Перспективы использования методов молекулярно-генетического анализа в почвенной экологии

Автор: Петрова С.Н., Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В.

Журнал: Вестник аграрной науки @vestnikogau

Рубрика: Научное обеспечение развития растениеводства

Статья в выпуске: 5 (26), 2010 года.

Бесплатный доступ

Показаны возможности современных молекулярных методов в экологии микроорганизмов почвы. Демонстрируется анализ динамики почвенных микроорганизмов во всех основных группах (грибы, археи, бактерии) с использованием ПЦР с детекцией в реальном времени и анализ видовой структуры с помощью метода T-RFLP.

Микробное сообщество почвы, пцр с детекцией в реальном времени

Короткий адрес: https://sciup.org/147123562

IDR: 147123562

Список литературы Перспективы использования методов молекулярно-генетического анализа в почвенной экологии

  • Ярилин, А.А. Золушка становится принцессой, или место биологии в иерархии наук [Текст]/А.А. Ярилин//Эколония и жизнь. -2008. -№12. -с. 10
  • Лукашов, В.В. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ [Текст]/В.В. Лукашов. -М.: БИНОМ. 209. -256 с
  • Hoppener-Ogawa, S. Specific detection and real-time PCR quantification of potentially mycophagous bacteria belonging to the genus collimonas in different soil ecosystems [Теxt]/S. Hoppener-Ogawa, J.H.J. Leveau, W. Smant, J.A. van Veen, W. de Boer//Appl. Environ. Microbiol. -2007. -V. 73. -13. -P. 4191-4197
  • Sung-Keun, R. Estimation of Distribution of a Commensal Thermophile in Soil by Competitive Quantitative PCR and Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis [Теxt]/R. Sung-Keun, S. Hong, J. Bae, C. Jeon, S. Lee, J. Song, H. Poo, M. Sung//J. Microbiol. Biotechnol. -2001. -Vol. 11. -No. 6. -P. 940-945
  • Chen, A., Molecular detection and direct enumeration of methanogenic Archaea and methanotrophic Bacteria in domestic solid waste landfill soils [Теxt]/A. Chen, K. Ueda, Y. Sekiguchi, A. Ohashi, H. Harada//Biotechnol. Lett. -2004. -V. 25. 18. -P. 1563-1569
  • Fierer, N. Assessment of soil microbial community structure by use of taxon-specific quantitative PCR assays [Теxt]/N. Fierer, J.A. Jackson, R. Vilgalys, R.B. Jackson//Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71, No. P. 4117-4120
  • Yu, Y. Group-specific primer and probe sets to detect methanogenic communities using quantitative real-time polymerase chain reaction [Теxt]/Y. Yu, Ch. Lee, J. Kim, S. Hwang//Biotechnol. Bioeng. -2005. -Vol. -89. No. -6., P -670-679
  • Singh, B.K. Use of Multiplex Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism for Rapid and Simultaneous Analysis of Different Components of the Soil Microbial Community [Теxt]/B.K. Singh, L. Nazaries, S. Munro, I.C. Anderson, K.D. Campbell//Appl. Environ. Microbiol. -2006. -Vol. 72. -No. 11. -P. 7278-7285
  • Sung-Keun, R. Estimation of Distribution of a Commensal Thermophile in Soil by Competitive Quantitative PCR and Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis. [Теxt]/R. Sung-Keun, S. Hong, J. Bae, C. Jeon, S. Lee, J. Song, H. Poo, M. Sung//J. Microbiol. Biotechnol. -2001. -Vol. 11. -No. 6. -P. 940-945
  • Innis, M. A., and D. H. Gelfand. PCR protocols: a guide to methods and applications [Теxt] San Diego, Calif. -Academic Press. -1990
  • Malferrari, G. High-quality genomic DNA from human whole blood and mononuclear cells [Теxt]/G. Malferrari, E. Monferini, P. DeBlasio, G. Diaferia, G. Saltini, E. Del Vecchio, L. Rossi-Bernardi, I. Biunno//BioTechniques. -2002. -Vol. 33. -No. 6. P. -1228-1230
  • Amarger, N. Genetically modified bacteria in agriculture [Теxt]//Biochimie. 2002. V. 84. P. 1061-1072
  • Hirsh, P.R. Release of transgenic bacterial inoculants -rhizobia as a case study//Plant and Soil. -2004. -V. -266.P. 1-10
  • Андронов, Е.Е. Влияние внесения генетически модифицированного штамма Sinorhizobium meliloti ACH-5 на структуру почвенного сообщества микроорганизмов [Текст]/Е.Е. Андронов, С.Н. Петрова, Е.П.Чижевская, Е.В. Коростик, Г.А. Ахтемова, А.Г Пинаев.//Микробиология. -2009. -Т.78. -№4. -с. 1-10
Еще
Статья научная