Оценка роли актинобактерий в активности глубоководных эндемичных видов амфипод, принадлежащих к роду Ommatogammarus
Автор: Протасов Е.С., Аксенов-грибанов Д.В., Войцеховская И.В., Тимофеев М.А.
Журнал: Журнал стресс-физиологии и биохимии @jspb
Статья в выпуске: 4 т.12, 2016 года.
Бесплатный доступ
Целью настоящего исследования было выявление ассоциаций между штаммами актинобактерий и глубоководными эндемическими амфиподами озера Байкал. Во время исследования сорок два штамма актинобактерий были выделены из амфиподов, принадлежащих к роду Ommatogammarus (O. albinus и O. flavus), которые были пойманы с глубины 80-200 м. Анализ части гена 16S рРНК показал, что полученные штаммы, принадлежащие к родам Streptomyces, Micromonospora и Pseudonocardia. Результаты исследования показывают, что актинобактерии, которые продуцируют противомикробные соединения, обитают в организме амфиподов из рода Ommatogammarus. Предполагается, что актинобактерии могут влиять на метаболизм глубоководных амфиподсосудов. Кроме того, актинобактерии, полученные из эндемичных амфипод озера Байкал, имеют потенциальные фармацевтические применения в качестве источника антибиотиков. Они также расширяют наше понимание взаимосвязи между микроорганизмами и эндемическими амфиподами.
Короткий адрес: https://sciup.org/14324001
IDR: 14324001
Список литературы Оценка роли актинобактерий в активности глубоководных эндемичных видов амфипод, принадлежащих к роду Ommatogammarus
- Anderson I., Abt B., Lykidis A., Klenk H.P., Kyrpides N. Ivanova N. (2012) Genomics of aerobic cellulose utilization systems in actinobacteria. PloS One, 7:e39331
- Atlas R., Busdosh M. (1982) Bacterial populations associated with the Arctic amphipod Boeckosimus affinis. Canadian Journal of Microbiology, 28, 92-99
- Axenov-Gribanov D., Rebets Y., Tokovenko B., Voytsekhovskaya I., Timofeyev M., Luzhetskyy A. (2015) The isolation and characterization of actinobacteria from dominant benthic macroinvertebrates endemic to Lake Baikal. Folia Microbiologica, 61(2):159-168
- Barlocher F (1982) The contribution of fungal enzymes to the digestion of leaves by Gammarus fossarum Koch (Amphipoda). Oecologia, 52, 5-8
- Barlocher F. (1981) Fungi on the food and in the faeces of Gammarus pulex. Transactions of the British Mycological Society, 76,160-165
- Bonfante P., Genre A. (2010) Mechanisms underlying beneficial plant-fungus interactions in mycorrhizal symbiosis. Nature communications, 1, 48
- Costa R., Keller-Costa T., Gomes N.C., da Rocha U.N., van Overbeek L., van Elsas J.D. (2013) Evidence for selective bacterial community structuring in the freshwater sponge Ephydatia fluviatilis. Microbial ecology, 65(1), 232-244
- Deming J., Tabor P., Colwell R. (1981) Barophilic growth of bacteria from intestinal tracts of deep-sea invertebrates. Microbial Ecology, 7(1), 85-94
- Duncan K.R., Crüsemann M., Lechner A., Sarkar A., Li J., Ziemert N., Wang M., Bandeira N., Moore B., Dorrestein P., Jensen P. (2015) Molecular Networking and Pattern-Based Genome Mining Improves Discovery of Biosynthetic Gene Clusters and their Products from Salinispora Species. Chemical Biology, 22, 460-471
- Kieser B, Buttner M, Charter K, Hopwood В (2000) Practical streptomyces genetics. John Innes Foundation, Norwich
- Parfenova V.V., Terkina I.A., Kostornova T.Y., Nikulina I.G., Chernikh V.I., Maksimova E.A. (2008) Microbial community of freshwater sponges in Lake Baikal. Biological Bulletin, 35, 374-379
- Takhteev V.V., Berezina N.A., Sidorov D.A. (2015) Checklist of the Amphipoda (Crustacea) from continental waters of Russia, with data on alien species. Arthropoda Selecta, 24, 335-370
- Taylor M.W., Radax R., Steger D., Wagner M. (2007) Sponge-associated microorganisms: evolution, ecology, and biotechnological potential. Microbiology and molecular biology reviews, 71(2), 295-347
- Timoshkin O.A., Sitnikova T.Y., Rusinek O.T., Pronin N.M., Proviz V.I., Mel'nik N.G., Kamaltynov R.M., Mazepova G.F., Adov F.V., Anohin B.A., Arov I.V., Baldanova D.R., Biserov V.I., Bondarenko N.A., Burdukovskaja T.G., Grajger M.Dzh., Danilov S.N., Dzjuba E.V., Dubeshko L.N., Dugarov Zh.N., Dudichev A.L., Evstigneeva T.D., Efremova S.M., Zhil'cova L.A., Kavakatsu M., Korgina E.M., Korobkova N.V., Krickaja U.A., Kutikova L.A., Ljamkin V.F., Natjaganova A.V., Naumova T.V., Nekrasov A.V., Novikova O.A., Obolkina L.A., Okuneva G.L., Podtjazhkina M.M., Pomazkova G.I., Popov V.V., Pronina S.V., Rozhkova N.A., Sanzhieva S.D., Semernoj V.P., Sideleva V.G., Slugina Z.V.,Starobogatov Ja., Stepan'janc S.D., Tanichev A.I., Tuzovskij P.V., Hamnueva T.R.,. Calolihin S.Ja, Sheveleva N.G., Shibanova I.V., Shirokaja A.A.,Shoshinin A.V. (2001) Index of animal species inhabiting Lake Baikal and its catchment area, Nowosibirsk: Nauka
