Построение этиопатогенетического образа концептов метатезауруса UMLS с использованием графовых метрик

Построение этиопатогенетического образа концептов метатезауруса UMLS с использованием графовых метрик

Автор: Астанин П.А., Раузина С.Е., Зарубина Т.В.

Журнал: Программные системы: теория и приложения @programmnye-sistemy

Рубрика: Медицинская информатика

Статья в выпуске: 3 (58) т.14, 2023 года.

Бесплатный доступ

Разработка средств информационной поддержки принятия клинических решений (ППКР) является актуальной задачей медицинской информатики. Довольно часто в системах ППКР используются информационно-поисковые алгоритмы, важным этапом проектирования которых служит создание средств автоматического распознавания этиопатогенетического образа заболеваний при работе с неструктурированным текстом. В настоящей статье произведены обзор и сравнительная характеристика аналитических метрик, применимых для построения образа концептов метатезауруса Unified Medical Language System (UMLS), представленного в виде графовой информационной модели. Предложен собственный вариант графовой метрики, показавший наибольшую эффективность при решении данной задачи.

Еще

Медицинская информационная система, информационно-поисковый алгоритм, база знаний, теория графов, umls

Короткий адрес: https://sciup.org/143180583

IDR: 143180583   |   DOI: 10.25209/2079-3316-2023-14-3-59-94

Список литературы Построение этиопатогенетического образа концептов метатезауруса UMLS с использованием графовых метрик

  • Астанин П. А., Ронжин Л. В., Раузина С. Е., Зарубина Т. В. Алгоритмы семантического анализа данных и возможности их применения в разработке медицинских информационных систем // Цифровая статистика. Новые задачи и траектория движения— 2022, Материалы IV Съезда медицинских статистиков Москвы (21–23 сентября 2022 года).– 2022.– С. 6–9.
  • Кукарцев В.В., Колмакова З. А., Мельникова О. Л. Системный анализ возможностей по извлечению именованных сущностей с применением технологии Text Mining // Перспективы науки.– 2019.– Т. 120.– №9.– С. 18–20. [РИНЦ]
  • Berlingerio M., Coscia M., Giannotti F., Monreale A.,Pedreschi D. Multidimensional networks: foundations of structural analysis // World Wide Web.– 2013.– Vol. 16.– Pp. 567–593. https://doi.org/10.1007/s11280-012-0190-4
  • Клабукова Д. Л., Давыдовская М. В. Внедрение международной терминологической базы MedDRA в практику фармаконадзора в Российской Федерации // Московская медицина.– 2020.– Т. 35.– №1.– С. 64–69. [РИНЦ]
  • Кузьмин А. Г., Умаров М. Ф. Интеграция современных медицинских информационных технологий // Вестник Вологодского государственного университета. Серия: Технические науки.– 2021.– Т. 12.– №2.– С. 32–35. [РИНЦ]
  • Зацман И. М., Золотарев О. В., Хакимова А. Х., Дунсяо Гу Модель и технология извлечения новых терминов из медицинских текстов // Информ. и её примен..– 2022.– Т. 16.– №4.– С. 80–86. https://doi.org/10.14357/19922264220412
  • Mougin F., Grabar N. Auditing the multiply-related concepts within the UMLS // Journal of the American Medical Informatics Association.– 2014.– Vol. 21.– No. e2.– Pp. e185–e193. https://doi.org/10.1136/amiajnl-2013-002227
  • Астанин П. А. Применение автоматизированного анализа семантической сети UMLS для решения задачи поиска релевантных знаний о ревматических заболеваниях // Математическое моделирование систем и процессов, Сборник материалов Международной научно-практической конференции (г. Псков, 9-11 ноября 2022 г.), Псков: Псковский государственный университет.– 2022.– ISBN 978-5-00200-102-6.– С. 6–12.
  • Ямашкин С. А., Скворцов М. А., Большакова М. В., Ямашкин А. А. Сравнительный анализ подходов к управлению базами данных для организации хранилища репозитория нейросетевых моделей // Современные наукоемкие технологии.– 2021.– №6-1.– С. 108–113. https://doi.org/10.17513/snt.38706
  • Елисеева Е.А., Горячкин Б.С., Виноградова М.В., Черненький М.В. Оценка времени выполнения поисковых запросов в NoSQL и объектно-реляционной базах данных // Динамика сложных систем— XXI век.– 2022.– Т. 23.– №2.– С. 44–51. https://doi.org/10.18127/j19997493-202202-05
  • Еремеев А. П., Мунтян Е.Р. Разработка онтологии на основе графов с множественными и разнотипными связями // Искусственный интеллект и принятие решений.– 2021.– №3.– С. 3–18. https://doi.org/10.14357/20718594210301
  • Nicosia V., Latora V. Measuring and modeling correlations in multiplex networks // Physical Review E.– 2015.– Vol. 92.– id. 032805. https://doi.org/10.1103/PhysRevE.92.032805
  • Battiston F., Nicosia V., Latora V. Structural measures for multiplex networks // Physical review E.– 2014.– Vol. 89.– id. 032804. https://doi.org/10.1103/PhysRevE.89.032804
  • Sz´arnyas G., K˝ov´ari Z., Sal´anki A.,Varro D.Towards the characterization of realistic models: evaluation of multidisciplinary graph metrics // Proceedings of the ACM/IEEE 19th International Conference on Model Driven Engineering Languages and Systems (Saint-malo, France, October 2–7, 2016), New York: ACM.– 2016.– ISBN 978-1-4503-4321-3.– Pp. 87–94. https://doi.org/10.1145/2976767.2976786
  • Nascimento M. C. V., Carvalho A. C.P. L. F. A graph clustering algorithm based on a clustering coefficient for weighted graphs // Journal of the Brazilian Computer Society.– 2011.– Vol. 17.– Pp. 19–29. https://doi.org/10.1007/s13173-010-0027-x
  • Пулькин И. С., Татаринцев А. В. Достаточная статистика для параметра распределения Парето // Russian Technological Journal.– 2021.– Т. 9.– №3.– С. 88–97. https://doi.org/10.32362/2500-316X-2021-9-3-88-97
  • Синицын В. Ю., Кашпарова В. С. Частотные свойства лексики научных текстов и законы Ципфа высших порядков // Вестник РГТУ. Серия: Информатика. Информационная безопасность. Математика.– 2022.– №4.– С. 75–91. https://doi.org/10.28995/2686-679X-2022-4-75-91
  • Ghaderpour E., Morris D. Cayley graphs on nilpotent groups with cyclic commutator subgroup are hamiltonian // Ars Mathematica Contemporanea.– 2011.– Vol. 7.– No. 1, Special Issue Bled’11.– Pp. 55–72. https://doi.org/10.26493/1855-3974.280.8d3
  • Каратеев А. Е. Хроническая боль в спине как проявление остеоартрита позвоночника: обоснование и практика применения симптоматических средств замедленного действия // Современная ревматология.– 2022.– Т. 16.– №4.– С. 88–97. https://doi.org/10.14412/1996-7012-2022-4-88-97
  • Higuchi H., Harada T., Hiroshige J. Evaluation of the usefulness of costovertebral angle tenderness in patients with suspected ureteral stone // J. Gen. Fam. Med..– 2023.– Vol. 24.– No. 1.– Pp. 56–58. https://doi.org/10.1002/jgf2.581
  • Се Л., Ду Ч., Ин Ч., Вэй Я. Острое расслоение аорты с правосторонней болью в грудной клетке и спине, сопровождающейся левосторонней дискинезией конечности // Кардиология.– 2022.– Т. 62.– №6.– С. 74–76. https://doi.org/10.18087/cardio.2022.6.n1818
  • Дуга С.В., Труфанов А. И. Сеть знаний как концепция систем поддержки принятия решения в предварительном следствии // Безопасность информационных технологий.– 2020.– Т. 27.– №3.– С. 54–65. https://doi.org/10.26583/bit.2020.3.05
  • Мосалов О. П. Векторные представления рёбер графа онтологии как инструмент для анализа и генерации новых данных // Информационно-технологический вестник.– 2021.– Т. 27.– №1.– С. 93–101. [РИНЦ]
  • Ананьева Е. А. Уровни представления маршрутных пассажирских транспортных сетей в виде графовых моделей // Colloquium-Journal.– 2019.– Т. 35.– №11-1.– С. 63–68. [РИНЦ]
  • Близнякова Е. А., Куликов А. А., Куликов А. В. Сравнительный анализ методов поиска кратчайшего пути в графе // Архитектура, строительство, транспорт.– 2022.– №1.– С. 80–87. https://doi.org/10.31660/2782-232X-2022-1-80-87
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp