Неинвазивныe методы молекулярной диагностики и клинического наблюдения и подходы к подбору персональной терапии при высокозлокачественных диффузных глиомах ствола мозга

Неинвазивныe методы молекулярной диагностики и клинического наблюдения и подходы к подбору персональной терапии при высокозлокачественных диффузных глиомах ствола мозга

Автор: Петерсен Е.В., Чудакова Д.А., Эрдынеева Д.Б., Калинкин А.А., Кларос Р., Шабалина Е.Ю., Гудков Д.А., Мынбаев О.А., Решетов И.В.

Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj

Рубрика: Обзоры

Статья в выпуске: 3 т.22, 2023 года.

Бесплатный доступ

Цель исследования - обобщение и анализ современных данных о неинвазивной молекулярной диагностике и соответствующих подходах к персонализированной терапии высокозлокачественных диффузных глиом ствола мозга (ДГСМ). материал и методы. Поиск соответствующих источников производился в системах Google Scholar, Pubmed, Elsevier, Web of Science, Elibrary. В обзор включены публикации с 2011 по 2022 г. Из 102 найденных статей 59 были использованы для написания обзора. Результаты. В обзоре рассмотрены спектр соматических драйверных мутаций, присутствующих в опухолевых клетках ДГСМ, и их связь с чувствительностью опухолевых клеток к определенным видам терапии - фармакогенетический подход к подбору индивидуальных методов лечения (таргетная терапия). Обсуждаются новые методы таргетной терапии ДГСМ, находящиеся на стадии доклинической лабораторной разработки. Рассмотрены примеры использования 3D-клеточных культур для разработки таргетной терапии, в том числе с применением перфузионных систем. Описаны методы анализа жидкостной биопсии, позволяющие обнаружить опухоль-специфичные биомаркеры при неинвазивной диагностике ДГСМ, в том числе ряд методов, еще не протестированных в клинике. Приведен список опухоль-специфичных биомаркеров для диагностики, мониторинга и выбора таргетной терапии ДГСМ. В заключение обсуждается возможность внедрения данных методов в клинику, с представлением результатов нескольких клинических испытаний. Заключение. В онкологии новые методы молекулярной генетики, такие как анализ жидкостной биопсии, позволяют производить диагностику и мониторинг лечения в случаях, когда классические методы, требующие забора ткани, оказываются не применимы (к примеру, анализ генетически гетерогенных опухолей и опухолей хирургически недоступной локализации). К таким опухолям относится ДГСМ - первичная опухоль головного мозга, наиболее часто встречающаяся у детей. Имеющиеся данные подтверждают актуальность поиска новых специфических опухолевых биомаркеров, а также мишеней для таргетной терапии детских диффузных глиом.

Еще

Неинвазивная диагностика, опухоли центральной нервной системы, диффузные глиомы ствола мозга, молекулярно-генетические маркеры, h3k27m, цифровая капельная пцр, жидкостная биопсия, 3d-клеточные культуры, перфузионная система клеточного культивирования, биобанкинг

Еще

Короткий адрес: https://sciup.org/140300171

IDR: 140300171   |   DOI: 10.21294/1814-4861-2023-22-3-108-118

Список литературы Неинвазивныe методы молекулярной диагностики и клинического наблюдения и подходы к подбору персональной терапии при высокозлокачественных диффузных глиомах ствола мозга

  • Khukhlaeva E.A., Konovalov A.N., Pronin I.N., Kornienko V.N., Gavryushin A.V. Neiroradiologiya i printsipy klassifikatsii opukholei stvola golovnogo mozga. Meditsinskaya vizualizatsiya. 2011; 6: 62-74.
  • Louis D.N., Perry A., Wesseling P., Brat D.J., Cree I.A., Figarella-Branger D., Hawkins C., Ng H.K., Pfister S.M., Reifenberger G., Soffietti R., von Deimling A., Ellison D.W. The 2021 WHO Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Neuro Oncol. 2021; 23(8): 1231-51. https://doi.org/10.1093/neuonc/noab106.
  • Dinikina Yu.V., Belogurova M.B. Osobennosti novoi klassifikatsii opukholei tsentral'noi nervnoi sistemy VOZ 2021: vzglyad klinitsista. Rossiiskii zhurnal personalizirovannoi meditsiny. 2022; 2(4): 77-90. https://doi.org/10.18705/2782-3806-2022-2-4-77-90.
  • Gianno F., Giovannoni I., Cafferata B., Diomedi-Camassei F., Minasi S., Barresi S., Buttarelli F.R., Alesi V., Cardoni A., Antonelli M., Puggioni C., Colafati G.S., Carai A., Vinci M., Mastronuzzi A., Miele E., Alaggio R., Giangaspero F., Rossi S. Paediatric-type diffuse high-grade gliomas in the 5th CNS WHO Classification. Pathologica. 2022; 114(6): 422-35. https://doi.org/10.32074/1591-951X-830.
  • Regentova O.S., Shcherbenko O.I. Sovremennoe sostoyanie problemy diagnostiki i lecheniya diffuzno rastushchikh gliom stvola mozga u detei i podrostkov. Vestnik Rossiiskogo nauchnogo tsentra rentgenoradiologii Minzdrava Rossii. 2019; 19(1): 95-130.
  • Hoffman L.M., Veldhuijzen van Zanten S.E.M., Colditz N., et al. Clinical, Radiologic, Pathologic, and Molecular Characteristics of LongTerm Survivors of Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG): A Collaborative Report From the International and European Society for Pediatric Oncology DIPG Registries. J Clin Oncol. 2018; 36(19): 1963-72. https://doi.org/10.1200/JCO.2017.75.9308.
  • Veldhuijzen van Zanten S.E.M., Sewing A.C.P., van Lingen A., Hoekstra O.S., Wesseling P., Meel M.H., van Vuurden D.G., Kaspers G.J.L., Hulleman E., Bugiani M. Multiregional Tumor Drug-Uptake Imaging by PET and Microvascular Morphology in End-Stage Diffuse Intrinsic Pontine Glioma. J Nucl Med. 2018; 59(4): 612-5. https://doi.org/10.2967/jnumed.117.197897.
  • Lobon-Iglesias M.J., Santa-Maria Lopez V., Puerta Roldan P., Candela-Canto S., Ramos-Albiac M., Gomez-Chiari M., Puget S., Bolle S., Goumnerova L., Kieran M.W., Cruz O., Grill J., Morales La Madrid A. Tumor dissemination through surgical tracts in diffuse intrinsic pontine glioma. J Neurosurg Pediatr. 2018; 22(6): 678-83. https://doi.org/10.3171/2018.6.PEDS17658.
  • Hoffman L.M., DeWire M., Ryall S., Buczkowicz P., Leach J., Miles L., Ramani A., Brudno M., Kumar S.S., Drissi R., Dexheimer P., Salloum R., Chow L., Hummel T., Stevenson C., Lu Q.R., Jones B., Witte D., Aronow B., Hawkins C.E., Fouladi M. Spatial genomic heterogeneity in diffuse intrinsic pontine and midline high-grade glioma: implications for diagnostic biopsy and targeted therapeutics. Acta Neuropathol Commun. 2016; 4: 1. https://doi.org/10.1186/s40478-015-0269-0. Erratum in: Acta Neuropathol Commun. 2016; 4: 13.
  • Bronkhorst A.J., Ungerer V., Holdenrieder S. The emerging role of cell-free DNA as a molecular marker for cancer management. Biomol Detect Quantif. 2019; 17. https://doi.org/10.1016/j.bdq.2019.100087.
  • Lu V.M., Power E.A., Zhang L., Daniels D.J. Unlocking the translational potential of circulating nucleosomes for liquid biopsy in diffuse intrinsic pontine glioma. Biomark Med. 2019; 13(8): 597-600. https://doi.org/10.2217/bmm-2019-0139.
  • Garnier D., Jabado N., Rak J. Extracellular vesicles as prospective carriers of oncogenic protein signatures in adult and paediatric brain tumours. Proteomics. 2013; 13(10-11): 1595-607. https://doi.org/10.1002/pmic.201200360.
  • Nobre L., Zapotocky M., Johnson M., Wasserman J., Abla O., Whitlock J., Tabori U., Hawkins C. Abstract 2226: Validation of a liquid biopsy tool to identify point mutations in pediatric brain tumor patients. Cancer Res. 2019; 79: 2226. https://doi.org/10.1158/1538-7445.AM2019-2226.
  • Nazaryan D., Drui A., Yas'ko L., Papusha L., Novichkova G. Zhidkostnye biopsii v detskoi neiroonkologii: v preddverii vozmozhnostei teranostiki. Voprosy gematologii/onkologii i immunopatologii v pediatrii. 2018; 17(1): 133-5. https://doi.org/10.24287/17261708-2018-17-1-133-135.
  • Lapin D.H., Tsoli M., Ziegler D.S. Genomic Insights into Diffuse Intrinsic Pontine Glioma. Front Oncol. 2017; 7: 57. https://doi.org/10.3389/fonc.2017.00057.
  • Dufour C., Vasseur R., PerbetR., LeblondP, VinchonM., Reyns N., Touzet G., Maurage C.A., Fabienne E., Florence R. DIPG-44. Molecular And Chromosomal Characterization Of A Unique Series Of Diffuse Midline Gliomas In Children And Young Adults. Neuro Oncol. 2018; 20s2: 57-8. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy059.137.
  • Wu G., Broniscer A., McEachron TA., Lu C., Paugh B.S.,Becksfort J., Qu C., Ding L., Huether R., Parker M., Zhang J., Gajjar A., Dyer M.A., Mullighan C.G., Gilbertson R.J., Mardis E.R., Wilson R.K., Downing J.R., Ellison D.W., Zhang J., Baker S.J.; St. .Jude Childrens Research Hospital Washington University Pediatric Cancer Genome Project. Somatic histone H3 alterations in pediatric diffuse intrinsic pontine gliomas and nonbrainstem glioblastomas. Nat Genet. 2012; 44(3): 251-3. https://doi.org/10.1038/ng.1102.
  • Lewis P.W., Muller M.M., Koleisky M.S., Cordero F., Lin S., Banaszynski L.A., Garcia B.A., Muir T.W., Becher O.J., Allis C.D. Inhibition of PRC2 activity by a gain-of-function H3 mutation found in pediatric glioblastoma. Science. 2013; 340(6134): 857-61. https://doi.org/10.1126/science.1232245.
  • Mohammad F., Helin K. Oncohistones: drivers of pediatric cancers. Genes Dev. 2017; 31(23-24): 2313-24. https://doi.org/10.1101/gad.309013.117.
  • Salloum R., McConechy M.K., Mikael L.G., Fuller C., Drissi R., DeWire M., Nikbakht H., De Jay N., Yang X., Boue D., Chow L.M.L., Finlay J.L., Gayden T., Karamchandani J., Hummel T.R., Olshefski R., Osorio D.S., Stevenson C., Kleinman C.L., Majewski J., Fouladi M., Jabado N. Characterizing temporal genomic heterogeneity in pediatric high-grade gliomas. Acta Neuropathol Commun. 2017; 5(1): 78. https://doi.org/10.1186/s40478-017-0479-8.
  • Park Y., An P., Ding D., Eberhart C.G., Raabe E.H. DIPG-34. A Human Neural Stem Cell Dipg Model Identifies The Relative Contribution Of Different Oncogenic Elements To Invasive Malignant Transformation. Neuro Oncol. 2018; 20 (s2): 55-6. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy059.127.
  • Silveira A.B., Kasper L.H., Fan Y., Jin H., Wu G., Shaw T.I., Zhu X., Larson J.D., Easton J., Shao Y., Yergeau D.A., Rosencrance C., Boggs K., Rusch M.C., Ding L., Zhang J., Finkelstein D., Noyes R.M., Russell B.L., Xu B., Broniscer A., Wetmore C., Pounds S.B., Ellison D.W., Zhang J., Baker S.J. H3.3 K27M depletion increases differentiation and extends latency of diffuse intrinsic pontine glioma growth in vivo. Acta Neuropathol. 2019; 137(4): 637-55. https://doi.org/10.1007/s00401-019-01975-4. Erratum in: Acta Neuropathol. 2019; 137(6): 1021.
  • Chan K.M., Fang D., Gan H., Hashizume R., Yu C., SchroederM., Gupta N., Mueller S., James C.D., Jenkins R., Sarkaria J., Zhang Z. The histone H3.3K27M mutation in pediatric glioma reprograms H3K27 methylation and gene expression. Genes Dev. 2013; 27(9): 985-90. https://doi.org/10.1101/gad.217778.113.
  • Louis D.N., Giannini C., Capper D., Paulus W., Figarella-Branger D., Lopes M.B., Batchelor T.T., Cairncross J.G., van den Bent M., Wick W., Wesseling P. cIMPACT-NOW update 2: diagnostic clarifications for diffuse midline glioma, H3 K27M-mutant and diffuse astrocytoma/anaplastic astrocytoma, IDH-mutant. Acta Neuropathol. 2018; 135(4): 639-42. https://doi.org/10.1007/s00401-018-1826-y.
  • Han H.J., Jain P., Resnick A.C. Shared ACVR1 mutations in FOP and DIPG: Opportunities and challenges in extending biological and clinical implications across rare diseases. Bone. 2018; 109: 91-100. https://doi.org/10.1016/j.bone.2017.08.001.
  • Carvalho D., Taylor K.R., Olaciregui N.G., Molinari V, Clarke M., Mackay A., Ruddle R., Henley A., Valenti M., Hayes A., Brandon A.H., Eccles S.A., Raynaud F., Boudhar A., Monje M., Popov S., Moore A.S., Mora J., Cruz O., Vinci M., Brennan P.E., Bullock A.N., Carcaboso A.M., Jones C. ALK2 inhibitors display beneficial effects in preclinical models of ACVR1 mutant diffuse intrinsic pontine glioma. Commun Biol. 2019; 2: 156. https://doi.org/10.1038/s42003-019-0420-8.
  • Saratsis A.M., Yadavilli S., Magge S., Rood B.R., Perez J., Hill D.A., Hwang E., Kilburn L., Packer R.J., Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012; 14(5): 547-60. https://doi.org/10.1093/neuonc/nos067.
  • WerbrouckC., Evangelista C.C.S., Lobon-IglesiasMJ., Barret E., Le Teuff G., Merlevede J., Brusini R., Kergrohen T., Mondini M., Bolle S., Varlet P., Beccaria K., Boddaert N., Puget S., Grill J., Debily M.A., Castel D. TP53 Pathway Alterations Drive Radioresistance in Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas (DIPG). Clin Cancer Res. 2019; 25(22): 6788-6800. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-19-0126.
  • Paugh B.S., Broniscer A., Qu C., Miller C.P., Zhang J., Tatevossian R.G., Olson J.M., Geyer J.R., Chi S.N., da Silva N.S., Onar-Thomas A., Baker J.N., Gajjar A., Ellison D.W., Baker S.J. Genome-wide analyses identify recurrent amplifications of receptor tyrosine kinases and cell-cycle regulatory genes in diffuse intrinsic pontine glioma. J Clin Oncol. 2011; 29(30): 3999-4006. https://doi.org/10.1200/JCO.2011.35.5677.
  • Paugh B.S., Zhu X., Qu C., Endersby R., Diaz A.K., Zhang J., Bax D.A., Carvalho D., Reis R.M., Onar-Thomas A., Broniscer A., Wetmore C., Zhang J., Jones C., Ellison D.W., Baker S.J. Novel oncogenic PDGFRA mutations in pediatric high-grade gliomas. Cancer Res. 2013; 73(20): 6219-29. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-13-1491.
  • Akamandisa M.P., Nie K., Nahta R., Hambardzumyan D., Castel-lino R.C. Inhibition of mutant PPM1D enhances DNA damage response and growth suppressive effects of ionizing radiation in diffuse intrinsic pontine glioma. Neuro Oncol. 2019; 21(6): 786-99. https://doi.org/10.1093/neuonc/noz053.
  • Chi A.S., Tarapore R.S., Hall M.D., Shonka N., Gardner S., Umemura Y., Sumrall A., Khatib Z., Mueller S., Kline C., Zaky W., Khatua S., Weathers S.P., Odia Y., Niazi T.N., Daghistani D., Cherrick I., Korones D., Karajannis M.A., Kong X.T., Minturn J., Waanders A., Arillaga-Romany I., Batchelor T., Wen P.Y., Merdinger K., Schalop L., Stogniew M., Allen J.E., Oster W., Mehta M.P. Pediatric and adult H3 K27M-mutant diffuse midline glioma treated with the selective DRD2 antagonist ONC201. J Neurooncol. 2019; 145(1): 97-105. https://doi.org/10.1007/s11060-019-03271-3.
  • Mount C.W., Majzner R.G., Sundaresh S., Arnold E.P., Kadapa-kkam M., Haile S., Labanieh L., Hulleman E., Woo P.J., Rietberg S.P., Vogel H., Monje M., Mackall C.L. Potent antitumor efficacy of anti-GD2 CAR T cells in H3-K27M+ diffuse midline gliomas. Nat Med. 2018; 24(5): 572-9. https://doi.org/10.1038/s41591-018-0006-x.
  • Wingerter A., El Malki K., Sandhoff R., Seidmann L., Wagner D.C., Lehmann N., Vewinger N., Frauenknecht K.B.M., Sommer C.J., Traub F., Kindler T., Russo A., Otto H., Lollert A., Staatz G., Roth L., Paret C., Faber J. Exploiting Gangliosides for the Therapy of Ewing's Sarcoma and H3K27M-Mutant Diffuse Midline Glioma. Cancers (Basel). 2021; 13(3): 520. https://doi.org/10.3390/cancers13030520.
  • Cobb D.A., de Rossi J., Liu L., An E., Lee D.W. Targeting of the alphav beta3 integrin complex by CAR-T cells leads to rapid regression of diffuse intrinsic pontine glioma and glioblastoma. J Immunother Cancer. 2022; 10(2). https://doi.org/10.1136/jitc-2021-003816.
  • Chung C., Sweha S.R., Pratt D., Tamrazi B., Panwalkar P., Banda A., Bayliss J., Hawes D., Yang F., Lee H.J., Shan M., Cieslik M., Qin T., Werner C.K., Wahl D.R., Lyssiotis C.A., Bian Z., Shotwell J.B., Yadav V.N., Koschmann C., Chinnaiyan AM., Bluml S., Judkins A.R., Venneti S. Integrated Metabolic and Epigenomic Reprograming by H3K27M Mutations in Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas. Cancer Cell. 2020; 38(3): 334-49. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.07.008.
  • Duchatel R.J., Mannan A., Woldu A.S., Hawtrey T., Hindley P.A., Douglas A.M., Jackson E.R., Findlay I.J., Germon Z.P., Staudt D., Kearney P.S., Smith N.D., Hindley K.E., Cain J.E., Andre N., La Madrid AM., Nixon B., De Iuliis G.N., Nazarian J., Irish K., Alvaro F., Eisenstat D.D., Beck A., Vitanza N.A., Mueller S., Morris J.C., Dun M.D. Preclinical and clinical evaluation of German-sourced ONC201 for the treatment of H3K27M-mutant diffuse intrinsic pontine glioma. Neurooncol Adv. 2021; 3(1). https://doi.org/10.1093/noajnl/vdab169.
  • Mackay A., Molinari V., Carvalho D., Pemberton H., Temelso S., Burford A., Clarke M., Fofana M., Boult J., Izquierdo E., Taylor K.,Bjerke L., Salom J.F., Kessler K., Rogers R., Chandler C., Zebian B., Martin A., Stapleton S., Hettige S., Marshall L., Carceller F., Mandeville H., Vaidya S., Bridges L., Al-Sarraj S., Pears J., Mastronuzzi A., Carai A., del Bufalo F., de Torres C., Sunol M., Cruz O., Mora J., Moore A., Robinson S., Lord C., Carcaboso A.M., Vinci M., Jones C. HGG-23. drug screening linked to molecular profiling identifies novel dependencies in patient-derived primary cultures of paediatric high grade glioma and dipg. Neuro Oncol. 2018; 20(S2): 93-4. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy059.295.
  • Fons N.R., Sundaram R.K., Breuer G.A., Peng S., McLean R.L., Kalathil A.N., Schmidt M.S., Carvalho D.M., Mackay A., Jones C., Car-caboso A.M., Nazarian J., BerensM.E., Brenner C., Bindra R.S. PPM1D mutations silence NAPRT gene expression and confer NAMPT inhibitor sensitivity in glioma. Nat Commun. 2019; 10(1): 3790. https://doi.org/10.1038/s41467-019-11732-6.
  • Carvalho D., Olaciregui N.G., Ruddle R., Donovan A., Pal A., Raynaud F., Richardson P.J., Carcaboso A.M., Jones C. DIPG-29. Pre-clinical efficacy of combined acvr1 and PI3K/mTOR inhibition in diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG). Neuro Oncol. 2018; 20: 54-5. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy059.122.
  • Panditharatna E., Kilburn L.B., Aboian M.S., Kambhampati M., Gordish-Dressman H., Magge S.N., Gupta N., Myseros J.S., Hwang E.I., Kline C., Crawford J.R., Warren K.E., Cha S., Liang W.S., Berens M.E., Packer R.J., Resnick A.C., Prados M., Mueller S., Nazarian J. Clinically Relevant and Minimally Invasive Tumor Surveillance of Pediatric Diffuse Midline Gliomas Using Patient-Derived Liquid Biopsy. Clin Cancer Res. 2018; 24(23): 5850-9. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-18-1345.
  • Huang T.Y., Piunti A., Lulla R.R., Qi J., Horbinski C.M., Tomita T., James C.D., Shilatifard A., Saratsis A.M. Detection of Histone H3 mutations in cerebrospinal fluid-derived tumor DNA from children with diffuse midline glioma. Acta Neuropathol Commun. 2017; 5(1): 28. https://doi.org/10.1186/s40478-017-0436-6.
  • Bruzek AK., Tunkle L., Stallard S., Thamilselvan V, Qin T., Wolfe I., Mody R., Muraszko K.L., Robertson P.L., Maher C.O., Garton H.J.L., Koschmann C. DIPG-06. rapid, ultra-deep sequencing of pediatric DIPG from cerebrospinal fluid using a novel hand-held electronic dna analysis platform. Neuro Oncol. 2019; 21s2: 69. https://doi.org/10.1093/neuonc/noz036.027.
  • Pan C., Diplas B.H., Chen X., Wu Y., Xiao X., Jiang L., Geng Y., Xu C., Sun Y., Zhang P., Wu W., Wang Y., Wu Z., Zhang J., Jiao Y., Yan H., Zhang L. Molecular profiling of tumors of the brainstem by sequencing of CSF-derived circulating tumor DNA. Acta Neuropathol. 2019; 137(2): 297-306. https://doi.org/10.1007/s00401-018-1936-6.
  • Cantor E., Wierzbicki K., Tarapore R.S., Ravi K., Thomas C., CartaxoR., Band Yadav V, RavindranR., BruzekA.K., Wadden J., .John V, May Babila C., Cummings J.R., Rahman Kawakibi A., Ji S., Ramos J., Paul A., Walling D., Leonard M., Robertson P., Franson A., Mody R., Garton H.J.L., Venneti S., Odia Y., Kline C., Vitanza N.A., Khatua S., Mueller S., Allen J.E., Gardner S.L., Koschmann C. Serial H3K27M cell-free tumor DNA (cf-tDNA) tracking predicts ONC201 treatment response and progression in diffuse midline glioma. Neuro Oncol. 2022; 24(8): 1366-74. https://doi.org/10.1093/neuonc/noac030.
  • Regentova O.S., Shcherbenko O.I., Dzhikiya E.L., Zakharenko M.V., Senchukova A.L., Izmailov T.R., Kulinich T.M., Bozhenko V.K. Soderzhanie i dinamika v protsesse lecheniya nekotorykh molekulyarno-geneticheskikh markerov v plazme krovi u bol'nykh glial'nymi opukholyami mozga po dannym «zhidkostnoi biopsii». Vestnik Rossiiskogo nauchnogo tsentra rentgenoradiologii Minzdrava Rossii. 2020; 20(2): 117-28.
  • Wadden J., Ravi K., John V., Babila C.M., Koschmann C. Cell-Free Tumor DNA (cf-tDNA) Liquid Biopsy: Current Methods and Use in Brain Tumor Immunotherapy. Front Immunol. 2022; 13. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.882452.
  • Zaytseva M., Usman N., Salnikova E., Sanakoeva A., Valiakhmetova A., Chervova A., PapushaL., Novichkova G., DruyA. Methodological Challenges of Digital PCR Detection of the Histone H3 K27M Somatic Variant in Cerebrospinal Fluid. Pathol Oncol Res. 2022; 28. https://doi.org/10.3389/pore.2022.1610024.
  • Ianno M.F., Biassoni V., Schiavello E., Carenzo A., Boschetti L., Gandola L., Diletto B., Marchesi E., Vegetti C., Molla A., Kramm C.M., van Vuurden D.G., Gasparini P., Gianno F., Giangaspero F., Modena P., Bison B., Anichini A., Vennarini S., Pignoli E., Massimino M., De Cecco L. A microRNA Prognostic Signature in Patients with Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas through Non-Invasive Liquid Biopsy. Cancers (Basel). 2022; 14(17): 4307. https://doi.org/10.3390/cancers14174307.
  • Pericoli G., Galardi A., Lisa Petrilli L., Colletti M., Ferretti R., Paolini A., Masotti A., Levi Mortera S., Petrini S., de Billy E., Pascucci L., Court W., Cacchione A., Carai A., Camassei F.D., Moore A., Carcaboso AM., .Jones C., Mastronuzzi A., LocatelliF., Di Giannatale A., Vinci M. PDTM-09. diffuse intrinsic pontine glioma and pediatric glioblastoma derived-exosomes have specific oncogenic signatures. Neuro Oncol. 2018; 20 s6: 205. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy148.851.
  • Petersen E.V., Chudakova D.A., Skorova E.Y., Anikin V., Reshetov I.V., Mynbaev O.A. The Extracellular Matrix-Derived Biomarkers for Diagnosis, Prognosis, and Personalized Therapy of Malignant Tumors. Front Oncol. 2020; 10. https://doi.org/10.3389/fonc.2020.575569.
  • Li Z., Langhans S.A. In Vivo and Ex Vivo Pediatric Brain Tumor Models: An Overview. Front Oncol. 2021; 11. https://doi.org/10.3389/fonc.2021.620831.
  • RotaCM., Brown A.T., Addleson E., Ives C., Trumper E., Pelton K., Teh W.P., Schniederjan M.J., Castellino R.C., Buhrlage S., Lauffenburger D.A., Ligon K.L., Griffith L.G., Segal R.A. Synthetic extracellular matrices and astrocytes provide a supportive microenvironment for the cultivation and investigation of primary pediatric gliomas. Neurooncol Adv. 2022; 4(1). https://doi.org/10.1093/noajnl/vdac049.
  • Kholosy M .W., Derieppe M., van den Ham F., Ober K., Su Y., Custers L., Schild L., van Zogchel M. J. L., M Wellens L., R Ariese H., Szanto C.L., Wienke J., Dierselhuis M.P., van Vuurden D., Dolman E.M., Molenaar J.J. Neuroblastoma and DIPG Organoid Coculture System for Personalized Assessment of Novel Anticancer Immunotherapies. J Pers Med. 2021; 11(9): 869. https://doi.org/10.3390/jpm11090869.
  • Carvalho D.M., Temelso S., Mackay A., Pemberton H.N., Rogers R., Kessler K., Izquierdo E., Bjerke L., Salom J.F., Clarke M., Grabovska Y., Burford A., Olaciregui N.G., Boult J.K.R., Molinari V., Fofana M., Proszek P., Potente E.F., Taylor K.R., Chandler C., Zebian B., Bhangoo R., Martin A.J., Dabbous B., Stapleton S., Hettige S., Marshall L.V., CarcellerF., MandevilleH.C., Vaidya S.J., Al-Sarraj S., Bridges L.R., Johnston R., Cryan J., Farrell M., Crimmins D., Caird J., Pears J., Pericoli G., Miele E., Mastronuzzi A., Locatelli F., Carai A., Robinson S.P., Hubank M., MonjeM., Moore A.S., Hassall T.E.G., Carcaboso A.M., Lord C.J., Vinci M., Jones C. Drug screening linked to molecular profiling identifies novel dependencies in patient-derived primary cultures of paediatric high grade glioma and DIPG. bioRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.12.29.424674.
  • Kozhushko N., Jedrysik M., Fillmore H. OTME-22. Bioinformatic evaluation of ECM molecules and angiogenic associate genes in diffuse midline glioma (DMG): mapping the tumour microenvironment. Neurooncol Adv. 2021; 3(s2): 18. https://doi.org/10.1093/noajnl/vdab070.073.
  • Jedrysik M., Loveson K.L., Kozusko N., Singh P., Allison K., Fillmore H.L. OPTC-4. Bioinformatic analysis of COLXIa1 gene expression and its alternative splicing regulation in Paediatric Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas (DIPGs). Neurooncol Adv. 2021; 3(S2): 6. https://doi.org/10.1093/noajnl/vdab070.025.
  • De T., Goyal S., Balachander G., Chatterjee K., Kumar P., Babu K G., Rangarajan A. A Novel Ex Vivo System Using 3D Polymer Scaffold to Culture Circulating Tumor Cells from Breast Cancer Patients Exhibits Dynamic E-M Phenotypes. J Clin Med. 2019; 8(9): 1473. https://doi.org/10.3390/jcm8091473.
  • Sherman H., Rossi A.E. A Novel Three-Dimensional Glioma Blood-Brain Barrier Model for High-Throughput Testing of Tumoricidal Capability. Front Oncol. 2019; 9: 351. https://doi.org/10.3389/fonc.2019.00351.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp