Предварительное описание нового вида галофильной метилобактерии рода Methylophaga из фильтрата полигона захоронения твёрдых бытовых отходов
Автор: Шаравин Д.Ю., Саралов А.И.
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 4, 2015 года.
Бесплатный доступ
Из слабощелочного фильтрата (pH 8.0-8.3) полигона твёрдых бытовых отходов (г. Пермь) с высоким уровнем загрязнения по аммонию, нитратам, нитритам и метану выделен и описан умеренно галофильный метилотрофный денитрификатор (изолят RS-MM3). Является аэробом, наиболее активную денитрификацию осуществляет на среде с пируватом. Способен расти в среде с 0.02-5% СН 3ОН, 0.2-10% NaCl при 10-40°C и pH 6.0-9.5. Факультативный метилотроф: метанол, метиламин, фруктозу и сахарозу использует в качестве источников углерода и энергии. При оптимальных условиях роста (30°C, pH 7.8, 30 г/л NaCl, 20 мкг/л витамин B 12) на среде с метанолом (5 мл/л) основными жирными кислотами являются C 16:1to7c, C 16:0, C 18:1to7c. Содержание Г+Ц в ДНК составляет 43.9 мол.%. По совокупности гено- и фенотипических признаков изолят отнесён к метилотрофным представителям Gammaproteobacteria рода Methylophaga в качестве нового вида Methylophaga RS-MM3 sp. nov. Филогенетическое сходство с различными ограниченно галоалкалофильными видами рода достигало межвидового уровня (95.3-96.7%).
Полигон твёрдых бытовых отходов, фильтрат, метилотрофия
Короткий адрес: https://sciup.org/147204742
IDR: 147204742
Список литературы Предварительное описание нового вида галофильной метилобактерии рода Methylophaga из фильтрата полигона захоронения твёрдых бытовых отходов
- Вайсман Я.И., Вайсман О.Я., Максимов С.В. Управление метаногенезом на полигонах твердых бытовых отходов. Пермь: Изд-во ПГТУ, 2003. 232 с
- Иванова Е.Г. и др. Факультативные и облигатные метилобактерии синтезируют цитокинины//Микробиология. 2000. Т. 69, № 6. С. 764-769
- Ножевникова А.Н., Каллистова А.Ю., Кевбрина М.В. Эмиссия и окисление метана на полигоне захоронения твердых бытовых отходов: сезонные измерения//Труды Института микробиологии им. С.Н. Виноградского. 2006. Т. 13. С. 172-191
- Amann R.I., Ludwig W., Schleifer K.H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation//Microbiol. Rev. 1995. Vol. 59. P. 143-169
- Doronina N.V., Darmaeva T.D., Trotsenko Y.A. Me-thylophaga alcalica sp. nov., a novel alkaliphilic and moderately halophilic, obligately methylotro-phic bacterium from an East Mongolian saline soda lake//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. Vol. 53. P. 223-229
- Juretschko S. et al. The microbial community composition of a nitrifying-denitrifying activated sludge from an industrial sewage treatment plant analyzed by the full-cycle rRNA approach//Syst. Appl. Microbiol. 2002. Vol. 25. P. 84-99
- Kim H.G. et al. Methylophaga aminisulfidivorans sp. nov., a restricted facultatively methylotrophic marine bacterium//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. Vol. 57. P. 2096-2101
- Knief C. et al. Cultivation-independent characterization of methylobacterium populations in the plant phyllosphere by automated ribosomal intergenic spacer analysis//Appl. and Environ. Microb. 2008. Vol. 74, № 7. P. 2218-2228
- Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing//Stackebrandt E., Goodfellow M. (eds) Nuc. Acids Tech. in Bact. Syst. Chichester: Academic Press, 1991. Р. 115167
- Lau E. et al. The methanol dehydrogenase gene mxaF, as a functional phylogenetic marker for proteobacterial methanotrophs in natural environments//PLOS ONE. 2013. Vol. 8. e56993
- Manz W. et al. Phylogenetic oligodeoxynucleotide probes for the major subclasses of proteobacteria: problems and solutions//Syst. Appl. Microbiol. 1992. Vol. 15. P. 593-600
- McDonald I.R., Murrell J.C. The methanol dehydro-genase structural gene mxaF and its use as a functional gene probe for methanotrophs and methy-lotrophs//Appl. Environ. Microbiol. 1997. Vol. 63. P. 3218-3224
- Snaidr J. et al. Phylogenetic analysis and in situ identification of bacteria in activated sludge//Appl. Environ. Microbiol. 1997. Vol. 63. P. 2884-2896
- Villeneuve C. et al. Methylophaga nitratireducen-ticrescens sp. nov. and Methylophaga frappieri sp. nov., isolated from biofilm of the methanol-fed denitrification system treating the seawater at the Montreal Biodome//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2013. Vol. 63. P. 2216-2222