Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки по данным, полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C

Автор: Кулакова Екатерина Викторовна, Спицина Анастасия Михайловна, Богомолов Антон Геннадьевич, Орлова Нина Геннадьевна, Дергилев Артур Игоревич, Чадаева Ирина Витальевна, Бабенко Владимир Николаевич, Орлов Юрий Львович

Журнал: Программные системы: теория и приложения @programmnye-sistemy

Рубрика: Программное и аппаратное обеспечение для супер ЭВМ

Статья в выпуске: 1 (32) т.8, 2017 года.

Бесплатный доступ

В связи с ростом объемов данных геномики о положении сайтов связывания транскрипционных факторов, хромосомных контактах, аннотации геномных характеристик, полученных с помощью современных технологий секвенирования, растет потребность в разработке нового программного обеспечения для их статистической обработки и анализа. Рассмотрены технологии получения и программы анализа геномных данных секвенирования на основе технологий ChIA-PET и Hi-C. Представлена разработанная компьютерная программа для обработки геномных данных о хромосомных контактах и их функциональной аннотации

ID: 14336112 Короткий адрес: https://sciup.org/14336112

Ред. заметка