Поиск и изучение генов, кодирующих металло-бета-лактамазы, у госпитальных штаммов Pseudomonas aeruginosa

Автор: Кузнецова Марина Валентиновна, Егорова Дарья Олеговна, Карпунина Тамара Исаковна

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Статья в выпуске: 3-4, 2011 года.

Бесплатный доступ

Изучены карбапенемоустойчивые нозокомиальные штаммы Pseudomonas аeruginosa, изолированные в хирургических стационарах г. Перми и пос. Лобаново. Установлено, что в геноме 34 культур присутствуют фрагменты ДНК, соответствующие по размеру генам blaVIM-2. Принадлежность амплифицированных генов к подгруппе blaVIM-2 была подтверждена результатами рестрикционного анализа с эндонуклеазой HindII. Сравнение нуклеотидных последовательностей blaVIM шести изолятов, принадлежащих к разным геномогруппам, показало высокий уровень сходства (99-100%) участков генов длиной 615-741 п.н. с геном blaVIM-2 референтного штамма P. aeruginosa COL-1 (GenBank GQ853417.1).

Еще

Pseudomonas аeruginosa, карбапенемы, металло-бета-лактамазы

Короткий адрес: https://sciup.org/147204561

IDR: 147204561

Список литературы Поиск и изучение генов, кодирующих металло-бета-лактамазы, у госпитальных штаммов Pseudomonas aeruginosa

Галкин Д.В. Карбапенемы через 20 лет после открытия: современные микробиологические и клинические аспекты//Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2007. Т. 9, № 2. С. 133-152.
Иванов Д.В. и др. Особенности антибиотикочувствительности важнейших грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций//Вест. Росс. гос. мед. ун-та. 2009. № 2. С. 26-29.
Руднов В.А. Антибиотикотерапия госпитальных инфекций, вызванных P. aeruginosae//Рус. мед. журн. 2005. Т. 13. № 7. С. 485-490.
Черкашин Е.А., Федорчук В.В., Иванов Д.В. и др. Исследование распространенности метало-бе-талактамаз в Российской Федерации//Вестн. Моск. ун-та. Сер. Химия. 2006. №4 7(3). С. 83-86.
Шевченко О.В., Эйдельштейн М.В., Степанова М.Н. Металло-лактамазы: значение и методы выявления у грамотрицательных неферментирующих бактерий//Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2007. Т. 9. № 3. С. 211-218.
Arakawa Y., Shibata N., Shibayama K. [et al] Convenient test for screening metallo-b-lactamaseproducing gram-negative bacteria by using thiol compounds//J. Clin. Microbiol. 2000. Vol. 38. P. 40-43.
Castanheira M., Toleman M.A., Jones R.N. et al. Molecular characterization of -lactamase gene, bla-GIM-1, encoding a new subclass of metallo-blactamase//Antimicrob. Agents Chemother. 2004. Vol. 48. P.4654-4661.
Lauretti L., Riccio M.L., Mazzariol A. et al. Cloning and characterization of [bla.sub.VIM], a new integron-borne metallo-[beta]-lactamase gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate//Antimicrob. Agents. Chemother. 1999. Vol. 43. P. 1584-1590.
Lee K., Lim J.B., Yum J.H. et al. [bla.sub.VIM-2] cassette-containing novel integrons in metallo-[beta]-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas putida isolates disseminated in a Korean hospital//Antimicrob. Agents. Chemother. 2002. Vol. 46. P. 1053-1058.
Lee K., Yum J.H., Yong D., et al. Novel acquired metallo-b-lactamase gene, blaSIM-1, in a class 1 integron from Acinetobacter baumannii clinical isolates from Korea. Antimicrob//Agents Chemother. 2005. Vol. 49. P. 4485-4491.
Poirel L., Naas T., Nicholas D. et al. Characterization of VIM-2, a carbapenem-hydrolyzing metallobeta-lactamase and its plasmid-and integron-borne gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate in France//Antimicrob. Agents. Chemother. 2000. Vol. 44. P. 891-897.
Poirel L., Magalhaes M., Lopes M., Nordmann P. Molecular analysis of metallo-beta-lactamase gene blaSPM-1-surrounding sequences from disseminated Pseudomonas aeruginosa isolates in Recife, Brazil//Antimicrob. Agents Chemother. 2004. Vol. 48. Р. 1406-1409.
Queenan A.M., Bush K. Carbapenemases: the versatile b-lactamases//Clin. Microbiol. Rev. 2007. Vol. 20. P. 440-458.
Riccio M.L., Franceschini N., Boschi L. et al. Characterization of the metallo-beta-lactamase determinant of Acinetobacter baumannii AC-54/97 reveals the existence of blaIMP allelic variants carried by gene cassettes of different phylogeny//Antimicrob. Agents Chemother. 2000. Vol. 44. P. 1229-1235.
Shibata N., Doi Y., Yamane K. et al. PCR typing of genetic determinants for metallo-beta-lactamases and integrases carried by gram-negative bacteriaisolated in Japan, with focus on the class 3 integron//J. Clin. Microbiol. 2003. Vol. 41. P. 5407-5413.
Stone G.G., Oberst R.D., Hays S. [et al.] Detection of Salmonella serovars from clinical samples by enrichment broth cultivation-PCR procedure//J. Clin. Microbiol. 1994. Vol. 32. P. 1742-1749.
Thompson J.D., Higgins D.G., Gibson T.J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment son//Nucl. Acids. Res. 1994. Vol. 22. P. 4673-4680.
Toleman M.A., Rolston K., Jones R., Walsh T.R. bla-VIM-7, an evolutionarily distinct metallo-betalactamase gene in a Pseudomonas aeruginosa isolate from the United States//Antimicrob. Agents Chemother. 2004. Vol. 48, N 1. P. 329-332.
Tsakris A., Pournaras S., Woodford N. et al. Outbreak of infections caused by Pseudomonas aeruginosa producing VIM-1 carbapenemase in Greece//J. Clin. Microbiol. 2000. Vol. 38. P. 1290-1292.
Van de Peer Y., DeWachter R. TREECON for Windows a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment//Comput. Appl. Biosci. 1994. Vol. 10. P. 569-570.

Еще

Статья научная