Новый подход к разработке кандидатной вакцины против ротавируса на основе двух вирусов растений

Автор: Рябчевская Е.М., Евтушенко Е.А., Архипенко М.В., Манухова Т.И., Донченко Е.К., Никитин Н.А., Атабеков И.Г., Карпова О.В.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Фитовирусы как инструмент биотехнологий

Статья в выпуске: 5 т.55, 2020 года.

Бесплатный доступ

Ротавирус А (род Rotavirus , сем. Reoviridae ) остается основной причиной вирусного гастроэнтерита у детей в возрасте до пяти лет. Существующие аттенуированные вакцины имеют ряд серьезных недостатков, к которым можно отнести потенциальный риск реверсии к патогенной форме, а также побочные эффекты, из которых наиболее опасна инвагинация кишечника. Более того, эти вакцины оказались менее эффективны в развивающихся странах, где как раз фиксируется большая часть смертей, ассоциированных с ротавирусной инфекцией. Таким образом, одна из актуальных задач вирусологических исследований - создание рекомбинантной вакцины против ротавируса. Ключевой вопрос при разработке таких вакцин заключается в подборе эффективного и безопасного адъюванта. Вирусы растений имеют большой потенциал для создания инновационных вакцин: они безопасны для человека и млекопитающих, обладают высокими иммуностимулирующими свойствами и могут выступать в роли носителя эпитопов патогенов. В представляемой работе впервые предложен подход к разработке вакцины против ротавируса А на основе сразу двух растительных вирусов - вируса мозаики альтернантеры (ВМАльт) и вируса табачной мозаики (ВТМ) в качестве одновременно носителей эпитопов и адъювантов. Сферические частицы (СЧ), формирующиеся при термической обработке ВТМ, были использованы в качестве адъюванта и платформы для презентации полученного в наших предыдущих исследованиях рекомбинантного химерного белка ER6, который представляет собой белок оболочки (БО) ВМАльт, слитый с эпитопом RV14 (RLSFQLMRPPNMTP) ротавирусного антигена VP6. Эпитоп RV14 способен индуцировать эффективный протективный иммунитет и консервативен для большинства штаммов ротавируса А, ввиду чего его использование позволяет надеяться на успешное преодоление одной из основных трудностей в разработке вакцин против ротавируса А - большого серологического разнообразия. В настоящей работе продемонстрировано, что ER6 эффективно сорбируется на поверхности СЧ с образованием комплексов СЧ-ER6, сохраняя при этом свою антигенную специфичность. Получены две иммунные сыворотки, обладающие специфичностью к участку RV14 в составе ER6. Первая сыворотка была получена путем истощения сыворотки к белку ER6 с использованием двух не содержащих последовательность эпитопа RV14 антигенов - БО ВМАльт и рекомбинантного БО ВМАльт (рБО ВМАльт), экспрессированного в клетках Escherichia coli . Вторая сыворотка была получена непосредственно при иммунизации синтетическим пептидом RLSFQLMRPPNMTP (RV14). Обе сыворотки использовали для анализа RV14 в составе комплексов СЧ-ER6. Методом иммунофлуоресцентной микроскопии показано, что комплексы СЧ-ER6 взаимодействуют как с истощенной сывороткой к ER6, так и с сывороткой к синтетическому пептиду RV14. Таким образом, эпитоп ротавируса А в составе комплексов СЧ-ER6 остается доступным для взаимодействия с антителами. Учитывая уникальные адъювантные свойства сферических частиц и характеристики выбранного эпитопа, полученные комплексы СЧ-ER6 могут рассматриваться как перспективный компонент для включения в состав рекомбинантных вакцин против ротавируса. Кроме того, можно надеяться, что предложенный в работе подход, предполагающий использование СЧ ВТМ в качестве платформы-адъюванта для химерного БО ВМАльт, содержащего эпитоп патогена, в дальнейшем окажется полезен при разработке вакцин не только против ротавируса, но и против других инфекционных агентов человека и сельскохозяйственных животных.

Еще

Вирусы растений, вирус табачной мозаики, сферические частицы, платформа-носитель, платформа-адъювант, вирус мозаики альтернантеры, химерный рекомбинантный белок, рекомбинантные вакцины, ротавирусная инфекция

Короткий адрес: https://sciup.org/142229427

IDR: 142229427   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2020.5.1004rus

Список литературы Новый подход к разработке кандидатной вакцины против ротавируса на основе двух вирусов растений

  • Sicard M., Bryant K., Muller M.L., Quach C. Rotavirus vaccination in the neonatal intensive care units: where are we? A rapid review of recent evidence. Curr. Opin. Pediatr., 2020, 32(1): 167-191 (doi: I0.1097/M0p.0000000000000869).
  • Troeger C., Khalil I.A., Rao P.C., Cao S., Blacker B.F., Ahmed T., Armah G., Bines J.E., Brewer T.G., Colombara D. V., Kang G., Kirkpatrick B.D., Kirkwood C.D., Mwenda J.M., Parashar U.D., Petri W.A., Riddle M.S., Steele A.D., Thompson R.L., Walson J.L., Sanders J.W., Mokdad A.H., Murray C.J.L., Hay S.I., Reiner R.C. Rotavirus vaccination and the global burden of rotavirus diarrhea among children younger than 5 years. JAMA Pediatrics, 2018, 172(10): 958965 (doi: 10.1001/jamapediatrics.2018.1960).
  • Kirkwood C.D., Ma L.F., Carey M.E., Steele A.D. The rotavirus vaccine development pipeline. Vaccine, 2019, 37(50): 7328-7335 (doi: 10.1016/j.vaccine.2017.03.076).
  • Weintraub E.S., Baggs J., Duffy J., Vellozzi C., Belongia E.A., Irving S., Klein N.P., Glanz J.M., Jacobsen S.J., Naleway A., Jackson L.A., DeStefano F. Risk of intussusception after monovalent rotavirus vaccination. N. Engl. J. Med., 2014, 370(6): 513-519 (doi: 10.1056/NEJMoa1311738).
  • Carlin J.B., Macartney K.K., Lee K.J., Quinn H.E., Buttery J., Lopert R., Bines J., Mcln-tyre P.B. Intussusception risk and disease prevention associated with rotavirus vaccines in Australia's national immunization program. Clinical Infections Disease, 2013, 57(10): 1427-1434 (doi: 10.1093/cid/cit520).
  • Burnett E., Parashar U., Tate J. Rotavirus vaccines: effectiveness, safety, and future directions. Pediatr. Drugs, 2018, 20(3): 223-233 (doi: 10.1007/s40272-018-0283-3).
  • Desselberger U., Wolleswinkel-van den Bosch J., Mrukowicz J., Rodrigo C., Giaquinto C., Vesi-kari T. Rotavirus types in Europe and their significance for vaccination. Pediatr. Infect. Dis., 2006, 25(1): S30-S41 (doi: 10.1097/01.inf.0000197707.70835.f3).
  • Sadiq A., Bostan N., Yinda K., Naseem S., Sattar S. Rotavirus: genetics, pathogenesis and vaccine advances. Rev. Med. Virol., 2018, 28(6): e2003 (doi: 10.1002/rmv.2003).
  • Velasquez D., Parashar U., Jiang B. Decreased performance of live attenuated, oral rotavirus vaccines in low-income settings: causes and contributing factors. Expert Review of Vaccines, 2018, 17(2): 145-161 (doi: 10.1080/14760584.2018.1418665).
  • Agarwal S., Hickey J.M., McAdams D., White J.A., Sitrin R., Khandke L., Cryz S., Joshi S.B., Volkin D.B. Effect of aluminum adjuvant and preservatives on structural integrity and physico-chemical stability profiles of three recombinant subunit rotavirus vaccine antigens. Journal of Pharmaceutical Sciences, 2020, 109(1): 476-487 (doi: 10.1016/j.xphs.2019.10.004).
  • Afchangi A., Jalilvand S., Mohajel N., Marashi S., Shoja Z. Rotavirus VP6 as a potential vaccine candidate. Rev. Med. Virol., 2019, 29(2): e2027 (doi: 10.1002/rmv.2027).
  • Estes M.K., Greenberg H.B. Rotaviruses. In: Fields virology /D.M. Knipe, P. Howley (eds.). Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, 2013: 1347-1395.
  • Estes M., Cohen J. Rotavirus gene structure and function. Microbiological Reviews, 1989, 53(4): 410-449.
  • Svensson L., Sheshberadaran H., Vene S., Norrby E., Grandien M., Wadell G. Serum antibody responses to individual viral polypeptides in human rotavirus infections. Journal of General Virology, 1987, 68(3): 643-651 (doi: 10.1099/0022-1317-68-3-643).
  • Desselberger U., Huppertz H.I. Immune responses to rotavirus infection and vaccination and associated correlates of protection. Journal of Infectious Diseases, 2011, 203(2): 188-195 (doi: 10.1093/infdis/jiq0 31).
  • Kovacs-Nolan J., Dongwan Y., Yoshinori M. Fine mapping of sequential neutralization epitopes on the subunit protein VP8 of human rotavirus. Biochemical Journal, 2003, 376(1): 269-275 (doi: 10.1042/BJ20021969).
  • Crawford S., Mukherjee S., Estes M., Lawton J., Shaw A., Ramig R., Prasad B. Trypsin cleavage stabilizes the rotavirus VP4 spike. Journal of Virology, 2001, 75(13): 6052-6061 (doi: 10.1128/JVI.75.13.6052-6061.2001).
  • Parbhoo N., Dewar J.B., Gildenhuys S. Sequence analysis and structural implications of rotavirus capsid proteins. Acta Virologica, 2016, 60(3): 260-270 (doi: 10.4149/av_2016_03_260).
  • Ward R.L., McNeal M.M. VP6: a candidate rotavirus vaccine. The Journal of Infectious Diseases, 2010, 202(Suppl. 1): S101-S107 (doi: 10.1086/653556).
  • Choi A.H.C., Basu M., McNeal M.M., Flint J., VanCott J.L., Clements J.D., Ward R.L. Functional mapping of protective domains and epitopes in the rotavirus VP6 protein. Journal of Virology, 2000, 74(24): 11574-11580 (doi: 10.1128/jvi.74.24.11574-11580.2000).
  • Aiyegbo M.S., Sapparapu G., Spiller B.W., Eli I.M., Williams D.R., Kim R., Lee D.E., Liu T., Li S., Woods V.L., Nannemann D.P., Meiler J., Stewart P.L., Crowe J.E. Human rotavirus VP6-specific antibodies mediate intracellular neutralization by binding to a quaternary structure in the transcriptional pore. PLoS ONE, 2013, 8(5): e61101 (doi: 10.1371/journal.pone.0061101).
  • Choi A., McNeal M., Basu M., Bean J., VanCott J., Clements J., Ward R. Functional mapping of protective epitopes within the rotavirus VP6 protein in mice belonging to different haplotypes. Vaccine, 2003, 21(7-8): 761-767 (doi: 10.1016/s0264-410x(02)00595-9).
  • Balke I., Zeltins A. Use of plant viruses and virus-like particles for the creation of novel vaccines. Advanced Drug Delivery Reviews, 2019, 145: 119-129 (doi: 10.1016/j.addr.2018.08.007).
  • Zhao Y., Hammond R. Development of a candidate vaccine for Newcastle disease virus by epitope display in the Cucumber mosaic virus capsid protein. Biotechnology Letters, 2005, 27(6): 375-382 (doi: 10.1007/s10529-005-1773-2).
  • Phelps J.P., Dao P., Jin H., Rasochova L. Expression and self-assembly of cowpea chlorotic mottle virus-like particles in Pseudomonas fluorescens. Journal of Biotechnology, 2007, 128(2): 290296 (doi: 10.1016/j.jbiotec.2006.10.005).
  • Mathieu C., Rioux G., Dumas M.C., Leclerc D. Induction of innate immunity in lungs with virus-like nanoparticles leads to protection against influenza and Streptococcus pneumoniae challenge. Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine, 2013, 9(7): 839-848 (doi: 10.1016/j.nano.2013.02.009).
  • Lebel M.-E., Daudelin J.-F., Chartrand K., Tarrab E., Kalinke U., Savard P., Labrecque N., Leclerc D., Lamarre A. Nanoparticle adjuvant sensing by TLR7 enhances CD8+ T cell-mediated protection from Listeria monocytogenes infection. The Journal of Immunology, 2014, 192(3): 10711078 (doi: 10.4049/jimmunol.1302030).
  • Acosta-Ramírez E., Pérez-Flores R., Majeau N., Pastelin-Palacios R., Gil-Cruz C., Ramírez-Saldaca M., Manjarrez-Orduco N., Cervantes-Barragán L., Santos-Argumedo L., Flores-Romo L., Becker I., Isibasi A., Leclerc D., Lypez-Macías C. Translating innate response into long-lasting antibody response by the intrinsic antigen-adjuvant properties of papaya mosaic virus. Immunology, 2008, 124(2): 186-197 (doi: 10.1111/j.1365-2567.2007.02753.x).
  • Brennan F., Jones T., Hamilton W. Cowpea mosaic virus as a vaccine carrier of heterologous antigens. Molecular Biotechnology, 2001, 17(1): 15-26 (doi: 10.1385/MB:17:1:15).
  • McCormick A.A., Palmer K.E. Genetically engineered tobacco mosaic virus as nanoparticle vaccines. Expert Review of Vaccines, 2008, 7(1): 33-41 (doi: 10.1586/14760584.7.1.33).
  • Denis J., Acosta-Ramirez E., Zhao Y., Hamelin M.E., Koukavica I., Baz M., Abed Y.,
  • Savard C., Pare C., Lopez Macias C., Boivin G., Leclerc D. Development of a universal influenza A vaccine based on the M2e peptide fused to the papaya mosaic virus (PapMV) vaccine platform. Vaccine, 2008, 26(27-28): 3395-3403 (doi: 10.1016/j.vaccine.2008.04.052).
  • Lico C., Mancini C., Italiani P., Betti C., Boraschi D., Benvenuto E., Baschieri S. Plant-produced potato virus X chimeric particles displaying an influenza virus-derived peptide activate specific CD8+ T cells in mice. Vaccine, 2009, 27(37): 5069-5076 (doi: 10.1016/j.vaccine.2009.06.045).
  • Kalnciema I., Skrastina D., Ose V., Pumpens P., Zeltins A. Potato virus Y-like particles as a new carrier for the presentation of foreign protein stretches. Molecular Biotechnology, 2012, 52(2): 129139 (doi: 10.1007/s12033-011-9480-9).
  • Evtushenko E., Ryabchevskaya E., Nikitin N., Atabekov J., Karpova O. Plant virus particles with various shapes as potential adjuvants. Scientific Reports, 2020, 10(1): 1-10 (doi: 10.1038/s41598-020-67023-4).
  • Donchenko E., Trifonova E., Nikitin N., Atabekov J., Karpova O. Alternanthera mosaic po-texvirus: several features, properties, and application. Advances in Virology, 2018, 2018: Article ID 197370 (doi: 10.1155/2018/1973705).
  • Ryabchevskaya E.M., Evtushenko E.K., Arkhipenko M.V., Donchenko E.K., Nikitin N.A., Ata-bekov J.G., Karpova O.V. Recombinant rotavirus antigen based on Althernanthera mosaic virus coat protein. Molecular Biology (Mosk.), 2020, 54(2): 278-284 (doi: 10.1134/S0026893320020132).
  • Choi A.H.C., Basu M., Mcneal M.M., Clements J.D., Ward R.L. Antibody-independent protection against rotavirus infection of mice stimulated by intranasal immunization with Chimeric VP4 or VP6 protein. Journal of Virology, 1999, 73(9): 7574-7581 (doi: 10.1128/JVI.73.9.7574-7581.1999).
  • Trifonova E.A., Nikitin N.A., Kirpichnikov M.P., Karpova O.V., Atabekov J.G. Obtaining and characterization of spherical particles — new biogenic platforms. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2015, 70(4): 194-197 (doi: 10.3103/S0096392515040094).)
  • Kondakova O., Trifonova E., Arkhipenko M., Nikitin N., Karpova O., Atabekov J. Development of avian influenza vaccine on the basis of structurally modified plant virus. Sel'skokhozyaistvennaya bi-ologiya [Agricultural Biology], 2017, 52(4): 731-738 (doi: 10.15389/agrobiology.2017.4.731eng).
  • Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd edition. Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor Lab. Press, New York, 1989.
  • Settembre E.C., Chen J.Z., Dormitzer P.R., Grigorieff N., Harrison S.C. Atomic model of an infectious rotavirus particle. The EMBO Journal, 2011, 30(2): 408-416 (doi: 10.1038/em-boj.2010.322).
  • Sehnal D., Rose A.S., Koca J., Burley S.K., Velankar S. Mol*: Towards a common library and tools for web molecular graphics. Workshop on Molecular Graphics and Visual Analysis of Molecular Data /J. Byska, M. Krone, B. Sommer (eds.). The Eurographics Association, 2018: 29-33 (doi: 10.2312/molva.20181103).
  • Berman H.M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T.N., Weissig H., Shindyalov I.N., Bourne Ph.E. The Protein Data Bank. Nucleic Acids Research, 2000, 28(1): 235-242 (doi: 10.1093/nar/28.1.235).
  • Jmol: an open-source Java viewer for chemical structures in 3D. Режим доступа: http://www.jmol.org. Без даты.
  • Mathieu M., Petitpas I., Navaza J., Lepault J., Kohli E., Pothier P., Prasad B.V.V., Cohen J., Rey F.A. Atomic structure of the major capsid protein of rotavirus: implications for the architecture of the virion. The EMBO Journal, 2001, 20(7): 1485-1497 (doi: 10.1093/emboj/20.7.1485).
  • Hulo C., de Castro E., Masson P., Bougueleret L., Bairoch A., Xenarious I., Le Mercier P. ViralZone: a knowledge resource to understand virus diversity. Nucleic Acids Research, 2011, 39(Database issue): D576-D582 (doi: 10.1093/nar/gkq901).
  • Denis J., Majeau N., Acosta-Ramirez E., Savard C., Bedard M., Simard S., Lecours K., Bolduc M., Pare C., Willems B., Shoukry N., Tessier P., Lacasse P., Lamarre A., Lapointe R., Macias C., Leclerc D. Immunogenicity of papaya mosaic virus-like particles fused to a hepatitis C virus epitope: evidence for the critical function of multimerization. Virology, 2007, 363: 59-68 (doi: 10.1016/j.virol.2007.01.011).
  • Rioux G., Babin C., Majeau N., Leclerc D. Engineering of papaya mosaic virus (PapMV) nano-particles through fusion of the HA11 peptide to several putative surface-exposed sites. PLoS ONE, 2012, 7(2): e31925 (doi: 10.1371/journal.pone.0031925;.
  • O'Hagan D.T., De Gregorio E. The path to a successful vaccine adjuvant — "The long and winding road". Drug Discovery Today, 2009, 14(11-12): 541-551 (doi: 10.1016/j.drudis.2009.02.009).
  • Del Giudice G., Rappuoli R., Didierlaurent A.M. Correlates of adjuvanticity: a review on adjuvants in licensed vaccines. Seminars in Immunology, 2018, 39: 14-21 (doi: 10.1016/j.smim.2018.05.001).
Еще
Статья научная