаются между собой, а также отличаются от исходного сообщества образца грунта как по составу, так и наличием доминирующих видов. Установлено, что в полученных НК доминировали грамотрицательные бактерии классов Gammaproteobacteria и Acidobacteria. Методом ДГГЭ-анализа в исследуемом микробном сообществе выявлены «некультивируемые» бактерии рода Halomonas, ранее не обнаруженные культуральны-ми методами.
Денатурирующий градиентный гель-электрофорез, ген 16s ррнк, некультивируемые бактерии, ортио-фталат, бифенил
Короткий адрес: https://sciup.org/147227017
IDR: 147227017
Список литературы Микробное сообщество техногенно загрязненного грунта района солеразработок (г. Березники)
- Бачурин Б.А. Эколого-геохимическая характеристика отходов калийного производства // Горный журнал. 2008. Т. 10. С. 88-91
- Бачурин Б.А., Одинцова Т.А. Отходы горно-обогатительного производства как источники эмиссии органических поллютантов // Горный информационно-аналитический бюллетень. 2009. Вып. 7. С. 374-380
- Бачурин Б.А., Одинцова Т.А., Первова Е.С. Эколо-го-геохимическая характеристика флотореаген-тов // Материалы II Всерос. науч. виртуал. он-лайн-конф. «Химическая наука: современные достижения и историческая перспектива). Казань, 2014. С. 17-22
- Воронина А.О. и др. Гены деструкции ароматических соединений в микробном сообществе почвы, загрязнённой отходами калийного производства (г. Березники, Пермский край) // Материалы X Всерос. конгресса молодых учёныхбиологов «Симбиоз-Россия-2017). Казань, 2017. С. 73-74
- Кандаурова Ю.М., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы орто-фталевой кислоты, выделенные из района добычи и переработки калийных солей (г. Березники, Пермский край) // Материалы XIV Всерос. науч.-практ. конф. с междунар. участием «Биодиагностика состояния природных и природно-техногенных систем). Киров, 2016. С. 329-332
- Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы стойких органических загрязнителей - эфиров фталевой кислоты, как основа для создания новых экобиотехнологий // Известия Самарского научного центра РАН, 2013. Т. 15, № 3(5). С. 1633-1636
- Корсакова Е.С. и др. Разнообразие бактерий-деструкторов органических загрязнителей шла-мохранилища калийного производства (г. Березники, Пермский край) // Российский иммунологический журнал. 2015. Т. 9, № 2. С. 591-593
- Назаров А.В. и др. Влияние нефтяного загрязнения на бактерии дерново-подзолистой почвы // Почвоведение. 2010. Т. 12. С. 1489-1493
- Панов А.В. и др. Влияние загрязнения почвы на состав микробного сообщества // Микробиология. 2013. Т. 82, № 2. С. 239-246
- Розанова Е.П., Назина Т.Н. Углеводородокисляющие бактерии и их активность в нефтяных пластах // Микробиология. 1982. Т. 51. С. 324-348
- Castle D.M., Montgomery M.T., Kirchman D.L. Effects of naphthalene on microbial community composition in the Delaware estuary // FEMS Microbiol. Ecol. 2006. Vol. 56. P. 55-63
- Dickinson I. et al. Extremophiles in an Antarctic marine ecosystem // Microorganisms. 2016. Vol. 4(1). Р. 8.
- DOI: 10.3390/microorganisms4010008
- Feris K.P. et al. A shallow BTEX and MTBE contaminated aquifer supports a diverse microbial community // FEMS Microb. Ecol. 2004. Vol. 48. P. 589-600
- Fierer N. et al. Assessment of soil microbial community structure by use of taxon-specific quantitative PCR assays // Applied And Environmental Microbiology. 2005. Vol. 71, № 7. P. 4117-4120
- Gutierrez T. et al. Role of bacterial exopolysaccha-rides (EPS) in the fate of the oil released during the deepwater horizon oil spill // PLOS ONE. June 2013. Vol. 8, № 6. e67717
- Muyzer G., de Waal E.C., Uitterlinden A.G. Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of poly-merase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA // Applied and Environmental Microbiology. 1993. Vol. 59. P. 695-700
- Puspita I.D. et al. Are uncultivated bacteria really un-cultivable? // Microbes and Environments. 2012. Vol. 27, № 4. Р. 356-366
- Tiirola M.A. et al. Isolation and characterization of No-vosphingobium sp. strain MT1, a dominant poly-chlorophenol-dagrading strain in a groundwater bioremediation system // Applied and Environmental Microbiology. 2002. Vol. 68. P. 173-180.
- Vin~asM. et al. Bacterial community dynamics and poly-cyclic aromatic hydrocarbon degradation during bio-remediation of heavily creosote-contaminated soil // Applied and Environmental Microbiology. 2005. Vol. 71, № 11. P. 7008-7018
- Zaitsev G.M. et al. Genetic control of degradation of chlorinated benzoic acids in Arthrobacter globi-formis, Corynebacterium sepedonicum and Pseu-domonas cepacia strains // FEMS Microbiol. Lett. 1991. Vol. 81. P. 171-176
