Определение индикаторных микроорганизмов для мониторинга инфекционных заболеваний рыб на примере Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край)

Определение индикаторных микроорганизмов для мониторинга инфекционных заболеваний рыб на примере Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край)

Автор: Суханова Е.В., Дзюба Е.В., Деникина Н.Н., Михеев И.Е., Матюгина Е.Б., Белькова Н.Л.

Журнал: Известия Самарского научного центра Российской академии наук @izvestiya-ssc

Рубрика: Мониторинг

Статья в выпуске: 1-4 т.12, 2010 года.

Бесплатный доступ

Многие микроорганизмы-возбудители инфекционных заболеваний рыб являются широко распространенными представителями микробиоценоза воды в естественных водоемах. Проявление их патогенности для рыб связано с изменениями ряда параметров среды обитания и характеристик состояния рыбного населения. Молекулярно-генетические методы на основе полимеразной цепной реакции позволяют корректно определять состав микрофлоры, вызывающей и сопутствующей инфекционным заболеваниям рыб. Проведена молекулярно-генетическая идентификация инфекционных агентов, ставших причиной «аэромоноза» в популяции окуня Perca fluviatilis озера Арахлей (Забайкальский край) в 2009 году. Детектированы генотипы бактерий родов Aeromonas и Flavobacterium, а также представителей рода Saprolegnia, подтверждена комплексная этиология заболевания окуня. Предложены виды ключевых индикаторных микроорганизмов для мониторинга состояния среды обитания и инфекционных заболеваний рыб в озерах Забайкалья.

Еще

Мониторинг бактериальных инфекций, индикаторные микроорганизмы, молекулярно- генетическая идентификация

Короткий адрес: https://sciup.org/148199103

IDR: 148199103

Список литературы Определение индикаторных микроорганизмов для мониторинга инфекционных заболеваний рыб на примере Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край)

  • Базарова, Б.Б. Структура и продуктивность растительности водных экосистем Восточного Забайкалья (на примере бассейна реки Хилок). Автореф. дисс. канд. биол. наук. Улан-Удэ, 2003. -18 с.
  • Белькова, Н.Л. Введение в молекулярную экологию микроорганизмов: Учебно-методическое пособие/Н.Л. Белькова, А.М. Андреева. -Ярославль: Изд-во ООО «Принтхаус», 2009. -91 с.
  • Бондарева, Е.И. Первичная продукция Ивано-Арахлейских озер/Е.И. Бондарева, Б.А. Шишкин//Зап. Заб. фил. Геогр. общ-ва СССР. -Чита, 1972. -Вып. 80. -С. 42-62.
  • Васильков, Г.В. Болезни рыб: Справочник. Под ред. В.С. Осетрова. 2-е изд./Г.В. Васильков, Л.И. Грищенко, В.Г. Енгашев и др. -М.: Агропромиздат, 1989. -288 с.
  • Гаевская, А.В. Паразиты и болезни морских и океанических рыб в природных и искусственных условиях. -Севастополь: ЭКОСИ-Гидрофизика, 2004. -237 с.
  • Дзюба, Е.В. Современные подходы и методология экологического мониторинга в условиях водоема и в аквакультуре/Е.В. Дзюба, Н.Л. Белькова, Н.В. Деникина и др.//Известия Самарского научного центра РАН. -2009. -Т. 11, № 1. -С. 466-471.
  • Елизов, В.И. Аэромоноз в регионе Байкала//Биоразнообразие экосистем Внутренней Азии: Тез. Всеросс. конф. с межд. уч. -Улан-Удэ: БНЦ СО РАН, 2006. -Т. 2. -С. 151-154.
  • Итигилова, М.Ц. Современное состояние зообентоса озера Арахлей (Забайкалье)/М.Ц. Итигилова, П.В. Матафонов//Проблемы воды и водных ресурсов на рубеже третьего тысячелетия: Материалы межд. конф. -Томск: Изд-во НТЛ, 2000. -С. 548-550.
  • Куклин, А.П. Фитопланктон, водоросли обрастаний и первичная продукция органического вещества//Ивано-Арахлейский заказник: природно-ресурсный потенциал. Чита: Поиск, 2002. -С. 80-84.
  • Купчинский, А.Б. Состояние ихтиофауны водохранилищ Ангары/А.Б. Купчинский, Е.С. Купчинская//Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. -2006. -Т. 48, № 2. -С. 56-61.
  • Матафонов, П.В. Зообентос/П.В. Матафонов, Д.В., Матафонов//Ландшафтное и биологическое разнообразие бассейна реки Хилок: Опыт изучение и управления. -Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2002а. -С. 110-116.
  • Матафонов, П.В. Зообентос озера Арахлей/П.В. Матафонов, Д.В. Матафонов//Ивано-Арахлейский заказник: природно-ресурсный потенциал территории. -Чита: Поиск, 2002б. -С. 89-96.
  • Матафонов, П.В. Сообщества зообентоса водоросли Cladophora aegagropila в озере Арахлей/П.В. Матафонов, Д.В. Матафонов, А.П. Куклин//Озера холодных регионов: Материалы межд. конф. Ч. 2 -Якутск: изд-во Якутского ун-та, 2000. -С. 127-136.
  • Михеев, И.Е. Факторы риска для популяции окуня Perca fluviatilis (озеро Арахлей, Забайкальский край)/И.Е. Михеев, Е.Б. Матюгина//В печати.
  • Михеев, И.Е. Новые факторы риска для рыбных ресурсов в бассейне Верхнего Амура (Забайкалье)//Третьи Дружининские чтения: Комплексные исследования в бассейне реки Амур: Мат. науч. конф. -Хабаровск: ДВО РАН, 2009. -кн. 2. -С. 225-228.
  • Austin, B. Progress in understanding the fish pathogen Aeromonas salmonicida//Trends in Biotechnology. -1997. -V. 15. -P. 131-134.
  • Collins, M.D. Aeromonas enteropelogenes and Aeromonas ichthiosmia are identical to Aeromonas trota and Aeromonas veronii, respectively, as revealed by small-subunit rRNA sequence analysis/M.D. Collins, A.J. Martinez-Murcia, J. Cai//Int. J. Syst. Bacteriol. -1993. -V. 43. -P. 855-856.
  • Dalsgaard, I. Virulence mechanisms in Cytophaga psychrophila and other Cytophaga-like bacteria pathogenic for fish//Annu. Rev. Fish. Dis. -1993. -V. 1. -P. 127-144.
  • De Kinkelin, P. Précis de pathologie des poissons/P. De Kinkelin, C. Michel, P. Ghittino//Institut National de la Recherche Agronomique -OIE, Paris, 1985. -348 pp.
  • Del Cerro, A. Simultaneous detection of Aeromonas salmonicida, Flavobacterium psychrophilum, and Yersinia ruckeri, three major fish pathogens, by multiplex PCR/D. del Cerro, I. Marquez, J.A. Guijarro//Appl. Environ. Microbiol. -2002. -V. 68. -P. 5177-5180.
  • Denis, A. Saprolegniales de poissons. Epidémiologie, thérapie, biotaxonomie//Thèse. Université Sciences et Techniques du Languedoc, Montpellier, 1985. -136 pp.
  • Dieguez-Uribeondo, J. Adaptation to parasitism of some animal pathogenic Saprolegniaceae. Universitatis Upsaliensis, Comprehensive Summaries of Uppsala Dissertations from the Faculty of Science and Technology, 1995. -83. ISBN 91-554-3527-0. -122 p.
  • Goldschmidt-Clermont, E. Identification of bacteria from the normal flora of perch, Perca fluviatilis L., and evaluation of their inhibitory potential towards Aeromonas species/E. Goldschmidt-Clermont, T. Wahli, J. Frey, S.E. Burr//J. Fish Dis. -2008. -V. 31. -P. 353-359.
  • Gudmundsdottir, B.K. Infections by atypical strains of the bacterium Aeromonas salmonicida//Icel. Agr. Sci. -1998. -V. 12. -P. 61-72.
  • Hastein, T. Bacterial vaccines for fish -an update of the current situation worldwide/T. Hastein, R. Gudding, O. Evensen//Dev. Biol. -2005. -V. 121. -P. 55-74.
  • Huys, G. High-resolution genotypic analysis of the genus Aeromonas by AFLP fingerprinting/G. Huys, R. Coopman, P. Janssen, K. Kersters//Int. J. Syst. Bacteriol. -1996 -V. 46. -P. 572-580.
  • Huys, G. New DNA-DNA hybridization and phenotypic data on the species Aeromonas ichthiosmia and Aeromonas allosaccharophila: A. ichthiosmia Schubert et al. 1990 is a later synonym of A. veronii Hickman-Brenner et al. 1987/G. Huys, P. Kampfer, J. Swings//Syst. Appl. Microbiol. -2001. -V. 24. -P. 177-182.
  • Izumi, S. Detection and identification of Flavobacterium psychrophilum from gill washings and benthic diatoms by PCR-based sequencing analysis/S. Izumi, H. Fujii, F. Aranishi//J. Fish Dis. -2005. -V. 28. -P. 559-564.
  • Larsson, M. Pathogenicity, morphology and isozyme variability among isolates of Aphanomyces spp. from weeds and various crop plants//Mycol. Res. -1994. -V. 98. -P. 231-240.
  • Liu, C. On the ecology of the Saprolegniaceae/C. Liu, P.A. Volz//Phytologica. -1976. -V. 34. -P. 209-230.
  • Lonnstrom, L.-G. Flavobacterium psychrophilum associated with mortality of farmed perch, Perca fluviatilis L./L.-G. Lonnstrom, M.L. Hoffren, T. Wiklund//J. Fish Dis. -2008. -V. 31. -P. 793-797.
  • Madetoja, J. Occurrence of Flavobacterium psychrophilum in fish-farming environments/J. Madetoja, I. Dalsgaard, T. Wiklund//Dis. Aquatic Organ. -2002. -V. 52. -P. 109-118.
  • Michel, C. A bacterial disease of perch (Perca fluviatilis L.) in an alpine lake: isolation and preliminary study of the causative organism//J. Wildl. Dis. -1981. -V. 17. -P. 505-510.
  • Rahman, M. Identification and characterization of pathogenic Aeromonas veronii Biovar Sobria associated with epizootic ulcerative syndrome in fish in Bangladesh/M. Rahman, P. Colque-Navarro, I. Kühn et al.//Appl. Environ. Microbiol. -2002, V. 68. -P. 650-655.
  • Roberts, R.J. Mycotic aspects of epizootic ulcerative syndrome (EUS) of Asian fishes/R.J. Roberts, L.G. Willoughby, S. Chinabut//J. Fish Dis. -1993. -V. 16. -P. 169-183.
  • Sambrook, J. Molecular Coning. A laboratory Manual. Vol. 2/J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. -Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. -345 pp.
  • Tiirola, M. Diagnosis of flavobacteriosis by direct amplification of rRNA genes/M. Tiirola, E.T. Valtonen, P. Rintamaki-Kinnunen, M.S. Kulomaa//Dis. Aquatic Organ. -2002. -V. 51. -P. 93-100.
  • Wahli, T. Aeromonas sobria, a causative agent of disease in farmed perch, Perca fluviatilis L./T. Wahli, S.E. Burr, D. Pugovkin et ak.//J. Fish Dis. -2005. -V. 28. -P. 141-150.
  • Wakabayashi, H. A study on serotyping of Cytophaga psychrophila isolated from fishes in Japan/H. Wakabayashi, T. Toyama, T. Iida//Fish Pathol. -1994. -V. 29. -P. 101-104.
  • Willoughby, L.G. Saprolegnias of salmonid fish in Windermere: a critical analysis//J. Fish Dis. -1978. -V. 1. -P. 51-67.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp