Мутационный профиль КRAS-позитивного колоректального рака

Мутационный профиль КRAS-позитивного колоректального рака

Автор: Телышева Е.Н., Шайхаев Е.Г., Снигирева Г.П.

Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj

Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования

Статья в выпуске: 1 т.21, 2022 года.

Бесплатный доступ

Цель исследования - изучение особенностей молекулярно-генетического профиля KRAS -позитивного колоректального рака (КРР). материал и методы. В исследование было включено 42 пациента с диагнозом колоректальный рак, в опухолевой ткани которых методом ПЦР в режиме «реального времени» выявлена мутация в гене KRAS. С помощью технологии секвенирования нового поколения (Ngs) на платформе illumina были проанализированы гены, участвующие в молекулярном патогенезе КРР: KRAS, BRAF, NRAS, APC, TP53, SMAD2, SMAD4, FBXW7, PIK3CA, CTNNB1, TCF7L2, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, ATM, TGF-BR2, AKT1, CDC27, CASP8, MAP2K4, DCC, DMD, MAP7, ERBB2, P3H3, MIER3, CADM1, FLT4, PTPN12, PIK3R1, EP300 . Пробоподготовку библиотек из выделенной ДНК проводили с использованием коммерческих наборов geneRead dNaseq targeted panel v2 Human colorectal cancer («Qiagen», США); NeBNext ultra dNa library prep kit for illumina и NeBNext multiplex oligos for illumina («New england Biolabs»). результаты. У 36 пациентов с KRAS -позитивным КРР зарегистрированы изменения в 13 генах, участвующих в молекулярном патогенезе заболевания. Всего было выявлено 82 соматические мутации. При этом у 9 больных дополнительно выявлено по одной мутации, у 17 - по 2 мутации, у 7 - по 3 мутации и у 3 - по 4 мутации. Сочетание сразу трех мутаций в ключевых генах, отвечающих за патогенез КРР ( KRAS, APC и TP53 ), было выявлено у 15 (36 %) больных. Сочетание двух мутаций в генах KRAS и APC выявлено у 10 (24 %) больных, в генах KRAS и TP53 - у 8 (19 %) больных. Самое большое количество соматических мутаций выявлено в генах APC (59,5 %) и TP53 (54,7 %). Показано, что сочетание трех мутаций в ключевых генах ( KRAS, APC и TP53 ) является наиболее неблагоприятным фактором прогноза и может свидетельствовать о более высокой агрессивности опухолевого процесса. заключение. Полученная с помощью метода Ngs информация о мутационном статусе KRAS-позитивной опухоли пациентов с КРР позволяет с учетом клинически

Еще

Колоректальный рак, соматические мутации, секвенирование нового поколения (ngs), таргетная терапия

Короткий адрес: https://sciup.org/140290556

IDR: 140290556   |   DOI: 10.21294/1814-4861-2022-21-1-47-56

Список литературы Мутационный профиль КRAS-позитивного колоректального рака

  • Arnold M., Sierra M.S., Laversanne M., Soerjomataram I., Jemal A., Bray F. Global patterns and trends in colorectal cancer incidence and mortality. Gut. 2017; 66(4): 683–91. doi: 10.1136/gutjnl-2015-310912.
  • Stewart B.W., Bray F., Forman D., Ohgaki H., Straif K., Ullrich A., Wild C.P. Cancer prevention as part of precision medicine: ‘plenty to be done’. Carcinogenesis. 2016; 37(1): 2–9. doi: 10.1093/carcin/bgv166.
  • Состояние онкологической помощи населению России в 2016 году / под ред. А.Д. Каприна, В.В. Старинского, Г.В. Петровой. М., 2017. 236 c. [The state of cancer care for the population of Russia in 2016 / Eds. A.D. Kaprin, V.V. Starinskiy, G.V. Petrov. Moscow, 2017. 236 p. (in Russian)].
  • Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2015 году (заболеваемость и смертность). М., 2017. 250 с. [Kaprin A.D., Starinskiy V.V., Petrova G.V. Malignant neoplasms in Russia in 2015 (morbidity and mortality). Moscow, 2017. 250 p. (in Russian)].
  • Armaghany T., Wilson J.D., Chu Q., Mills G. Genetic alterations in colorectal cancer. Gastrointest Cancer Res. 2012; 5(1): 19–27.
  • Кит О.И., Водолажский Д.И. Молекулярная биология колоректального рака в клинической практике. Молекулярная биология. 2015; 49(4): 531–40. [Kit O.I., Vodolazhskii D.I. The molecular biology of colorectal cancer in clinical practice. Molecular Biology. 2015; 49(4): 531–40. (in Russian)].
  • Price T.J., Tang M., Gibbs P., Haller D.G., Peeters M., Arnold D., Segelov E., Roy A., Tebbutt N., Pavlakis N., Karapetis C., Burge M., Shapiro J. Targeted therapy for metastatic colorectal cancer. Expert Rev Anticancer Ther. 2018; 18(10): 991–1006. doi: 10.1080/14737140.2018.1502664.
  • Cai Z.X., Tang X.D., Gao H.L., Tang C., Nandakumar V., Jones L., Ye H., Lou F., Zhang D., Sun H., Dong H., Zhang G., Liu Z., Dong Z., Guo B., Yan H., Yan C., Wang L., Su Z., Wang F.Y., Wan J.J., Fang F.O., Chen H.L., Shang D., Huang X.F., Chen S.Y., Guo H.S. APC, FBXW7, KRAS, PIK3CA, and TP53 Gene Mutations in Human Colorectal Cancer Tumors Frequently Detected by Next-Generation DNA Sequencing. J Mol Genet Med. 2014; 8: 4. doi: 10.4172/1747-0862.1000145.
  • Afrăsânie V.A., Marinca M.V., Alexa-Stratulat T., Gafton B., Păduraru M., Adavidoaiei A.M., Miron L., Rusu C. KRAS, NRAS, BRAF, HER2 and microsatellite instability in metastatic colorectal cancer – practical implications for the clinician. Radiol Oncol. 2019; 53(3): 265–74. doi: 10.2478/raon-2019-0033.
  • Lupini L., Bassi C., Mlcochova J., Musa G., Russo M., Vychytilova-Faltejskova P., Svoboda M., Sabbioni S., Nemecek R., Slaby O., Negrini M. Prediction of response to anti-EGFR antibody-based therapies by multigene sequencing in colorectal cancer patients. BMC Cancer. 2015; 15: 808. doi: 10.1186/s12885-015-1752-5.
  • Гервас П.А., Литвяков Н.В., Попова Н.О., Добродеев А.Ю., Тарасова А.С., Юмов Е.Л., Иванова Ф.Г., Черемисина О.В., Афанасьев С.Г., Гольдберг В.Е., Чердынцева Н.В. Проблемы и перспективы совершенствования молекулярно-генетической диагностики для назначения таргетных препаратов в онкологии. Сибирский онкологический журнал. 2014; 2: 46–55. [Gervas P.A., Litviakov N.V., Popova N.O., Dobrodeev A.Yu., Tarasova A.S., Yumov E.L., Ivanova F.G., Cheremisina O.V., Afanasyev S.G., Goldberg V.E., Cherdyntseva N.V. Problem and perspective to improve molecular testing to choose appropriate target therapy. Siberian Journal of Oncology. 2014; 2: 46–55. (in Russian)].
  • Therkildsen C., Bergmann T.K., Henrichsen-Schnack T., Ladelund S., Nilbert M. The predictive value of KRAS, NRAS, BRAF, PIK3CA and PTEN for anti-EGFR treatment in metastatic colorectal cancer: A systematic review and meta-analysis. Acta Oncol. 2014; 53(7): 852–64. doi: 10.3109/0284186X.2014.895036.
  • Lin P.S., Semrad T.J. Molecular Testing for the Treatment of Advanced Colorectal Cancer: An Overview. Methods Mol Biol. 2018; 1765: 281–97. doi: 10.1007/978-1-4939-7765-9_18.
  • Ben Brahim E., Ayari I., Jouini R., Atafi S., Koubaa W., Elloumi H., Chadli A. Expression of epidermal growth factor receptor (EGFR) in colorectal cancer: An immunohistochemical study. Arab J Gastroenterol. 2018; 19(3): 121–4. doi: 10.1016/j.ajg.2018.08.002.
  • Gleeson F.C., Kipp B.R., Voss J.S., Campion M.B., Minot D.M., Tu Z.J., Klee E.W., Sciallis A.P., Graham R.P., Lazaridis K.N., Henry M.R., Levy M.J. Endoscopic ultrasound fine-needle aspiration cytology mutation profiling using targeted next-generation sequencing: personalized care for rectal cancer. Am J Clin Pathol. 2015; 143(6): 879–88. doi: 10.1309/AJCPU3J7FGAYQBRL.
  • Chang P.Y., Chen J.S., Chang N.C., Chang S.C., Wang M.C., Tsai S.H., Wen Y.H., Tsai W.S., Chan E.C., Lu J.J. NRAS germline variant G138R and multiple rare somatic mutations on APC in colorectal cancer patients in Taiwan by next generation sequencing. Oncotarget. 2016; 7(25): 37566–80. doi: 10.18632/oncotarget.8885.
  • Cornejo K.M., Cosar E.F., Paner G.P., Yang P., Tomaszewicz K., Meng X., Mehta V., Sirintrapun S.J., Barkan G.A., Hutchinson L. Mutational Profile Using Next-Generation Sequencing May Aid in the Diagnosis and Treatment of Urachal Adenocarcinoma. Int J Surg Pathol. 2020; 28(1): 51–9. doi: 10.1177/1066896919872535.
  • Dallol A., Buhmeida A., Al-Ahwal M.S., Al-Maghrabi J., Bajouh O., Al-Khayyat S., Alam R., Abusanad A., Turki R., Elaimi A., Alhadrami H.A., Abuzenadah M., Banni H., Al-Qahtani M.H., Abuzenadah A.M. Clinical significance of frequent somatic mutations detected by high-throughput targeted sequencing in archived colorectal cancer samples. J Transl Med. 2016; 14(1): 118. doi: 10.1186/s12967-016-0878-9.
  • Имянитов Е.Н. Клинико-молекулярные аспекты колоректального рака: этиопатогенез, профилактика, индивидуализация лечения. Практическая онкология. 2005; 6 (2): 65–70. [Imyanitov E.N. Clinical and molecular aspects of colorectal cancer: etiopathogenesis, prevention, individualization of treatment. Practical Oncology. 2005; 6 (2): 65–70. (in Russian)].
  • Schell M.J., Yang M., Teer J.K., Lo F.Y., Madan A., Coppola D., Monteiro A.N., Nebozhyn M.V., Yue B., Loboda A., Bien-Willner G.A., Greenawalt D.M., Yeatman T.J. A multigene mutation classification of 468 colorectal cancers reveals a prognostic role for APC. Nat Commun. 2016; 7: 11743. doi: 10.1038/ncomms11743.
  • Wang C., Ouyang C., Cho M., Ji J., Sandhu J., Goel A., Kahn M., Fakih M. Wild-type APC Is Associated with Poor Survival in Metastatic Microsatellite Stable Colorectal Cancer. Oncologist. 2021; 26(3): 208–14. doi: 10.1002/onco.13607.
  • Li X.L., Zhou J., Chen Z.R., Chng W.J. P53 mutations in colorectal cancer – molecular pathogenesis and pharmacological reactivation. World J Gastroenterol. 2015; 21(1): 84–93. doi: 10.3748/wjg.v21.i1.84.
  • Conlin A., Smith G., Carey F.A., Wolf C.R., Steele R.J. The prognostic significance of K-ras, p53, and APC mutations in colorectal carcinoma. Gut. 2005; 54(9): 1283–6. doi: 10.1136/gut.2005.066514.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp