Популяционная структура соболя (Martes zibellina Linnaeus, 1758) Среднего Приамурья: кластерный анализ субпопуляций право- и левобережья реки Амур
Автор: Брыкова А.Л., Родимцева Д.В., Фрисман Л.В.
Журнал: Региональные проблемы @regionalnye-problemy
Рубрика: Математическое моделирование. Биология
Статья в выпуске: 4 т.26, 2023 года.
Бесплатный доступ
Проведенный ранее мониторинг аллельного состава субпопуляций соболя Приамурья в охотничьи сезоны 2011-2021 гг. показал присутствие аллелей, маркирующих различия соболиного населения левобережья и правобережья р. Амур. При попарном сравнении сезонных сборов субпопуляций лево- и правобережья был обнаружен разброс уровня генетической дифференциации от практически нулевых значений до промежуточного уровня. Стало понятно, что для определения количества различающихся генетических групп соболя в данном регионе необходимо привлечение дополнительных математических методов работы с полученными данными. Целью настоящей работы является определение и визуализация наиболее вероятного числа различающихся генетических групп соболей рассматриваемой территории. Были изучены три субпопуляции соболя Буреинского нагорья (левобережье р. Амур) и для сравнения рассмотрена одна субпопуляция c западных склонов Сихотэ-Алиня (правобережье р. Амур). Анализ данных по двум микросателлитным локусам Ma3 и Mer041 на материале охотничьих зимних сезонов с 2011 г. по 2022 г. проведен с помощью программ Structure 2.3.4 и Structure Harvester. По результатам, полученным с помощью этих программ, можно предположить, что на рассматриваемой территории данный вид представлен двумя генетическими группами (кластерами) - «левобережной» и «правобережной». Структура сохраняется как для материала сборов рассматриваемых зимних охотничьих сезонов 2012-2013 гг. и 2013-2014 гг., так и для суммарных сборов 2011-2022 гг. Формирование такой структуры, несомненно, - результат наложения истории становления ареала вида и генетической специфики различающихся антропогенно обусловленных интродукций из двух географических районов, проводимых здесь в середине прошлого века.
Соболь, кластерный анализ, генетические группы, микросателлитные локусы, субпопуляции, буреинское нагорье
Короткий адрес: https://sciup.org/143181149
IDR: 143181149 | DOI: 10.31433/2618-9593-2023-26-4-24-32
Список литературы Популяционная структура соболя (Martes zibellina Linnaeus, 1758) Среднего Приамурья: кластерный анализ субпопуляций право- и левобережья реки Амур
- Абрамов К.Г. Соболь в охотничьем хозяйстве Дальнего Востока. М.: Наука, 1967. 116 с.
- Каштанов С.Н., Свищева Г.Р., Лазебный О.Е., Колобков Д.С., Пищулина С.Л., Мещерский С.Л., Рожнов В.В. Влияние антропогенных факторов на генетическое разнообразие вида соболь (Martes zibellina L.) // Молекулярная биология. 2015. Т. 49, № 3. С. 449-454. DOI: 10.7868/S002689841503009X.
- Каштанов С.Н., Свищева Г.Р., Пищулина С.Л., Лазебный О.Е., Мещерский И.Г., Симакин Л.В., Рожнов В.В. Географическая структура генофонда соболя (Martes zibellina L.): данные анализа микросателлитных локусов // Генетика. 2015. Т. 51, № 1. С. 78-88. DOI: 10.7868/ S001667581501004X.
- Крестов П.В., Баркалов В.Ю., Омелько А.М., Якубов В.В., Накамура Ю., Сато К. Реликтовые комплексы растительности современных рефугиумов северо-восточной Азии // Ко-маровские чтения. Владивосток: Дальнаука, 2009. Вып. 56. С. 5-63.
- Фрисман Л.В., Шлюфман К.В., Брыкова А.Л. Генетическая структура популяции соболя (Martes zibellina L.) Буреинского нагорья по сборам одного охотничьего сезона // Региональные проблемы. 2019. Т. 22, № 4. С. 46-55. DOI: 10.31433/2618-9593-2019-22-4-46-55.
- Earl Dent A., VonHoldt B.M. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation Genetics Resources. 2012. Vol. 4. P. 359-361. DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7.
- Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular ecology. 2005. Vol. 14, N 8. P. 2611-2620. DOI: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x.
- Falush D., Stephens M., Pritchard J.K. Inference of population structure using multilocus genotype data: linked loci and correlated allele frequencies // Genetics. 2003. Vol. 164, N 4. P. 1567-1587. PMID: 12930761.
- Frisman L.V., Brykova A.L. Monitoring of the Genetic Structure of the Sable Population (Martes zibellina Linnaeus, 1758) in the Middle Amur Region // Russian Journal of Genetics. 2023. Vol. 59, N 4. P. 375-384. DOI: 10.1134/ S1022795423040038.
- Modorov M., Monakhov V., Mikryukov V., Erokhin N., Tkachenko I., Polezhaeva M., Ranyuk M. Microsatellite multiplex assay for sable (Martes zibellina) and pine marten (Martes martes) // Mammal Research. 2020. Vol. 65. P. 855-862. DOI: 10.1007/s13364-020-00529-4.
- Ranyuk M., Modorov M., Monakhov V., Devyat-kin G. Genetic differentiation of autochthonous sable populations in Western and Eastern Siberia // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. 2021. Vol. 59. P. 2539-2552. DOI: 10.1111/jzs. 12565.
- Smulders M.J.M., Van Der Schoot J., Arens P., Vosman B. Trinucleotide repeat microsatellite markers for black poplar (Populus nigra L.) // Molecular Ecology Notes. 2001. Vol. 1, N 3. P. 188190. DOI: 10.1046/j .1471-8278.2001.00071.x.
