Новые данные по распределению основных филогенетических линий восточно-азиатской мыши Apodemus peninsulae на востоке России

Новые данные по распределению основных филогенетических линий восточно-азиатской мыши Apodemus peninsulae на востоке России

Автор: Шереметьева И.Н., Цуканова В.Д., Тимофеева Д.М., Гуськов В.Ю., Картавцева И.В.

Журнал: Региональные проблемы @regionalnye-problemy

Рубрика: Биология

Статья в выпуске: 3 т.23, 2020 года.

Бесплатный доступ

На основании данных об изменчивости участка гена cyt b мтДНК (992 пары нуклеотидов) проанализировано распределение филогенетических линий Apodemus peninsulae из ранее не исследованных регионов Забайкалья и Дальнего Востока России. По результатам анализа все особи восточноазиатской мыши из рассматриваемых регионов отнесены к двум филогенетическим линиям «Korea» и «Amur». Показано, что особи с гаплотипом «Korea» проникают не только на южный Алтай и восточное Забайкалье, но встречаются также и в северных районах Забайкалья (окрестности пос. Таксимо). Выдвинуто предположение, что формирование филогруппы «Amur» происходило в районе Среднего и/или Нижнего Амура.

Еще

Восточноазиатская лесная мышь, цитохром b (cyt b), митохондриальная днк, филогенетические линии

Короткий адрес: https://sciup.org/143173181

IDR: 143173181   |   DOI: 10.31433/2618-9593-2020-23-3-10-20

Список литературы Новые данные по распределению основных филогенетических линий восточно-азиатской мыши Apodemus peninsulae на востоке России

  • Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Доклады Академии наук СССР. 1976. Т. 231, № 1. С. 205-207.
  • Воронцов Н.Н., Бекасова Т.С., Крал Б., Коробицына К.В., Иваницкая Е.Ю. О видовой принадлежности азиатских лесных мышей рода Apodemus Сибири и Дальнего Востока // Зоологический журнал. 1977. Т. 56, № 3. С. 437-449.
  • Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН, 1995. 522 с
  • Картавцева И.В. Кариосистематика лесных и полевых мышей (Rodentia, Muridae). Владивосток: Дальнаука, 2002. 142 с
  • Павленко М.В. Внутривидовая генетическая дифференциация и геногеография восточноазиатской лесной мыши Apodemus peninsulae (Rodentia, Muridae) // Генетика. 1994. Т. 30. C. 115-116
  • Павленко М.В. Внутривидовая дифференциация и геногеография трансферринов восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae // Современные подходы к изучению изменчивости. Владивосток: ДВО АН СССР, 1989. C. 61-73
  • Рослик Г.В., Картавцева И.В. Полиморфизм и мозаицизм по числу В-хромосом у восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae (Rodentia) Дальнего Востока России // Цитология. 2009. Т. 51, № 11. С. 929-939
  • Рослик Г.В., Картавцева И.В., Иваса М. Изменчивость и стабильность числа В-хромосом в материковых и островных популяциях восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae (Rodentia, Muridae) // Проблемы эволюции. 2003. Т. 5. С. 136-149
  • Рубцов Н.Б., Картавцева И.В., Рослик Г.В., Карамышева Т.В., Павленко М.В., Иваса М.А., Ко Х.C. Особенности В-хромосом восточноазиатской мыши Apodemus peninsulae (Thomas, 1906) Забайкалья и Дальнего Востока, выявленные FISH методом // Генетика. 2015. Т. 51, № 3. С. 341-350
  • Abe S., Han S. H., Kojima H., Ishibashi Y., Yoshida M. C. Differential staining profiles of B chromosomes in the East-Asiatic wood mouse Apodemus peninsulae // Chromosome Science. 1997. Vol. 1, N 1. P. 7-12
  • Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques // Nucleic Acids Research. 1997. Vol. 25, N 22. P. 4692-4693
  • Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Molecular Biology and Evolution. 1999. Vol. 16, N 1. P. 37-48
  • Bayarlkhagva D., Tumendemberel O., Damdin B. Mitochondrial cytochrome b gene study of Apodemus peninsulae in Mongolia // International Journal of Current Research. 2013. Vol. 5, N 12. P. 3892-3896
  • Bekasova T.S., Vorontsov N.N, Korobitsyna K.V., Korablev V.P. B-chromosomes and comparative kariology of the mice of the genus Apodemus // Genetica (Ned). 1980. Vol. 52-53. P. 33-44
  • Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evolutionary Bioinformatics Online. 2005. Vol. 1. P. 47-50
  • Ge D., Feijo A., Cheng J., Lu L., Liu R., Abramov A.V., Xia L., Wen Z., Zhang W., Shi L., Yang Q. Evolutionary history of field mice (Murinae: Apodemus), with emphasis on morphological variation among species in China and description of a new species // Zoological Journal of the Linnean Society. 2019. Vol. 187, N 2. P. 518-534
  • Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Acids. Symp. 1999. N 41. P. 95-98
  • Jeon M.G., Kim J.Y., Park Y.C. Phylogenetic Analysis of the Complete Mitochondrial Genome of the Korean Field Mouse Apodemus Peninsulae (Rodentia, Murinae) From China. // Mitochondrial DNA. 2016. 27(4).2408-9
  • DOI: 10.3109/19401736.2015.1030618
  • Kartavtseva I.V., Roslik G.V. A complex B chromosome system in the Korean field mouse, Apodemus peninsulae // Cytogenetic and Genome Research. 2004. Vol. 106, N 2-4. P. 271-278
  • Koh H.S., Jang K.H., Wang J., Lee B.K., Park NJ. Sequence diversity of the mitochondrial DNA cytochrome b gene and control region in the two subspecies of the Korean field mouse (Apodemus peninsulae) // Acta Theriologica Sinica. 2010. Vol. 30, N 3. P. 256-263
  • Koh H. S., Lee W. J. Geographic Variation of Morphometric Characters in Five Subspecies of Korean Field Mice, Apodemus peninsulae Thomas (Rodentia, Mammalia) in Eastern Asia // Korean Journal Zool. 1994. Vol. 37. P. 33-39
  • Librado P., Rozas J. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. 2009. N 25. P. 1451-1452
  • Liu S.Y., He K., Chen S.D., Jin W., Murphy R.W., Tang M.K., Liao R., Li F.J. How many species of Apodemus and Rattus occur in China? A survey based on mitochondrial cyt b and morphological analyses // Zoological Research. 2018. Vol. 39, N 5. P. 309-320
  • Liu X., Wei F., Li M., Jiang X., Feng Z., Hu J. Molecular phylogeny and taxonomy of wood mice (genus Apodemus Kaup, 1829) based on complete mtDNA cytochrome b sequences, with emphasis on Chinese species // Molecular Phylogenetics and EvolutioN 2004. Vol. 33, N 1. P. 1-15
  • Oh D.J., Kim T.W., Chang M.H., Han S.H., Oh H.S. and Kim, S.J. The mitochondrial genome of Apodemus peninsulae (Rodentia, Muridae) // Mitochondrial DNA. 2011. 22 (4). 99-101
  • Sakka H., Quere J.P., Kartavtseva I.V., Pavlenko M.V., Chelomina G.N, Atopkin D.M., Bogdanov A.S., Michaux J. Comparative phylogeography of four Apodemus species (Mammalia: Rodentia) in the Asian Far East: evidence of Quaternary climatic changes in their genetic structure // Biological Journal of the Linnean Society. 2010. Vol. 100. P. 797-821
  • Serizawa K., Suzuki H., Iwasa M., Tsuchiya K., Pavlenko M., Kartavtseva I., Chelomina G., Dokuchaev N, Han S.H. A spatial aspect on mitochondrial DNA genealogy in Apodemus peninsulae from East Asia // Biochemical Genetics. 2002. N 40 P. 149-161
  • Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0 // Mol Biol Evolution. 2013. Vol. 30, N 12. P. 2725-2729
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp