Наносенс и калибровка портативных биосенсорных аналитических устройств с использованием ДНК-биодатчиков

Хромов А.В. Никулин А.В. Компанец Олег Николаевич Чулков Д.П.

Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie

Рубрика: Работы с конференции

Статья в выпуске: 1 т.29, 2019 года.

Бесплатный доступ

Обсуждается возможность использования высокостабильного лекарственного противоракового препарата Наносенс в качестве дополнительного стандарта оптической активности для калибровки портативных биосенсорных аналитических устройств на основе ДНК-биодатчиков и дихрометра.

оптическая активность \ круговой дихроизм \ калибровка дихрометра \ биосенсор на основе днк \ биологически активные соединения

Похожие статьи в разделе Oтрасли промышленности и ремесла для изготовления и обработки различных изделий

Многофункциональная аналитическая система для определения характеристик оптического сигнала кругового дихроизма биологически активного материала
Многофункциональная аналитическая система для определения характеристик оптического сигнала кругового дихроизма биологически активного материала

Верещагин Ф.В., Гусев В.М., Компанец Олег Николаевич, Павлов М.А., Чулков Д.П., Евдокимов Ю.М., Скуридин С.Г.

Компактная оптическая биосенсорная аналитическая система для медицины
Компактная оптическая биосенсорная аналитическая система для медицины

Верещагин Ф.В., Гусев В.М., Компанец Олег Николаевич, Павлов М.А., Чулков Д.П., Евдокимов Ю.М., Скуридин С.Г.

Исследование взаимодействия модифицированной боронитридной наноструктуры с молекулой ацетона
Исследование взаимодействия модифицированной боронитридной наноструктуры с молекулой ацетона

Борознина Наталья Павловна, Ерофеев Данил Романович, Борознин Сергей Владимирович

К вопросу о токсичности препаратов на основе наноселена
К вопросу о токсичности препаратов на основе наноселена

Карпова Е.А., Демиденко О.К., Ильина О.П.

Короткий адрес: https://sciup.org/142218195

IDS: 142218195   |   УДК: 681.7.08   |   DOI: 10.18358/np-29-1-i7681

Nanosens and calibration of portable biosensor analytical devices with using DNA biosensing units

The possibility of using the highly stable anti-cancer drug Nanosens as an additional standard of optical activity for calibration of portable biosensor analytical devices based on DNA biosensing units and a dichrometer is discussed.

Текст научной статьи Наносенс и калибровка портативных биосенсорных аналитических устройств с использованием ДНК-биодатчиков

Спектрометры оптического кругового дихроизма (КД) — дихрометры — используются во многих лабораториях для изучения физико-химических свойств природных соединений и химических веществ, в том числе их оптической активности. В последнее время дихрометры стали широко применяться в портативных биосенсорных аналитических системах с использованием в качестве биодатчиков "жидких" частиц холестерической жидкокристаллической дисперсии (ХЖКД) или наноконструкций (НаК) двухцепочечной ДНК, в которых молекулы ДНК пространственно упорядочены и "сшиты" между собой различными наномостиками [1, 2]. Для биодатчиков на основе НаК ДНК характерна не только аномальная оптическая активность, проявляемая в виде интенсивной полосы в спектре КД на длине волны ~ 260– 270 нм, но и дополнительная аномальная оптическая активность в области поглощения элементов наномостиков (450–650 нм), "сшивающих" НаК ДНК, в частности хромофоров антибиотиков. Величина аномальной оптической активности таких биодатчиков в полосе поглощения антибиотика остается неизменной в течение длительного времени и может уменьшаться (вплоть до полного исчезновения) под действием биологически активных соединений (БАС), "мишенью" для которых служат структурные элементы наномостиков. Встраивание в структуру "жидких" частиц ХЖКД ДНК биологически активных соединений (например, противоопухолевых антибиотиков) также приводит к появлению в спектре кругового дихроизма дополнительной аномальной полосы в видимой области спектра, амплитуда которой исполь- зуется для установления в анализируемой жидкой среде их наличия и концентрации.

Задачу исследования оптических свойств и контроля качества биодатчиков на основе ДНК, а также изменения этих свойств при взаимодействии с БАС можно решать с использованием портативных дихрометров, работающих как в широком диапазоне длин волн от 200 до 750 нм (излучатель — ксеноновая лампа), так и на дискретных длинах волн (источники — миниатюрные светоизлучающие диоды), одна из которых — 270 нм, а другие в полном соответствии с особенностями спектра КД ДНК-биодатчиков, — на длинах волн дополнительной аномальной полосы КД в видимой области спектра. Важным требованием при этом остается точность измерений дихрометром величины оптической активности исследуемого биодатчика в исходном состоянии и при его взаимодействии с БАС. Важно также, чтобы соединения, используемые в качестве эталонов оптической активности, были стабильными и могли воспроизводить эту характеристику в течение длительного периода. Для повышения точности калибровки желательно, чтобы характерные рабочие линии в спектре КД эталонных соединений находились в области длин волн, в которой используется дихрометр биосенсорной системы.

В качестве эталонных соединений для измерения регистрируемой дихрометром характеристики оптической активности чаще всего используют d-10-пропиламмниевую соль камфорсульфоновой кислоты (КСК), водный раствор которой обладает КД положительного знака при λ = = 290.5 нм и отрицательного знака при λ = = 192.2 нм, и d-10-камфорсульфонат с практически теми же характеристиками, а также

Наносенс

Длина волны, нм

Рис. 2. П ол ож е ни е а номальной полос ы К Д ХЖК Д Д НК отри ц ат е л ьн ого зна к а , п ол ос КД КСК и Наносен с а ( п ол ожит е льного з н а к а) в обла с ти 30 0 нм и аномальных полос КД отрицательного знака (пункт и рные л и н ии) мол е к у лярных и н ан о -конструкций (НаК) ДНК с разными интеркаля-торам и , в страи в аемыми в их структуру, в области 500 нм.

Видно, что спектр КД Наносенса хорошо "накладывается" на положение полос КД в обеих областях спектра иодид трис(этилендиамин)кобальта(III) моногидрата, водный раствор которого генерирует полосу КД с максимумом при 490 нм [3].

Для тестирования и калибровки оптической ак- тивности биодатчиков на основе ДНК предлагалось использовать также полимерные материалы на основе вышеупомянутых наноконструкций ДНК, включенных в состав полимерного гидроге- ля [4]. Существенным недостатком, препятствующим использованию таких материалов для калибровки дихрометров, остается сложность их изготовления: по этой причине они могут быть доступны пока только узким специалистам, профессионально работающим с НаК ДНК и полимерными гелями.

В настоящей работе предлагается рассмотреть в качестве вторичного стандарта оптической активности в области длин волн, на которых работают дихрометры биосенсорных устройств, разработанный в НИОПИК препарат Наносенс, имеющий характерные рабочие линии в спектре КД одновременно как в ультрафиолетовой, так и в видимой областях спектра (рис. 1), которые стабильны и могут воспроизводить характеристику оптической активности в течение длительного периода (более трех лет).

НАНОСЕНС И ЕГО ОПТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА

Наносенс представляет собой стабильную нанодисперсию фталоцианина цинка (средний размер частиц 100–150 нм) — органического красителя (пигмента), практически нерастворимого в воде и органических растворителях, в виде жидкости ярко-синего цвета с содержанием фталоцианина цинка 0.1–0.2 %, поверхностно-активной добавки (Проксанол 268) 0.1–10.0 %, хлорида натрия 0.1–1.5 % и воды (остальное). Химическое название препарата — тетрабензо-5,10,15,20-тетрааза-порфирин цинка. Хранится он в защищенном от света месте при температуре не выше 8 ºС или в замороженном виде при температуре не выше –8 ºС. Основное назначение препарата — лечение злокачественных новообразований методом импульсной лазерной абляции наночастиц [5]. После лазерного облучения некоторая часть фталоцианина цинка, находящегося в опухоли в виде наночастиц и подвергшаяся воздействию лазерного импульса, прямо на месте воздействия излучения испаряется и переходит в молекулярную форму, превращаясь в один из самых эффективных фотосенсибилизаторов для фотодинамической терапии. При дополнительном облучении опухоли непрерывным лазером фотосенсибилизатор генерирует синглетный кислород и перекись водорода, которые поражают клетки опухоли повторно — тем самым реализуется двойное избирательное воздействие на опухоль при однократном введении препарата.

Спектр кругового дихроизма Наносенса (с исходной концентрацией 2 мг/мл) в области 190– 750 нм приведен на рис. 1. Он имеет два выраженных пика: положительный на длине волны 295 нм и отрицательный на длине волны 550 нм. Для сравнения на рис. 2 показаны положения аномаль- ных полос КД комплексов ДНК с интеркалятора-ми (раздельно) дауномицином, порфином, миток-сантроном, сангвиритрином, PicoGreen, SYBR Green, оптическую активность которых и связанную с нею концентрацию требуется контролировать.

НАНОСЕНС КАК ВТОРИЧНЫЙ СТАНДАРТ ОПТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ

Предпосылки

Решение поставленной задачи состоит в определении и контроле характеристик оптической активности Наносенса при помощи первичного эталона (водный раствор КСК) и поверки характеристик КД дихрометров биосенсорных устройств на основе ДНК при их работе в УФ и видимом диапазонах длин волн по аттестованным характеристикам оптической активности Наносенса. В данной работе все измерения выполнялись на спектрометре кругового дихроизма (дихромет-ре) СКД-2МУФ, входящем в состав биосенсорной аналитической системы, в которой в качестве биодатчика используются "жидкие" частицы ХЖКД комплексов ДНК с интеркаляторами.

Решению задачи, как следует из сказанного выше, способствуют:

  •    наличие аномальной положительной полосы в спектре КД Наносенса на длине волны 295 нм;

  •    стабильность амплитуды и положения этой полосы при установленной концентрации раствора препарата;

  •    близость указанной полосы Наносенса в УФ-области к полосе КД положительного знака на 290.5 нм первичного эталона — водного раствора КСК;

  •    наличие дополнительной оптической активности Наносенса, проявляемой в виде отрицательной полосы в спектре его КД на длине волны 550 нм, располагаемой в области аномальных полос КД "жидких" частиц ХЖКД комплексов ДНК с интеркаляторами;

  •    наличие для Наносенса при соблюдении фиксированных условий его разбавления определенного соотношения между амплитудой интенсивной положительной полосы в спектре КД в УФ-области (295 нм) и амплитудой отрицательной полосы в видимом диапазоне (550 нм);

  •    долговременная стабильность оптических характеристик Наносенса.

Калибровка дихрометров по величине оптической активности Наносенса реализуется в три этапа.

Этап 1 калибровки

На этапе 1 определяется величина оптической активности на длине волны 295 нм (Δ А НС, 295 ) стандартного раствора Наносенса (2 мг/мл), содержащего распределенные по объему наночастицы фталоцианина. Для ее определения используются близость полос КД и наблюдаемое при измерениях соотношение k 1 между величинами (амплитудами) регистрируемых дихрометром положительного сигнала КД раствора эталона (КСК) на длине волны 290.5 нм (КДΔ A 290 ), соответствующего [3] известной величине эталонной оптической активности раствора КСК (Δ А эталон ), и положительного сигнала КД раствора Наносенса с максимумом КДΔ A 295 на длине волны 295 нм.

Cпектрометр КД измеряет отношение переменной составляющей сигнала на частоте модуляции круговой поляризации излучения (с длиной волны λ ), пропорциональной величине кругового дихроизма Δ А λ ( Δ А λ = ( A R А L ) λ — разность поглощения А λ в веществе света с правой и левой круговыми поляризациями), к постоянной составляющей регистрируемого сигнала, пропорциональной средней величине светового потока I λ . При этом переменная составляющая величины измеряемого на выходе фотоприемника сигнала КД Δ U λ = Δ I λ × × S λ × T λ , а постоянная (не модулированная) составляющая U 0 = I λ × S λ ( S λ — чувствительность фотоприемника, T λ — величина усиления электронного тракта спектрометра КД), из чего следует Δ U λ = (Δ I λ / I λ ) × U 0 × T. В этих условиях регистрируемые при измерениях сигналы КД растворов КСК и Наносенса можно записать в виде:

  • КДΔ A 290 = Δ А КСК, 290 × U 0 ( I 290 × S 290 ) × Т 290

и

  • КДΔ A 295 = Δ А НС, 295 × U 0 ( I 295 × S 295 ) × T 295 .

С учетом одинакового значения усиления электронного тракта Т для двух близких длин волн (290.5 и 295 нм) находим из приведенных выше выражений искомое значение Δ А НС, 295 КД раствора Наносенса (толщиной L ) на основе наночастиц фталоцианина цинка на длине волны 295 нм:

Δ А НС, 295 = k 1 ( A L A R ) КСК, 290 = k 1 Δ ε КСК, 290 С КСК, М L .

Здесь круговой дихроизм водного раствора КСК Δ ε КСК, 290 = 2.37 М –1 см –1 и является эталонной величиной для КСК на длине волны 290.5 нм , концентрация С КСК, М выражена в М/л и длина оптического пути L — в см [3].

Для калибровки используются водные растворы КСК, имеющие концентрацию 3, 15, 150 мкг/мл, с оптической плотностью соответственно 31 × 10–6, 154 × 10–6 и 1544 × 10–6 оптических единиц (о.е.) и растворы Наносенса с такой же концентрацией. Исходя из измеренной величи- ны сигнала КД раствора Наносенса на длине волны 295 нм, находим, что оптической плотности раствора Наносенса ΔАНС, 295 = 150 × 10–6 о.е. соответствует концентрация КСК в растворе СКСК = = 6.5 × 10–5 М/л (при длине оптического пути в кювете L = 1 см). Это означает, что при помощи спектрометра КД, откалиброванного согласно описанной выше процедуре измерений и ставшего в результате этого рабочим средством измерения КД, можно проводить тестирование и определение величины сигнала КД любого другого оптически активного соединения или материала при облучении его циркулярно-поляризованным светом вблизи 295 нм, исходя из соотношения регистрируемых спектрометром КД сигналов КД этого соединения (материала) и дополнительного стандарта — раствора Наносенса (КДΔA295).

Этап 2 калибровки

На этапе 2 определяется величина Δ А НС, 537 кругового дихроизма раствора Наносенса в видимой области. При определении этой величины используем, во-первых, определенную на этапе 1 величину оптической активности на длине волны 295 нм (Δ А НС, 295 ) раствора Наносенса и, во-вторых, измеренное соотношение k 2 максимума сигнала КД Наносенса на длине волны 295 нм (КДΔ A 295) и наблюдаемого минимума его сигнала КД в видимой области на длине волны 550 нм:

Δ А НС, 550 = k 2 × Δ А НС, 295 × Т 295 / T 550

(здесь Т 295 и T 550 — измеряемые характеристики усиления Т λ электронного тракта дихрометра в фиксированной полосе частот на указанных выше длинах волн).

Этап 3 калибровки

На этапе 3 полученные на дихрометре характеристики КД дополнительного стандарта на основе раствора Наносенса на длине волны 550 нм используются непосредственно для калибровки в видимой области оптической активности образцов, имеющих в своем составе "жидкие" частицы ХЖКД комплексов "ДНК + интеркалятор" (рис. 2). Задача определения величины (КДΔ A ДНК+БАС, вид ) решается аналогично решенной на этапе 1, т. е. путем непосредственного измерения соотношения k i сигналов КД Δ А НС , 550 и сигналов КД в видимой области спектра образцов, содержащих тот или иной ( i -й) комплекс "ДНК + интеркалятор", например, "ДНК-SYBR Green", при этом используется близость их полос КД ( Т 550 ~ T 500 ). Аналогичным образом могут быть получены результаты измерения КД других образцов, содержащих комплексы "ДНК-PicoGreen", "ДНК-сангвиритрин", "ДНК-дауномицин", "ДНК-митоксантрон".

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Проведение описанных выше измерительных процедур означает, что при помощи дихрометра, откалиброванного таким образом и ставшего рабочим средством измерения КД на длине волны 295 и 550 нм, можно проводить определение оптической активности любого другого обладающего этим свойством соединения при облучении его циркулярно поляризованным светом, исходя из соотношения регистрируемых дихрометром сигналов КД от этого соединения (материала) и от вторичного стандарта на основе раствора Наносенса.

Рассмотренный способ калибровки спектрометров кругового дихроизма (поверки измерительной системы спектрометра КД), входящих в состав биосенсорных систем на основе ДНК-биодатчиков, с применением в качестве дополнительного стандарта оптической активности (кругового дихроизма) растворов препарата Наносенс, содержащих наночастицы фталоцианина цинка, может найти применение в спектральном приборостроении и аналитической биохимии, в том числе клинической биохимии.

Список литературы Наносенс и калибровка портативных биосенсорных аналитических устройств с использованием ДНК-биодатчиков

  • Евдокимов Ю.М., Салянов В.И., Семенов С.В., Скуридин С.Г. Жидкокристаллические дисперсии и наноконструкции ДНК/Под ред. Ю.М. Евдокимова. М.: Радиотехника, 2008. 294 с.
  • Евдокимов Ю.М., Салянов В.И., Скуридин С.Г. Наноструктуры и наноконструкции на основе ДНК/Под ред. Ю.М. Евдокимова. М.: САЙНС-ПРЕСС, 2010. 254 с.
  • Schippers P.H., Dekkers H.P.J.M. Direct determination of absolute CD data and calibration of commercial instruments//Analitical Chemistry. 1981. Vol. 53, no. 6. P. 778-782 DOI: 10.1021/ac00229a008
  • Гусев В.М., Компанец О.Н., Павлов М.А., Чулков Д.П., Евдокимов Ю.М., Скуридин С.Г. Наноконструкции ДНК для тестирования и калибровки спектрометров кругового дихроизма//Наукоемкие технологии. 2013. № 4. C. 68-76.
  • Хромов А.В., Коган Б.Я., Фейзулова Р.К.-Г., Панкратов А.А., Якубовская Р.И. Доклинические исследования лекарственного препарата Наносенс//Biomedical Photonics. 2015. № S1. С. 12-13.