Однонуклеотидный полиморфизм опухоли молочной железы и экспрессия АВС-транспортеров после неоадъювантной химиотерапии
Автор: Цыганов Матвей Михайлович, Ибрагимова Марина Константиновна, Слонимская Елена Михайловна, Чердынцева Надежда Викторовна, Литвяков Николай Васильевич
Журнал: Сибирский онкологический журнал @siboncoj
Рубрика: Лабораторные и экспериментальные исследования
Статья в выпуске: 5 (71), 2015 года.
Бесплатный доступ
В настоящее время практически не изученным остается механизм регуляции экспрессии генов АВСтранспортеров, который связан с индивидуальными особенностями организма опухоленосителя и его опухоли, определяемыми генным однонуклеотидным полиморфизмом (SNP - Single Nucleotide Polymorphism). Проведено изучение ассоциации SNP в широкогеномном масштабе с уровнем экспрессии генов АВС-транспортеров после неоадъювантной химиотерапии (НХТ) у 68 больных с морфологически верифицированным раком молочной железы (РМЖ). При помощи количественной ПЦР с обратной транскрипцией в режиме реального времени изучена экспрессия 4 генов АВС: ABCB1, ABCC1, ABCC2, ABCG2 в операционном материале после НХТ. для исследования SNP проводили микроматричный анализ на дНК-чипах высокой плотности, которые содержат более 750 тыс. однонуклеотидных полиморфизмов. В результате биоинформатического анализа было идентифицировано 6 SNP, которые статистически значимо связаны с послеоперационным уровнем экспрессии генов АВС: ABCB1, ABCC1, ABCC2 и ABCG2. Показано, что у носителей редкого генотипа уровень экспрессии всех 4 исследованных генов в опухоли после воздействия химиопрепаратов либо снижен (rs2680835, rs1951366 и rs12018988), либо повышен (rs4676478, rs6896596, rs1154121) по сравнению с носителями частого и гетерозиготного генотипов этих SNP. Обсуждены возможные механизмы влияния выявленных SNP и их генов на экспрессию АВС-транспортеров.
Авс-транспортеры, рак молочной железы, однонуклеотидный полиморфизм, микроматричное исследование
Короткий адрес: https://sciup.org/14056581
IDR: 14056581
Список литературы Однонуклеотидный полиморфизм опухоли молочной железы и экспрессия АВС-транспортеров после неоадъювантной химиотерапии
- Литвяков Н.В. Регуляция экспрессии генов множественной лекарственной устойчивости в опухоли молочной железы при проведении неоадъювантной химиотерапии: Автореф. дис. … д-ра биол. наук. Томск, 2014. 47 с
- Литвяков Н.В. Градиентный феномен экспрессии генов множественной лекарственной устойчивости в опухоли молочной железы при проведении неоадъювантной химиотерапии: связь с прогрессированием заболевания//Сибирский онкологический журнал, 2013. № 4. С. 5-11
- Литвяков Н.В., Гарбуков Е.Ю., Слонимская Е.М., Цыганов М.М., Денисов Е.В., Вторушин С.В., Христенко К.Ю., Завьялова М.В., Чердынцева Н.В. Связь безметастатической выживаемости больных раком молочной железы и вектора изменения экспрессии генов множественной лекарственной устойчивости в опухоли при проведении неоадъювантной химиотерапии//Вопросы онкологии. 2013. Т. 59, № 3 (59). С. 334-340
- Литвяков Н.В., Чердынцева Н.В., Цыганов М.М., Денисов Е.В., Мерзлякова М.К., Гарбуков Е.Ю., Вторушин С.В., Завьялова М.В., Слонимская Е.М. Ассоциация генетического полиморфизма с изменением экспрессии генов множественной лекарственной устойчивости в опухоли молочной железы в процессе неоадъювантной химиотерапии//Медицинская генетика. 2011. Т. 10, № 10. С. 37-43
- Allen J.D., Jackson S.C., Schinkel A.H. A mutation hot spot in the Bcrp1 (Abcg2) multidrug transporter in mouse cell lines selected for Doxorubicin resistance//Cancer Res. 2002. Vol. 62 (8). P. 2294-2299
- Di Francia R., Siesto R.S., Valente D., Spart D., Berretta M. Pharmacogenomics panel test for prevention toxicity in patient who receive Fluoropirimidine/Oxaliplatin-based therapy//Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci. 2012. Vol. 16 (9). P. 1211-1217
- Einert T.R., Schmidt G., Binnig G. Diagnostics//Ann. Oncol. 2012. Vol. 23 (Suppl. 5): P. 12-22 DOI: 10.1093/annonc/mds161
- Errico A., Claudiani P., D’Addio M., Rugarli E.I. Spastin interacts with the centrosomal protein NA14, and is enriched in the spindle pole, the midbody and the distal axon//Hum. Mol. Genet. 2004. Vol. 13 (18). P. 2121-2132
- Gillet J.P., Gottesman M.M. Overcoming multidrug resistance in cancer: 35 years after the discovery of ABCB1//Drug Resistance Updates. 2012. Vol. 15 (1-2). P. 2-4 DOI: 10.1016/j.drup.2012.03.001
- Gökmen-Polar Y., Toroni R.A., Hocevar B.A., Badve S., Zhao Q., Shen C., Bruckheimer E., Kinch M.S., Miller K.D. Dual targeting of EphA2 and ER restores tamoxifen sensitivity in ER/EphA2-positive breast cancer//Breast Cancer Res. Treat. 2011. Vol. 127 (2). P. 375-384. doi: 10.1007/s10549-010-1004-y
- Gottesman M.M., Fojo T., Bates S.E. Multidrug resistance in cancer: role of ATP-dependent transporters//Nat. Rev. Cancer. 2002. Vol. 2 (1). P. 48-58
- He Y.J., Winham S.J., Hoskins J.M., Glass S., Paul J., Brown R., Motsinger-Reif A., McLeod H.L Carboplatin/taxane-induced gastrointestinal toxicity: a pharmacogenomics study on the SCOTROC1 trial//Pharmacogenomics J. 2015 DOI: 10.1038/tpj.2015.52
- Henriksen U., Gether U., Litman T. Effect of Walker A mutation (K86M) on oligomerization and surface targeting of the multidrug resistance transporter ABCG2//J. Cell Sci. 2005. Vol. 118 (7). P. 1417-1426
- Hoffmeyer S., Burk O., von Richter O., Arnold H.P., Brockmöller J., Johne A., Cascorbi I., Gerloff T., Roots I., Eichelbaum M., Brinkmann U. Functional polymorphisms of the human multidrug-resistance gene: multiple sequence variations and correlation of one allele with P-glycoprotein expression and activity in vivo//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. Vol. 97 (7). P. 3473-3478
- Honjo Y., Hrycyna C.A., Yan Q.W., Medina-Pérez W.Y., Robey R.W., van de Laar A., Litman T., Dean M., Bates S.E. Acquired mutations in the MXR/BCRP/ABCP gene alter substrate specificity in MXR/BCRP/ABCPoverexpressing cells//Cancer Res. 2001. Vol. 61 (18). P. 6635-6639
- Huang Y., Sadée W. Membrane transporters and channels in chemoresistance and -sensitivity of tumor cells//Cancer Lett. 2006. Vol. 239 (2). P. 168-182
- Huang Y. Pharmacogenetics/genomics of membrane transporters in cancer chemotherapy//Cancer Metastasis Rev. 2007. Vol. 26 (1). P. 183-201
- Januchowski R., Zawierucha P., Ruciński M., Andrzejewska M., Wojtowicz K., Nowicki M., Zabel M. Drug transporter expression profiling in chemoresistant variants of the A2780 ovarian cancer cell line//Biomed. Pharmacother. 2014. Vol. 68 (4). P. 447-453 DOI: 10.1016/j.biopha.2014.02.002
- Januchowski R., Wojtowicz K., Sujka-Kordowska P., Andrzejewska M., Zabel M. MDR gene expression analysis of six drug-resistant ovarian cancer cell lines//Biomed. Res. Int. 2013 DOI: 10.1155/2013/241763
- Kim H.S., Kim M.K., Chung H.H., Kim J.W., Park N.H., Song Y.S., Kang S.B. Genetic polymorphisms affecting clinical outcomes in epithelial ovarian cancer patients treated with taxanes and platinum compounds: a Korean population-based study//Gynecol. Oncol. 2009. Vol. 113 (2): P. 264-269 DOI: 10.1016/j.ygyno.2009.01.002
- Litviakov N.V., Cherdyntseva N.V., Tsyganov M.M., Denisov E.V., Garbukov E.Y., Merzliakova M.K., Volkomorov V.V., Vtorushin S.V., Zavyalova M.V., Slonimskaya E.M., Perelmuter V.M. Changing the expression vector of multidrug resistance genes is related to neoadjuvant chemotherapy response//Cancer Chemother. Pharmacol. 2013. Vol. 71 (1). P. 153-163 DOI: 10.1007/s00280-012-1992-x
- Mannan A.U., Boehm J., Sauter S.M., Rauber A., Byrne P.C., Neesen J., Engel W. Spastin, the most commonly mutated protein in hereditary spastic paraplegia interacts with Reticulon 1 an endoplasmic reticulum protein//Neurogenetics. 2006. Vol. 7 (2). P. 93-103
- Nakanishi T. Drug transporters as targets for cancer chemotherapy//Cancer Genomics Proteomics. 2007. Vol. 4 (3). P. 241-254
- Pfaffl M.W. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR//Nucleic Acids Res. 2001. Vol. 29 (9). P. e45
- Polgar O., Ozvegy-Laczka C., Robey R.W., Morisaki K., Okada M., Tamaki A., Koblos G., Elkind N.B., Ward Y., Dean M., Sarkadi B., Bates S.E. Mutational studies of G553 in TM5 of ABCG2: a residue potentially involved in dimerization//Biochemistry. 2006. Vol. 45 (16): P. 5251-5260
- Robey R., Honjo Y., Morisaki K., Nadjem T.A., Runge S., Risbood M., Poruchynsky M.S., Bates S.E. Mutations at amino-acid 482 in the ABCG2 gene affect substrate and antagonist specificity//Br. J. Cancer. 2003. Vol. 89 (10). P. 1971-1978
- Sauer G., Brehm G., Schneider S., Nielsch K., Wehrspohn R.B., Choi J., Hofmeister H., Gösele U. Highly ordered monocrystalline silver nanowire arrays//J. Appl. Phys. 2002. Vol. 91 (5): P. 3243-3247
- Schwartz G.F., Hortobagyi G.N. Proceedings of the consensus conference on neoadjuvant chemotherapy in carcinoma of the breast, April 26-28, 2003, Philadelphia, Pennsylvania//Cancer. 2004. Vol. 100 (12). P. 2512-2532
- Taheri M., Mahjoubi F., Omranipour R. Effect of MDR1 polymorphism on multidrug resistance expression in breast cancer patients//Genet. Mol. Res. 2010. Vol. 9 (1). P. 34-40 DOI: 10.4238/vol9-1gmr669
- Tamura A., Wakabayashi K., Onishi Y., Takeda M., Ikegami Y., Sawada S., Tsuji M., Matsuda Y., Ishikawa T. Re-evaluation and functional classification of nonsynonymous single nucleotide polymorphisms of the human ATP-binding cassette transporter ABCG2//Cancer Sci. 2007. Vol. 98 (2). P. 231-239
- Teft W.A., Mansell S.E., Kim R.B. Endoxifen, the active metabolite of tamoxifen, is a substrate of the efflux transporter P-glycoprotein (multidrug resistance 1)//Drug Metab. Dispos. 2011. Vol. 39 (3). P. 558-562 DOI: 10.1124/dmd.110.036160
- Vega-Gálvez A., Di Scalab K., Rodrígueza K., Lemus-Mondacaa R., Mirandaa M., Lópeza J., Perez-Wona M. Effect of air-drying temperature on physico-chemical properties, antioxidant capacity, colour and total phenolic content of red pepper (Capsicum annuum, L. var. Hungarian)//Food Chemistry. 2009. Vol. 117 (4). P. 647-653 DOI: 10.1016/j.foodchem.2009.04.066
- Xu Y., Jiang Z., Yin P., Li Q., Liu J. Role for Class I histone deacetylases in multidrug resistance//Exp. Cell Res. 2012. Vol. 318 (3). P. 177-186 DOI: 10.1016/j.yexcr.2011.11.010
- Zhuang G., Brantley-Sieders D.M., Vaught D., Yu J., Xie L., Wells S., Jackson D., Muraoka-Cook R., Arteaga C., Chen J. Elevation of receptor tyrosine kinase EphA2 mediates resistance to trastuzumab therapy//Cancer Res. 2010. Vol. 70 (1). P. 299-308 DOI: 10.1158/00085472.CAN-09-1845