Оценка качества наблюдений растений рода Rosa (Rosaceae) на Inaturalist и практические рекомендации для наблюдателей на примере некоторых регионов России

Оценка качества наблюдений растений рода Rosa (Rosaceae) на Inaturalist и практические рекомендации для наблюдателей на примере некоторых регионов России

Автор: Хапугин А.А., Сенчугова М.А.

Журнал: Фиторазнообразие Восточной Европы @phytodiveuro

Статья в выпуске: 1 т.17, 2023 года.

Бесплатный доступ

Качество данных о биологическом разнообразии играет большую роль в понимании действительного распространения организмов. Это особенно важно для таксономических групп, сложных для идентификации. В настоящей работе мы оценили точность идентификации наблюдений представителей рода Rosa (Rosaceae), размещенных на онлайн-платформе iNaturalist. Для этого были проверены все наблюдения Rosa, сделанные в июле и августе 2021-2022 гг. и загруженные на платформу iNaturalist до 13.12.2022 г. с территорий семи регионов центра Европейской России (Костромская, Нижегородская, Тамбовская, Тульская области, Республика Мордовия, Республика Татарстан, Чувашская Республика) и двух регионов Зауралья (Тюменская и Курганская области). Из общего числа видов были выделены пять хорошо идентифицируемых видов Rosa (R. acicularis, R. glauca, R. rugosa, R. spinosissima, R. villosa), при определении которых, как правило, не возникает проблем ни у экспертов платформы iNaturalist, ни у искусственного интеллекта на этом ресурсе. Эти виды были исключены из финального анализа. Полученные результаты показали, что в восьми из девяти регионов России 62.7±11.3% наблюдений Rosa невозможно определить до видового уровня ввиду недостатка признаков, представленных на фотографиях этих наблюдений. Лишь для Тюменской области отмечена относительно высокая доля наблюдений (69.4%), которые могут быть определены до видового уровня. Это свидетельствует о высокой доле осведомленности наблюдателей платформы iNaturalist о видовом составе шиповников Тюменской области и/или том, какие именно признаки важно отразить на фотографиях для идентификации наблюдений Rosa до видового уровня. Для снижения доли неидентифицируемых наблюдений шиповников, размещенных на платформе iNaturalist, мы представили практические рекомендации для публикации фотонаблюдений представителей рода Rosa и указали на ключевые признаки, необходимые для идентификации растений этой группы. Данные платформы iNaturalist представляют собой мощный инструмент для сбора данных о биоразнообразии. Тем не менее, эти краудсорсинговые данные должны быть как можно более точными, чтобы они могли быть полезны в научных исследованиях. Составленные нами рекомендации должны помочь в повышении точности данных о роде Rosa на платформе iNauralist, и могут быть применимы и к другим группам растений.

Еще

Биоразнообразие, гражданская наука, краудсорсинговые данные, таксономически сложные таксоны, шиповник

Короткий адрес: https://sciup.org/148326118

IDR: 148326118   |   DOI: 10.24412/2072-8816-2023-17-1-100-114

Список литературы Оценка качества наблюдений растений рода Rosa (Rosaceae) на Inaturalist и практические рекомендации для наблюдателей на примере некоторых регионов России

  • Allen J.L., McMullin R.T. 2022. Assessing Identification Accuracy of Research Grade iNaturalist Observations in Lichens and other Taxonomically Difficult Organisms. — Biodiversity Information Science and Standards. 6: e95689. DOI: 10.3897/biss.6.95689
  • Alvarado-Cárdenas L.O., Chávez-Hernández M.G., Pío León J.F. 2020. Gonolobus natu-ralistae (Apocynaceae; Asclepiadoideae; Gonolobeae; Gonolobinae), a new species from México. — Phytotaxa. 472(3): 249-258. DOI: 10.11646/phytotaxa.472.3.3
  • Aristeidou M., Herodotou C., Ballard H.L., Higgins L., Johnson R.F., Miller A.E., Young A.N., Robinson L.D. 2021. How Do Young Community and Citizen Science Volunteers Support Scientific Research on Biodiversity? The Case of iNaturalist. — Diversity. 13: 318. DOI: 10.3390/d13070318
  • [Buzunova] Бузунова И.О. 2001. Роза, шиповник - Rosa L. — В кн.: Флора Восточной Европы. Т. 10. Санкт-Петербург. С. 329-361.
  • Callaghan C.T., Mesaglio T., Ascher J.S., Brooks T.M., Cabras A.A., Chandler M., Cornwell W.K., Cristóbal Ríos-Málaver I., Dankowicz E., Urfi Dhiya'ulhaq N., Fuller R.A., Galindo-Leal C., Grattarola F., Hewitt S., Higgins L., Hitchcock C., James Hung K.L., Iwane T., Kahumbu P., Kendrick R., Kieschnick S.R., Kunz G., Lee C.C., Lin C.T., Loarie S., Norman Medina M., McGrouther M.A., Miles L., Modi S., Nowak K., Oktaviani R., Waswala Olewe B.M., Pagé J., Petrovan S., Saari C., Seltzer C.E., Seregin A.P., Sullivan J.J., Sumana-pala A.P., Takoukam A., Widness J., Willmott K., Wüster W., Young A.N. 2022. The benefits of contributing to the citizen science platform iNaturalist as an identifier. — PLoS Biology. 20(11): e3001843. DOI: 10.1371/journal.pbio.3001843
  • Filippova N.V., Ageev D.V., Basov Yu.M., Bilous V.V., Bochkov D.A., Bolshakov S.Yu., Bushmakova G.N., Butunina E.A., Davydov E.A., Esengeldenova A.Yu., Filippov I.V., Filippova A.V., Gerasimov S.V., Kalinina L.B., Kinnunen J., Korepanov A.A., Korotkikh N.N., Kuzmin I.V., Kvashnin S.V., Mingalimova A.I., Nakonechnyi N.V., Nurkhanov R.N., Popov E.S., Potapov K.O., Rebriev Yu.A., Rezvyi A.S., Romanova S.R., Strus T.L., Sundström C., Svetasheva T.Yu., Tabone M., Tsarakhova S.G., Vasina A.L., Vlasenko A.V., Vlasenko V.A., Yakovchenko L.S., Yakovlev A.A., Zvyagina E.A. 2022. Crowdsourcing fungal biodiversity: revision of iNaturalist observations in Northwestern Siberia. — Nature Conservation Research. 7(Suppl.1): 64-78. DOI: 10.24189/ncr.2022.023
  • Gagarin V.G., Gusakov V.A. 2022. Miconchus prokini sp. nov. (Nematoda: Mononchida) from lake El'gygytgyn, Chukotka, Russia. — Nature Conservation Research. 7(2): 88-94. DOI: 10.24189/ncr.2022.022
  • Heberling J.M., Miller J.T., Noesgaard D., Weingart S.B., Schigel D. 2021. Data integration enables global biodiversity synthesis. - Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118(6): e2018093118. DOI: 10.1073/pnas.2018093118
  • Izdebska J.N., Rolbiecki L. 2020. The Biodiversity of Demodecid Mites (Acariformes: Prostigmata), Specific Parasites of Mammals with a Global Checklist and a New Finding for Demodex sciurinus. — Diversity. 12(7): 261. DOI: 10.3390/d12070261
  • [Khapugin] Хапугин А.А. 2015. Род Rosa L. в бассейне реки Мокша: дисс. ... канд. биол. наук. Москва. 160 с.
  • Khapugin A.A., Kuzmin I.V. 2022. Data for Distribution of Vascular Plants (Tracheo-phytes) of Urban Forests and Floodplains in Tyumen City (Western Siberia). — Data. 7(12): 180. DOI: 10.3390/data7120180
  • Koo K.S., Oh J.M., Park S.J., Im J.Y. 2022. Accessing the Accuracy of Citizen Science Data Based on iNaturalist Data. - Diversity. 14: 316. DOI: 10.3390/d14050316
  • Lohonya K., Livermore L., Wajer J., Crowther R., Devenish E. 2022. Digitisation of the Natural History Museum's collection of Dalbergia, Pterocarpus and the subtribe Phaseolinae (Fabaceae, Faboideae). — Biodiversity Data Journal. 10: e94939. DOI: 10.3897/BDJ.10.e94939
  • McMullin R.T., Allen J.L. An assessment of data accuracy and best practice recommendations for observations of lichens and other taxonomically difficult taxa on iNaturalist. — Botany. 100(6): 491-497. DOI: 10.1139/cjb-2021-0160
  • [Naumenko] Науменко Н.И. 2008. Флора и растительность Южного Зауралья. Курган. 512 с.
  • [Polozhiy] Положий А.В. 1988. Rosa L. Шиповник. — В кн.: Флора Сибири. Новосибирск. С.124-129.
  • Ritz C.M., Schmuths H., Wissemann V. 2005. Evolution by Reticulation: European Dogroses Originated by Multiple Hybridization Across the Genus Rosa. — Journal of Heredity. 96(1): 4-14. DOI: 10.1093/jhered/esi011
  • Schanzer I.A., Kutlunina N.A. 2010. Interspecific hybridization in wild roses (Rosa L. sect. Caninae DC.). - Biology Bulletin. 37(5): 480-488
  • Seregin A.P., Bochkov D.A., Shner J.V., Garin E.V., Pospelov I.N., Prokhorov V.E., Golyakov P.V., Mayorov S.R., Svirin S.A., Khimin A.N., Gorbunova M.S., Kashirina E.S., Kuryakova O.P., Bolshakov B.V., Ebel A.L., Khapugin A.A., Mallaliev M.M., Mirvoda S.V., Lednev S.A., Nesterkova D.V., Zelenova N.P., Nesterova S.A., Zelenkova V.N., Vinogradov G.M., Biryukova O.V., Verkhozina A.V., Zyrianov A.P., Gerasimov S.V., Murtazaliev R.A., Basov Y.M., Marchenkova K.Yu., Vladimirov D.R., Safina D.B., Dudov S.V., Degtyarev N.I., Tretyakova D.V., Chimitov D.G., Sklyar E.A., Kandaurova A.N., Bogdanovich S.A., Dubynin A.V., Chernyagina O.A., Lebedev A.V., Knyazev M.S., Mitjushina I.Yu., Filippova N.V., Dudova K.V., Kuzmin I.V., Svetasheva T.Yu., Zakharov V.P., Travkin V.P., Magazov Y.O., Teploukhov V.Yu., Efremov A.N., Deineko O.V., Stepanov V.V., Popov E.S., Kuz-menckin D.V., Strus T.L., Zarubo T.V., Romanov K.V., Ebel A.L., Tishin D.V., Arkhipov V.Yu., Korotkov V.N., Kutueva S.B., Gostev V.V., Krivosheev M.M., Gamova N.S., Belova V.A., Kosterin O.E., Prokopenko S.V., Sultanov R.R., Kobuzeva I.A., Dorofeev N.V., Yakovlev A.A., Danilevsky Y.V., Zolotukhina I.B., Yumagulov D.A., Glazunov V.A., Baku-tov V.A., Danilin A.V., Pavlov I.V., Pushay E.S., Tikhonova E.V., Samodurov K.V., Epikhin D.V., Silaeva T.B., Pyak A.I., Fedorova Y.A., Samarin E.S., Shilov D.S., Borodulina V.P., Kropocheva E.V., Kosenkov G.L., Bury U.V., Mitroshenkova A.E., Karpenko T.A., Os-manov R.M., Kozlova M.V., Gavrilova T.M., Senator S.A., Khomutovskiy M.I., Borovichev E.A., Filippov I.V., Ponomarenko S.V., Shumikhina E.A., Lyskov D.F., Belyakov E.A., Koz-hin M.N., Poryadin L.S., Leostrin A.V. 2020 a. «Flora of Russia» on iNaturalist: a dataset. — Biodiversity Data Journal. 8: e59249. DOI: 10.3897/BDJ.8.e59249
  • [Seregin et al.] Серегин А.П., Бочков Д.А., Шнер Ю.В., Гарин Э.В., Майоров С.Р., Голяков П.В., Большаков Б.В., Прохоров В.Е., Маллалиев М.М., Виноградов Г.М., Эбель Александр Л., Каширина Е.С., Бирюкова О.В., Курякова О.П., Мирвода С.В., Химин А.Н., Муртазалиев Р.А., Зеленкова В.Н., Дудов С.В., Горбунова М.С., Герасимов С.В., Эбель Алексей Л., Травкин В.П., Чернягина О.А., Разина Е.А., Зырянов А.П., Третьякова Д.В., Леднев С.А., Теплоухов В.Ю., Кузменкин Д.В., Кривошеев М.М., Попов Е.С., Султанов Р.Р., Басов Ю.М., Дудова К.В., Тишин Д.В., Яковлев А.А., Данилевский Ю.В., Поспелов И.Н., Кандаурова А.Н., Кутуева С.Б., Юмагулов Д.А., Самодуров К.В., Смирнова Л.Я., Бурый В.В., Юсупов В.Е., Епихин Д.В., Репина Т.Г., Богинский Е.И., Дубынин А.В., Коробков А.В., Нестеркова Д.В., Полуянов А.В., Данилин А.В., Ефремов А.Н., Пожидаева Л.В., Верхозина А.В., Постников Ю.А., Линник Е.А., Кобузева И.А., Прокопенко С.В., Шумихина Е.А., Кушунина М.А., Кузьмин И.В., Разран Л.М., Сухова Д.В., Попов А.В. 2020 b. Флора России на платформе inaturalist: большие данные о биоразнообразии большой страны. — Журнал общей биологии. 81(3): 223-233.
  • [Silaeva et al.] Силаева Т.Б., Лукиянов С.В., Моисеева П.А., Уразова Н.В., Синичкина А.Д., Есина И.Г., Федашева Е.С., Аникина Е.П., Бойнова Я.Ю., Ведякова Д.П., Пись-маркина Е.В., Учеваткина Ю.П., Агеева А.М., Хапугин А.А. 2022. Дополнения к чужеземной флоре Республики Мордовия (Европейская Россия). — Полевой журнал биолога. 4(2): 95-118. DOI: 10.52575/2712-9047-2022-4-2-95-118
  • Urbanavichus G.P., Urbanavichene I.N. 2022. First records of lichenised and lichenicolous fungi for the lichen flora of Russia and Eastern Europe. — Nature Conservation Research. 7(2): 95-97. DOI: 10.24189/ncr.2022.024
  • Wessels P., Moran N., Johnston A., Wang W. 2019. Hybrid expert ensembles for identifying unreliable data in citizen science. — Engineering Applications of Artificial Intelligence. 81: 200-212. DOI: 10.1016/j.engappai.2019.01.004
  • Wittmann J., Girman D., Crocker D. 2019. Using iNaturalist in a Coverboard Protocol to Measure Data Quality: Suggestions for Project Design. — Citizen Science: Theory and Practice. 4(1): 21. DOI: http://doi.org/10.5334/cstp.131
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp